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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000123_pilon:1012349..1018447- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14673.4.p1 ID=MSTRG.14673.4.p1|Name=MSTRG.14673.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6099bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:1012349..1018447- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGAGATTGATTACAATGTTCAAATGATTTGCTTGTGAATGGCTATTTAAG
GACTGTTTTGTGAGTACACTTTCTTCTTAATGAAGCTTCTTTTCAAGTCT
GTCATCCTTAATGATATCTTTTAATAGATCTTAGTAATGCTATTTAATTT
TATTAGCATGCCATTTATGTTTGATAAGATTTTAGAGTGTGATTAACGGA
AGTGGAAAACTCAATTTCTTATTACAAATTTATTGAAACCAATACCAATC
CTGATGGTTTCATCTGATAGTTTTTTTTAGTTTTTGTGGTCCGTGGATTA
CTATGGACTTCACTCGTATCCTTTCAATTATCTAAACCGATTTTCTTTAT
CTTTGGGATATCAACTTAAAGTTTGGTGCTATGATTCCAGAACAGTGGTG
TGATGTAAGCTTATGTTTTGTTGTCGATTCTATCCTTATTGTTTTTGTTT
TGTTTTGTGGTATAGTTAAGTTTTTTTGAAGTGCTTTCTGACGACTTTCG
GTGTTTGAGTTACTGTGTTTTATCTTAATTACATAGTTTCTAGAGGGATC
AAAACCCCCCTTAAGTGCTAACCCCCCCTTAGGAAATACATTTAAAATTT
CACTCCCCCCCCCCTTAAAAATCTAGTATAAATGAAACGATTGTACAAGA
GTCATAACTAGTTTAGATGATGAAAAAAATTGAAATTTTGCATAATTCAA
GGAAGATCCCCCTAAGGAAGATCCCCTCTTAACTGGCAACCCCCCCCCTT
AGGAAAGTCATACTTTAGCACCCCCCTTGCTTTTGGTTCATCAAAACCCA
AGACCCCCCCCCCCCCCCTAAATGTAAGGGGGTATGTAATTAATCTTAAA
CCTAGAAATTCATTTGGTATCGTTCTAAAACGCCCACCGGTAAAATCAAC
AAAATTTTGTCAATATTAAATTACTTACCTTTTTTCAAAATATTGCATCC
TTTTAGTCTTCCAAAACCTCTTGCGCAATCTTTTTAAATTGACGTCAGAC
CGGATGTGTGCTTTATCCAGTTAGGTTGCTCTTAAAAGATGTTCCTGCGG
AATAATTTCTCAATCCTGGTGTAATAACGTGATTTTGACCCCTTATGATC
TTTTCACATTTCACCTTGAAACAGAAAACCTTTTCATGCTAATGAGGATA
ATTAGTTCGTAGGCGAACTAATGCTTTTTAATGTGATAACGAATTTGTTG
CTCTCTCCTTTCGTGAAAGCAAGTTTTTAATCACCGTTTCCTCCTTACAA
ATCAAGATGAACTTTTCATTATTATTGTGACTGTTTTGTGTGCTGTGTGT
TATTTTTTATTTTTGTTGGTTACGCATTCGCTGAGCTTTGATATTAATAC
AAATAGAGTCGACGCTCTCTAATTCGATTTTCAAGGGATTTTCACCGAAC
AAGGGAGCATATTGAATAGTAAGTAGATCATCGTTTGGGAGAGTTTCTTG
TTGCCGGTGACTTTCAATAATATCGAACAGTAGCACGTCGAATTAGAGAG
CGTCAACTGTAGATTTAAAAAACTGTGCATTTCCAACATCAAAGCTATTG
AAGCCGTATTCGGGGGCGTTCAGTGCCTCCATATAGATTATGCTATACTT
AGTTTTAGACTCGACAGTTTGTAAAATAATGCCATCAGAGGTTTGAAATT
