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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000126_pilon:429890..434515- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14842.1.p1 ID=MSTRG.14842.1.p1|Name=MSTRG.14842.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4626bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:429890..434515- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACATAATGAAGTTCCGATTTTCAAACTACAGGTGAAAGTACAACAGCTGG
TCGTATATTGAGTCGTGATCATTTCGGTGACAAGTTAAAGGAGTTCATTC
GTGGTGATCTGTCAGACAAACGCCCTTTTGTTTGGGGTACATGCAGTGGG
TTGATCATGCTGGCAAACGATCTTGAAAATCAAAAGCAAGGAGGACAATA
CCATGTATGTTAAATTTTGTCTCTTTTTTATTGTTTATTTTTTGTCTTTT
AAAATCTTAACATTTAAGTATTGAATCGATGTAAAGTCGAAAGGAGTTTC
GTTTCAATAATTTATACGAAAAATAAACGATGATTTTGTTTATTCTTAAT
TGAAATTTAAGTTGAAAGATACATTAAAGTTGGTTGTAACAAGATATAAT
TCATACAGCTGTTTGGTTGTTAGTGGTAAAATCAGTCTAACGTCACTTTC
AACCAATCAGCTTTTGGTCCGTATGTAAGTTAGAAGACATTGCAATATGA
ATATGGTAAGGCCAATTTTTGTACACCTGTCCCGTCCGTACCTAAAAATT
CTCCCAAATTGCTAAACCTATTTATTTGGTGTATACTCTATGATGAATCA
CGTATGGCTCCTCTATATTCCTTTTTGCAGACTGTAGGACCCTAGAGGTG
TGGTGAGGTTTCTCATTTTAAACAAAATAAAAACTGTTATTTCTACAAAA
AAGAGACACTTATAAGACTAACTTACTCTTAAAATGTTTCTACAAAGTAT
TCTAACCAATCTAATCGTTTTTCTGAATTACATTTCTGGTTGAGGGGTAG
CTAATTTGCGTAACGGAAGGACAACTTTCAAATTTTAATTAACCATTTCT
AAGGAAAAACTTGTTTCAAAATGATAGTTTAATTTTAATAGTCAAAAGAT
CGGTAACCTAAAATGATGAACTAACCGAACTAACTATAAACTACAAAGCG
CCTAAAATTGTAAATATTAGGTATGATCGTAAAGAAGGGACAAATTCTAA
AAATTTTCAAAATTGAAAATAGCTCTTTTGGCCCATCAAGCCTCATCCCA
AGTTTCCCTAAAATTTAGGTGACCCACTGTAGGTGACCCCTGAACCGAAA
TGTGAGTTTGTTTCAGTTTCTTAAAATTTATATTGAGCATTCAAAAAAAG
ACGCGAAAACGCGTCCTATGTACCTAAGGTTTAATGAGACCCCGGTAAAA
TTGTTATGGTCAAAACAACTTCGATAACTCCTAATTGTCATTGTCGCAGT
TTGAGCAGTGTGGGGTCTTTCAAAAAAAGCAAAATTTGTTAACCCTTTGA
CGCGCAGATTTTTGAAAATGTGAATCATTTTCAATAAACTTCCAATTCTC
AGCGTTTTTGTAAATTTTTGGGCAACCATGGAAAGGTAATCTAACTCTTT
CAAAAAAGCATGGGTTTCATCCCTTTTAAGTCTAGGGCGGAGACCCAGCT
TTACTTGGATTTGGTGTTTCAGGACGCGGAAACACGTCTATGAGCCTACG
GTATGAGACCCCGGTAAAATTGTTTTATGGTCAAAACAACTCCAATAACT
CCTAATTGTCATTTTCAGGTATTGAGCAGTTTTGGAGTCTTCAAAAAAAA
TCAAAATTTTTGGTTAACCCTTTGAGCGCGCAGCAGTTTTGAAAATGTTG
AAAAATTTCAATGATTTTTTTTTGAAATTTGAAACTTCAAAATGGCGTAA
