MSTRG.14839.7.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14839.7.p1
Unique NameMSTRG.14839.7.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000126_pilon:392004..411781-

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14839.7.p1 ID=MSTRG.14839.7.p1|Name=MSTRG.14839.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19778bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:392004..411781- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GATGGTGACTCCTTTTTCGTCATGACTAATATGGTGATAACACCAAAACA ATATCAAGGGAAATGTCCTGAAGATCCGGAATCATATCGTACAATTTGTA AAACAGACAAAGATTGTCAACAAGGAACTTCCAATAAATATGGACACGGT GAGATTATAAAACTTCAAGCATCCCATAAAAGCTACAATCACTACAATAG TATATTGGCACCAGCCTCAAAAGACCACTACATTTATTCGCTTCCCCCTC CCTAAATCCCCTCCCCCTAATTTCAATGGTTGAAGAGGCAACAGGGCTGC AGACTAAATTGTAACATCAAAAATTAGTGTTTACTGCCAAGTACCATTGC AGTGGTTGTAATTTTTTGTAACGTTATGAGTAAACTTCAGAAGAAATTCG GCTTTTTCAACAACACGATGTCCCACTTTCCCTTGGCAGTAAACACATTT TCGAACTCTTGTTTTTCCATCTCCAGGCGAACGTTCAGGACGATGTGTAC CATCAGATCGTAATTCAACAGTCAAGGTCTGTGAGAGTTATGGCTGGTGT CCGACAGAATATGATGTCCTTCCTATGGAAAACTACAATAATTTCAGGTA TTTGTTCATCCATAATAAAACCCATCAAAAGGGTATACTTACCATATAGT ATATATTGGACGATGAAAAGGATCTGAGGCCGTCTATGTATATGGTGTTG TTTTTGTATATTTCTTAAAAATCTAGTTGCTTTTATAAGTTTATTGTTTG TCGATGATGTTAGTTGATGTTGTGTTGCTTCCAAGGATAAACTAATATGG TAATGGTACAATTATCTCAACTGGAGTGTTATTCGAACACATACATACAC GTTTTTTACGAGAACATCCAAAATTTCGAAGCCTTGAGATGTTCTTAACT TTTTAGTTTAAAGCCTAAATACTTTCTTAACATGTTCCTACTTTCGCCGT 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ATTTAAGGTTTATTTCTTTCTGAATACTCAGGTTAATATCGAATTTATGA GGATTTCTACCAGAAATAAAAGTTTAAACAAAAACTCTAGTTTTTGAAAC ATGGGACCCTATTTAAACACCCTCTTAGGGTTGTCGAAAAATCGTCAAAT TTGGTAGGTAGGTTCCCTATGATGAAAGAACGATTTTGAATTTTAGAATT TTTGAAATTCCGATTTCCCGATTTTTAATTAACGAAAAACCCAAATTTTA CCCCCGTCTTTTAAAAAAAGCAACAAGAAAAATGCCTAAATTGAAAAAGT CTAAAATTCAATTTTTTTATTTTCACTTAGGCTTGCTTCATGCCAAATTT CAGGTCTCTACGATGTCGGAAACATACCGTATAAATACCCCTCCAAGCTT TTTCAAGCAAAATTGCCTGGTCAATCGTTGATTTTTACCATATATGGGCA AAACGAAAATCTAAATTTTTCGAGTTTCAGAAGGGTCTTGATAACAAGTG ACCCCATTTTCGAGCACTACTCATTGAGAGCTATCGAATGGTCGTACTAC CAAAGAGCTAACTGAATTTTTATTTTTTCGTTCTAAATTCGATGACGTCA TCAGCTATCACGTGACAATTCTTTTTTCAAAATTTTTTTGAAATTTATTT TGTGAAATTCATATAAAGGTTGATTGTGGAACAAAAAGTGTATAATGATC AACAAAGTGGTCGAAAATGCCGCAAGTTGTATTAGGTTGCGGAGCGAGTG GGAGAAAAAAGGCCATTTTTTGCCGCCGTGCACAACGGGTATACACAACC CATTACTTATGACCAATGAAGCTCACTGATATGCTTATTTTTTCACGAAA TCCACGTGTCAATGTGCATATAAAAAGGAAAACATCAACATACTTAAGAA