|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000007_pilon:543181..547550- Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1473.1.p1 ID=MSTRG.1473.1.p1|Name=MSTRG.1473.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4370bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:543181..547550- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAAACATGCAATTGCCAGATTATCTCAAACCATATTCTGATATGATTGA
AACTGCGTTCTTTAAAGAAGTTCCCCTCATTTTTCACATAGAGGAATTGG
GTAAAATCGGTTATCTAACAATTCATGAAAGTTTGGTCGAGGAAGGTAAA
TCTCAGCGGAGACCAGGTTTACATACTGAATCTCCTGGTTATATTTATGT
TAAGAATGGTTTAAGTGATGAAAAGTGTGAGGAGTTGTGCATTGAAAAGG
GTTCTGGTTATGATGAAATCGTCCCTTTTCCTGTTTCGTGGGGACAGTTT
GGTTACACTAGTATAGATGTCCCTCATGGTGGTATTTATATGGCATCCAA
TGTTGATGATTCTTGTAAAGTTTGGGATTGTCAGATTGTTACTGACAATA
ATGGCGAGGAGTTGATTCGCAAACATGGAGATATTGAGCATTTACGATGT
TTCTTGCCAGAATCAACACTTTTAAAATCTAATTATCTCTATTGGATAAC
GGATCGTACACCTCACGAATCTCTGCCATTGAAGAAAGGAACATACAGAC
AGTTTTTTAGGCTTGTAACACACAGAGTTTCAGTTTGGTATGAAGATCAT
TCAACCAAAAATCCTAATGGTGTTGTCCCTGATCCGAAGATGACTAGGAT
AGTGAAAGGGTCAAAATTTGATGAGAACTATGTCACTGTTGTAGGTTAAG
AAAGGTTATCAACTCTTTGTGTGATTTTTGCAAGCTCAATCTTTATTTAG
GGTTATCCTTAAATTTTTTTATTGCCTAATAAATGAAATTTGTTTTATAT
TTTATGTCGTTTTTCAGACCAACTAATTCAAGAAAATCATGCCATTTTAG
GGAGTATTATACCGGGGGTGCGCCAAAAAAAGTATACAGTATTGTGAAGA
TATAGTGAGTTTATGGTTAAAGACTTTTAGTTGATTCTTTTTCTATTCTA
TAGAGAAAAGCTCAACTTAAATTTTGATCTTTAAAACTTTTAAAATCGGT
TCACTCAATCAAAAGTTATGTTAATAAAAACTGGAGATTTTGAGTAGTCA
AAATGACAAAATTTATGTCAACTATACTGATGCGCCTTTTTCTTTTCATA
ATTCAAAGTCGTAACCAATGGTATCACATTTATTTTTTTTATCAAAGATT
TTGACCCAAATTTGGGGGTCGGGAGTTTTCCATTGTAGTGCCCGTTTTTT
GACTATAAAAAGTTTTGTCAGGTGTAATTCCCAAGACTCCTCTCCAAGTA
ATATCTTTTTTCGAATAAATCAAATCTGGTAATTCCCATCATATTTCATG
AATCTCAAGGGGGCGGTCCCCTACTATTTAATATAACGTTTTATGATAAT
TCATTTGTATCATGGATTATAATGTAATCATATAATATTTTTCAGTAAAA
TAATAATTTTATCGATTTTAACTTCTCTCAAAGCATTCTTGTTTTTTGGT
ATTTTTAATGCTGTTTTTTTTTTTATTACTGTAATCAAAACTTTTTCTCA
AACTGTGTCAGTTTTGAACAGATATATATATAGATTTATTAAACAAACGT
TCAATTATCAAAAGTTGACTAAATTTTTGGTTACAATTCTGTAGCATATA
AAAATACTAAAAATCGTCTTTGAGCTCGGCAAATATTCTTCTTAAAAACT
TTTGGCAGATATAACCTAAATCTCATTGTGATACAGACATCACTGCATTC
CAGCTTTTATGATTGTTTACTTTTCGCTTTTATATAAATATAATTATTTA
TACTGTATTTAATTAGAAATCTTTTTGTAAAGAAAATTTTATGACCTACC