AAGCTTGTAGCTTTTGATTCAGACACTCGTTTTGGTACCAACCTTTGGAA
AGGTAATTCTATACTCTTTCAAAAAGCATTGGGTTTAATCCCCTTTAAAT
CAAGTCCTAGGGAGCTGAGACCCAAGCTTTGGGACTTGGTATTTTGGCTG
TTTCAGGACGCGAAAACACGTCCTATGGAGCCTAAGGGTTAATGAGACCC
CTGGTAAAGATTTTTTTATGGTCAAAACAACTCCGAATAACTCCTAATTG
TCATTTTCAGGTATTTGAGCAGTTTGGAGTCTTCAAAAAAAATCAAAAAT
TTTTTGGTTAACCCTTTGAGTAGTTTTGAAAATTTTGAAAAATTTCAATT
TTTTTTGAAATTTGAAATTTTAAAATGGCGTAAAAGCTTTAGCTTTTGAT
TCAGACACTCGTTTTGGTACCATTGGAAAGGTAATTTTATACTCTTTCAA
AAACATTTGGTTTCTTTCCCTTTAAATATAGTCCTAGGGAGATGGGACCC
CAGCTTTAGGACTTGGTAGTTTGGCTGTTTCAGGACGCGAAAACGCGTCC
TATGGAGCCTAAGGGTTAAGAGATAAAAAGAAGTCATTGTAGTGTAGCAA
ATGTGAGAACAGTCTACAATAGGTCTTTCAACAATGCAATAACTTCAGAT
ATCTTGGCTTTGAAGAAAGAAACACTATAATGAACATCCAAGTCCCTGTA
ACACTCCCTTTTAAAAAAGGCGTAACGGAAGGGACATCCATAACGGAAGG
GACATCAAATTTTCCAAGGAGATAACTCCCACCACATCGTTAATATTAAG
TTTAAATGTACCTGCAAGTAAGAAGTCTAATGAGGGTAGTAGTCAACCAC
AAGGAAAAGTTTTTAAGTCGAAGATTTGAGATGCTGTTCAATTTAATGTT
TGCGTAACGGAAGGGACAAAACCAAGGCACATTTCCAATGGGAAGGACTG
TCAATGAAAAAACATGTCAAAAATAGAGGATAATGGTTTGGAAATTGAAT
TTGGAGTAATCCCAATGGTAACTTGTGAGAATTTAACATAAACTATAGCT
ACACTCATTTTGTTTTATAAGCATACGGTAAATTTCGGCTGAAGCTCACT
ATGCTTAAGTAAAGCTCAATTTTGAGCCTCGACTATGCTTAACCCTATGC
TTGGTAAAAAAATTATGAAGGGGGGGGGTAAGTTTTTTTGTACATTTTCC
CCTCTCTTTAATCTTAAGAGATATGAAGACATTCTATTGCTTTCGAATGT
TTACCATATGATATATGATATATGATTCTTTCTTCTGTTATTTTCTGAAG
TTTTGGAAATTATGATTCTAAAAATTTCTTTGGTTGAGCCTCAAGGTATG
CTTAGCATATGCTTAATTTTTCTGGAAATTTGAGCTTCAGTATGCTTATA
AACGTTATGCTTATAAAACAAAATGAGTGTATTTGACAAAGATTTTCTTG
AAAATGAATTTGCGTAACGGAAGGGACAAGATCAGAGTCGCAAAACATGC
TTTTTAGAAAAATGCAAAACCTGAGCAACAGTGAAAAAAGTATTTACTCA
AAATATTGTGAAAACTCGCTCCTATCAATATTAGGTGGACTGAAAAAAAA
TTGAAAGTGAATATTTTGTCCCAGTTGAAGAAAAAACAATTTTGAATCTT
ATTTTTTTTGCATTTTCGTAGAAAAATGTGAAATTTAGACTTCTGCAGGG
TCTGTAAGAGGAAAGACTGTCCTATTGCTGGCCAAACTCTGATTGTAAGG
GCACTTTCTACCCCAGATCAATAATCAATTGGAAGTTTTGCAAGTTTAAT
GCTAGTTTTCAAGATATGAGCAGTAAAAGTCAAAAGCGTAACGGAAGGGA
CAGGTGTACCAAAAATGTGGCCTTTACCCATATATCATGAATTTACTAGC
TTAACAACCAACTTTTTAATGTAGTCTTTGTCTACTGAGAAGCCTTTTAA
TTTTCTGGCTATTTGACTTTTAACTAAAGATTGGTGGACTCGATGTAACC
GTCTCACGAAATTTCTTCGGTCGCCAAATCAACAGTTTTGAAGCTGACGT
