MSTRG.14770.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14770.1.p1
Unique NameMSTRG.14770.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000125_pilon:467333..486599-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14770.1.p1 ID=MSTRG.14770.1.p1|Name=MSTRG.14770.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19267bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:467333..486599- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGTAGTTTGCATAGCTTAACAACCGATATATTAAAGAGCGAGCGTGGGAG TATGGAGTATTGGCAAATTTTGCTAGAAAAATAAAGGAAAAGATTTTGCT GCAGAAAGAAAAAGTGTCAGTAGGAGTAGTAGGAGTGAGTGGTCATGACA GCCATCCAAGAAAGAGAAGCTTGAAACCAGTTTACTATGGCTCAAAATGG ATTCACTAGGGATAGACCTAGTGTCAGAAATGGGAATCCTTTTGATTACG CCTTCAAGGTATACATTCATACATTCATTTTGCCTGCTGCTGCTTTTTTG ATATTTTATTTTTTTTTAAATTCTCTTCTTTGATTTGATGGAAGCTTAAA AAGCTAACTTGTTGGACTCTTTGAAGTCTAGTCTACACCACACTTCTCCA TATTGCTGCTTTGTTATTTATATTTTATTTATTATTTGCATATACCTCTA TTTGCCTTTTTATCTTGGATATTTGCTTGGTGGGGAGGTTCCATCCCAAT AAACTACAACTACAATTAAGGCGGCAAAAATTTTTCGGGTTTCCATTCCA GACGTAATTAATCGAACCAATCGAACGGTATTTTTAATCGAACTTTGTCG AGCTTATAATCGAACTTTGTTGGCCGATTAATGTTCGACTAAGTTCGGTT GTCGAACTTTAATCGAATACTCACTAATTTCTCAAAATACAAAGTTCGAT TAAGTTTTTGATTACTGAAATCGAACTTAATCGAACTTTTTTTAAAGAGA CCTCGACAGTTCAATTAGTTCAATTACATTAATCGAACTTAATCGAAATA ATCGAACTTAATCAAACTTTATCAAGTTTATTCAAACAAAAATTTGAGAA AACCCGAGCAAGTGACAGTTACATCAAAATGCCTCGAAAATGTCAATATG AAAATTGCGTAATCAGAGAGCGTATGTCTCGCTCATTATAAAAAGGCGAA 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TTTAGGCGTGGTTATCAGAAATTAGAGAGTATGCACCAAATGACGCTGTC ATTATGTTGCTCGGCAACAAGGTAACACATAATAAACTTAATTACTAGAA TAAATATGCATCTGTATGTTTTTTATAATGTTCCAAGTATTTCAAAATCT TTAGAGCTCTCACTTCCATTGAACTTGCTTCGATTGGTATGTAAAATGTT GTGGAGATGTCTGTTCCCTCAAAAGTTTTGACCAACTCTGTCCCCCAAAG CTTGATTTTTGACCCTCGTATATTTTCGATTCCTTTTAGTGTGATTTGGC AAAAGAAAGACAAGTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGTAC GTGTTAAGATGAGCACTACATGTTTTTATTTTATAAGATTTGTGTTTTTC ATTTTATCATAGATTTTCTTATAGAGTATATTCTTACAAAAAGCGTGTAA ACTCGGTAATCTTTCGGCTAGCGTACCCTCTTTACTTCTTATTGTTCTAT TGTTCTACCAGTCGTCTCAAAAAACTGAGTAATTATTTTTGTGTTTGTTT GTCCACAAAGTTTTGAAACTTACTGTATTCTTCTTGTTAAGGATTATAAT GTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGATCTAGC GTTCGAAGCTGCTTCAAGGTATCTTTCATCTTTCACTGCCCTATTTTCTT CTCTATCGTATTTGCTATCCAGAACAACAAGGCAAGCAAGATTTAAAACT TTTAGACTAAAAGTCAGGTTGCTCGGCACCTGTGGTCAAGAGTGTCAGCT AAACTCCCATTTCTGACCTAACACCATACCATTAAAGACAAGGGTCAAGG ATAGGTTAACAAATCCAGGGGAATAAAATGAACTTTGACTGCGATGTTCT TCGAATCTTACTCTCACTAAGAAATGTTCGTATAATACTTTATATAATTC 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ATAAATTGGTTCAGCTTCTGCCTGGTGCCACCCAAATTTTCCGAAATGAA TCAAAACAATTGTTTGACGCCTTTGTCCGGGATTATTTTTACCTCAGACT CAAAATATTACGTTAGGTTCATCTTACCAACTTTTTGTTAGAAAATTAAA AAATTATTTAAATTTTGTCCTGTAATGTTATGTCAAAATGTTTTTTTGCA ATGAGTTTTTGAACTTAAATGAATTTTATTAAGTGTAATTCACTACTTTC TAAAAGTACATGGAGAAAATGTTCGGATTCCAGAGCTTAATCAAATGCGA TTGGTTAGTCTTAATATCCAAAAAGGTCTTAAGTCTAACCTTATCTAAGC AATAGCTATACAAAGGAATACTGGTTTTTTCTCAGCGGCTTGTATCTAAG AGAGAAAAGCAAAAATGAGGTTTTCTACCACTCGTCATTATTAATTTTAC TTTTCTTTTTGTCTTTTATGTTAATTTTTTGGTTTTTAATTATTTTTTTT TTAATGAAGGTTGTTAATTTTAGGTTAATAAAAACTTTAGATACTACTGT TGTGATGTTTTGCTGTACATAAAGTATTCTTATAATTTGGAAGTTCATTT GTTACTTTGTTTCGGTTATTTTGGAAATTTGTTATGTTTTAATTATTGTA GTAATCTCCAGATTTTCTGGTTTGTATTTTTCTAGTTTACTATAATTTTA CGAAAGTATTTTCAATTCGCACGAAGTTATTATACCTTTACTTCAGAGCA CTTCACTTGGTTATTTTACGCTTCGCTTCAATTGTATAGAAAGGGACTAG CGTATAGGAGCTTACCACATTTAAACAAAAAACCGAATGTTTTGAGTCTG AGAACCAAGTCACCAAGTGAGCGTATTGAGCTTTATATAGGATGAAGGAG GATGAAGCCTAAAACCCGGATAAACCATAAGTCATCAAAACCTAGATATT TTCATTTCATAATGGACATCATCTTATATCTATCACCAAATTTTTGTTCA TATATTTATTAGTACTGGTATATAATCATTATCACATGCATTTTTTGCGT ATTATTTTCTTTAATTACTTTTATTTTGGTTTAACTATTATATTTTTTAA AAAAGTCAAAGAATAAACTGGAGTTACATCACGAAAATTTTATAACCATA AAATGATAATTATTTAAGTATCTTTTAACTGAATTTCGGTTATAGTCTTA TTTTTCTAACAACTCTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000125_pilon:467333..486599-

>MSTRG.14770.1.p1 ID=MSTRG.14770.1.p1|Name=MSTRG.14770.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5832bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:467333..486599- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGAATTAATGAATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTA
ATATTGGACAATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGG
TAAGATTATAATGTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAA
TGTTGATCTAGCGTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAG
ACAAGTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAG
AAATTAGAGAGTATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAAC
AAGCTCTATTGCTGCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAAC
ACGAGGATTTGGGACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCA
TGCATACTATAGAGATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAG
AAAGTCAAGTTACAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGAC
ATGTGTTTTAATCCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCA
TCTCGACTGTAGGAATTGACTTTAGGATGGCTCAAAATGGATTCACTAGG
GATAGACCTAGTGTCAGAAATGGGAATCCTTTTGATTACGCCTTCAAGAG
AATTAATGAATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAAT
ATTGGACAATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTA
AGATTATAATGTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATG
TTGATCTAGCGTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGAC
AAGTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAA
ATTAGAGAGTATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAA
GCTCTATTGCTGCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACAC
GAGGATTTGGGACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATG
CATACTATAGAGATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAA
AGTCAAGTTACAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACAT
GTGTTTTAATCCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATC
TCGACTGTAGGAATTGACTTTAGGATGGCTCAAAATGGATTCACTAGGGA
TAGACCTAGTGTCAGAAATGGGAATCCTTTTGATTACGCCTTCAAGAGAA
TTAATGAATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAATAT
TGGACAATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAG
ATTATAATGTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTT
GATCTAGCGTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAA
GTCAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAAT
TAGAGAGTATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGC
TCTATTGCTGCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACACGA
GGATTTGGGACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCA
TACTATAGAGATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAG
TCAAGTTACAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGT
GTTTTAATCCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTC
GACTGTAGGAATTGACTTTAGGATGGCTCAAAATGGATTCACTAGGGATA
GACCTAGTGTCAGAAATGGGAATCCTTTTGATTACGCCTTCAAGAGAATT
AATGAATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAATATTG
GACAATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAGAT
TATAATGTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGA
TCTAGCGTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAAGT
CAAAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAATTA
GAGAGTATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGCTC
TATTGCTGCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACACGAGG
ATTTGGGACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCATA
CTATAGAGATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAGTC
AAGTTACAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGTGT
TTTAATCCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTCGA
CTGTAGGAATTGACTTTAGGATGGCTCAAAATGGATTCACTAGGGATAGA
CCTAGTGTCAGAAATGGGAATCCTTTTGATTACGCCTTCAAGAGAATTAA
TGAATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAATATTGGA
CAATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAGATTA
TAATGTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGATC
TAGCGTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAAGTCA
AAAGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAATTAGA
GAGTATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGCTCTA
TTGCTGCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACACGAGGAT
TTGGGACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCATACT
ATAGAGATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAGTCAA
GTTACAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGTGTTT
TAATCCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTCGACT
GTAGGAATTGACTTTAGGATGGCTCAAAATGGATTCACTAGGGATAGACC
TAGTGTCAGAAATGGGAATCCTTTTGATTACGCCTTCAAGAGAATTAATG
AATATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAATATTGGACA
ATATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAGATTATA
ATGTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGATCTA
GCGTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAAGTCAAA
AGGGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAATTAGAGA
GTATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGCTCTATT
GCTGCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACACGAGGATTT
GGGACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCATACTAT
AGAGATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAGTCAAGT
TACAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGTGTTTTA
ATCCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTCGACTGT
AGGAATTGACTTTAGGATGGCTCAAAATGGATTCACTAGGGATAGACCTA
GTGTCAGAAATGGGAATCCTTTTGATTACGCCTTCAAGAGAATTAATGAA
TATAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAATATTGGACAAT
ATGTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAGATTATAAT
GTACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGATCTAGC
GTTCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAAGTCAAAAG
GGAGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAATTAGAGAGT
ATGCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGCTCTATTGC
TGCTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACACGAGGATTTGG
GACACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCATACTATAG
AGATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAGTCAAGTTA
CAAGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGTGTTTTAAT
CCGATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTCGACTGTAG
GAATTGACTTTAGGATGGCTCAAAATGGATTCACTAGGGATAGACCTAGT
GTCAGAAATGGGAATCCTTTTGATTACGCCTTCAAGAGAATTAATGAATA
TAGAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAATATTGGACAATAT
GTTTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAGATTATAATGT
ACCATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGATCTAGCGT
TCGAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAAGTCAAAAGGG
AGGAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAATTAGAGAGTAT
GCACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGCTCTATTGCTG
CTTTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACACGAGGATTTGGGA
CACAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCATACTATAGAG
ATGCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAGTCAAGTTACA
AGTGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGTGTTTTAATCC
GATTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTCGACTGTAGGA
ATTGACTTTAGGATGGCTCAAAATGGATTCACTAGGGATAGACCTAGTGT
CAGAAATGGGAATCCTTTTGATTACGCCTTCAAGAGAATTAATGAATATA
GAAGCACGCGGTAAAGAACACAATGGAAAATTTAATATTGGACAATATGT
TTCAGAGAAAGAACAAAAGCCTGGATGCTGTGGGTAAGATTATAATGTAC
CATTCCTGGAAACAAGCGCAAAATCGGGGCTGAATGTTGATCTAGCGTTC
GAAGCTGCTTCAAGTGTGATTTGGCAAAAGAAAGACAAGTCAAAAGGGAG
GAAGGTGAAAAATTAGCGCAGGCGTGGTTATCAGAAATTAGAGAGTATGC
ACCAAATGACGCTGTCATTATGTTGCTCGGCAACAAGCTCTATTGCTGCT
TTATGATGTGGGTAGCAGAAAATCATTCGAAAACACGAGGATTTGGGACA
CAGCCGGACAAGAGAGATTTCGAAGCATCACGCATGCATACTATAGAGAT
GCACATGAACAAAACCATAAACGTGGACGGGAAGAAAGTCAAGTTACAAG
TGATGTTGATTGGTGACAGTGGTGTAGGGAAGACATGTGTTTTAATCCGA
TTCAAAGATGGCGCATTTTTAAGTGGTAGTTTCATCTCGACTGTAGGAAT
TGACTTTAGGATGGCTCAAAATGGATTCACTAGGGATAGACCTAGTGTCA
GAAATGGGAATCCTTTTGATTACGCCTTCAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14770MSTRG.14770Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14770.1.p1MSTRG.14770.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14770.1.p1.exon9MSTRG.14770.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.1.p1.exon8MSTRG.14770.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.1.p1.exon7MSTRG.14770.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.1.p1.exon6MSTRG.14770.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.1.p1.exon5MSTRG.14770.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.1.p1.exon4MSTRG.14770.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.1.p1.exon3MSTRG.14770.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.1.p1.exon2MSTRG.14770.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14770.1.p1.exon1MSTRG.14770.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000125_pilongenomesc0000125_pilon:467333..486599 -