TGGAGGTCCTTTAATTTGACCGTTGTCCGTCTGTCCGTTTGTCTGTTATA
AGCTTACCTCAGATTTGGCTCATTAGTTTTTTTTTATTTTTTGTACAGTG
ATGCAAAATAGCAATGGCTTAAATGTCACGGAGCCCAATTTTTGAAGAAA
AAAAATTGGGCAAATTTGGGCCAAAAACCGCCTAAAGATATGGTTTTTTG
TACTTTGCGCAAAATAGCTTCATTAGTTTTACCCTGATTTTTTGCAGAAA
TATCGAGTGCTAGTTGGCCTAAAATGTGGCTGAAGTGATTTTCCTCAGAA
CATTTTTTTCGTCGTAAAATACGGATTTTTTGTTTTTTAGGGAAATTACC
TTTTAATATTTTCCTGTTACAAGCTTATCTCGGGATCGGCTCATTAGCTT
TTTCTGATTTTTAGCACAAAACATACAAAATGGTAATTCCAAAATGTAAC
AGAATCAAAAAAAAAAATTCTTTTTTTTTGGGGGTTGGGGGAGAATTTGG
GCCAAAAATGCCTAAAAATAGGGTTTTTTGGACTTTTTGTGAAATTGCTT
CGTTAGTTTCTTCTAATTTTTGCACAAAGATATAGGACAAGGTTCTCTGT
AATATGGCTTAAGTAGTTTTTTTTTTCAGAAATTTTTTTTACCGTAAAAA
TCGGATTTTCTTATTTAAAGAAATTACCTTTAGTCGTTTTGAGGGGAAAT
GAGCAGTTCTCGCGATTGGCTTGGTATATTTTCCTAATTTTTTGCTCAGT
GATATAAAACCGCGATTGCCTATAAATGGGGTCTTTGGACTTTGGAAATA
GCTTCATTAATTTTTTCTGATTTTTTTTGCATAAACATAGAGGGAAAGGT
TTTCCAGACATTTTTTCTTGCCATAAAATTCCGATTTTCTTATTTAATGA
AACAAAAATACCCTTCAGTAAATTTATGGGGAAATGAATATTTCTCGCGA
TTGGCTTGGTATTATTTTCTGATTTTTAGTTAGTCTGACAATTGTTGCCA
TTTTTTCTATTTTTTTTACTACACTATAGCCTTTAGGTAGGTCTATTCAG
CATGTAGCTTGTTATTTTTGAAATATCTATTTCTCCTGTAATTCTTTTTT
CTTCATTCTTATTCTTCCTGATTCTTCTCACAAAACAAATCATAAAAGTG
ATCGAATTCGAATTTCCGAATCATGGAAAGAAAAATGTTACAATGTAAAT
TTATTGGTTTTACATTGTTTCTTTACTTTCTATGATCGAAAGAAAGAAAG
AAAATGAAAGAAAATTAAGTAAATCTTTTTATTTGTGTCTACAAAAAAGA
AAGAAACAAACAAAGAATATTAAAAAAACAAATTTGTTTCAAGACCCTTC
AACATTGTAATGGCAGAATTAGATAGAAAAATGGATAAATTGAAGTTAGA
AAAAAAGAATCCAATAAACCCTGTGTTGCGCACCATTTTACAAGGTGTTG
CTGATGAGAATTGTCAATTTTCTAAACTTTATGGTATGCCTCATGTTGTT
AAGTTGATATGGGAAAAAGTTTTGGTAGCAATGCATATGCATATTAAATT
TGGAAAGGATGAGAATTATGTGGAAGATTACAACCCACCTCCACCATTCA
TAGCCCAAACTGGCTTTCGGCTTTGATTTGATGTGAAATTCCCTAAACCA
ACTGATATCAATATCAACATGATGCTTTTTGTCATGGCAGAGAAATTTAA
AAACATGCAATTGCCAGATTATCTCAAACCATATTCTGATATGATTGAAA
CTGCGTTCTTTAAAGAAGTTCTCCTCCTTAATTTTGAAATAGTAGAATTT
GGTAAAATCGGTTACCTAACAATTCATGAAAGTTTGGTCGAGGAAGGTAA
ATCTCAGCGGAGACCAGGTTTACATACTGAATCTCCTGGTTATATTTATG
TTAAGAATGGTTTAAGTGATGAAAAGTGTGGAGGAGTTGTGCATTGAAAA
GGGTTCTGGTTATGATGAAATCAATCCTTTTCCTGTTTGGTGGGGAAAGT
TTGGTTACACTGGTAAGGACATCCCTAATGGTGGTATTTATATGCCATCC
AATGTTGATGATTCTTGTGAAGTTTGGGATTGTCAGATTGTTGCTGACAA
TAATGGCGAGGAGTTGATTCGCAAACATGGGGATATTGAGCATTTACGAT
GTTTCTTGCCAGAATCAACACTTTTAAAATCTAATGCTCTCTATTGGATA
