MSTRG.14769.6.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14769.6.p1
Unique NameMSTRG.14769.6.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000125_pilon:450940..466989-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.14769.6.p1 ID=MSTRG.14769.6.p1|Name=MSTRG.14769.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16050bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:450940..466989- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACATGTTTTTTTTTATAAGCAAATGTATGCCCCTTGGTCAGGCTCGTGTA TGCTTAAGTTCTCAAAGCATCCAGGCATAGCTTATGCTTATTATATGCTT ATGAATCATGCTTTATGATTCACCTCGAGCCAAGTTTTTAGTGAAATTTC AGAAATTTTGTTAAAATTTGTTCAGATTTTGGGCCGTGGAAACTCTTTTT TTTACTTGACCTCTACCAAACCTTTTTAAACAGATAAAAATGACAACTTG AAAAATATTTCAGGCTGACATGTATGTTTAGGAATTCTGCAAATCTGAGC CTTCATATGCTTATAAGCGTTATGCTTATAAAAAAAACATGTAAGCCTTA TTTTTTCAGCACGCGCGTTTTATAAAAATATACAAAATTTCTGAAACCTT CGGATACACCCCCTTCTCACAGACCTGGTGGAACCCCTCCCACTGGAAAA ATTGGTCAAAATATTGTCCCCAGTGGAAAATTATATTTTGATAAATGTCC CAGCCATAAAGAACATGGGATTATCAATCCCAAACGAGTTCAATCTGTTA TTTCATCCCCACTGGATTAAAAAATCGAGTTTTGTACAGAAATACGAGTC TGTGAGAAAGGGGTGTTTGGATGTTCTCAACTTTTTGAGTTTTGAGCCTG AAAATAATTTTAACATGCTTTTATTTTCCGAGTATTATTGTCCATTTTCC TAAGAATTCGGGCAAGTCCACAAAGCCTTAAAATATAAACTTGTTGTTAA TATTTTGGCTATCGAAGGCTTATGTTCTTATAAAGTTGTCCTAATAAAGA AACGTTTATATCTTTCCTAACTTCGTCGGCATGTTTGATATTACGCTCAT TTCTGCTGACCATCAGCTCTCCGCAATCAAAAAGCGAAACGGTAACAAAA ATTGAATTTCCTTTTTTCAGTTTTGAAGAAATGGTCTTGATGGGCTTAAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000125_pilon:450940..466989-

>MSTRG.14769.6.p1 ID=MSTRG.14769.6.p1|Name=MSTRG.14769.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=21522bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:450940..466989- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCAATGCGAGTGACAACAAAAGGATTCAGCGTGCTTGACTCGATCACTC
GAGAGGTCATATTTGCGATAGAGCCAAGGAAAACTTAACGCCTTAGAGAA
ATGTCAGGAATTGCGCCTGATGAATTGATGAATATTGAAAGTATCCAGGA
ATTGATTGACGCCGACCTGCTTCAAATAGATTCCAGTTTTGAAGAAATGG
TCTTGATGGGCTTAAGGACTCGCGATGGTTTATCTTGCAAAGTCAAGAAG
AAAGGCCATGGGATAAGCATTAATCGTTCCCTCAATCACCAAGAGAAGTT
AACTTCTACCTCGTCAAATCATACTATTAGAAATCGTCATGAATTCCAAC
AAATTGCAGATCCAAAACGCTGGATGTCTCAGGAGCTCATGGAAGGGTCA
TGAAAGTTATCACAATTCGGCTTATTGGAATGACATGGATTATATCGGAA
