MSTRG.1467.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1467.3.p1
Unique NameMSTRG.1467.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000007_pilon:488491..560558-

Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1467.3.p1 ID=MSTRG.1467.3.p1|Name=MSTRG.1467.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=72068bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:488491..560558- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACACTATATTAGCTTCAAGTACATTGGACGAGACAAGTTATATATCAAA AACAAAATTATCTGAATCAGAGGATCCATACCATAGACACAAATTCAACC AACAAATCAGTGATGAGTTGGACAGCGATAGGCCAATCCCTGATACGCGC CCGCCACAGTAAAGTTAACAATTTATTTTTTTACTAAATCGGAAATCATT TATTCAAAAAATATGAAATGCTTGGGGGAAGGAATGTGTGTTTTTTGGCT ACAGAAGGGAAGTCTGCTTTTGAAACTGGCAACTTGAGAACCTTGCATTA CATATTTATAACTCTTACATTTTCAAAGATTAAATGACAGATTACCAACT TTCTGCCTGTCCTTACTTGGTTTCTTTACTAACCTAACTTCTTATGTTTT GTATCTAGATGTTTAGAGGAGAGTTATGACAAGCGGGTGTCCAGCACTTC GATTATCATCACTTTTCATAATGAAGCCCGGTCAGCTTTGCTACGGACTA TTAAAAGGTAAATCAAAATACAGTTGTACAGGCAATATGAATACAGGTGT TTTGCTTACAGTTGCCTTTTTCTCTATTTTTATCCTTACACATTGCTCAA ATTTTGCGGCTTCGTGCTAAGGATCGTTTCTCATGATGATATTCTTACAT TTTGATATTTTTAGATTTGTTGTTCTTATACAGTATACGGTGCGGCCTCC GTAATGTTAATGAGCGTAATATCTTTTCTTGATTATCATACATTATTATA TCTTATACTTTCAGCGTACTGGATAGAACACCACCTCGCCTACTAATGGA GATTATCCTGGTTGATGATTTTAGTGCCAATGGTAAGTGAATGCAAAATT GCGTTCGGAACAGCCAACTAAAAACTTTCTGGTGCAATTGATGTTTCCAT CTAGCTTATTTTTCAATTTTTAACCGTTTCTTCCATAGAAAAAGATGGTG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:488491..560558-

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GAACGAACCCTTACCGAGAAATTTCATTCAAAACCTGGATGTGTGGTGGA
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GACAGCGATAGGCCAATCCCTGATACGCGCCCGCCACACATTGGAAGTTT
ATGATTCGTGAACGGTTACGTCATCAAGCAACAAATCTATGCATCGAAAG
GAAATCGGATGGCTCGTTACTCTTAGCAAGATGTGAAAATTTCAGTCCAC
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GACCGTTATAAAAGAATATTCTATCGAGCACGTGGTGGAAATATGAACGA
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TTATGAGTTTCCTCTTGGTAATGGACACACGTACCTTATTACACCAGTAA
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AGCTTTGCTACGGACTATTAAAAGAACACTATATTAGCTTCAAGTACATT
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GATAGGCCAATCCCTGATACGCGCCCGCCACACATTGGAAGTTTATGATT
CGTGAACGGTTACGTCATCAAGCAACAAATCTATGCATCGAAAGGAAATC
GGATGGCTCGTTACTCTTAGCAAGATGTGAAAATTTCAGTCCACAACAGA
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ATCCAGAGTTGAGGAACGTGCGACGTGTTGCCGAAGTGTGGATGGACCGT
TATAAAAGAATATTCTATCGAGCACGTGGTGGAAATATGAACGAACCCTT
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CTTTTACTACCAAATTTCTCTTCTAACAATGGGTAATGTCAGTAACAGGA
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GTATTCCCAAGGATAAGAAAATGAATCAAAGAGCGACGTTTAATCAGAGA
AAGACTGAAATGTCGTCCTTTCGATTGGTATCTGATGGAAGTCTATCCAG
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TGCTCACGAGTTGGTCATATCTTTCGTAAATCTCATCCTTATGAGTTTCC
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TTGCTAGAAATATGGGGTGCGGAAAACTTCGGATTTGACTGGAACATGCA
TTTTATTTGGGAACCATTACTTGAAAAAGAAATGAAAGAACAAAAAGCTG
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AAAAGAAATGAAAGAACAAAAAGCTGATTCAACTCACCCAATCAGGATCC
ACTTGCGATAGCTTCACCGGTGATTGACATCATCAAAACGGATACGTTGG