AAACTTTTTTTTTCATTTTTGCGCACCCTCGACTCCTCCTCCTCGATTAC TCCAGTTTTACGACACTGGCCTTGGCCTTGTGTTAAAATATCGACAGATG ATTTGTGAGAAGTAATACTTATTAGACGAAGAAATGAATAATCAATTTTT CATTTTATTTTTCAAATTCTCTTTTGTATTGCAATTTTGTTTTCAGAATT TACACAGTTATGCGAAACCCTTTGTCAAATGAACTATTTACCTTACTTGT CGCCCACAAACAGCAATTCTCCTTGTCAAAAAAGGTTAAGTTTGAATCGG AGGGTAATATAATTCCGATTTCTCTCTTCAGGCAACATTTTGGTGTGACT TTATCGTGTTGAATTTGGCGAAGAAACGTAACGTGTATCGAAATCATATT TGCGAGAGTGTGGGACGAGGAATGTCCAGTAACGAAAAAAGCTCTCTTGA TGGTGATACAAAGCAGGTACTCTTAAGCCTTCTTCCTGTCTTCTGTACTA AAATAAACGCATCTTTTTTTTCTCATTGTATATCTTACCCAAGATTGACG CCCGAAAATCTTTTTATAAAGAAGCTCGAGGCCCAAGTTTCAAAAATATT TGAAGAATAATTCTGTACTTCAAAAGTTGTGTTAAACTTTTTCGTCAAAT AGAATTTTTATGCTTTTTTATCAATAGTGTCATTCTCTACAAAATTCTTT ATTCTCTTTCATACGTTTTTTTAGCATTGAATAATCTTTAAATTAATTCT CAAATGTTTCAGAATTGTGATGAAAAGAAGACTCAAGAGGAAAATAACTT GTTAGTGCATGCTTTTTGAAAAGTGTGT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000126_pilon:392004..411781-

>MSTRG.14839.7.p1 ID=MSTRG.14839.7.p1|Name=MSTRG.14839.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=8235bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:392004..411781- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATTGTGATGAAAAGAAGACTCAAGAGGAAAATAACTTGTTAGTGCATGC
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TCCAGTAACGAAAAAAGCTCTCTTGATGGTGATACAAAGCAGATATGCAG
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TCAAGTTGAGAGATATTGTGGAAAGTTGTGGCGACGATTATACTCAAGTT
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TCCTGATCAAAAATCAAATCCATTTTCCCAAGTTCAAAGTAACAAGGCGA
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GTGATAACACCAAAACAATATCAAGGGAAATGTCCTGAAGATCCGGAATC
ATATCGTACAATTTGTAAAACAGACAAAGATTGTCAACAAGGAACTTCCA
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TGAATTTGGCGAAGAAACGTAACGTGTATCGAAATCATATTTGCGAGAGT
GTGGGACGAGGAATGTCCAGTAACGAAAAAAGCTCTCTTGATGGTGATAC
AAAGCAGATATGCAGATTATTATGTTGAGAATGGGACGAGATATCGAACA
TTGACCAAAGCTTATGGCATCAAGTTCGAACTGGTCGTTCATGGAGAGGT
TGGATGACGTTGACACACCACTTTCGCATGGCTACAATTTCAGGGAGCAG
TTTATGGAATAGTTATGGAATGGGATTGTAATTTGGATCACTCATTGGAT
GAATGCTATCCTGAGTACAAATTCAAGAGGAACAATATCGTCCACCACCA
AAAAAGTGGTTCATATATGAAAAGATGTCGTTACAACTCGACTACTGATC
CACTATGTCCCATATTCAAGTTGAGAGATATTGTGGAAAGTTGTGGCGAC
GATTATACTCAAGTTGGGTTCGAGCAAAACGATACCACTTCTGGATGGAA
CGAAAGAATCGACAGTCCTGATCAAAAATCAAATCCATTTTCCCAAGTTC
AAAGTAACAAGGCGAACGTTCAGGACGATGTGTACCATCAGATCGTAATT
CAACAGTCAAGGTCTGTGAGAGTTATGGCTGGTGTCCGACAGAATATGAT
GTCCTTCCTATGGAAAACTACAATAATTTCAGGATGGTGACTCCTTTTTC
