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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000126_pilon:98933..105959+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14818.2.p1 ID=MSTRG.14818.2.p1|Name=MSTRG.14818.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7027bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:98933..105959+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TAAGTACGTACTTTACACAAAAGTACTTGGTACAAGTCAAGAATAGATGT
TTCGGTTCTCTGTGAGTCAAACAAGCACTCTGGTTTTAGCTTAATGAGAA
GTCACATTTGAACTGAATTCTAGTTGATCTTTTTTCATGTTATGTTTCAA
AATTAGAATGAAAAATACCTTCCGAAGAAATTAAGAGCTTGACCTTTGTT
AcagtgttaaaaaaatttgggaTTGTTTGCATTTTTGTTGGACGAATATT
TTGACATAATGACAATTGatgttaaagatattcaaatCATTAATAAAGGT
AATTACAGTTTTGTTAATTTGGAAATGCTAATTAATGTTAATTAATTGAA
CATTACAGTCGTCACCATTGAGTTACCAAACCGGAAgagctagaggcgag
actccttgatgggaaatgaaaccacttatttcccatccagaacgcccgcg
cgaaGTCTTtgcacaaacgccggattgaaactaaaatctatcgctagatt
tgaaaaaattatagtcatccaaaacaaaggaaccactagatacaatccgt
cgtcatgattacggcgcgttctatgcgcgttttgaatgggaaataagtag
cttcaatttctcttgcttgagaagggttaaagtttcgcctttAGCCCTTT
GGGTTCGAAACTCAATGGTAGTCCCCTTCTTCAGACCTGTAACGTTTTTG
CAGCGTTTCCTTTGCGTAGTCACTTGAGTATCGTTACTACATAGCATCAC
CAACATTCAGCCTTGGtcaggcccggtggaagcgAGGAGACTGGgaagac
ttcagcctccccacttgtgaacaaatgagatttttttctcaaactcctag
cgaattttatctcattttgagccttcagcctccccacttttacggttgct
CCGCCTGACCTGTTGGTGATAGTAGCACAACAGTATATCATTCagctacg
gtgcacaaggttgtgggttcgaccACCCATTCGGGTTATACCAAACATTT
AGTAAAGATGATACTCTGATGCTTGAGGCTCccccagcggttttcgtgat
tgcgtgattggCATTTTTCCGTGATTGCATGATCAGACGAACCAGcgtga
tcaacgtgatcgtgatagaaagaaaatttaactcgtgataacgtgatttg
ggaattttttgcgtgattgcatggctttgaaaggtgactgAAGGAAGGTC
TCATAATTCTATGCTTGATGCTAAGCAACTAAAGAGatggatcaagggta
agtggtgAAATCCAGGGAAAAGAGTGGCACCCTAAGCTACCTTCAGttag
acagctagagaaaagggagccttataaacatccaatattttttatacCTT
CGAATGTTCTTGACTGTTTTACTTTTAAGCCTATGAATGTTcgtaagatg
ttcttattttcaccgttttgcGAGTACTTTTGTGTggtttcctaagaaat
ttggtccgctaagccttaaatgttcttagcttgttcttaatattttggcc
atcggcCATATATTGTtttatactttgttcttataaaaacggtGTATTTC
ATTTGGTTGTCCGTAAAAACTTAAttccttttttcaaaagctaGCCCAGC
TGTCACAccacgttgtttcaatgttcatacAACGTTATATGgccgttgtg
aacgttagaaaaacgttgaaacaacgttgtgtgccagctgggagtaCACA
