MSTRG.14770.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14770.2.p1
Unique NameMSTRG.14770.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000125_pilon:467645..486599-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14770.2.p1 ID=MSTRG.14770.2.p1|Name=MSTRG.14770.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18955bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:467645..486599- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGTAGTTTGCATAGCTTAACAACCGATATATTAAAGAGCGAGCGTGGGAG TATGGAGTATTGGCAAATTTTGCTAGAAAAATAAAGGAAAAGATTTTGCT GCAGAAAGAAAAAGTGTCAGTAGGAGTAGTAGGAGTGAGTGGTCATGACA GCCATCCAAGAAAGAGAAGCTTGAAACCAGTTTACTATGGCTCAAAATGG ATTCACTAGGGATAGACCTAGTGTCAGAAATGGGAATCCTTTTGATTACG CCTTCAAGGTATACATTCATACATTCATTTTGCCTGCTGCTGCTTTTTTG ATATTTTATTTTTTTTTAAATTCTCTTCTTTGATTTGATGGAAGCTTAAA AAGCTAACTTGTTGGACTCTTTGAAGTCTAGTCTACACCACACTTCTCCA TATTGCTGCTTTGTTATTTATATTTTATTTATTATTTGCATATACCTCTA TTTGCCTTTTTATCTTGGATATTTGCTTGGTGGGGAGGTTCCATCCCAAT AAACTACAACTACAATTAAGGCGGCAAAAATTTTTCGGGTTTCCATTCCA GACGTAATTAATCGAACCAATCGAACGGTATTTTTAATCGAACTTTGTCG AGCTTATAATCGAACTTTGTTGGCCGATTAATGTTCGACTAAGTTCGGTT GTCGAACTTTAATCGAATACTCACTAATTTCTCAAAATACAAAGTTCGAT TAAGTTTTTGATTACTGAAATCGAACTTAATCGAACTTTTTTTAAAGAGA CCTCGACAGTTCAATTAGTTCAATTACATTAATCGAACTTAATCGAAATA ATCGAACTTAATCAAACTTTATCAAGTTTATTCAAACAAAAATTTGAGAA AACCCGAGCAAGTGACAGTTACATCAAAATGCCTCGAAAATGTCAATATG AAAATTGCGTAATCAGAGAGCGTATGTCTCGCTCATTATAAAAAGGCGAA 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TTTAGGCGTGGTTATCAGAAATTAGAGAGTATGCACCAAATGACGCTGTC ATTATGTTGCTCGGCAACAAGGTAACACATAATAAACTTAATTACTAGAA TAAATATGCATCTGTATGTTTTTTATAATGTTCCAAGTATTTCAAAATCT TTAGAGCTCTCACTTCCATTGAACTTGCTTCGATTGGTATGTAAAATGTT GTGGAGATGTCTGTTCCCTCAAAAGTTTTGACCAACTCTGTCCCCCAAAG CTTGATTTTTGACCCTCGTATATTTTCGATTCCTTTTAGTGTGATTTGGC AAAAGAAAGACAAGTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGTAC GTGTTAAGATGAGCACTACATGTTTTTATTTTATAAGATTTGTGTTTTTC ATTTTATCATAGATTTTCTTATAGAGTATATTCTTACAAAAAGCGTGTAA ACTCGGTAATCTTTCGGCTAGCGTACCCTCTTTACTTCTTATTGTTCTAT TGTTCTACCAGTCGTCTCAAAAAACTGAGTAATTATTTTTGTGTTTGTTT GTCCACAAAGTTTTGAAACTTACTGTATTCTTCTTGTTAAGGATTATAAT GTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGATCTAGC GTTCGAAGCTGCTTCAAGGTATCTTTCATCTTTCACTGCCCTATTTTCTT CTCTATCGTATTTGCTATCCAGAACAACAAGGCAAGCAAGATTTAAAACT TTTAGACTAAAAGTCAGGTTGCTCGGCACCTGTGGTCAAGAGTGTCAGCT AAACTCCCATTTCTGACCTAACACCATACCATTAAAGACAAGGGTCAAGG ATAGGTTAACAAATCCAGGGGAATAAAATGAACTTTGACTGCGATGTTCT TCGAATCTTACTCTCACTAAGAAATGTTCGTATAATACTTTATATAATTC TAGTATTTCGAAAGTAAATCAAATCCGATAACACATTTTTTTTGCTTTTT TCAGAGAATTAATGAATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAA TTTAATATTGGACAATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTG TGGGTAATAAAAGAGTATCTTTAGCCTGCATTCTGTTCCACTTAGATGTT ATTTATCATTTTGGAAGAAGGCGGGAGATACCAATAATAGCCAATTGTAG GGCATGTTAAATTATAAAGTCAAATATGAAATAAATAGAGGAATTATTCT GGAAGCCATTCCTATCTTATGGAAAAGTGCAGTGACTATTCCTTTCTGAG TGGTCCTGGTTTTTGTTTTTGAAGATACAAATTACCTTTGAATTGACTGT TTTGGACTAACGAGATCTGTAAGGGTTTTGGTTTGACGAGATCTGTAAGG ATTATAGTATCGCAGATCCATTGTCAACTTGTGCTGGTTATGACTGATAG CAAGATGGAAAAATAATGATAAGCTTGGTTAGACTGAAAAGGTGCTGCTT TGAATTTGATCAGTCGTTTTGGTATAGCTTCTTCCTTTTGTCTTTTTTTT TAATTTGGTTTCCTTCTAAAGCATAGATATAATTATTTTTTCGATACAGT ATATATTTTTCGTCTTTATATTTTGTTTTTTTTCTTACGAAACAAGATGT TTTGGATAGATTTAGAACGTTTTTTGAAATATTTTTTTAGCAAAAAAGTA TAGATTTTTTCTTTAATTTTTCAATATTTTTTTGGAACGTTTCTATAGTA TAATCTATTTTCATTATTTATGCTGCATGCACCAGGTTTATATTTTTCTT TTAGCCGGATTTTAATAAAGAAAGCTTTTTTTTCAAATGACTGCTTTAGT CAGCCTACGATACCATACAAATAAGAATTTGTTGACTTGATTTATCCAAA ATAAATTGGTTCAGCTTCTGCCTGGTGCCACCCAAATTTTCCGAAATGAA