GTCATGACTAATATGGTGATAACACCAAAACAATATCAAGGGAAATGTCC
TGAAGATCCGGAATCATATCGTACAATTTGTAAAACAGACAAAGATTGTC
AACAAGGAACTTCCAATAAATATGGACACGAATTGTGATGAAAAGAAGAC
TCAAGAGGAAAATAACTTGTTAGTGCATGCTTTTTGAGCAACATTTTGGT
GTGACTTTATCGTGTTGAATTTGGCGAAGAAACGTAACGTGTATCGAAAT
CATATTTGCGAGAGTGTGGGACGAGGAATGTCCAGTAACGAAAAAAGCTC
TCTTGATGGTGATACAAAGCAGATATGCAGATTATTATGTTGAGAATGGG
ACGAGATATCGAACATTGACCAAAGCTTATGGCATCAAGTTCGAACTGGT
CGTTCATGGAGAGGTTGGATGACGTTGACACACCACTTTCGCATGGCTAC
AATTTCAGGGAGCAGTTTATGGAATAGTTATGGAATGGGATTGTAATTTG
GATCACTCATTGGATGAATGCTATCCTGAGTACAAATTCAAGAGGAACAA
TATCGTCCACCACCAAAAAAGTGGTTCATATATGAAAAGATGTCGTTACA
ACTCGACTACTGATCCACTATGTCCCATATTCAAGTTGAGAGATATTGTG
GAAAGTTGTGGCGACGATTATACTCAAGTTGGGTTCGAGCAAAACGATAC
CACTTCTGGATGGAACGAAAGAATCGACAGTCCTGATCAAAAATCAAATC
CATTTTCCCAAGTTCAAAGTAACAAGGCGAACGTTCAGGACGATGTGTAC
CATCAGATCGTAATTCAACAGTCAAGGTCTGTGAGAGTTATGGCTGGTGT
CCGACAGAATATGATGTCCTTCCTATGGAAAACTACAATAATTTCAGGAT
GGTGACTCCTTTTTCGTCATGACTAATATGGTGATAACACCAAAACAATA
TCAAGGGAAATGTCCTGAAGATCCGGAATCATATCGTACAATTTGTAAAA
CAGACAAAGATTGTCAACAAGGAACTTCCAATAAATATGGACACGAATTG
TGATGAAAAGAAGACTCAAGAGGAAAATAACTTGTTAGTGCATGCTTTTT
GAGCAACATTTTGGTGTGACTTTATCGTGTTGAATTTGGCGAAGAAACGT
AACGTGTATCGAAATCATATTTGCGAGAGTGTGGGACGAGGAATGTCCAG
TAACGAAAAAAGCTCTCTTGATGGTGATACAAAGCAGATATGCAGATTAT
TATGTTGAGAATGGGACGAGATATCGAACATTGACCAAAGCTTATGGCAT
CAAGTTCGAACTGGTCGTTCATGGAGAGGTTGGATGACGTTGACACACCA
CTTTCGCATGGCTACAATTTCAGGGAGCAGTTTATGGAATAGTTATGGAA
TGGGATTGTAATTTGGATCACTCATTGGATGAATGCTATCCTGAGTACAA
ATTCAAGAGGAACAATATCGTCCACCACCAAAAAAGTGGTTCATATATGA
AAAGATGTCGTTACAACTCGACTACTGATCCACTATGTCCCATATTCAAG
TTGAGAGATATTGTGGAAAGTTGTGGCGACGATTATACTCAAGTTGGGTT
CGAGCAAAACGATACCACTTCTGGATGGAACGAAAGAATCGACAGTCCTG
ATCAAAAATCAAATCCATTTTCCCAAGTTCAAAGTAACAAGGCGAACGTT
CAGGACGATGTGTACCATCAGATCGTAATTCAACAGTCAAGGTCTGTGAG
AGTTATGGCTGGTGTCCGACAGAATATGATGTCCTTCCTATGGAAAACTA
CAATAATTTCAGGATGGTGACTCCTTTTTCGTCATGACTAATATGGTGAT
AACACCAAAACAATATCAAGGGAAATGTCCTGAAGATCCGGAATCATATC
GTACAATTTGTAAAACAGACAAAGATTGTCAACAAGGAACTTCCAATAAA
TATGGACACGAATTGTGATGAAAAGAAGACTCAAGAGGAAAATAACTTGT
TAGTGCATGCTTTTTGAGCAACATTTTGGTGTGACTTTATCGTGTTGAAT
TTGGCGAAGAAACGTAACGTGTATCGAAATCATATTTGCGAGAGTGTGGG
ACGAGGAATGTCCAGTAACGAAAAAAGCTCTCTTGATGGTGATACAAAGC
AGATATGCAGATTATTATGTTGAGAATGGGACGAGATATCGAACATTGAC
CAAAGCTTATGGCATCAAGTTCGAACTGGTCGTTCATGGAGAGGTTGGAT
GACGTTGACACACCACTTTCGCATGGCTACAATTTCAGGGAGCAGTTTAT
GGAATAGTTATGGAATGGGATTGTAATTTGGATCACTCATTGGATGAATG