ttacttatctggcacccagatgatgaaattttcatccgacacgctaaagc
tctaaaagtcgggaaaattttcaacatctggaaggtttacattacggaat
tttgcgagaccacgtcaagaattttgcagcgggaggtctggtaacccagc
cctcgttttcggggattggtgggtccaaccgaaatatttctaGGTTTACG
GGCAAGGACTGTTAAACCCAActgaggatgcggcacatcaaaaaccgact
atcattcctctccgatgggaaattggcccgctccctttagagcttcagcg
tgggcggccgccaatccgccatcggaatatcagataaacacATTACAGAT
AATTCAAGAATATCTTGggaaatttataaacaaaaagcaGAGTTAAGCTC
TAAGCTCCATGATCGGCAACATCAAAGAAACTAAACAGATACTTAAAAGC
TACTTTAAGACACTTTTAGAAAATAGAATGATCTCATTTTGTAATAAATC
ACAAGAGGGTTTGTTTATAACTTGAAGCCTCACTTAGTATCTGTTTACAA
ATGAAAAGTATGTGATTTCAATGAGAATCTTATACGTTCAGGAAATCTCA
ATTGAATCCTGGACTGAACTGAAATCGTGTGATGAGAATCACGTCaaaga
atacaccttttcgaccgtattcgccaattgccgcgcgggcattttttttc
ctgttttacCACCCAAAAACcgccccagtctttttttttcgcacctaaag
gcaatagaaaaaagtgtaaaaaggattggatcgagtttagggtggtaaat
caAATAATTAAGTGACGTGACTACAGTCGAAAAAGTGTATACCGTATGAA
TGGAATTATTAGGAAACGATTTGTCAATACCACAAATTTTGTCCATGCGT
AAAGTATCCTACTTGCCAAATAAAGTCGTATTTGAAATtataaataaatt
gaaagatTCTAATTTGCAATACATCCCAGCTGGCATATAACGTCAAATAA
atgacacacaacgttatttcaacgttcatctaacgttatatggacgttgt
gaacattaaaggttttgtttttacataagtgttcccgtttcatatcagac
acatatttcatatcaggacagtgcctGCCTATCACTGgtttaaaaaattc
taccgggtctgtgagaagggagtgtagtTAAATGTGTAGTAAAACCTCAT
TCCTACCCTAACTTTTCCTGCGTGATATCCGCGTCTCAACCcaactggcg
tgccagtctaaatATGTTCTAAGCATATAGAAAAATTCACGCCGTTAAAG
CTGGAATCTCAGGAGTATATTTTGACCATATTTTTAGATTTCCTATAGCC
tagaaaacgctatattgccaaaAACCAGTGTGTCTTAGCCTactgaatac
gggcttagttaactaggctttCTCTGCATGGTGAGGATGAGGAAATCGAA
AATGTATAAGCACTTCCGAACATATCGTCAAGCCCTCCTTTCACAGCTTC
CCTTCCATTATGCGGGTTATACcacctctctctctctctctttgcATGGT
AGGATTTTCTATATTAGCTCCTCTTTATCTTATTTTTCCTGTAGCCAAAT
GATCTCAATTTAGTCTGAATAACGTCACATGACGTCACATTATGACTACG
CAATCAGCGCTCCGCATACATAACCATAGTCCGTAAAAACCTGGAAGTCT
GGAagcttatttttttaactttttgtcagctttttcctttgttgctatca
aaaaataaagatcaatttgctcagtttttgatcaagTTTTTGACCAAGTA
cccctcttgggattggtttaagattcaatcacatgatcaaaaagtgagcg
aaacaaacgcaagttcaagtaagaaacaatggaaagacacAAAAGGCTTC
CGCAAAccgggttttttatacggactatatGGCGTAACCGACCAATTTGA
CCACGTTCAAGCAATACTCCTCTCCTCTTATCAGTAACATTGTCTATatg
aaatttgatatttctaAGCAAATGCCAAACTCGTTCTCAATCCTTTAGAT
cgatttttatgattctgacaGCGCTCACGGTTGTGTCACGTTCACCAGTA
TAAACAAAAAGTGATGCAAGAGGCTCAGGGTACGTGACCGagatttgata
