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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000126_pilon:291750..300675- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14833.1.p1 ID=MSTRG.14833.1.p1|Name=MSTRG.14833.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8926bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:291750..300675- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATACAATGTAACTAGACCCAAAAAAGGGACTTCAATTTTCTTAGAGAAGG
GTGCAACCATGAAGTAACAGGTTTACTACTAGAAGAAGGCAAGAAGAAAA
CATAACTCTACGTTGGTGATAAAAAAGGGTGAGTAGGTTTTCATTTTTAA
ACTTTAAAACATTATTATAGTTAATTCTCGCTAATTCGAACTCGAACGCG
AAATCTAATTTGTTCGAATTACAGAGATATTGAATTTATAGAGAACAATT
CAGGAGTGTTTCTTCTTAACTGGAACTGAGATTGAGTTCGAATTATAGAA
AGATTCGAATAATAGAAGGTCGAACTAAAGAGTTCACTGTGATTTGTTAA
ACGTTGGATCTAGCAAAATGTAAGAGTCCTAACCTTGCTTAAAACATGGG
TCAAGCTGGAGTTTTTACAAGGTTTTCGATGATTCGGTTGATGGTTGAAT
CTTGAGACAAAGGATTTTATTGCTTTTTCTAAAGAACGCGTAGTCTCTAT
TATTTCAAATGACCAATTAGTGAAGTATCTTATAAAAACTCCAGCTTGTC
CCTAAAACATTAGGTTCCTCAAACAAACCCCTGCTCCAGGATATCATCTC
TTGAACAAAGTTCGAGCCAAAGCAGTATGAAAGCCCAGCGACATTCAGTC
GGAACCACTACATAGAAATGGGAACTATTGCCTTAACGGGAAATATTTCC
CGAACGGGAAGGTGAAAAACTTCCCGAAATGGATAAAATTTCCGAATCAG
GAAGTTAACCAGTTTCCCGATCGGGAATGAGACCTCTGCGCACTCCGGAA
ATGGTCGTGTAAGGTAAATAACTGATGCCTATTGTAAAAGAAGGTAAATA
AATACCTTTCACTGGGTAGTTAAGAAATCCACCGGGTAATCGCTTTCTTA
ATTCTACTTTCCCCATTCCCAATTAAAAACTTCCCTATTTGGAAACTTCT
TCTCGATCGGGAAACAAAAATCTGTTTTGTTTACAAAAATTCAACTTCCC
GTTCGGGAACAATGAAAAATTCTTGACCAAAACGAGAAACAGAAAAATGA
TGAAATTTTCAATCTGGAAACAGTTTCCTTTTTGGGTTATTTTCACCTTC
CCGTTCGGGAAATATTTCCCGTTAAGGCAATAGTTGCCATTTCTATGTAG
TGGTTCCGACTGACAAGTATCACGGAGAATTTTGAAAACTTCTTGACTCT
TAGTACGAATTGTACGTATTGAGAACAAACTTTTAATTATTGCTATGTCA
GTCTGAGCTTAATAGGCATTTTAGTTGTATCTTTGAATAATATTTTTCAG
CCCAAAATTTATATATTACATATATGGAAACAGATGGAAAATGAATGATA
TCATTTTTTCAAAAATTCCTAAATAAAACATATACATAAAGTCATTGACT
TTTTTCTAAAGTTTTCTAAGTTCCGACTGACATAGCAATAATTAAAAGTT
TGTTCTCAAAACGTACAATTCGTACTCAGAGTCAAGAAGTTTTCAAAATT
