MSTRG.14839.8.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14839.8.p1
Unique NameMSTRG.14839.8.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000126_pilon:398686..413313-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14839.8.p1 ID=MSTRG.14839.8.p1|Name=MSTRG.14839.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14628bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:398686..413313- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAAATATCCAAAAGTTTGAAATCTCAAGATGAATCAAAGCCGGAAGCAG ATGGTGCTTGAAAAGTCAAAGTTTCATTGCATCAATTTCCTGTTAAGTTA TGAGACTGGTAAAGTTGTGGAGATTCAAAATAAGAAAGTTGCTTTTTGGT ATCGTCTCATCCAACTCAGTGTTATCATTTATGTTATTGGGTAAGTGAAA GGAGAATTTTCACATTTTTTATTTGAAATTTCTTTTGCAAGTAGCCCTGG CTTATATTGGTACACTTTTTTTTTTATAAGAACCAGTAAATTTTTGTTGA GGCTCGGCTGTTCTTATTTTTTTGGCACTTCGAGCCTCAAATTGTTCTTG TCCTTGTATTTTTGGGTTTGAACCCTAATTTCATTAATTTGGCCCTTATT TTACCTAAAACTCAGCAACTCCAGGCTCAGGATTGTTCTTAAATTGTTCT TATTTTTTGGCATTTTTGAGCCTCATTGTTCTTATAAAATTGTTCTTATA AAAAAAAGAAAAGTGTATTCCTGATATGCATCACTGGAATGTCTTCTGAC ATTAAATCATGGACCCAATAGCTGATTGGTTGTAAGTGACGTAAAACCAG TCAATACGTCACTTTACAACCAATCATGTCACGATGGTCTTGGGTTGAAA GAATTTAAGCTTCTAGGTGACTAAAATTAGTAAAACACTTCTGATTTCGT TAAGGAAATATATGTGGAGGTCAGATCCTAAAGAACTAGACATTCCAAAA GCTTTCTACCTTCCCTGTCTCGGAGCTTGTCTCTCCATATTGCGACACTC AGTGGAATCAAATCTCTGAAAAATGAGCATTTTTTAAACTTTCATTTTCA TATTATCCTCTCTTCATTTAGTTACGCCATCATTTACGACAAAGGTTACC AAGAAATAGATTCTGCAATCAGTTCCACCAATACCAAAGTCAAGGGAATC 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AGACCTCTTTTTAAAAGTTCAGATTGATTTTCAGTGTTAAATTTGTGCCT TTCGGAATTGTTAGAATTTCAATCCAAACCATGAGATTAACCAGGAATCC CATGCTTGTTTTCGTGAAATTCTGAATAAATTTCCCTCGTTGCACTTTTC AAAAAATTTCAAAATTGACCATGAGATTACTAGTTCAAAGTAATTATCCA ACATTTTTTGAGTTGTGTTCACTTCGCGAATAAGACCTTTCCAAATTCCC CATTGGGACTTAATTTCGCTTAAATCGGCGAAATCCGCGAAATTTAATCC CAACGAAAAATTTCCCATTGAAGTGAAACACAAACAAAACCTCAAATTTA GCTACATTCCCAGCTGGCACACGACGTTGTTTCAACGTTCATCTAACGTT ATATGGACGTTGTGAACGTTAGATAAACGTCGAAAAAACGTTGTGTGCCA GCTGGGTTATAGTTACATTTTTCTTCATATTTTGGTAGATTGGACGATGA GAAAACTCCCCTTTCACACGGTTACAATTTCAGGTAAAAAACATTCATCG TTTTGATATTGACCTAAATTTTCCCTAATTTTCAATTTTTTGTGATATTT ATCAACTGGTGAAAAAGTGTTAATTTTTCTCTTTGGTTTATAGTTCCTTT TCGATTTTAGATATGTGAATTACTTTGTTGAGAATGGGACGAGATATCGA ACATTGACGAAAGCTTATGGAATTAAATTCGAACTGGTCGTGTTTGGAAA GGTTTGATTCATTTCTGGAGAAAAGGGGTTTGAGGGGGTACCCGATTCCG CAATGCCACCAAGACCCAAATACACAAAATTCCACCACCAAAAATCTTTT