TCAAAACAATTGTTTGACGCCTTTGTCCGGGATTATTTTTACCTCAGACT CAAAATATTACGTTAGGTTCATCTTACCAACTTTTTGTTAGAAAATTAAA AAATTATTTAAATTTTGTCCTGTAATGTTATGTCAAAATGTTTTTTTGCA ATGAGTTTTTGAACTTAAATGAATTTTATTAAGTGTAATTCACTACTTTC TAAAAGTACATGGAGAAAATGTTCGGATTCCAGAGCTTAATCAAATGCGA TTGGTTAGTCTTAATATCCAAAAAGGTCTTAAGTCTAACCTTATCTAAGC AATAGCTATACAAAGGAATACTGGTTTTTTCTCAGCGGCTTGTATCTAAG AGAGAAAAGCAAAAATGAGGTTTTCTACCACTCGTCATTATTAATTTTAC TTTTCTTTTTGTCTTTTATGTTAATTTTTTGGTTTTTAATTATTTTTTTT TTAATGAAGGTTGTTAATTTTAGGTTAATAAAAACTTTAGATACTACTGT TGTGATGTTTTGCTGTACATAAAGTATTCTTATAATTTGGAAGTTCATTT GTTACTTTGTTTCGGTTATTTTGGAAATTTGTTATGTTTTAATTATTGTA GTAATCTCCAGATTTTCTGGTTTGTATTTTTCTAGTTTACTATAATTTTA CGAAAGTATTTTCAATTCGCACGAAGTTATTATACCTTTACTTCAGAGCA CTTCACTTGGTTATTTTACGCTTCGCTTCAATTGTATAGAAAGGGACTAG CGTATAGGAGCTTACCACATTTAAACAAAAAACCGAATGTTTTGAGTCTG AGAACCAAGTCACCAAGTGAGCGTATTGAGCTTTATATAGGATGAAGGAG GATGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000125_pilon:467645..486599-

>MSTRG.14770.2.p1 ID=MSTRG.14770.2.p1|Name=MSTRG.14770.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6183bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:467645..486599- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGAATTAATGAATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTA
ATATTGGACAATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGG
TAAGATTATAATGTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAA
TGTTGATCTAGCGTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAG
ACAAGTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAG
AAATTAGAGAGTATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAAC
AAGCTCTATTGCTGCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAAC
ACGAGGATTTGGGACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCA
TGCATACTATAGAGATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAG
AAAGTCAAGTTACAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGAC
ATGTGTTTTAATCCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCA
TCTCGACTGTAGGAATTGACTTTAGGATGGTAGCACAAAGAGTTCGTAAC
GCAAAGCAACTTGGTTTAAATTTGACCACGAGTGAGAAATTCAAGAAACA
TCAACGTCTTGATCCTGATATCAAACATCTTTTTAAGAGAATTAATGAAT
ATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAATATTGGACAATA
TGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAGATTATAATG
TACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGATCTAGCG
TTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAAGTCAAAAGG
GAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAATTAGAGAGTA
TGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGCTCTATTGCT
GCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACACGAGGATTTGGG
ACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCATACTATAGA
GATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAGTCAAGTTAC
AAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGTGTTTTAATC
CGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTCGACTGTAGG
AATTGACTTTAGGATGGTAGCACAAAGAGTTCGTAACGCAAAGCAACTTG
GTTTAAATTTGACCACGAGTGAGAAATTCAAGAAACATCAACGTCTTGAT
CCTGATATCAAACATCTTTTTAAGAGAATTAATGAATATAGAAGCACGCG
GTAAAGAACACAATGGAAAATTTAATATTGGACAATATGTTTCAGAGAAA
GAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAGATTATAATGTACCATTCCTGGA
AACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGATCTAGCGTTCGAAGCTGCTT
CAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAAGTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAA
AATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAATTAGAGAGTATGCACCAAATGAC
GCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGCTCTATTGCTGCTTTATGATGTG
GGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACACGAGGATTTGGGACACAGCCGGACA
AGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCATACTATAGAGATGCACATGAAC
AAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAGTCAAGTTACAAGTGATGTTGAT
TGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGTGTTTTAATCCGATTCAAAGATG
GCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTCGACTGTAGGAATTGACTTTAGG
ATGGTAGCACAAAGAGTTCGTAACGCAAAGCAACTTGGTTTAAATTTGAC
CACGAGTGAGAAATTCAAGAAACATCAACGTCTTGATCCTGATATCAAAC
ATCTTTTTAAGAGAATTAATGAATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAA
TGGAAAATTTAATATTGGACAATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTG
GATGCTGTGGGTAAGATTATAATGTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAA
TCGGGGCTGAATGTTGATCTAGCGTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTG
GCAAAAGAAAGACAAGTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGC
GTGGTTATCAGAAATTAGAGAGTATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGT
TGCTCGGCAACAAGCTCTATTGCTGCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAAT
CATTCGAAAACACGAGGATTTGGGACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGA
AGCATCACGCATGCATACTATAGAGATGCACATGAACAAAACCATAAACG
TGGACGGGAAGAAAGTCAAGTTACAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGT
GTAGGGAAGACATGTGTTTTAATCCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAG
TGGTAGTTTCATCTCGACTGTAGGAATTGACTTTAGGATGGTAGCACAAA
GAGTTCGTAACGCAAAGCAACTTGGTTTAAATTTGACCACGAGTGAGAAA
TTCAAGAAACATCAACGTCTTGATCCTGATATCAAACATCTTTTTAAGAG
AATTAATGAATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAAT
ATTGGACAATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTA
AGATTATAATGTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATG
TTGATCTAGCGTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGAC
AAGTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAA
ATTAGAGAGTATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAA
GCTCTATTGCTGCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACAC
GAGGATTTGGGACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATG
CATACTATAGAGATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAA
AGTCAAGTTACAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACAT
GTGTTTTAATCCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATC
TCGACTGTAGGAATTGACTTTAGGATGGTAGCACAAAGAGTTCGTAACGC
AAAGCAACTTGGTTTAAATTTGACCACGAGTGAGAAATTCAAGAAACATC
AACGTCTTGATCCTGATATCAAACATCTTTTTAAGAGAATTAATGAATAT
AGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAATATTGGACAATATG
TTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAGATTATAATGTA
CCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGATCTAGCGTT
CGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAAGTCAAAAGGGA
GGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAATTAGAGAGTATG
CACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGCTCTATTGCTGC
TTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACACGAGGATTTGGGAC
ACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCATACTATAGAGA
TGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAGTCAAGTTACAA
GTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGTGTTTTAATCCG
ATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTCGACTGTAGGAA
TTGACTTTAGGATGGTAGCACAAAGAGTTCGTAACGCAAAGCAACTTGGT
TTAAATTTGACCACGAGTGAGAAATTCAAGAAACATCAACGTCTTGATCC
TGATATCAAACATCTTTTTAAGAGAATTAATGAATATAGAAGCACGCGGT
AAAGAACACAATGGAAAATTTAATATTGGACAATATGTTTCAGAGAAAGA
ACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAGATTATAATGTACCATTCCTGGAAA
CAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGATCTAGCGTTCGAAGCTGCTTCA
AGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAAGTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAA
TTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAATTAGAGAGTATGCACCAAATGACGC
TGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGCTCTATTGCTGCTTTATGATGTGGG
TAGCAGAAAATCATTCGAAAACACGAGGATTTGGGACACAGCCGGACAAG
AGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCATACTATAGAGATGCACATGAACAA
AACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAGTCAAGTTACAAGTGATGTTGATTG
GTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGTGTTTTAATCCGATTCAAAGATGGC
GCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTCGACTGTAGGAATTGACTTTAGGAT
GGTAGCACAAAGAGTTCGTAACGCAAAGCAACTTGGTTTAAATTTGACCA
CGAGTGAGAAATTCAAGAAACATCAACGTCTTGATCCTGATATCAAACAT
CTTTTTAAGAGAATTAATGAATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATG
GAAAATTTAATATTGGACAATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGA
TGCTGTGGGTAAGATTATAATGTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATC
GGGGCTGAATGTTGATCTAGCGTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGC
AAAAGAAAGACAAGTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGT
GGTTATCAGAAATTAGAGAGTATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTG
CTCGGCAACAAGCTCTATTGCTGCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCA
TTCGAAAACACGAGGATTTGGGACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAG
CATCACGCATGCATACTATAGAGATGCACATGAACAAAACCATAAACGTG
GACGGGAAGAAAGTCAAGTTACAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGT
AGGGAAGACATGTGTTTTAATCCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTG
GTAGTTTCATCTCGACTGTAGGAATTGACTTTAGGATGGTAGCACAAAGA
GTTCGTAACGCAAAGCAACTTGGTTTAAATTTGACCACGAGTGAGAAATT
CAAGAAACATCAACGTCTTGATCCTGATATCAAACATCTTTTTAAGAGAA
TTAATGAATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAATAT
TGGACAATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAG
ATTATAATGTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTT
GATCTAGCGTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAA
GTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAAT
TAGAGAGTATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGC
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GGATTTGGGACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCA
TACTATAGAGATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAG
TCAAGTTACAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGT
GTTTTAATCCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTC
GACTGTAGGAATTGACTTTAGGATGGTAGCACAAAGAGTTCGTAACGCAA
AGCAACTTGGTTTAAATTTGACCACGAGTGAGAAATTCAAGAAACATCAA
CGTCTTGATCCTGATATCAAACATCTTTTTAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14770MSTRG.14770Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14770.2.p1.exon10MSTRG.14770.2.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.2.p1.exon9MSTRG.14770.2.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.2.p1.exon8MSTRG.14770.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.2.p1.exon7MSTRG.14770.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.2.p1.exon6MSTRG.14770.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.2.p1.exon5MSTRG.14770.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.2.p1.exon4MSTRG.14770.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.2.p1.exon3MSTRG.14770.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.2.p1.exon2MSTRG.14770.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.2.p1.exon1MSTRG.14770.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14770.2.p1MSTRG.14770.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000125_pilongenomesc0000125_pilon:467645..486599 -