TAGGTCCAGATGTTGGATGAAGTTGGATTGGAACGTTATGAAGTTTCAAA
TTTTGCAAAATTGTTCCTTCCTAAAGACGATGCTCTTGCTGAAATGTATG
ATCTCTCAGTTCAGATATGTGATTTGGGAGGGAACCATGTATCCCTGTAC
CAGTTGACGATGAAAAAACATACACCTATGGAACGTGACCATCGAAAGGG
TAGAATCCTGTTACAAGAAAGCAATGGAATTATTTGGTGGGAGGGTATCC
ATTGATTTTATGTTTGGACGTCCAAAACAATCAGTGCAAGATTGGAAGAA
GGAACTTAAACAAGCCTTAAACAACAAGGATCTGAAAATGTTAGGAAGAG
AGCATACCTCGGAGCAAGCCATCAGAAACTTCAAAACGGAAGGTATCAAT
CGTGTTTCCATAGGTATTCAAGCACACCCAGTCTTGCTCCACCTTACGTG
GTATCTGCCATTCTGGAGACTATTCATAAAAATGCATTCATTGCTGACTC
AGCGGAAATTACATTGGAAGCGAATCCAACCACGACAGAAGAATCAAAAT
TGAGACGGAACATCAACGAAGATGAGATGATAGGAGGCTTGCAAACTGAT
CTTGAACATTTCATAAAGGACTATCATATTGGTGAAGTCAAATCGGTCTA
TTTTGGCGGAGTGGCCATTTTGCAACAAGTTGTGTCCTTATTGTGACTTC
AACAAATATATCAGATGCGATGGGCGGCCAAGCTGGTATCAACGTTTCCA
GAAAGCTTCATCTCGAAGAGAAGACTGTTAACGAGTTTGTTGCCAAGGAG
ATGTTTGTCACGTGATCTCAATGCGAGTGACAACAAAAGGATTCAGCGTG
CTTGACTCGATCACTCGAGAGGTCATATTTGCGATAGAGCCAAGGAAAAC
TTAACGCCTTAGAGAAATGTCAGGAATTGCGCCTGATGAATTGATGAATA
TTGAAAGTATCCAGGAATTGATTGACGCCGACCTGCTTCAAATAGATTCC
AGTTTTGAAGAAATGGTCTTGATGGGCTTAAGGACTCGCGATGGTTTATC
TTGCAAAGTCAAGAAGAAAGGCCATGGGATAAGCATTAATCGTTCCCTCA
ATCACCAAGAGAAGTTAACTTCTACCTCGTCAAATCATACTATTAGAAAT
CGTCATGAATTCCAACAAATTGCAGATCCAAAACGCTGGATGTCTCAGGA
GCTCATGGAAGGGTCATGAAAGTTATCACAATTCGGCTTATTGGAATGAC
ATGGATTATATCGGAATAGGTCCAGATGTTGGATGAAGTTGGATTGGAAC
GTTATGAAGTTTCAAATTTTGCAAAATTGTTCCTTCCTAAAGACGATGCT
CTTGCTGAAATGTATGATCTCTCAGTTCAGATATGTGATTTGGGAGGGAA
CCATGTATCCCTGTACCAGTTGACGATGAAAAAACATACACCTATGGAAC
GTGACCATCGAAAGGGTAGAATCCTGTTACAAGAAAGCAATGGAATTATT
TGGTGGGAGGGTATCCATTGATTTTATGTTTGGACGTCCAAAACAATCAG
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GATGAAAAAACATACACCTATGGAACGTGACCATCGAAAGGGTAGAATCC
TGTTACAAGAAAGCAATGGAATTATTTGGTGGGAGGGTATCCATTGATTT
TATGTTTGGACGTCCAAAACAATCAGTGCAAGATTGGAAGAAGGAACTTA
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CATAGGTATTCAAGCACACCCAGTCTTGCTCCACCTTACGTGGTATCTGC
CATTCTGGAGACTATTCATAAAAATGCATTCATTGCTGACTCAGCGGAAA
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AACATCAACGAAGATGAGATGATAGGAGGCTTGCAAACTGATCTTGAACA
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GAGTGGCCATTTTGCAACAAGTTGTGTCCTTATTGTGACTTCAACAAATA
TATCAGATGCGATGGGCGGCCAAGCTGGTATCAACGTTTCCAGAAAGCTT
CATCTCGAAGAGAAGACTGTTAACGAGTTTGTTGCCAAGGAGATGTTTGT