ataaaaatttttccttttttacttCTAGCTATTCCACCATCGACGCCAGG
ATGTCAACCACATCACGCAACACCGCATTTCCATGGCAGCTCTAAATCTT
TAAACATGATCATTGGGTACAAAACAACACCTCAGTACCCACTCCACGCT
ATTGATACTATAAGCCAAAGAGATGTACACAATCTAGTTTCATACGCTGG
GGAATTAAATTATAACACAGCGGGAACTCCACATGGCAGTAATAAAGATA
TTCGAAGTCTTTATTCTACAGAAGATCACCATAATGTCAATAAAATGTAT
TTACCAAGTCGCCAGAATTCGATCATCTGCGCGCAGAATCCAAGATTTTC
AACATACGGATATGTGAGTATTAAATaaagtcaactctctctaattcgaa
cttctgttatccaaatctttctgtaattcgaactaaaatatttctcCCTT
CAGCttaaaagtggtttaaattaatCTCTGTtactcgaatctttctctaa
ttcgaagaaaacttTTGGTCACATGAAGATCGAGTTAGAGAGAGTCAATT
GTATTATCTTTTGGGATTTTAATCTAGGATGAAATACTGTTACAAGTCAG
TCTAATCGAAAGCCAAAAATAGAACTTTTTAATCCTTTTTTGATTCGTAT
TAAAAGctccatttttaaaaattcgaCTAAACTGCAAGTTTCTGGAGTTT
CACTGACAAGAGCAATTTCTCCGAATGaaaaaaaGTCTTCTACTATCTAA
TCTATCCTTTTGCCCTCCCTGTTCATATCAAGTAGACCTAATTTCAAAGT
ATGTATTCCCCTACGgtaaaactttattatttttcCAACCTCGTTCGAAT
GCCTAATCCCTTTTTTGACTGATGAGGATATAATCCCACAGATTTCTGTC
cgaaaagcccgaagggctaggtCTCTCATACTTTAAGCTCTTCAAAGcaa
caaaaattgaatatcgcaaaaaatattgctgttatttttttcgaaaaccc
gcgaagctccTTACTGGTCAAGCGCTGagattctattgtaatgtcacgtg
acctatgtaggatttcctacgaaagcacgacatctagccctttgatCTGT
GGATTAGCCCTGTAGGGAATGATAAACATGACATAAACATTTAGAGATAA
CgcaatattttccaaaatccGAGACCTGGGCCAAAActcatcaaataaaa
aaaaaacgtcgaTGACGTTCACCCTGGGATCAAGGGTGttgttttaagtc
aaaattaaaattgaaatttcgacTTACCGAATCTATCTTTTATTGACAAT
GATTTTCACAATCTTTCTTTTCACCAACATATTTAGCCACATACGGTTGT
ATTGAGTCAAGGTTCATCAGAACTGGAGAAACACCAAGCAGCAGATATAC
CAAATTATGGAAAACTGGCCTGGTTTGCTTGTATATTCTTTTTTCCTCTT
GGTTTGATTGCACTGAAGAAACATTACGAGGTAAAATGAATTTCAACATT
CAgataactaaagtctgtcccaATATTcctttcattttctaattctAAAT
CTCGCTAAATCTTTTCTATCTCATAATATCCTACTCcttattatcttttc
aacaagcaaaaaatcactATCAAATTTTATATACTATCAAAAATTATATC
CTGTTCTTACTTCACTATTTGTGAGTATTGTTGGTGtttttttAGTCCGC
Aaagcctaaaaaatgttcttaatttgttcttaatattttagccaacgaag
ccttatgttcttgtttagttttttcttatatagAAAGCGTGTATATAATC
TGAATATATCTGATTCCGTTACAGACACGAAAGTTTCGTTATCGGAACCC
GGATAAAGCACGAGCAGCATCAGACGTGACTCGATTCTTTGGAGCGTTTT
CTATTCTTCTTGGAATTGTTCTTTACGCCCTAATTGTTGTAATTCGGTTA
CGTTTATCTTACGAAAATGGCGAAAAGTTCATATGACAGAGATTATTAAC
TGAAGAAGCATTTTAGCTTTAAGGAGAAGCTGTGAAATGGTGGAATATTC
AATGCTGTTAACAGCAATTCATGAAATGACTTCCCAGCTGggacacaacg