CTCCGTGACTTGGTATCGAATCTATAATTCCTGGATTGTAAAATGAATAC
CCATTCCAGGCCATATATGCGGCGTTCATGTCTTGTTTATTATTGGTTAT
CAGTACCGTGAAAAGCACAGGTCGAATCATATATCGACGCTGTGCCGACC
AATCCAGATTCTATTCAGCGCGCAATCAACGCAGAGAAACGACCATCCAA
GATCTTGGATGAGGTTCAAAGTTGATATTTTTATTCCCGTCGTTGAAAAC
ACAACTCAGTAATGTCATCTATGCTTTTTAAAAAGAGTCAGTGATAGAGA
ATCATAACAAAGAGTCTGTCTATTATTTCGATTCAATTAAAATAGCATTA
CCATAATTAATAGTTTAGTAACTACTGTTATACATTTGAGAATCATGTAA
AAGATTTCTTTCGAAAGAAACTCATTTCAATTACACTTGGAGGTTTCTGT
GGAATTCGTAAATAGTAAACTGCAAACTGATACAGTCTGCTAGACATTAA
TATGGTAATATTTGCTCTTCATATTTGATTCTTTCTACAGTGATTAGATT
GACACGTGCGCGATAAAATTTCTATAATTGGTCTTCAGAGGTTAATATAT
TCTTTGAAAACTTAACCTCTGATACTCAGGGTAGATTGTCAGTACTAATA
AAATAAACTTAAAACGAAGAAGCACTGTTATCAAAAACGGACGTACAACA
CGGCGGACAGCGACATGCTAATGAAAGGTCCGATGCTGGGCCAATTATTC
TACAGGTGGGAAATAAATATCCCGGCGTCATAGGAAAAAAATACTCCCCA
GTATGTATTTTGTACACGGAAAAAAGTACTCCTAGTCCCAGTAGACTTAA
TACTCTGGCTATCAATAATCCCTAAAAAGATCTCTAGGATTGATCCAGAA
GGGCCTGCTAGTGATAGAAGTTAATGATAAGCAAGTAATTTTGAAACAGC
ACTATGAGGATATTCCCTTTCGCAGACAGAATGGAGCCCCTGTAAAACCT
TCTAGTCACTCAAATTCTATTACATTCAACTGATCAAATTTGGCCTGAAA
ATTAGTTCGGAAGCTAAAAGAATCGAGATCATTTTCAAGCAATTTAGGGG
TCAAAGTAGTAAAAATTGGGTATAACGCCTAAAATATCTCAATTACAGCT
TATAGATAAGAACAGGATAAGAACAATTTAAGGGTCAATGTCCCAAAGAA
ATAAGAACAGCCAAGCCTCAGCAAAATTGTACTGGTTCCTATAAAAAAAG
TGTATTTTCCCGATTCTTCTACCCAAGCCTAGGATATTTTCACTCGTAGG
CAGCTTAGCCTGTCAAAGCCTTTTGAATATTGCTATTTCTATATATAACC
GATTTGTCATACATTGTAAACACCATATTTTGTATCATGTGCAAAATTAG
CCCACTAGACTGTATTGTTTTGGTGAAATACTCGAAAAAGCGGCAAAGTC
AGATTTACTTATTATTGTTTTGATACTTAGACAATGCTCTTACAGAAGGC
ACAACTCGGTTCCTTGACCAAAACTTAGTGCCCTCTAAATCTTTTTTAAT
TTTAGAAATATTTCTTAATTAAAACTTAAATGAATCATAGTTTTCCGTTG
ACATGGTTTTGTAATTTTGATTTTTATAAGAACCATACCATTTGGGCTGA
GCCTCTGTTGTTCCTAATTATTCTATTTTGATTTCCTTAATATGACCCGA
CCAAAATATTTATTTAAAATTCTTACAAGTCTATTTTCTTCTATCTGCCG
AGAGTGCTCGATGATATCAGAGGTTGTTCAAATTAAAGGAAAGAGAACTT
TAAGTTTCGTGTAGCTCATATGGACGACAATCATCAGCTAAATGAAAATC
TTTAAAGTCTTTAAAAATTCTATATTTTTTAAACGTAATTTGAGTTTTTG