CACGTGATCTCAATGCGAGTGACAACAAAAGGATTCAGCGTGCTTGACTC
GATCACTCGAGAGGTCATATTTGCGATAGAGCCAAGGAAAACTTAACGCC
TTAGAGAAATGTCAGGAATTGCGCCTGATGAATTGATGAATATTGAAAGT
ATCCAGGAATTGATTGACGCCGACCTGCTTCAAATAGATTCCAGTTTTGA
AGAAATGGTCTTGATGGGCTTAAGGACTCGCGATGGTTTATCTTGCAAAG
TCAAGAAGAAAGGCCATGGGATAAGCATTAATCGTTCCCTCAATCACCAA
GAGAAGTTAACTTCTACCTCGTCAAATCATACTATTAGAAATCGTCATGA
ATTCCAACAAATTGCAGATCCAAAACGCTGGATGTCTCAGGAGCTCATGG
AAGGGTCATGAAAGTTATCACAATTCGGCTTATTGGAATGACATGGATTA
TATCGGAATAGGTCCAGATGTTGGATGAAGTTGGATTGGAACGTTATGAA
GTTTCAAATTTTGCAAAATTGTTCCTTCCTAAAGACGATGCTCTTGCTGA
AATGTATGATCTCTCAGTTCAGATATGTGATTTGGGAGGGAACCATGTAT
CCCTGTACCAGTTGACGATGAAAAAACATACACCTATGGAACGTGACCAT
CGAAAGGGTAGAATCCTGTTACAAGAAAGCAATGGAATTATTTGGTGGGA
GGGTATCCATTGATTTTATGTTTGGACGTCCAAAACAATCAGTGCAAGAT
TGGAAGAAGGAACTTAAACAAGCCTTAAACAACAAGGATCTGAAAATGTT
AGGAAGAGAGCATACCTCGGAGCAAGCCATCAGAAACTTCAAAACGGAAG
GTATCAATCGTGTTTCCATAGGTATTCAAGCACACCCAGTCTTGCTCCAC
CTTACGTGGTATCTGCCATTCTGGAGACTATTCATAAAAATGCATTCATT
GCTGACTCAGCGGAAATTACATTGGAAGCGAATCCAACCACGACAGAAGA
ATCAAAATTGAGACGGAACATCAACGAAGATGAGATGATAGGAGGCTTGC
AAACTGATCTTGAACATTTCATAAAGGACTATCATATTGGTGAAGTCAAA
TCGGTCTATTTTGGCGGAGTGGCCATTTTGCAACAAGTTGTGTCCTTATT
GTGACTTCAACAAATATATCAGATGCGATGGGCGGCCAAGCTGGTATCAA
CGTTTCCAGAAAGCTTCATCTCGAAGAGAAGACTGTTAACGAGTTTGTTG
CCAAGGAGATGTTTGTCACGTGATCTCAATGCGAGTGACAACAAAAGGAT
TCAGCGTGCTTGACTCGATCACTCGAGAGGTCATATTTGCGATAGAGCCA
AGGAAAACTTAACGCCTTAGAGAAATGTCAGGAATTGCGCCTGATGAATT
GATGAATATTGAAAGTATCCAGGAATTGATTGACGCCGACCTGCTTCAAA
TAGATTCCAGTTTTGAAGAAATGGTCTTGATGGGCTTAAGGACTCGCGAT
GGTTTATCTTGCAAAGTCAAGAAGAAAGGCCATGGGATAAGCATTAATCG
TTCCCTCAATCACCAAGAGAAGTTAACTTCTACCTCGTCAAATCATACTA
TTAGAAATCGTCATGAATTCCAACAAATTGCAGATCCAAAACGCTGGATG
TCTCAGGAGCTCATGGAAGGGTCATGAAAGTTATCACAATTCGGCTTATT
GGAATGACATGGATTATATCGGAATAGGTCCAGATGTTGGATGAAGTTGG
ATTGGAACGTTATGAAGTTTCAAATTTTGCAAAATTGTTCCTTCCTAAAG
ACGATGCTCTTGCTGAAATGTATGATCTCTCAGTTCAGATATGTGATTTG
GGAGGGAACCATGTATCCCTGTACCAGTTGACGATGAAAAAACATACACC
TATGGAACGTGACCATCGAAAGGGTAGAATCCTGTTACAAGAAAGCAATG
GAATTATTTGGTGGGAGGGTATCCATTGATTTTATGTTTGGACGTCCAAA
ACAATCAGTGCAAGATTGGAAGAAGGAACTTAAACAAGCCTTAAACAACA
AGGATCTGAAAATGTTAGGAAGAGAGCATACCTCGGAGCAAGCCATCAGA
AACTTCAAAACGGAAGGTATCAATCGTGTTTCCATAGGTATTCAAGCACA