CTATCCTGAGTACAAATTCAAGAGGAACAATATCGTCCACCACCAAAAAA
GTGGTTCATATATGAAAAGATGTCGTTACAACTCGACTACTGATCCACTA
TGTCCCATATTCAAGTTGAGAGATATTGTGGAAAGTTGTGGCGACGATTA
TACTCAAGTTGGGTTCGAGCAAAACGATACCACTTCTGGATGGAACGAAA
GAATCGACAGTCCTGATCAAAAATCAAATCCATTTTCCCAAGTTCAAAGT
AACAAGGCGAACGTTCAGGACGATGTGTACCATCAGATCGTAATTCAACA
GTCAAGGTCTGTGAGAGTTATGGCTGGTGTCCGACAGAATATGATGTCCT
TCCTATGGAAAACTACAATAATTTCAGGATGGTGACTCCTTTTTCGTCAT
GACTAATATGGTGATAACACCAAAACAATATCAAGGGAAATGTCCTGAAG
ATCCGGAATCATATCGTACAATTTGTAAAACAGACAAAGATTGTCAACAA
GGAACTTCCAATAAATATGGACACGAATTGTGATGAAAAGAAGACTCAAG
AGGAAAATAACTTGTTAGTGCATGCTTTTTGAGCAACATTTTGGTGTGAC
TTTATCGTGTTGAATTTGGCGAAGAAACGTAACGTGTATCGAAATCATAT
TTGCGAGAGTGTGGGACGAGGAATGTCCAGTAACGAAAAAAGCTCTCTTG
ATGGTGATACAAAGCAGATATGCAGATTATTATGTTGAGAATGGGACGAG
ATATCGAACATTGACCAAAGCTTATGGCATCAAGTTCGAACTGGTCGTTC
ATGGAGAGGTTGGATGACGTTGACACACCACTTTCGCATGGCTACAATTT
CAGGGAGCAGTTTATGGAATAGTTATGGAATGGGATTGTAATTTGGATCA
CTCATTGGATGAATGCTATCCTGAGTACAAATTCAAGAGGAACAATATCG
TCCACCACCAAAAAAGTGGTTCATATATGAAAAGATGTCGTTACAACTCG
ACTACTGATCCACTATGTCCCATATTCAAGTTGAGAGATATTGTGGAAAG
TTGTGGCGACGATTATACTCAAGTTGGGTTCGAGCAAAACGATACCACTT
CTGGATGGAACGAAAGAATCGACAGTCCTGATCAAAAATCAAATCCATTT
TCCCAAGTTCAAAGTAACAAGGCGAACGTTCAGGACGATGTGTACCATCA
GATCGTAATTCAACAGTCAAGGTCTGTGAGAGTTATGGCTGGTGTCCGAC
AGAATATGATGTCCTTCCTATGGAAAACTACAATAATTTCAGGATGGTGA
CTCCTTTTTCGTCATGACTAATATGGTGATAACACCAAAACAATATCAAG
GGAAATGTCCTGAAGATCCGGAATCATATCGTACAATTTGTAAAACAGAC
AAAGATTGTCAACAAGGAACTTCCAATAAATATGGACACGAATTGTGATG
AAAAGAAGACTCAAGAGGAAAATAACTTGTTAGTGCATGCTTTTTGAGCA
ACATTTTGGTGTGACTTTATCGTGTTGAATTTGGCGAAGAAACGTAACGT
GTATCGAAATCATATTTGCGAGAGTGTGGGACGAGGAATGTCCAGTAACG
AAAAAAGCTCTCTTGATGGTGATACAAAGCAGATATGCAGATTATTATGT
TGAGAATGGGACGAGATATCGAACATTGACCAAAGCTTATGGCATCAAGT
TCGAACTGGTCGTTCATGGAGAGGTTGGATGACGTTGACACACCACTTTC
GCATGGCTACAATTTCAGGGAGCAGTTTATGGAATAGTTATGGAATGGGA
TTGTAATTTGGATCACTCATTGGATGAATGCTATCCTGAGTACAAATTCA
AGAGGAACAATATCGTCCACCACCAAAAAAGTGGTTCATATATGAAAAGA
TGTCGTTACAACTCGACTACTGATCCACTATGTCCCATATTCAAGTTGAG
AGATATTGTGGAAAGTTGTGGCGACGATTATACTCAAGTTGGGTTCGAGC
AAAACGATACCACTTCTGGATGGAACGAAAGAATCGACAGTCCTGATCAA
AAATCAAATCCATTTTCCCAAGTTCAAAGTAACAAGGCGAACGTTCAGGA
CGATGTGTACCATCAGATCGTAATTCAACAGTCAAGGTCTGTGAGAGTTA
TGGCTGGTGTCCGACAGAATATGATGTCCTTCCTATGGAAAACTACAATA
ATTTCAGGATGGTGACTCCTTTTTCGTCATGACTAATATGGTGATAACAC
CAAAACAATATCAAGGGAAATGTCCTGAAGATCCGGAATCATATCGTACA
ATTTGTAAAACAGACAAAGATTGTCAACAAGGAACTTCCAATAAATATGG
ACACGAATTGTGATGAAAAGAAGACTCAAGAGGAAAATAACTTGTTAGTG