TGATAATGCGATGATGTTTTGAAAAAATTCAATCTGTGAAGGTATTTTAA
TTTGTGTTTTGTTCATCTCTTGATACTTTTGACCTTCTTTTATAATATGA
CTTAAGTGGATTTCGTCTCTTCGATGTTTTATGATAGTGTGGTATTAAAA
AACATTTTTAGCAAATTTATTTGGAGTTGCTTTTGATTTGAATGCATCAG
AAGATCAAAGATGTATATGCATCAAAGGTCATATTTCGAGAATGTTATTG
CATGGTATTAAAAGAGGATCGGAATAAACTTGTTCTAAGGGGCATATTGT
GTATTTGTTTTGTATAGACGTCGTTGACTTTTGATGTGTGTTGTGTGGCA
TTTTTAAGATCACGGATAGAAATACCATCAGCCTCGCGCTTATCTTGCGT
AAAGCGTATGGATTACAGCAATGGATTTTGAATTTCATGTATCGGGTCTG
TTACGGAAAGATTTTCGTCTTGCTATTCAAGTACGTCTTTTTAAATTGTT
TGCCGATTTTCTAACCCTTTAGCCCTTATTTACTGGCTTTACTTAGGCCT
TCCCTCTGACAAGAAAATACATGTCTTGTTGTCTACGGGGGCACCCTGGA
GACTTTAAACGTGGTAGATTTGTTTAACATTGGGATGGGCTTTTTAACAA
AACCATATTTGTCGAAAATTTCGCCTTATATTTAAACTGTATAGGAATAA
ACAGGTAGTTGAGATTGAAGCTAATTTAGAATCTACTACTACAAAGAAAA
GATTGAGAGTTTTTGGTCATAAATTAAGTACGGGATATATTGGTTGACAC
AGCCAGATAGATATTTACTTTATCTCACTTTCAAGAAATCCATATACAAA
TTCAATAAAATTTTCATGGATGCGACTCGAGTCAGGAACTCATTTACCAA
GTTGCTATAGATTTTCTTTCTTGTAAGGTTGCATCAATAAGGAAAAAAAT
ATCCAACACTCGTGTTTACTTTGCATGATGGTATGTAACTATCTGTTAAG
AGTAATTTATTCAGGATAGACAGTCGAACGAGAAGTTAACTTGACTCCCG
AACGGTAAGATCTCCCGATTAGGTTTTGAAAATATCTCGGCACCCAAAAA
GGAAGATAGAGAATTCTTCCTAATTCGGAAGATCTGCCGGTTTAGGAAGG
TTTGATTTCTTCAAAACAGAAACGGGAAGTAAGATAGAAAAATGTAAACA
ATGAAACAGACTGCCCGATTCAGAAGAAAATCCTTCTAAAATTCAGAAAA
TCGTCGCCTCAACATGAAGCACTTCATTTGTCGTTTTTCAATCAAACAGT
TAGTATGAACAATTTCAGGTGAAAAAATGTTTTAGGTATTTATTCTTTCG
TTACCTTTCGTCAAATTTTATCCTCTGATTTTTGATTTTCGTAGCATGGG
ATTCTTATAAAGTAGACTCTTATAAGAAAAATGAATATACTCATATTGTG
CACCAGCCCTTGTTTACTTCGTAAGAACTAATGACCGAAAGGTATATTAT
TGATTTGGGACATAATCAGTGTGAGAAACCAAAAAAAGAAACCATGAGAC
ACGCACTTTTTTTCTTGTGTTGGTGGGATGGAGCATGTTGCATTGCACCA
ACGCGAAAAAAACTTCTCGTGTCTCCAAGCCTTAAGTAAGATGAAATTTT
TTTTTTAAATAAAGGAAAAGATACTAAAGTCGAACTCAGTGCGGCGTGCA
CGTTCGACTATTTCAAATGTAATTGATAATTGAACTTTTAATGACTGGTT
GTCTACTCTCACTCCGTTACTCACGTAATTTTTTAGTTTCTATTGCCAAT
CGATTTGGAAAAGATGATCCGCCCGATGTATCACATGAAGTTAAGACTAA
TGATCTCTTCTTTGATTGGCTTCATCTATCAGTGATTTTTATGGTGATCC
TGAATTCAAATTAGTCCAGACCAGAGCCTCCCATACAAATGCTTCTTAAG
ACCTGCCCTCCCTTTGTTGATTAGCGTCTGATATGTATCAAATGGTATTA