ATTCTTAAATTGTTCTTATATAAAAAGCGTGGATGACCCGAAAAGGATTA
AAATATTCCCGAGGATTCTTACATCCACCTGTTTCATAAAATTGTTTCAA
AGATTATGTAATAAATGAATTCGCACCTCCCATTTACCGCTAAAATAAGA
AGGAAAAACCATGTAAAACCAACTTGGAAAAATGTTAGATTAAGATGATA
ATTGGAAAAATAATTAAGAGCTAATTAAATTTTAATTAAACCCCTATACT
TGGAAAAAATACGATAATCATAGATTTAGCAGGAATATAAATACCGCTAA
AACATAATTTGAAATAAAAAATTTGTAAAAATTATTACAAGAAAAAATAG
ATAAAGCCTTCGGAAAATAAATATTACATTAAACCAATACTATACTTCTG
GTATTACAGCGCTACTATATTCCATAATAGAATTGAAACATTAAATCCTA
TTGGCGTTATAACGTAAGGCACAACGTGAATGAGTTATGCCTTACATTTT
ATAATTTTACAATCAACGGATTTCTTAGTTCCTGTGCTAGTTGTAAAAAG
TTTTATATAAATGAACACATTTGTAAATTTCAAGTATCATTTAAACGCTG
TGATAATCCTGGCAAGAAGGTTGGAGAAGTTGTCGTTTTTAAAAATTCAT
AATTCTACTATTCTATATTGGTGAGTCACGATTTCATTTTTTTAATAGTA
GACTTCTTAGACTCGAAGACTTTGTAACTATCTTAAAAGAATAATCTCCG
AGCCAAAGTAAATTTTGCGAACGGGATTTGCTTTCAAAAGGAGCTTACAG
CCGGGTAGAGTTGGTGGTCTTTCTAGAGTTCGGCGGCGTTTTTTCGAAAC
TTCACCGCAATAAATTCTTTTATAACTACTGCCATTACTGGATTTAAACA
CTACGTATCTACAAACAATGTCGTGCATAATTGAGTGAAATTAGAGAGTC
TCTCACCACATTCCCCTAACACCCTGCTTGGCAGTGCTTGCGATTCGAAC
ACAGTCGAAACCTTCACACTACCAATCGGCAGAATGTTAGTGAGACACAA
TGATAGCCTCATCCAGATGGTGAATGAATGTATACCGAAGTTTATCATTC
TACGTCTGCATTTTTAGCTTTAAGGGCGGTCTTCACTTGCGTGCGCTGCG
ATCGCACATTTTGGCTTCAATTCTTTTTGCTTGGAAAAAAGATTACGTCA
TAAAAATGTAGCGCGCGCTCAAAAAAAAAGTTGAACACATTTCAATTTTT
TTCAACCGTTACGTCAGATCGCGCCAATGGAATTGCTTCATTTTTCTTTT
GACCAATAGCGTGGAAGCTTTGCTCGAAAAAGTGCGATCAAAGCGCGCAC
AAGTGGAGACCGGCCTTTACTAAGCTTATTTAACATGTATGATCGATGAT
TTCTGATTTAGTTATACTGTAAAACAATCTCCCGCCCCTTTTACTACAAT
GCTAATGGCGATTGCTCAGTCGCTGTAATTTTTAGGCTAGAATATTTATC
CAATATTTCAGTAAAGGGGGAAGGAGAAGGAAAACTGATGCAATTACACG
TTTTTTTTATAAGAACATATAAGAACACAAGGCTTCGATAGCCAAATGCT
AAGAACAAGTTATGAACTAAGGCTTTGCGGACTCAAAAACACCCGACTTC
TAAGAAAGTGGGTAAAAATGGTCACAAAATTGAGAAAATAAGAACATTTT
GAGAAAATTTTTAGGCTTGAAAGCCAAAAATTTAAGAACATCGGAAGGCT
TCAAAATTCTGGATGTTCTGATAAAAAAACTTATAGTAGATTTGTACACT
TTTCCATTTTAAATTGACAAATTTTTTTATAAGAAATGTGTTTTTTCATT
TCATCATGGATATTCTTTACTTTTATGTTATCCTTAGGATTAGTAGCAAA
CTCTATGATATTCTTAGCATATTCTTAATTTTTTTGGCAAATTTCATCAT