GAAATTCCGCGAAACTATTTACTAAATTCCGTTTCTCCGCACTAAAATTA CCCAATTTCCGACATTCGTTCGAAATTCTGTGCTGTATATGAAGTACTCG AGATCATCCCTTTCACTACAGTTAAATGAGGTTTTCTTGCATTATAAAAT GAGAAAATGTCTACTTAAATTTGACTTAGACTAATTGTGTGATTGAGTGA AATTGTTTAATTTAAAGGTTTTTTAATTGTATATTAATTGGTTGATTTTT TGAACGCACTAATTCAAGCATTAAAGTAGTACCTTACATAGGGAACTAAT TTTCACTTTTTTTTTTCGCGATTTTTCGGACGTGAAAAATCTGTGGAAAT TAGAACCCGTGAATTACAAATTTGGCCATTTCTCATAAGAAATTTCGAAA AATCCCTAGGAAAATGAAAGAAATTGTAAAACTAGCAAAACGACGAAAAT TAGTTACCGCAAAATACGGTTTTTCTGATTTTTTTCGACCGCGAAAATTA CTTCCCGTTTAAATTAGTTCCCTCAAGGTATGTCGATTAATGGGTGCACA TTAACCTCATTTTAGGCGGGGAAATTTGACATTATTCCATTGCTCATGAA CCTTGGAGCAGGTATTGGCTTGCTTGGTATAGTAAGTTATCTTTCATTAT CTCATTCCGTGAGCAAAATTTGTTTCTGCGCAATCAACTTGCGCAATAAA GCTCTAATTGTCATATCTCTGAGGAGTGAGCAAATAATTAAGGGTTTCAT TTTTATGAAAAAAGAATAAAATATTTCAGTTCTTAGACGTTAGAAGGTTT TTTTTTGATGAGTTGTCTCTTTGGCTGCTTCAAAAGTTGTTTGAAGAAAA TGTCATTCTATACCGCTGGTACACTGATCTTTAACTACTTGACTGGATCG GGCTTCTCATATAAAAGGACGCGTGTCCAGTTTTAGAGCTGACTAGTCCG CCATCTTGTTTTCAATTCCGGTCGTCAACAGCGCGATCCGAATGTTTTGA AATTCAAACGTTCGAGAATCCAACGTAAAATAGAAAACAACATGGCGGTC CAGTCGACTTCAAAACTGGAACACTTCCACAGGAAATCTGTGAACAGTTA CCCTAATTAGTGTGCAAAAGATTATGATATCTGTGTCTGGTGACAATTGA CGTTTGATCTAGCATCTAGTAACTATTTTTATTTCGTAGGCAACTATTTG GTGTGATTTTATTGTGTTGAATTTGGTGGAGAAAAAAGAAGTGTACCGTG AACATATTTTGGAAAGTGTGGAAGAGCAAGCTTTGAGACGAGAAACTTTG AGACGAGCAAGAGAACAAAGTATTCAAAATGAATTTGCTAATAATGAATT TACTAACAATGAATTTGCTGAACTATAGCATCAACTATTAATTTTTGTAC TACATTCTTAACCTCGTCCCCATGTATCCCAGACTTTATTTACGTTACTT ATGAACGCCAGAGAATACCCTGGTGTTGCCTGATGCGAGTTCCCCCTCTC AGAGGGGGGAACTTCTCAAAACAATACGTCATAAAAAATCTGATGTTACT AAGTTACACTGCAATGCAATGGTTTAAAATCCAGGAACAAATGAAATCTG ACGTTTTGTTTTTGAATTACGTAGTCTTACGCATTCGAAAAACAGACAAT GCCAGGGTAGTGGTATCAGACCATGTTCACACGTTACTGTTCCGTTTCGC TCCGGTATGATTTTCGTTACGGATCGAGAATATTCATATTTGTTTCGGAA CGTGTCGGAGCAAGAAAACAGAGCAGTGACATTCCGATGAAAAAGTGGAG CGAAACCGTTTCGATCTGTTTTGCTTTGAAACATCTTCTTTTTTGACGTT TCGAATTTTGACGCTCACACACTTGTTTTGGAGCTGTTTCGTTTCGGAAC GGAACGGAACCGTAACGTCTGAACATGGTCTCAGTAAGCATAAAAAAGCT GATGATACGCAGGGAACGAGGTTGCTACATTCTAATAATTCGTTTTATGT CAAATTGTCCTTGTAATTTTCGAAGACTTTTATCAGGCTTGGGTGATCTT GACATATAGAAGGTTGAAAATACGGGGGAAGTTGGGGTTTCAAAATATTG AGACCCTCGCAAACCTTTTAATAGGTTTTTTACAAGACACAACAAGTATT CACAGAATCGCCTTAAAATCACGAAAACTAAATAAAAATGATTTATGTGT GTAGGGAGGCCCCCCAGCAGACCTTCAATTCACGCAATCACACAAAAAAT