AAGTCAGAACTTATTTCAAGCGCTCAATTAGCAGTATTTTTATCAAAGTT
GTGACTTTATAAATTAGCATTTTGAGAGAGGTACTAGTTTTTAATAGTGG
TATGGTATTTTAAAATGACTTTATTAATTATCATTTTGAGAGAGTTTTCT
AGCGATATCGAAACTGAATTCAAGTGGCTTAAACAAACTGTGGTTATGGG
AAGTGTCATTTCAATGTACATTATACTGTTCTTAAAAAGGAACTCTTTGT
TGTTAGAAACTAAAAATATCCGAAACTCGTGGTAGCAAACTCATCACTTA
GTTATCTTATTTAATGTGAAAATTACTTATAATCAGTTTCAAATGATCTC
TTATTAATTAACAAGAGTTGATATTTTTTTTTGCTTGTTGTCATGTTATG
GTTTATTCAAGATGAAGTCTTATGTTGACCAGTTCGTAAAAATGAGGGCA
TGACTATGTATAATTTTTCAAACGGAATTCTTTAAAGATGACTAATTTGT
TGTGATTTGATAATCAGCGTTTCGTATACACACCCCTGTCTCATTAGAGA
TTTAAAGATGCTGAGTTAAATCTCTGTGCTGGATATGGAAATTCTACTGC
TGGGATAGACTGGAGTCGTTTATAATGCGTGTAATACAGTAGTATAGGCG
TTATATGATAATACGATTATTGTTACTGGATTTAGTTTGACTAAAATTGT
TCCTCTATTACTTTTTGCTTTATTTCTACTATGTCTGAATTAGTCGTCTA
GCTTTCTAGACTACTGCTGGGATCGAGTAGGATTCAAAAATCTTTTGCAT
GATTTTACGATCGATTACTTACCCGTTGACCGACCTGAACTTGTCGGCCT
CCAAATGCGATTTTCCACATTATATTATATTTCAATATAGTTTTGAGCGA
CCGTAGTGCAGTGGTAGAGCATCCGGCTATGGGTCATACCAAAGATTCCC
AAAATGGTACTTGATGCTTCTTTGCTTGATGCCTCTCTGCTTGATGCTCA
GCAATTAGGAGAAGGATCAAGGGTACGTGGAGATCCAGGGAGAAATAGTG
GCGCCCTCCCCTACCTTCGGGTAGATAGCTATCAAAAGAGGAGCCTTCGG
GTCACCTCCGACTGCGGTCGCAGACTTCCTTACTTCAATATAGTTTTACT
TTTTCATTGTTCATTTTCAGTGATGGAAAAAACAACAGGACATATCATTT
CAACGTTGCTTTGTATATTTTTTTCCTTATTGGATAATTACACAGACATT
GCACAGAGTGTGATCCACTTCTGCAACCACAAGAGATGGTATGGTCATCT
CACCATGGCGCTTGTTGTGGCGCCCGCCCTCATCAATAGTGTGTATACCG
CCTGTATGTTTTACTGTAATAAAGGACGGATTGTACATAACGTTAAGTTC
CCGTATCCAAAAGTTGTTTACGTGTTATGTTTTCTACTTCATGGTCATTA
CGCACGTCAAATCATTTGGATATACGCACTACGTACGAAAGCGCTTAACG
AAAGACTGGCCAAAGAGCTTGTTTCAACTGGACGAGATATGAGTTTTTAT
TTGGAGATATTTCTTGAATCGATGCCTCAAATGATGCTACAGTTATATAT
TATGACAGTCATTTACGGAGAGTTGCGTTTAATGGGATGCATTACGTTGT
TTACGTCTTTCGTTGCGACGTCTTGGGGATTATTATTACTTTATAACGAC
GGCAAAGAACGATTTTTCGCTTTTTTGATCAACGGATTCTGGCTTGCATC
ACGTGTTTTATCACTAGCCGTATTTTCGAGTATCCGACGATTTGCTATAT
TCGCTATTTTGTCTGTGCATTTCCTATTCGTCCTTCCGTTATGGTTTTAC
GAAAGCAAGAGACATCCGTTAGCGGAAGAACGGCTAACACGACGCGGGTT
TTGTCATACGTTTGTTTCGGACTTCTTTTTCGCTATCTTGTACGCCGTAT
GTAACACCGTCACGCCGATGATCACACGTTATTACTTCCCGTTGTCGTTC
ATGTTTATTATAGAGAACGTCGTATGTGCCGTAACCGTTTATTACTTCGG