CATGCTTTTTGAGCAACATTTTGGTGTGACTTTATCGTGTTGAATTTGGC
GAAGAAACGTAACGTGTATCGAAATCATATTTGCGAGAGTGTGGGACGAG
GAATGTCCAGTAACGAAAAAAGCTCTCTTGATGGTGATACAAAGCAGATA
TGCAGATTATTATGTTGAGAATGGGACGAGATATCGAACATTGACCAAAG
CTTATGGCATCAAGTTCGAACTGGTCGTTCATGGAGAGGTTGGATGACGT
TGACACACCACTTTCGCATGGCTACAATTTCAGGGAGCAGTTTATGGAAT
AGTTATGGAATGGGATTGTAATTTGGATCACTCATTGGATGAATGCTATC
CTGAGTACAAATTCAAGAGGAACAATATCGTCCACCACCAAAAAAGTGGT
TCATATATGAAAAGATGTCGTTACAACTCGACTACTGATCCACTATGTCC
CATATTCAAGTTGAGAGATATTGTGGAAAGTTGTGGCGACGATTATACTC
AAGTTGGGTTCGAGCAAAACGATACCACTTCTGGATGGAACGAAAGAATC
GACAGTCCTGATCAAAAATCAAATCCATTTTCCCAAGTTCAAAGTAACAA
GGCGAACGTTCAGGACGATGTGTACCATCAGATCGTAATTCAACAGTCAA
GGTCTGTGAGAGTTATGGCTGGTGTCCGACAGAATATGATGTCCTTCCTA
TGGAAAACTACAATAATTTCAGGATGGTGACTCCTTTTTCGTCATGACTA
ATATGGTGATAACACCAAAACAATATCAAGGGAAATGTCCTGAAGATCCG
GAATCATATCGTACAATTTGTAAAACAGACAAAGATTGTCAACAAGGAAC
TTCCAATAAATATGGACACGAATTGTGATGAAAAGAAGACTCAAGAGGAA
AATAACTTGTTAGTGCATGCTTTTTGAGCAACATTTTGGTGTGACTTTAT
CGTGTTGAATTTGGCGAAGAAACGTAACGTGTATCGAAATCATATTTGCG
AGAGTGTGGGACGAGGAATGTCCAGTAACGAAAAAAGCTCTCTTGATGGT
GATACAAAGCAGATATGCAGATTATTATGTTGAGAATGGGACGAGATATC
GAACATTGACCAAAGCTTATGGCATCAAGTTCGAACTGGTCGTTCATGGA
GAGGTTGGATGACGTTGACACACCACTTTCGCATGGCTACAATTTCAGGG
AGCAGTTTATGGAATAGTTATGGAATGGGATTGTAATTTGGATCACTCAT
TGGATGAATGCTATCCTGAGTACAAATTCAAGAGGAACAATATCGTCCAC
CACCAAAAAAGTGGTTCATATATGAAAAGATGTCGTTACAACTCGACTAC
TGATCCACTATGTCCCATATTCAAGTTGAGAGATATTGTGGAAAGTTGTG
GCGACGATTATACTCAAGTTGGGTTCGAGCAAAACGATACCACTTCTGGA
TGGAACGAAAGAATCGACAGTCCTGATCAAAAATCAAATCCATTTTCCCA
AGTTCAAAGTAACAAGGCGAACGTTCAGGACGATGTGTACCATCAGATCG
TAATTCAACAGTCAAGGTCTGTGAGAGTTATGGCTGGTGTCCGACAGAAT
ATGATGTCCTTCCTATGGAAAACTACAATAATTTCAGGATGGTGACTCCT
TTTTCGTCATGACTAATATGGTGATAACACCAAAACAATATCAAGGGAAA
TGTCCTGAAGATCCGGAATCATATCGTACAATTTGTAAAACAGACAAAGA
TTGTCAACAAGGAACTTCCAATAAATATGGACACG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14839MSTRG.14839Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14839.7.p1MSTRG.14839.7.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14839.7.p1.exon9MSTRG.14839.7.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.14839.7.p1.exon3MSTRG.14839.7.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.7.p1.exon2MSTRG.14839.7.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14839.7.p1.exon1MSTRG.14839.7.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000126_pilongenomesc0000126_pilon:392004..411781 -