CCCAGTCTTGCTCCACCTTACGTGGTATCTGCCATTCTGGAGACTATTCA
TAAAAATGCATTCATTGCTGACTCAGCGGAAATTACATTGGAAGCGAATC
CAACCACGACAGAAGAATCAAAATTGAGACGGAACATCAACGAAGATGAG
ATGATAGGAGGCTTGCAAACTGATCTTGAACATTTCATAAAGGACTATCA
TATTGGTGAAGTCAAATCGGTCTATTTTGGCGGAGTGGCCATTTTGCAAC
AAGTTGTGTCCTTATTGTGACTTCAACAAATATATCAGATGCGATGGGCG
GCCAAGCTGGTATCAACGTTTCCAGAAAGCTTCATCTCGAAGAGAAGACT
GTTAACGAGTTTGTTGCCAAGGAGATGTTTGTCACGTGATCTCAATGCGA
GTGACAACAAAAGGATTCAGCGTGCTTGACTCGATCACTCGAGAGGTCAT
ATTTGCGATAGAGCCAAGGAAAACTTAACGCCTTAGAGAAATGTCAGGAA
TTGCGCCTGATGAATTGATGAATATTGAAAGTATCCAGGAATTGATTGAC
GCCGACCTGCTTCAAATAGATTCCAGTTTTGAAGAAATGGTCTTGATGGG
CTTAAGGACTCGCGATGGTTTATCTTGCAAAGTCAAGAAGAAAGGCCATG
GGATAAGCATTAATCGTTCCCTCAATCACCAAGAGAAGTTAACTTCTACC
TCGTCAAATCATACTATTAGAAATCGTCATGAATTCCAACAAATTGCAGA
TCCAAAACGCTGGATGTCTCAGGAGCTCATGGAAGGGTCATGAAAGTTAT
CACAATTCGGCTTATTGGAATGACATGGATTATATCGGAATAGGTCCAGA
TGTTGGATGAAGTTGGATTGGAACGTTATGAAGTTTCAAATTTTGCAAAA
TTGTTCCTTCCTAAAGACGATGCTCTTGCTGAAATGTATGATCTCTCAGT
TCAGATATGTGATTTGGGAGGGAACCATGTATCCCTGTACCAGTTGACGA
TGAAAAAACATACACCTATGGAACGTGACCATCGAAAGGGTAGAATCCTG
TTACAAGAAAGCAATGGAATTATTTGGTGGGAGGGTATCCATTGATTTTA
TGTTTGGACGTCCAAAACAATCAGTGCAAGATTGGAAGAAGGAACTTAAA
CAAGCCTTAAACAACAAGGATCTGAAAATGTTAGGAAGAGAGCATACCTC
GGAGCAAGCCATCAGAAACTTCAAAACGGAAGGTATCAATCGTGTTTCCA
TAGGTATTCAAGCACACCCAGTCTTGCTCCACCTTACGTGGTATCTGCCA
TTCTGGAGACTATTCATAAAAATGCATTCATTGCTGACTCAGCGGAAATT
ACATTGGAAGCGAATCCAACCACGACAGAAGAATCAAAATTGAGACGGAA
CATCAACGAAGATGAGATGATAGGAGGCTTGCAAACTGATCTTGAACATT
TCATAAAGGACTATCATATTGGTGAAGTCAAATCGGTCTATTTTGGCGGA
GTGGCCATTTTGCAACAAGTTGTGTCCTTATTGTGACTTCAACAAATATA
TCAGATGCGATGGGCGGCCAAGCTGGTATCAACGTTTCCAGAAAGCTTCA
TCTCGAAGAGAAGACTGTTAACGAGTTTGTTGCCAAGGAGATGTTTGTCA
CGTGATCTCAATGCGAGTGACAACAAAAGGATTCAGCGTGCTTGACTCGA
TCACTCGAGAGGTCATATTTGCGATAGAGCCAAGGAAAACTTAACGCCTT
AGAGAAATGTCAGGAATTGCGCCTGATGAATTGATGAATATTGAAAGTAT
CCAGGAATTGATTGACGCCGACCTGCTTCAAATAGATTCCAGTTTTGAAG
AAATGGTCTTGATGGGCTTAAGGACTCGCGATGGTTTATCTTGCAAAGTC
AAGAAGAAAGGCCATGGGATAAGCATTAATCGTTCCCTCAATCACCAAGA
GAAGTTAACTTCTACCTCGTCAAATCATACTATTAGAAATCGTCATGAAT
TCCAACAAATTGCAGATCCAAAACGCTGGATGTCTCAGGAGCTCATGGAA
GGGTCATGAAAGTTATCACAATTCGGCTTATTGGAATGACATGGATTATA
TCGGAATAGGTCCAGATGTTGGATGAAGTTGGATTGGAACGTTATGAAGT
TTCAAATTTTGCAAAATTGTTCCTTCCTAAAGACGATGCTCTTGCTGAAA