ttgttttaacgttcaaataactttatttggacgttattaatgtcacatgg
acgttgctttgacgttgtgtgccgtctgggttAGTAGTAGGTCTAATAAC
AATCTGATTGACctgacaaaataatttttgtgaGAGCTATCAGATTCATC
ACAAAACGAGCTCAGGGACTGGGTATGAATTTGTTTTAATGCTAAGAGAT
TATCGAATCATTGGTCCCCAAAAGGAAGAACATCAAAAAGGACATCCATA
TGACCTCCATAACGTTGTCAGTCAACTAGGAAAGGATTTAGATACAAAGG
ACGAGGAACATGGAAGCTCGAAGAAATTTAAGATTCTTAATagcgaaaat
tttttctttgttgtaaATTAGAGAGGAATCATATGGATGAGAACCTTTTG
TTTGTTGGTGTAAACGTTAATCGTTTTTTGCTATTTCAGATAATTTATAC
AGTGCTGGAAATGTGCTTAACCGTAAACGTAAACACACGTTATTATTAAC
ATATACCTTTGAGAATTGTTTGctggtcatcaaaatacatatcttataat
attttaaatcatttaccttatcggccaactTAAGTcagccctaagtgact
aaaatttggcttggtgactaaaattagggccaactaaaaatttgggccga
ttaaaatttgggccgactaaaaatttaaaaatggccaaaacttaattatt
agtcggcccttaatgacaaaattttgacgaggtgactaaaataagggccg
actaataattaaggccgaataaaattaaggccgactaagttttggccgat
aaggtaaagcatttttatttgaaaattagaaacgtattgaaattttgtat
gtatatatttataatgaaataaaataaaattaaataatttgGCAGAGACT
CTCAAAGGAGGGTAACGCCCCTAACTCACAATCACATTTGCTGTGAAAGA
AAATGATAACATCTATATGGCCCCCTATATgcctaaaatattttacagat
taAGTAAGGCAAAGCAGAAAGAAAACTTTAAGTTTGTTAAACTATACTTT
AAAAAGCTTACTATATTCATACATCCC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000126_pilon:98933..105959+ >MSTRG.14818.2.p1 ID=MSTRG.14818.2.p1|Name=MSTRG.14818.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2724bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:98933..105959+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAATTGatgttaaagatattcaaatCATTAATAAAGCTATTCCACC
ATCGACGCCAGGATGTCAACCACATCACGCAACACCGCATTTCCATGGCA
GCTCTAAATCTTTAAACATGATCATTGGGTACAAAACAACACCTCAGTAC
CCACTCCACGCTATTGATACTATAAGCCAAAGAGATGTACACAATCTAGT
TTCATACGCTGGGGAATTAAATTATAACACAGCGGGAACTCCACATGGCA
GTAATAAAGATATTCGAAGTCTTTATTCTACAGAAGATCACCATAATGTC
AATAAAATGTATTTACCAAGTCGCCAGAATTCGATCATCTGCGCGCAGAA
TCCAAGATTTTCAACATACGGATATCCACATACGGTTGTATTGAGTCAAG
GTTCATCAGAACTGGAGAAACACCAAGCAGCAGATATACCAAATTATGGA
AAACTGGCCTGGTTTGCTTGTATATTCTTTTTTCCTCTTGGTTTGATTGC
ACTGAAGAAACATTACGAGACACGAAAGTTTCGTTATCGGAACCCGGATA
AAGCACGAGCAGCATCAGACGTGACTCGATTCTTTGGAGCGTTTTCTATT
CTTCTTGGAATTGTTCTTTACGCCCTAATTGTTGTAATTCGGTTACGTTT
ATCTTACGAAAATGGCGAAAAGTTCATATGAATGACAATTGatgttaaag
atattcaaatCATTAATAAAGCTATTCCACCATCGACGCCAGGATGTCAA