GAATATTTAAGAATAATAAAAGTATTTTCTTACAAAAAAATCGTGTAGGC
TAATCTTAAACCTTCTCCATCGCCTTGAAAGCATAAGAAATCAAAAACTA
TTTCATTGGCTACAAAGTTCAAAGGAAAATGTATAATTTTTTTTGTCCTA
AAATAAATCGTTAAGAGTGCCTGAACGGCTGAAACAATAATGATTATAAT
ATGAAAATATGAAAATCTTATTTGTCTTAATTCCAAAGTGGCAAAAAGGG
GATAATAACTGGCAATAACTAGCATCTTAGTGCAAATTTTCTCTATTTCA
GTGACCAAAATCATTTAAAAATGAAAACGAACATTAAAAAAAATAGTTTT
AACTGTGTCACTCTATGGTATCATGGGATAGTATTGTGAGTTTATCTGGC
TGTCCTCAATAAATTGCACACTAAAACCACCCACACTGGATTTTTTTGAG
CTGTGGGAACAATAGAATTTTAATTCAGATTGGGATCTCGAATGAAATTT
AACTTCGAGACGCAATTTTTTTTCCGTATGCGGCCCAAGCCCTGATTTAG
CGGCTCAAGACCTTAATTACCGGCCCAAGACCTGGGAAACTTTTCGACTT
TTGAAACTTGCTTTTTTGGAAAAAGAAGATGAACGAACCGTTATATTCCC
ATGGAAAAGTACTTCAATTTGATGATCTTTGATGATCTTCTAATGAATGT
TTTTTACTAGTTTTTAGAAATTTTAAGGCCAATAATTCAGGTCTGGGGTC
ACTATAAATTCTAAAATCATGGCAAAAATCGTCTCAAAAATCGCAAAGTT
TCCCAGGTCTTGGGCCGGTAATTCAGGTCTTGGGTGACTTACGGAAAAAA
AAATTTGCCTGCGAGACAGGGGTGTGTAAAAGATCATGTACTATTTGTCA
AGAATATTTTTATTCTCTGATTAATGAGATTAATTGAACTGGGTTTCGCA
AAAAGTTACTGATTACATTTATACGCCCCTGTGTCACAGACCCGCTGGGA
CTCCAGCCCCACTGGAAAATTTGGCAAAAAATTTTCTCCTTGTGGGAAAA
TACCCTGGAATTTCAGCTCACTGAGAAATTGACTTTAATTTCATCCCCAC
TCGATAAATTTAAATTTTGCATTAAAAATTGCACTCCAAAATCAAAATCA
TCCCCACTGGATCTTTAAACCTTGGAACAATATAATTTCTATTCCCACTG
ATGAAAAAAAAATCTCATCGGGCCTGTGAGACAGGGGTGTATTTATTTAC
TGTGATATACACACGGTCTTGGTACCCAGATTCAAGATTTTCATTTTCAG
TCCCCGTCAAGGAAAATCTTCCTTAACTTCCATAATTCAATCTCTCTGTA
ATTCGAACAAATAAGATTCCCCGTTTGAGTTCGAATTAGCGAGAGTTTAC
TGCATTTTTTATAACCAATTTTTATTTTCTATAATAACTCAATACTGACC
ATTTTTTTCTATCTTTTTTAGAATGTTCGAAGTCATTTTCAAGATGGTAT
CGTTCACTTATTCAGATTACCAAGCTCAAATGACATTTACTCAATGGAAA
CAAAAACGTAGACAAACCATGATTGCAATGTTATTGGTGAATCTAGTTGG
TGGTATGGATATCAGCATCATATTGGCAACTATTGTACCATATCTTAGAT
ATACCATCATTGTTCAGGATGTCAATGCATTTTACGCGTTTATCACTACA
GCTTTTTGTGTTAGTTCAGCAGTGTTTGGAATCATATCTGGCAAGCTTGT
TGATCGCACTAGACAAATGAAGATCTTCACCAGTATAACGTTACTATTGC
AGGTGGTTGGGAATCTAGTCTACACCATACCAATATCATCAGCTTTTCCT
TTGGTTGGCAGACTCCTGGCAGGTGCTGGTGAAAGTTTTACTGGTGTCTG