TGTATGATCTCTCAGTTCAGATATGTGATTTGGGAGGGAACCATGTATCC
CTGTACCAGTTGACGATGAAAAAACATACACCTATGGAACGTGACCATCG
AAAGGGTAGAATCCTGTTACAAGAAAGCAATGGAATTATTTGGTGGGAGG
GTATCCATTGATTTTATGTTTGGACGTCCAAAACAATCAGTGCAAGATTG
GAAGAAGGAACTTAAACAAGCCTTAAACAACAAGGATCTGAAAATGTTAG
GAAGAGAGCATACCTCGGAGCAAGCCATCAGAAACTTCAAAACGGAAGGT
ATCAATCGTGTTTCCATAGGTATTCAAGCACACCCAGTCTTGCTCCACCT
TACGTGGTATCTGCCATTCTGGAGACTATTCATAAAAATGCATTCATTGC
TGACTCAGCGGAAATTACATTGGAAGCGAATCCAACCACGACAGAAGAAT
CAAAATTGAGACGGAACATCAACGAAGATGAGATGATAGGAGGCTTGCAA
ACTGATCTTGAACATTTCATAAAGGACTATCATATTGGTGAAGTCAAATC
GGTCTATTTTGGCGGAGTGGCCATTTTGCAACAAGTTGTGTCCTTATTGT
GACTTCAACAAATATATCAGATGCGATGGGCGGCCAAGCTGGTATCAACG
TTTCCAGAAAGCTTCATCTCGAAGAGAAGACTGTTAACGAGTTTGTTGCC
AAGGAGATGTTTGTCACGTGAT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14769MSTRG.14769Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14769.6.p1MSTRG.14769.6.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14769.6.p1.exon17MSTRG.14769.6.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon16MSTRG.14769.6.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon15MSTRG.14769.6.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon14MSTRG.14769.6.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon13MSTRG.14769.6.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon12MSTRG.14769.6.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon11MSTRG.14769.6.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon10MSTRG.14769.6.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon9MSTRG.14769.6.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon8MSTRG.14769.6.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon7MSTRG.14769.6.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon6MSTRG.14769.6.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon5MSTRG.14769.6.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon4MSTRG.14769.6.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon3MSTRG.14769.6.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon2MSTRG.14769.6.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14769.6.p1.exon1MSTRG.14769.6.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000125_pilongenomesc0000125_pilon:450940..466989 -