CCACATCACGCAACACCGCATTTCCATGGCAGCTCTAAATCTTTAAACAT
GATCATTGGGTACAAAACAACACCTCAGTACCCACTCCACGCTATTGATA
CTATAAGCCAAAGAGATGTACACAATCTAGTTTCATACGCTGGGGAATTA
AATTATAACACAGCGGGAACTCCACATGGCAGTAATAAAGATATTCGAAG
TCTTTATTCTACAGAAGATCACCATAATGTCAATAAAATGTATTTACCAA
GTCGCCAGAATTCGATCATCTGCGCGCAGAATCCAAGATTTTCAACATAC
GGATATCCACATACGGTTGTATTGAGTCAAGGTTCATCAGAACTGGAGAA
ACACCAAGCAGCAGATATACCAAATTATGGAAAACTGGCCTGGTTTGCTT
GTATATTCTTTTTTCCTCTTGGTTTGATTGCACTGAAGAAACATTACGAG
ACACGAAAGTTTCGTTATCGGAACCCGGATAAAGCACGAGCAGCATCAGA
CGTGACTCGATTCTTTGGAGCGTTTTCTATTCTTCTTGGAATTGTTCTTT
ACGCCCTAATTGTTGTAATTCGGTTACGTTTATCTTACGAAAATGGCGAA
AAGTTCATATGAATGACAATTGatgttaaagatattcaaatCATTAATAA
AGCTATTCCACCATCGACGCCAGGATGTCAACCACATCACGCAACACCGC
ATTTCCATGGCAGCTCTAAATCTTTAAACATGATCATTGGGTACAAAACA
ACACCTCAGTACCCACTCCACGCTATTGATACTATAAGCCAAAGAGATGT
ACACAATCTAGTTTCATACGCTGGGGAATTAAATTATAACACAGCGGGAA
CTCCACATGGCAGTAATAAAGATATTCGAAGTCTTTATTCTACAGAAGAT
CACCATAATGTCAATAAAATGTATTTACCAAGTCGCCAGAATTCGATCAT
CTGCGCGCAGAATCCAAGATTTTCAACATACGGATATCCACATACGGTTG
TATTGAGTCAAGGTTCATCAGAACTGGAGAAACACCAAGCAGCAGATATA
CCAAATTATGGAAAACTGGCCTGGTTTGCTTGTATATTCTTTTTTCCTCT
TGGTTTGATTGCACTGAAGAAACATTACGAGACACGAAAGTTTCGTTATC
GGAACCCGGATAAAGCACGAGCAGCATCAGACGTGACTCGATTCTTTGGA
GCGTTTTCTATTCTTCTTGGAATTGTTCTTTACGCCCTAATTGTTGTAAT
TCGGTTACGTTTATCTTACGAAAATGGCGAAAAGTTCATATGAATGACAA
TTGatgttaaagatattcaaatCATTAATAAAGCTATTCCACCATCGACG
CCAGGATGTCAACCACATCACGCAACACCGCATTTCCATGGCAGCTCTAA
ATCTTTAAACATGATCATTGGGTACAAAACAACACCTCAGTACCCACTCC
ACGCTATTGATACTATAAGCCAAAGAGATGTACACAATCTAGTTTCATAC
GCTGGGGAATTAAATTATAACACAGCGGGAACTCCACATGGCAGTAATAA
AGATATTCGAAGTCTTTATTCTACAGAAGATCACCATAATGTCAATAAAA
TGTATTTACCAAGTCGCCAGAATTCGATCATCTGCGCGCAGAATCCAAGA
TTTTCAACATACGGATATCCACATACGGTTGTATTGAGTCAAGGTTCATC
AGAACTGGAGAAACACCAAGCAGCAGATATACCAAATTATGGAAAACTGG
CCTGGTTTGCTTGTATATTCTTTTTTCCTCTTGGTTTGATTGCACTGAAG
AAACATTACGAGACACGAAAGTTTCGTTATCGGAACCCGGATAAAGCACG
AGCAGCATCAGACGTGACTCGATTCTTTGGAGCGTTTTCTATTCTTCTTG
GAATTGTTCTTTACGCCCTAATTGTTGTAATTCGGTTACGTTTATCTTAC
GAAAATGGCGAAAAGTTCATATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000126_pilon | genome | sc0000126_pilon:98933..105959 + |
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