TATCGGCGAAGTGATCAGAATCTACGACACCAAAGGAAGCAATCGAATAA
TCTGTTGGCTAGCAATGATGAGCTCTTTTGGATACGTCATAGGTCCTGTT
ATATCAATCCCATTATCAAAATGTCATTTCAAAATATACGAATTGCGAAT
TGATGGTTATAACATTGCTGGCGTTTTAATTGCTATTTTATGTTCGCTTA
CCTTCATGTTATGCCAGTTTATGATGCATGATTGCTCAAAAATCTTCGAT
ATGAAAAGTTATCTAGCTGAGCAAGGGCTAGAGGACGAACCAGACTCAAT
CGAAGATGAATTCTTTATCAACAATAACAATAACAAAGTGCTGTGTCATG
AAGAAACATCTTCCTCTGAAGATGAAGATGAAAATATTGCCAAGGAGGAA
GAAAGCTTATTACCACAAAACTCAAAATCAAAACTTTCAAATCCTTTCTG
TTTTGCCAAGGATGAAGAAAGCTTATTACCACAAAACTCAAAATCCAAAC
TTTCAAATCCTTTCTGTTTTGCCAAGGATGAAGAAAGCTTATTACCACAA
AACTCAAAATCAAAACTTTCAAATCCTTTCTGTTTTGCTAAAGATGAAGA
AAGCTTATTACCTCAAAACTCAAAATCCAAACTTTCAAATCCTTTCTATT
TTGTTAGAACATTCGATCAATGGATGGTACTTGTCTATTCCTTCATCATG
ATGTTTATAATCGCCAGTGGTGAATCTTTGATCCCACTTATCAACTATGA
GGTTATGAATTGGTCCTTAAACGCACTTGTTATTATCTTTGTTGGTTACG
GTATAGTGTTATTGGCAACTTCAATGTTGTTATCAAAAATCTGCACCGGA
GATAAATCAATCTATCGTGTAGGGTATGCTAGTTTCCCATGTGTTATATC
CTTCTACTTAGCATTACTTCTTATGTCTTTGGACATTCGTAATAAAAACA
GGGATATTTTCTACATGTTTTTATTCGTGCTCTCACTCGTTTTCATATGG
TTTATGGAATCGATTGTAATGCGAAGTATGTTTGGTCGAATGGTGCCATC
AGAGTTACAAAGCTTTGCCGAAGCTTTAAGAGCAGCTGTATCCAGATTTG
GTATGGTGGTGTCGAGTTTTGTATCACCTTTCCTGCTATCAGTTTTGATG
TATTATTCAAGTTGCTTTCTCGTCGTAGGAGTTATTATGCTGGTGGTTTA
TATTGCGAGGAGAAGACAATTGACTGATATTCAGTTTATTAAACTTTAGA
ACAGTCTAAATCATGGTCTCCTTTTAGCAGATGTTTTACTATAAAAGTTA
GTCTGGTAAGTTACTCAAGGTAAATGGCCATACGTGCGGCCCTTAAGGAT
ATATTTTCCAAGCTTCCCGAAGTGCACTGTAAGGGTCCGATTTCAAAGGC
CTAATTTAGGGCCGCACGTATAGTCGTTTTGGAATCTACTATGAAACTGC
AGGTGGTATAAAGAGCAAGAATCTGTTGTATGAAAGGAGTTTAGCTTAAG
TAGAGGGTTCTATTAGTCCTTTTTCTTTTCTTTTCACCACTGTACTCTTT
TTAACTAACTTACCCAAAGTCGATTTTATTTCATAACCCCGCATTCTACG
ATTTTCAATTTTTCGTTTGTAAATATTTCAAAGAAGATTATATAGAAATG
TTAAAGAAAAATGTATATTATTATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000126_pilon:291750..300675- >MSTRG.14833.1.p1 ID=MSTRG.14833.1.p1|Name=MSTRG.14833.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1677bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:291750..300675- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTCGAAGTCATTTTCAAGATGGTATCGTTCACTTATTCAGATTACCA
