MSTRG.14673.2.p3 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14673.2.p3
Unique NameMSTRG.14673.2.p3
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000123_pilon:1012292..1029485-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14673.2.p3 ID=MSTRG.14673.2.p3|Name=MSTRG.14673.2.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17194bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:1012292..1029485- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCTTGTGTTGGTGGGATGGAGCATGTTGCATTGCACCAACGCGAAAAAAA CTTCTCGTGTCTCCAAGCCTTAAGTAAGATGAAATTTTTTTTTTAAATAA AGGAAAAGATACTAAAGTCGAACTCAGTGCGGCGTGCACGTTCGACTATT TCAAATGTAATTGATAATTGAACTTTTAATGACTGGTTGTCTACTCTCAC TCCGTTACTCACGTAATTTTTTAGTTTCTATTGCCAATCGATTTGGAAAA GATGATCCGCCCGATGTATCACATGAAGTTAAGACTAATGATCTCTTCTT TGATTGGCTTCATCTATCAGTGATTTTTATGGTGATCCTGAATTCAAATT AGTCCAGACCAGAGCCTCCCATACAAATGCTTCTTAAGACCTGCCCTCCC TTTGTTGATTAGCGTCTGATATGTATCAAATGGTATTAAAGTCAGAACTT ATTTCAAGCGCTCAATTAGCAGTATTTTTATCAAAGTTGTGACTTTATAA ATTAGCATTTTGAGAGAGGTACTAGTTTTTAATAGTGGTATGGTATTTTA AAATGACTTTATTAATTATCATTTTGAGAGAGTTTTCTAGCGATATCGAA ACTGAATTCAAGTGGCTTAAACAAACTGTGGTTATGGGAAGTGTCATTTC AATGTACATTATACTGTTCTTAAAAAGGAACTCTTTGTTGTTAGAAACTA AAAATATCCGAAACTCGTGGTAGCAAACTCATCACTTAGTTATCTTATTT AATGTGAAAATTACTTATAATCAGTTTCAAATGATCTCTTATTAATTAAC AAGAGTTGATATTTTTTTTTGCTTGTTGTCATGTTATGGTTTATTCAAGA TGAAGTCTTATGTTGACCAGTTCGTAAAAATGAGGGCATGACTATGTATA ATTTTTCAAACGGAATTCTTTAAAGATGACTAATTTGTTGTGATTTGATA 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CATTTGGATATACGCACTACGTACGAAAGCGCTTAACGAAAGACTGGCCA AAGAGCTTGTTTCAACTGGACGAGATATGAGTTTTTATTTGGAGATATTT CTTGAATCGATGCCTCAAATGATGCTACAGTTATATATTATGACAGTCAT TTACGGAGAGTTGCGTTTAATGGGATGCATTACGTTGTTTACGTCTTTCG TTGCGACGTCTTGGGGATTATTATTACTTTATAACGACGGCAAAGAACGA TTTTTCGCTTTTTTGATCAACGGATTCTGGCTTGCATCACGTGTTTTATC ACTAGCCGTATTTTCGAGTATCCGACGATTTGCTATATTCGCTATTTTGT CTGTGCATTTCCTATTCGTCCTTCCGTTATGGTTTTACGAAAGCAAGAGA CATCCGTTAGCGGAAGAACGGCTAACACGACGCGGGTTTTGTCATACGTT TGTTTCGGACTTCTTTTTCGCTATCTTGTACGCCGTATGTAACACCGTCA CGCCGATGATCACACGTTATTACTTCCCGTTGTCGTTCATGTTTATTATA GAGAACGTCGTATGTGCCGTAACCGTTTATTACTTCGGTGAAGTCAAACG TATCGTCAATGGTGAAAAGGCTTATATCAAATTCAAGAACTGGCCCTACG CGTCAACTTTCATGGTAGGATTTTATACGGTCACGATAATTGCGTTTTTA TTAACACTTACAGTTCAATTAATAAAATGTTCGAATCGAATTGATAAAAC ATTTATGCAATCGAACATTCGAAAGATCATCAGTAAAATACGACCGATTG AAGCGATTAAGAAATCAGTTTTCAGAAGACGTGGGACGAATAACGAAGCC GGCTTGAGAACAATCAGATCTGAAAGTTGAAAATGGATTTTTCTGTATAT ATTACGAAAGTATACCTATTTTATGGTCTGACTAGATTGTGGTAAAATAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000123_pilon:1012292..1029485-

>MSTRG.14673.2.p3 ID=MSTRG.14673.2.p3|Name=MSTRG.14673.2.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2052bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:1012292..1029485- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAAAAGAGAAATAAACGCGGGTGGTCATACCATCAGCGCCCAAGAGAAA