TGAAGTCAAACGTATCGTCAATGGTGAAAAGGCTTATATCAAATTCAAGA
ACTGGCCCTACGCGTCAACTTTCATGGTAGGATTTTATACGGTCACGATA
ATTGCGTTTTTATTAACACTTACAGTTCAATTAATAAAATGTTCGAATCG
AATTGATAAAACATTTATGCAATCGAACATTCGAAAGATCATCAGTAAAA
TACGACCGATTGAAGCGATTAAGAAATCAGTTTTCAGAAGACGTGGGACG
AATAACGAAGCCGGCTTGAGAACAATCAGATCTGAAAGTTGAAAATGGAT
TTTTCTGTATATATTACGAAAGTATACCTATTTTATGGTCTGACTAGATT
GTGGTAAAATAAAAATTGTAAATATGATCTTTGTTTATAAATAAATAAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000123_pilon:1012349..1018447- >MSTRG.14673.4.p1 ID=MSTRG.14673.4.p1|Name=MSTRG.14673.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1170bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:1012349..1018447- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAAAACAACAGGACATATCATTTCAACGTTGCTTTGTATATTTTT
TTCCTTATTGGATAATTACACAGACATTGCACAGAGTGTGATCCACTTCT
GCAACCACAAGAGATGGTATGGTCATCTCACCATGGCGCTTGTTGTGGCG
CCCGCCCTCATCAATAGTGTGTATACCGCCTGTATGTTTTACTGTAATAA
AGGACGGATTGTACATAACGTTAAGTTCCCGTATCCAAAAGTTGTTTACG
TGTTATGTTTTCTACTTCATGGTCATTACGCACGTCAAATCATTTGGATA
TACGCACTACGTACGAAAGCGCTTAACGAAAGACTGGCCAAAGAGCTTGT
TTCAACTGGACGAGATATGAGTTTTTATTTGGAGATATTTCTTGAATCGA
TGCCTCAAATGATGCTACAGTTATATATTATGACAGTCATTTACGGAGAG
TTGCGTTTAATGGGATGCATTACGTTGTTTACGTCTTTCGTTGCGACGTC
TTGGGGATTATTATTACTTTATAACGACGGCAAAGAACGATTTTTCGCTT
TTTTGATCAACGGATTCTGGCTTGCATCACGTGTTTTATCACTAGCCGTA
TTTTCGAGTATCCGACGATTTGCTATATTCGCTATTTTGTCTGTGCATTT
CCTATTCGTCCTTCCGTTATGGTTTTACGAAAGCAAGAGACATCCGTTAG
CGGAAGAACGGCTAACACGACGCGGGTTTTGTCATACGTTTGTTTCGGAC
TTCTTTTTCGCTATCTTGTACGCCGTATGTAACACCGTCACGCCGATGAT
CACACGTTATTACTTCCCGTTGTCGTTCATGTTTATTATAGAGAACGTCG
TATGTGCCGTAACCGTTTATTACTTCGGTGAAGTCAAACGTATCGTCAAT
GGTGAAAAGGCTTATATCAAATTCAAGAACTGGCCCTACGCGTCAACTTT
CATGGTAGGATTTTATACGGTCACGATAATTGCGTTTTTATTAACACTTA
CAGTTCAATTAATAAAATGTTCGAATCGAATTGATAAAACATTTATGCAA
TCGAACATTCGAAAGATCATCAGTAAAATACGACCGATTGAAGCGATTAA
GAAATCAGTTTTCAGAAGACGTGGGACGAATAACGAAGCCGGCTTGAGAA
CAATCAGATCTGAAAGTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000123_pilon | genome | sc0000123_pilon:1012349..1018447 - |
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