AGCTCAAATGACATTTACTCAATGGAAACAAAAACGTAGACAAACCATGA
TTGCAATGTTATTGGTGAATCTAGTTGGTGGTATGGATATCAGCATCATA
TTGGCAACTATTGTACCATATCTTAGATATACCATCATTGTTCAGGATGT
CAATGCATTTTACGCGTTTATCACTACAGCTTTTTGTGTTAGTTCAGCAG
TGTTTGGAATCATATCTGGCAAGCTTGTTGATCGCACTAGACAAATGAAG
ATCTTCACCAGTATAACGTTACTATTGCAGGTGGTTGGGAATCTAGTCTA
CACCATACCAATATCATCAGCTTTTCCTTTGGTTGGCAGACTCCTGGCAG
GTGCTGGTGAAAGTTTTACTGGTGTCTGTATCGGCGAAGTGATCAGAATC
TACGACACCAAAGGAAGCAATCGAATAATCTGTTGGCTAGCAATGATGAG
CTCTTTTGGATACGTCATAGGTCCTGTTATATCAATCCCATTATCAAAAT
GTCATTTCAAAATATACGAATTGCGAATTGATGGTTATAACATTGCTGGC
GTTTTAATTGCTATTTTATGTTCGCTTACCTTCATGTTATGCCAGTTTAT
GATGCATGATTGCTCAAAAATCTTCGATATGAAAAGTTATCTAGCTGAGC
AAGGGCTAGAGGACGAACCAGACTCAATCGAAGATGAATTCTTTATCAAC
AATAACAATAACAAAGTGCTGTGTCATGAAGAAACATCTTCCTCTGAAGA
TGAAGATGAAAATATTGCCAAGGAGGAAGAAAGCTTATTACCACAAAACT
CAAAATCAAAACTTTCAAATCCTTTCTGTTTTGCCAAGGATGAAGAAAGC
TTATTACCACAAAACTCAAAATCCAAACTTTCAAATCCTTTCTGTTTTGC
CAAGGATGAAGAAAGCTTATTACCACAAAACTCAAAATCAAAACTTTCAA
ATCCTTTCTGTTTTGCTAAAGATGAAGAAAGCTTATTACCTCAAAACTCA
AAATCCAAACTTTCAAATCCTTTCTATTTTGTTAGAACATTCGATCAATG
GATGGTACTTGTCTATTCCTTCATCATGATGTTTATAATCGCCAGTGGTG
AATCTTTGATCCCACTTATCAACTATGAGGTTATGAATTGGTCCTTAAAC
GCACTTGTTATTATCTTTGTTGGTTACGGTATAGTGTTATTGGCAACTTC
AATGTTGTTATCAAAAATCTGCACCGGAGATAAATCAATCTATCGTGTAG
GGTATGCTAGTTTCCCATGTGTTATATCCTTCTACTTAGCATTACTTCTT
ATGTCTTTGGACATTCGTAATAAAAACAGGGATATTTTCTACATGTTTTT
ATTCGTGCTCTCACTCGTTTTCATATGGTTTATGGAATCGATTGTAATGC
GAAGTATGTTTGGTCGAATGGTGCCATCAGAGTTACAAAGCTTTGCCGAA
GCTTTAAGAGCAGCTGTATCCAGATTTGGTATGGTGGTGTCGAGTTTTGT
ATCACCTTTCCTGCTATCAGTTTTGATGTATTATTCAAGTTGCTTTCTCG
TCGTAGGAGTTATTATGCTGGTGGTTTATATTGCGAGGAGAAGACAATTG
ACTGATATTCAGTTTATTAAACTTTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000126_pilon | genome | sc0000126_pilon:291750..300675 - |
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