MSTRG.1467.7.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1467.7.p1
Unique NameMSTRG.1467.7.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000007_pilon:493969..560558-

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1467.7.p1 ID=MSTRG.1467.7.p1|Name=MSTRG.1467.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=66590bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:493969..560558- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACACTATATTAGCTTCAAGTACATTGGACGAGACAAGTTATATATCAAA AACAAAATTATCTGAATCAGAGGATCCATACCATAGACACAAATTCAACC AACAAATCAGTGATGAGTTGGACAGCGATAGGCCAATCCCTGATACGCGC CCGCCACAGTAAAGTTAACAATTTATTTTTTTACTAAATCGGAAATCATT TATTCAAAAAATATGAAATGCTTGGGGGAAGGAATGTGTGTTTTTTGGCT ACAGAAGGGAAGTCTGCTTTTGAAACTGGCAACTTGAGAACCTTGCATTA CATATTTATAACTCTTACATTTTCAAAGATTAAATGACAGATTACCAACT TTCTGCCTGTCCTTACTTGGTTTCTTTACTAACCTAACTTCTTATGTTTT GTATCTAGATGTTTAGAGGAGAGTTATGACAAGCGGGTGTCCAGCACTTC GATTATCATCACTTTTCATAATGAAGCCCGGTCAGCTTTGCTACGGACTA TTAAAAGGTAAATCAAAATACAGTTGTACAGGCAATATGAATACAGGTGT TTTGCTTACAGTTGCCTTTTTCTCTATTTTTATCCTTACACATTGCTCAA ATTTTGCGGCTTCGTGCTAAGGATCGTTTCTCATGATGATATTCTTACAT TTTGATATTTTTAGATTTGTTGTTCTTATACAGTATACGGTGCGGCCTCC GTAATGTTAATGAGCGTAATATCTTTTCTTGATTATCATACATTATTATA TCTTATACTTTCAGCGTACTGGATAGAACACCACCTCGCCTACTAATGGA GATTATCCTGGTTGATGATTTTAGTGCCAATGGTAAGTGAATGCAAAATT GCGTTCGGAACAGCCAACTAAAAACTTTCTGGTGCAATTGATGTTTCCAT CTAGCTTATTTTTCAATTTTTAACCGTTTCTTCCATAGAAAAAGATGGTG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:493969..560558-

>MSTRG.1467.7.p1 ID=MSTRG.1467.7.p1|Name=MSTRG.1467.7.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6240bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:493969..560558- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTTATTTGGGAACCATTACTTGAAAAAGAAATGAAAGAACAAAAAGCTG
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TTTAGTGCCAATGATGTTTAGAGGAGAGTTATGACAAGCGGGTGTCCAGC
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ACAAATTCAACCAACAAATCAGTGATGAGTTGGACAGCGATAGGCCAATC
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TGTTCAGAAACAATGGTTCAATCAACTCGGACAATACGACCCTCTGCTAG
AAATATGGGGTGATTTGACTGGAACATGCATTTTATTTGGGAACCATTAC
TTGAAAAAGAAATGAAAGAACAAAAAGCTGATTCAACTCACCCAATCAGG
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TTGGAATATAAAGCCTCTTCAAATTACTTGAAAGGAGGGTTGATTCGTTC
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GTTGAACAGAAAAAGATGGTGCTTTGTTGAAAGACCTACCCAAAATTGTT
TTGATGCGGAACGACAAACGAGAAGCGTACTGGATAGAACACCACCTCGC
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TCATAATGAAGCCCGGTCAGCTTTGCTACGGACTATTAAAAGAACACTAT
ATTAGCTTCAAGTACATTGGACGAGACAAGTTATATATCAAAAACAAAAT
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AGTGATGAGTTGGACAGCGATAGGCCAATCCCTGATACGCGCCCGCCACA
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GGAACATGCATTTTATTTGGGAACCATTACTTGAAAAAGAAATGAAAGAA
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GGTTGATGATTTTAGTGCCAATGATGTTTAGAGGAGAGTTATGACAAGCG
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AGAGGATCCATACCATAGACACAAATTCAACCAACAAATCAGTGATGAGT
TGGACAGCGATAGGCCAATCCCTGATACGCGCCCGCCACA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467MSTRG.1467Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467.7.p1MSTRG.1467.7.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467.7.p1.exon8MSTRG.1467.7.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1467.7.p1.exon7MSTRG.1467.7.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1467.7.p1.exon6MSTRG.1467.7.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1467.7.p1.exon5MSTRG.1467.7.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1467.7.p1.exon4MSTRG.1467.7.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1467.7.p1.exon3MSTRG.1467.7.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1467.7.p1.exon2MSTRG.1467.7.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1467.7.p1.exon1MSTRG.1467.7.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007_pilongenomesc0000007_pilon:493969..560558 -