ACTGATCGTACACCTCACGAATCTCTGCCATTGAAGAAAGGAATATACAG
ACAGTTTTTTAGGCTTGTAACGCACAGAGTTTCAGTTAGGTATGAAGATC
ATTCAACCAAAAATCCTAATGGAGTTGTCCCTGATCCGAAGATGACTAGG
ATAGTGAAAGGGTCAAAATTTGACGAGGACTATGTCACTGTTGTAGGTTA
AGAAAGGTTATCAACTCTTTGTTTGAAAGCTCAATCTTTATTTAGGGTTA
TCTCTAAATTTTTTTATTACCTAATAAATGAAATTTGTTTTGTATTTTAT
GGCTTTTTTTAGACCAACTAATTCAAGAAAATCATGCCGTTTTAGGGAGT
ATTATACCGGGGATCCGCCA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:543181..547550- >MSTRG.1473.1.p1 ID=MSTRG.1473.1.p1|Name=MSTRG.1473.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1398bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:543181..547550- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTATGAAGATCATTCAACCAAAAATCCTAATGGAGTTGTCCCTGATCCGA
AGATGACTAGGATAGTGAAAGGGTCAAAATTTGACGAGGACTATGTCACT
GTTGTAGGTTAAGAAAACATGCAATTGCCAGATTATCTCAAACCATATTC
TGATATGATTGAAACTGCGTTCTTTAAAGAAGTTCCCCTCATTTTTCACA
TAGAGGAATTGGGTAAAATCGGTTATCTAACAATTCATGAAAGTTTGGTC
GAGGAAGGTAAATCTCAGCGGAGACCAGGTTTACATACTGAATCTCCTGG
TTATATTTATGTTAAGAATGGTTTAAGTGATGAAAAGTGTGAGGAGTTGT
GCATTGAAAAGGGTTCTGGTTATGATGAAATCGTCCCTTTTCCTGTTTCG
TGGGGACAGTTTGGTTACACTAGTATAGATGTCCCTCATGGTGGTATTTA
TATGGCATCCAATGTTGATGATTCTTGTAAAGTTTGGGATTGTCAGATTG
TTACTGACAATAATGGCGAGGAGTTGATTCGCAAACATGGAGATATTGAG
CATTTACGATGTTTCTTGCCAGAATCAACACTTTTAAAATCTAATTATCT
CTATTGGATAACGGATCGTACACCTCACGAATCTCTGCCATTGAAGAAAG
GAACATACAGACAGTTTTTTAGGCTTGTAACACACAGAGTTTCAGTTTGG
TATGAAGATCATTCAACCAAAAATCCTAATGGAGTTGTCCCTGATCCGAA
GATGACTAGGATAGTGAAAGGGTCAAAATTTGACGAGGACTATGTCACTG
TTGTAGGTTAAGAAAACATGCAATTGCCAGATTATCTCAAACCATATTCT
GATATGATTGAAACTGCGTTCTTTAAAGAAGTTCCCCTCATTTTTCACAT
AGAGGAATTGGGTAAAATCGGTTATCTAACAATTCATGAAAGTTTGGTCG
AGGAAGGTAAATCTCAGCGGAGACCAGGTTTACATACTGAATCTCCTGGT
TATATTTATGTTAAGAATGGTTTAAGTGATGAAAAGTGTGAGGAGTTGTG
CATTGAAAAGGGTTCTGGTTATGATGAAATCGTCCCTTTTCCTGTTTCGT
GGGGACAGTTTGGTTACACTAGTATAGATGTCCCTCATGGTGGTATTTAT
ATGGCATCCAATGTTGATGATTCTTGTAAAGTTTGGGATTGTCAGATTGT
TACTGACAATAATGGCGAGGAGTTGATTCGCAAACATGGAGATATTGAGC
ATTTACGATGTTTCTTGCCAGAATCAACACTTTTAAAATCTAATTATCTC
TATTGGATAACGGATCGTACACCTCACGAATCTCTGCCATTGAAGAAAGG
AACATACAGACAGTTTTTTAGGCTTGTAACACACAGAGTTTCAGTTTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000007_pilon | genome | sc0000007_pilon:543181..547550 - |
|