TTTCCCCAAATTCACGCATTCACGCAATGTTTTTTGTCGCAATTCACGCA ATTTTTGTTCACGCAAAGCTTCCCAACTCATGCATTCAGGTAATTTTTTT TTAGTTTTTACGCATTCACGCAAGTGAAAAAGCCCATTCATGCATTCATG CAAACCGATGAGGGGGGGCTTTAGGGGGTGAAATGGAATGGAACAGAGAT AGGAAAGTTGTGAAATGGAATGGAACAGAGATGATCTAGGAAAATTAACG AGGGTACATTTTTTCGAGGGGATTTGCAGTAATTGCGGAGGGACTCGCCG CAATTAAAAAAATAACTATGAAAACGAATTTTTCACAACAATCATCTCTT TTTTATTCCTTCTTTTTATCTTTTTTGCTACTGATATGTTCACGATAATT ACCCATTTAATTAATTTCATCTCAATTGCTTTTTAAAGTAGAAAACTCGC TCATACTTTGAAGCCCCGGATTTCGGAGAGTTTTTCCTGAGGTTTTTACC CAAATTTTGATGACCTTTAGTGATTAATGGGACCTTTGCGGGCTCGAAAA TTTTCCGTTATTATTGTTCACTTTAATGACTTCTTTAAGGGCTCTAACCG TAGTGAATTTTCATATTTGCTATGAACAACACATAGGTTTCTGCCTGATG TAACCAAAAAAACTATATGGCATGTTATACATTTTCTGTTAGGCCAACAA TCCCTGAATCTAAAAATTTCAAAATCGCAATGAAAAAATTTGATGAAGAA GAAAATGAAGAGTTTTGCGAAGAAAAGTATTTCAACTTTGAGGACCTTAT TTTGGCGAAGAATAAACATTTAAAAAATATTTTTTTGCATCATTAGATGG TGTATCTTAAACTAAACTAAAACAAATTTTTGTAAAGTTTCTTAGTCTTA AAATCTTGAATTTTTTGAATTCTCAAAAGTTTTCGAAGTCTTAAAATCTG GAATTGGTTTGTGACCAATTTTTCATTCTAATTTTTGTTCGAAATTTTTA GATATTTCAATATTTTGCAGACAATTGGAAAAAATCAAAAGAAAAAGGTG AATTACCCATTGAAAGCATATGCCGACATTGGCAAAAAGTAACGATTTTG ACTTCATTTTCTGAATAATATGAAGTATTAGCCAAGGACTATAATTTTGA TTTGAACATTGTAATTTTTCAACATATAAAAGTTTGTAACTATTCATTTT TTTCATTTCAAACCACCTAATACAAAAATCTTGTAAAAATAATAAATTTT CGGCAAATAGGTCGAAACAAATCCCGACAATGGCAAGGAAATAAAAAATG CTCATGTCGGCATATACCGACATCGGCACGGAAAGGGTTAATTACTCTTG ACAGAAATAATTACCAAAAAACTTTTAAAGGCAGTTTTTTGTTTAAAGTG TCAAGGAACCCAAAACAAAAGTTTTATCTTCAAATCCCTAGAAAATATTC TGACTATGGTCAAAGCACTTAATGCCTTGCCTTTAATCAGTCGGACAAGA TTCTGAAGCGATTGAAAATTTTTTTTGAAATACAAAGGAATAATTGTAAC TTGGCCTGTAGCTAGCCTAGAAATCTAAGCTAGTTTTTAATTCAGTCACT AGGATAAATTTGATGGTAAGTTGTGACTGAATAACAGTATTCCAAGTAAA TTTAAAATCTGTAAATATAAAAAATCTTTAAAGCACCGAAAATGCTATAT TACCATAAGCCGTGTGTCCTAGCCTTGTGAATACGGGCTTAGTTAACTAG GCTAGCCTGTAGCCAAATACTTGTAAGGTTCATAAAATTCTTATTTCAAA ATATCAGGCATTTTTAAAAGAGAGGTTCATTGTATAGATTATTTTATTGT ACCGCACGATACCCTATATTGTTTAAGAACGTCCCTATGATTAGGGACAG ATATCTGTATCTCTGCTCACTAGATCGGTTTTTTCCGATCCAGTAGTTTG AATGAAGATCAGTAGGAAACTAGAAAAAAAGGTCCTTTAATATAAGACGT TCCTATATGTAAGGACGGTCCTAAAATATAAGAATGGTGTAAATCCATTT CATCATGGATATTCTTTACTTATTTTGGAAAATCATCCTAAAATAGTCTT ACAGCATTCTTAGTTTAGGACCCTAATTCAGACTAGATTTAACATCTAGT ACATACGTCTCATCAAGCATAAAATGGCATTTTTTATTGTGAAAGGAGTG ATCCTTACTTGGGGGTAAATGACAATTTATAATTGAAAATGCTCTAAAAA TGGCATTCTTAGCTTGAGCAGCAAAATTCCATGATGATGATATTCTTAGC