AGAATCCTCGTGCAAGCTTACAAATTATTTGGCTGCTCCTCGAAAATGAA
CCATGAATTCTACGCTATGATCAAAGATCAATTATCACATTGGGCCATAC
CAAAACCAATTCATGACGTGATATGGCGTCACAACTTCACCATCTTCCAT
ACAAAGTTCAAGGAAGCCTCTGTATCAAACAAAAGTCATATCATGACGAC
AGACGCAGCTGTTGTTAAGGAAACCAACAAAAATGGCGTCGATTTTTCGA
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GAGGAAAAGAAGGAGGAGACAAAACTTATGACGTCATCATTGAGAAGGGA
ATATGCTGCATGGCAAAGAGTGTTGAACGAATTCTGCCATCCGCAGATTC
TTCAAGAGTACGGTCAATTTGAGGATGATACGAGCAGGATGAAGTTTCTC
GATTGCATGAGAGCAAAAAGAGAAATAAACGCGGGTGGTCATACCATCAG
CGCCCAAGAGAAAAGAATCCTCGTGCAAGCTTACAAATTATTTGGCTGCT
CCTCGAAAATGAACCATGAATTCTACGCTATGATCAAAGATCAATTATCA
CATTGGGCCATACCAAAACCAATTCATGACGTGATATGGCGTCACAACTT
CACCATCTTCCATACAAAGTTCAAGGAAGCCTCTGTATCAAACAAAAGTC
ATATCATGACGACAGACGCAGCTGTTGTTAAGGAAACCAACAAAAATGGC
GTCGATTTTTCGAAACTGACTAAAGTTCGTTGATTAACCAGATGACCACT
CACTCATTAGATGGAGGAAAAGAAGGAGGAGACAAAACTTATGACGTCAT
CATTGAGAAGGGAATATGCTGCATGGCAAAGAGTGTTGAACGAATTCTGC
CATCCGCAGATTCTTCAAGAGTACGGTCAATTTGAGGATGATACGAGCAG
GATGAAGTTTCTCGATTGCATGAGAGCAAAAAGAGAAATAAACGCGGGTG
GTCATACCATCAGCGCCCAAGAGAAAAGAATCCTCGTGCAAGCTTACAAA
TTATTTGGCTGCTCCTCGAAAATGAACCATGAATTCTACGCTATGATCAA
AGATCAATTATCACATTGGGCCATACCAAAACCAATTCATGACGTGATAT
GGCGTCACAACTTCACCATCTTCCATACAAAGTTCAAGGAAGCCTCTGTA
TCAAACAAAAGTCATATCATGACGACAGACGCAGCTGTTGTTAAGGAAAC
CAACAAAAATGGCGTCGATTTTTCGAAACTGACTAAAGTTCGTTGATTAA
CCAGATGACCACTCACTCATTAGATGGAGGAAAAGAAGGAGGAGACAAAA
CTTATGACGTCATCATTGAGAAGGGAATATGCTGCATGGCAAAGAGTGTT
GAACGAATTCTGCCATCCGCAGATTCTTCAAGAGTACGGTCAATTTGAGG
ATGATACGAGCAGGATGAAGTTTCTCGATTGCATGAGAGCAAAAAGAGAA
ATAAACGCGGGTGGTCATACCATCAGCGCCCAAGAGAAAAGAATCCTCGT
GCAAGCTTACAAATTATTTGGCTGCTCCTCGAAAATGAACCATGAATTCT
ACGCTATGATCAAAGATCAATTATCACATTGGGCCATACCAAAACCAATT
CATGACGTGATATGGCGTCACAACTTCACCATCTTCCATACAAAGTTCAA
GGAAGCCTCTGTATCAAACAAAAGTCATATCATGACGACAGACGCAGCTG
TTGTTAAGGAAACCAACAAAAATGGCGTCGATTTTTCGAAACTGACTAAA
GTTCGTTGATTAACCAGATGACCACTCACTCATTAGATGGAGGAAAAGAA
GGAGGAGACAAAACTTATGACGTCATCATTGAGAAGGGAATATGCTGCAT
GGCAAAGAGTGTTGAACGAATTCTGCCATCCGCAGATTCTTCAAGAGTAC
GGTCAATTTGAGGATGATACGAGCAGGATGAAGTTTCTCGATTGCATGAG
AG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14673MSTRG.14673Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14673.2.p3MSTRG.14673.2.p3-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14673.2.p3.exon6MSTRG.14673.2.p3.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14673.2.p3.exon5MSTRG.14673.2.p3.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14673.2.p3.exon4MSTRG.14673.2.p3.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14673.2.p3.exon3MSTRG.14673.2.p3.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14673.2.p3.exon2MSTRG.14673.2.p3.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14673.2.p3.exon1MSTRG.14673.2.p3.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000123_pilongenomesc0000123_pilon:1012292..1029485 -