CACTCTTTCCGAAGACGGCTTAACCAAAGGAACTGACGACGGCAGTACTT
CCTTCCACGGAGTTTTCATAAGAGCACCAGCTGTTGTTTCTTGTAATAAA
GAGCAGGTTAAAGTTCTCGGTACCATTATGAAAGAGGAGAAAAGTACGGA
ACCGATTATTGTTGCTGTTCAACAAGACAACATTGTGGCCACTTCATTTC
ACCCAGAGCTGACAGAGGATTTGAGATGGCATACCCATTTCTTGAAAATG
GTTCTCTCGCAATAATGAATGGGATTTTGATTTTGGTTTTGGCATACCTT
ATCGGCCAAAACTTAGTCTCAGCCTTAATTTTAGTCGGCCTTAATTTGAA
TAGGCCTTAATTATTAGTTGGCCCTAATTTTAGTCACCACGTCAAAATTT
AGTCACTAAGGGCCGACTTATAATTAAGACCGACTAAAAATTTGGGTCAT
TTCTAAATTAACAAGCAGATGGAAATTAGGAGAAAGCGTAAAATACTGCA
AAATAAGAAAAGCTTAATTTTAAACTTTTAATTTGGCCCAAATCTTTAGT
CGACCCTAATTTTAGTCACCAAGCCAAAATTTAGTCACTTAGGGCCGATA
AGGTATGGTCGATAATGTATGGCTTGATGTATGTTAACTCTCTGTGTTCG
ACTGTCTAAGGACTAGAAAGTAATACTTTAGAATTTTATCAGATTTTTAT
AGTTTTTTTTTTCAATTGAGTGTGCGAGTGTATTTTATGAATTTGTAAAG
TTTGGATAATAATATGATAATTTAATGAATTTGATTTTATAGCAAGATTT
TTAAGCTGTTAAAAGAAGCATATGTACGTTTCTTAACCCTATTAGCCCCA
AGCTTTTTTGACTTTGGTATCCCCAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000126_pilon:429890..434515- >MSTRG.14842.1.p1 ID=MSTRG.14842.1.p1|Name=MSTRG.14842.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=768bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:429890..434515- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTGGTGGACTCGATGTAACCGTCTCACGAAATTTCTTCGGTCGCCAAAT
CAACAGTTTTGAAGCTGACGTCACTCTTTCCGAAGACGGCTTAACCAAAG
GAACTGACGACGGCAGTACTTCCTTCCACGGAGTTTTCATAAGAGCACCA
GCTGTTGTTTCTTGTAATAAAGAGCAGGTTAAAGTTCTCGGTACCATTAT
GAAAGAGGAGAAAAGTACGGAACCGATTATTGTTGCTGTTCAACAAGACA
ACATTGTGGCCACTTCATTTCACCCAGAGCTGACAGAGGATTTGAGATGG
CATACCCATTTCTTGAAAATGGTTCTCTCGCAATAAATGCTGGCAAACGA
TCTTGAAAATCAAAAGCAAGGAGGACAATACCATATTGGTGGACTCGATG
TAACCGTCTCACGAAATTTCTTCGGTCGCCAAATCAACAGTTTTGAAGCT
GACGTCACTCTTTCCGAAGACGGCTTAACCAAAGGAACTGACGACGGCAG
TACTTCCTTCCACGGAGTTTTCATAAGAGCACCAGCTGTTGTTTCTTGTA
ATAAAGAGCAGGTTAAAGTTCTCGGTACCATTATGAAAGAGGAGAAAAGT
ACGGAACCGATTATTGTTGCTGTTCAACAAGACAACATTGTGGCCACTTC
ATTTCACCCAGAGCTGACAGAGGATTTGAGATGGCATACCCATTTCTTGA
AAATGGTTCTCTCGCAATAAATGCTGGCAAACGATCTTGAAAATCAAAAG
CAAGGAGGACAATACCAT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000126_pilon | genome | sc0000126_pilon:429890..434515 - |
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