ATATTCTTAATTTTTTGCCCATTTTCATCATGGACATTCTTATAAAGTGT ATTCTTATTAAAAAAAGCGTGTACGGTATCGTATCGTGCCGTACTGTTAA TGATGTAAATAAATATGAAGTATACATTAATCAGAAAACAAAATAAAAAT TCGAAATTTTCAACTTTGGTCATATTCATTTCCATCTATGGTAAAGTTTC ACATAAATATTTAAATTCTCTTTCGAGCAATGACTTTCAGACGAATATTG TTTTGGAAAAGAAGCATAATATTTTCATGTTTCCGTTTTCTTTTACTTAT TATTGTCTTTTATTTCCATCTTTGAAGAAAAAATTTTTTCTAGAATGTCA GATGATCCAATTATTCATGTCACGAATATTATCCAGGAAATAATGTACGA AAGGAAGACATTGAGAAAATTAGTACGAAATTCTATATTTTCTGATGGTG GAGAAATATCGAAAATATAGAAGGCCATTGATAATCAATACAGACTTTTG TGGCTAGCGCAAGGAATATTTACAACACTCCTGTTTCCATCTCCAATGTT GGCTGCTTTAATCTCACCCATCACATCTTTTCTTTTCACTATTTTCTAAC CTGAGATCAGATCGTTATTGTTTTCTGCCCACCACGCTGAAGCTCTAAAG GGATGTGTCAAAACATAACAATCTGACGAATATGCAATCTCATTTTCTTG GGTCCGCGCTGCGCCAAGAATGGGCTGGGAACGACAACAAAGTAGCGAGA CAAAAGTGAAATAGGGTGCCGTATCAGGAAAATTTAGTTTTGGTTGACTC TTGTTGTAGAATTTTCCACGGAAGGACTATTTTCCTCATGCCAAAGTATT TAAAAAATTCACTTCAAATTCTCTTTAAATCACATTTTGGTATTTGGTAG GTATTACATGCATTACTTATTTAGCCCACTTGGTCCTTTTTTAACTTTTT GCTTCATCACATGAGATTGTTGCGTCATCAATAAGTTCCTAATGCAATAC TGACAACTTTCCTTTTTTTAATGTTTTCTATTGTATTTTTTCTAACAGTA TTTGCAACTACAATTATTTTTGCTACAATTTTCCGCAACCTTCTTGCCAG AATAATTATTTCAAGTACAGTTAATGATCTTTCCGCATTATCGGTTTGCT ATATAAATAAACTGATTAAATTGTCTTAGTTAGAATGTATTTGTATCAAA ATCAAAACAAGAAGAAAGAAACAAAGCGAAACATTGAAGATGGGATTCGA AGATTTTAAAATGCAAGATTTGAGTGCTTTATTGACCTATGAAACTGGTA AAGTTGTGGAAATTCAGAATAAGAAAGTTGGCATCTGGTATCGCTCCATT CAAATTGCCATCATCATTTACGTCATTGGGTGAGGCTTTTCTTGGGATCC AATGCAATGGAAATTATTCTAAAAATGATTTTAAAACTTAATACTTTGAA CATTATTGGATTATTTACTAGTTGCTTCCTTCATTCCTCTTTACATGTTT TATTATAAGAACATCTAAAAATTTCGAAGCCTTTGGATGTTCTTAACTTT TTAGTTTTAACCCTAAAATGTTCTTAACTTATTCTTAATATTTTGCCCAT CGAAGCCTTATGTTCTTATACAGCCTTTGCAGTTTTTATATAAAAGATAT GTAGTTATTTCTTTTTATGTCAACTGAAGGGACCAGAAAACTTGTTCGAG TTAAGGAGATATTCGAATTATAGAGGTCAGAATCATGGAGACTCCACTGT ATAATCTCTTCTGTTTTCTAATCAATGGTTAACCCCTCGTTATTTAGTTA CGTCATCATTTACGACAAAGGTTACCAAGCAACAGATTCTGCCATCAGTT CAACCAATACCAAAGTCAAGGGAATCACACATGTTGATTTTGGGAATTTC CCTTCCACCCTTTTTAATGGGAGGAGAGTTTATGATCCTGAAGACTATGT AGTTAAACAGGTACATTCCCAGCTGGCACACAACGTTGTTTCAACGTTCA TCTAACGTTATATGGACGTTGTGAACGTTAAATAAACGTTAAAACAACGT TGTGTGCTAGCTGGGTTATGATTTAGTTGACACTCTCCAACAATAAACAC CCCTGTCTCAAAGACCCAGTGAAACTTTTTTCCCCAGTGAAGATAATTGA AATCCCAATGGGGGTGGATATTCTATTGTTCTAAGGTTAAAATTTCAGTA GTATTGAAATTCCAGAGTATTTTTCCACCAGGACGAAATTTTTCCCAAAT TTTCCTGTGGGGCTGGGGTCGCAGCGGGTTTGTGACACAGGGTGTAGTAA GGAAAAAATAGATGAAATTGAGTTAAGAAATATTTTTGAATGACTCATCC ATATGGCATACAGTGACCCTTTCAAAACAAGCTGTAGGAAAGCGAAGGAA TGAGGGTCAAATAACTTCCGATTTCTGATAGGCTTTAGAATGTTGGCGTA TGCTCGCAAATACATAGAACTAACTTGCTTAGCCTTTGCTCTTACCAGAA TGGTAATTCATTTTTCGTCATGACAAATATGGTGATAACACCAAAACAAT ACCAAGGGAAATGTCCCGAAGATAATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000126_pilon:398686..413313-

>MSTRG.14839.8.p1 ID=MSTRG.14839.8.p1|Name=MSTRG.14839.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1206bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:398686..413313- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATGGTAATTCATTTTTCGTCATGACAAATATGGTGATAACACCAAAACA
ATACCAAGGGAAATGTCCCGAAGATAATTTACGCCATCATTTACGACAAA
GGTTACCAAGAAATAGATTCTGCAATCAGTTCCACCAATACCAAAGTCAA
GGGAATCACACATGTTAATTTTGGGAATTTCCCTTCGACCTTTTTTAATG
GGAGGATGATTTATGATCCGCAAGATTACGTCATCAAACAAATGAATCAA
AGCCGGAAGCAGATGGTGCTTGAAAAGTCAAAGTTTCATTGCATCAATTT
CCTGTTAAGTTATGAGACTGGTAAAGTTGTGGAGATTCAAAATAAGAAAG
TTGCTTTTTGGTATCGTCTCATCCAACTCAGTGTTATCATTTATGTTATT
GGAATGGTAATTCATTTTTCGTCATGACAAATATGGTGATAACACCAAAA
CAATACCAAGGGAAATGTCCCGAAGATAATTTACGCCATCATTTACGACA
AAGGTTACCAAGAAATAGATTCTGCAATCAGTTCCACCAATACCAAAGTC
AAGGGAATCACACATGTTAATTTTGGGAATTTCCCTTCGACCTTTTTTAA
TGGGAGGATGATTTATGATCCGCAAGATTACGTCATCAAACAAATGAATC
AAAGCCGGAAGCAGATGGTGCTTGAAAAGTCAAAGTTTCATTGCATCAAT
TTCCTGTTAAGTTATGAGACTGGTAAAGTTGTGGAGATTCAAAATAAGAA
AGTTGCTTTTTGGTATCGTCTCATCCAACTCAGTGTTATCATTTATGTTA
TTGGAATGGTAATTCATTTTTCGTCATGACAAATATGGTGATAACACCAA
AACAATACCAAGGGAAATGTCCCGAAGATAATTTACGCCATCATTTACGA
CAAAGGTTACCAAGAAATAGATTCTGCAATCAGTTCCACCAATACCAAAG
TCAAGGGAATCACACATGTTAATTTTGGGAATTTCCCTTCGACCTTTTTT
AATGGGAGGATGATTTATGATCCGCAAGATTACGTCATCAAACAAATGAA
TCAAAGCCGGAAGCAGATGGTGCTTGAAAAGTCAAAGTTTCATTGCATCA
ATTTCCTGTTAAGTTATGAGACTGGTAAAGTTGTGGAGATTCAAAATAAG
AAAGTTGCTTTTTGGTATCGTCTCATCCAACTCAGTGTTATCATTTATGT
TATTGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14839MSTRG.14839Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14839.8.p1.exon3MSTRG.14839.8.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.8.p1.exon2MSTRG.14839.8.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.8.p1.exon1MSTRG.14839.8.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14839.8.p1MSTRG.14839.8.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000126_pilongenomesc0000126_pilon:398686..413313 -