AATATAAAGCCTCTTCAAATTACTTGAAAGGAGGGTTGATTCGTTCACGT
TTGAAAGGTGTGAGCGTCGCCAAGTCATCCATCTTAACATTCCTTGATAG
CCACTGTGAAGTGAACGTCGGTTGGATTGAACCATTGCTAGCAAAAGTTG
AACAGAAAAAGATGGTGCTTTGTTGAAAGACCTACCCAAAATTGTTTTGA
TGCGGAACGACAAACGAGAAGCGTACTGGATAGAACACCACCTCGCCTAC
TAATGGAGATTATCCTGGTTGATGATTTTAGTGCCAATGATGTTTAGAGG
AGAGTTATGACAAGCGGGTGTCCAGCACTTCGATTATCATCACTTTTCAT
AATGAAGCCCGGTCAGCTTTGCTACGGACTATTAAAAGAACACTATATTA
GCTTCAAGTACATTGGACGAGACAAGTTATATATCAAAAACAAAATTATC
TGAATCAGAGGATCCATACCATAGACACAAATTCAACCAACAAATCAGTG
ATGAGTTGGACAGCGATAGGCCAATCCCTGATACGCGCCCGCCACACATT
GGAAGTTTATGATTCGTGAACGGTTACGTCATCAAGCAACAAATCTATGC
ATCGAAAGGAAATCGGATGGCTCGTTACTCTTAGCAAGATGTGAAAATTT
CAGTCCACAACAGAAATGGTCTTTTACTACCAAATTTCTCTTCTAACAAT
GGGTAATGTCAGTAACAGGAATGATTCAAAACGAAAAAGACAAATGTTTA
TATGCTTCAAAGAAGAGTAAAAGAATATCTCTCAAAGATTGTAACAACTC
CGATTTTAATCAGGGTTCCAAATGTTGACGAGTTAGCTTATGGGGAGATC
AAGCAAATTTATAAGGGACAATCGTATTGTTTATCTGAGTCTAAAACTTC
AAAGGTTTTAGCTGTAAAATGTATTCCCAAGGATAAGAAAATGAATCAAA
GAGCGACGTTTAATCAGAGAAAGACTGAAATGTCGTCCTTTCGATTGGTA
TCTGATGGAAGTCTATCCAGAGTTGAGGAACGTGCGACGTGTTGCCGAAG
TGTGGATGGACCGTTATAAAAGAATATTCTATCGAGCACGTGGTGGAAAT
ATGAACGAACCCTTACCGAGAAATTTCATTCAAAACCTGGATGTGTGGTG
GAAGTTTGAAAATCATCCCTTGCTCACGAGTTGGTCATATCTTTCGTAAA
TCTCATCCTTATGAGTTTCCTCTTGGTAATGGACACACGTACCTTATTAC
ACCAGTAATTGCAGGTGGTGTATTTGCTGTTCAGAAACAATGGTTCAATC
AACTTGGACAATACGATTCTTTGCTAGAAATATGGGGTGCGGAAAACTTC
GGATTTGACTGGAACATGCATTTTATTTGGGAACCATTACTTGAAAAAGA
AATGAAAGAACAAAAAGCTGATTCAACTCACCCAATCAGGATCCACTTGC
GATAGCTTCACCGGTGATTGACATCATCAAAACGGATACGTTGGAATATA
AAGCCTCTTCAAATTACTTGAAAGGAGGGTTGATTCGTTCACGTTTGAAA
GGTGTGAGCGTCGCCAAGTCATCCATCTTAACATTCCTTGATAGCCACTG
TGAAGTGAACGTCGGTTGGATTGAACCATTGCTAGCAAAAGTTGAACAGA
AAAAGATGGTGCTTTGTTGAAAGACCTACCCAAAATTGTTTTGATGCGGA
ACGACAAACGAGAAGCGTACTGGATAGAACACCACCTCGCCTACTAATGG
AGATTATCCTGGTTGATGATTTTAGTGCCAATGATGTTTAGAGGAGAGTT
ATGACAAGCGGGTGTCCAGCACTTCGATTATCATCACTTTTCATAATGAA
GCCCGGTCAGCTTTGCTACGGACTATTAAAAGAACACTATATTAGCTTCA
AGTACATTGGACGAGACAAGTTATATATCAAAAACAAAATTATCTGAATC
AGAGGATCCATACCATAGACACAAATTCAACCAACAAATCAGTGATGAGT
TGGACAGCGATAGGCCAATCCCTGATACGCGCCCGCCACACATTGGAAGT
TTATGATTCGTGAACGGTTACGTCATCAAGCAACAAATCTATGCATCGAA
AGGAAATCGGATGGCTCGTTACTCTTAGCAAGATGTGAAAATTTCAGTCC
ACAACAGAAATGGTCTTTTACTACCAAATTTCTCTTCTAACAATGGGTAA
TGTCAGTAACAGGAATGATTCAAAACGAAAAAGACAAATGTTTATATGCT
TCAAAGAAGAGTAAAAGAATATCTCTCAAAGATTGTAACAACTCCGATTT
TAATCAGGGTTCCAAATGTTGACGAGTTAGCTTATGGGGAGATCAAGCAA
ATTTATAAGGGACAATCGTATTGTTTATCTGAGTCTAAAACTTCAAAGGT
TTTAGCTGTAAAATGTATTCCCAAGGATAAGAAAATGAATCAAAGAGCGA
CGTTTAATCAGAGAAAGACTGAAATGTCGTCCTTTCGATTGGTATCTGAT
GGAAGTCTATCCAGAGTTGAGGAACGTGCGACGTGTTGCCGAAGTGTGGA
TGGACCGTTATAAAAGAATATTCTATCGAGCACGTGGTGGAAATATGAAC
GAACCCTTACCGAGAAATTTCATTCAAAACCTGGATGTGTGGTGGAAGTT
TGAAAATCATCCCTTGCTCACGAGTTGGTCATATCTTTCGTAAATCTCAT
CCTTATGAGTTTCCTCTTGGTAATGGACACACGTACCTTATTACACCAGT
AATTGCAGGTGGTGTATTTGCTGTTCAGAAACAATGGTTCAATCAACTTG
GACAATACGATTCTTTGCTAGAAATATGGGGTGCGGAAAACTTCGGATTT
GACTGGAACATGCATTTTATTTGGGAACCATTACTTGAAAAAGAAATGAA
AGAACAAAAAGCTGATTCAACTCACCCAATCAGGATCCACTTGCGATAGC
TTCACCGGTGATTGACATCATCAAAACGGATACGTTGGAATATAAAGCCT
CTTCAAATTACTTGAAAGGAGGGTTGATTCGTTCACGTTTGAAAGGTGTG
AGCGTCGCCAAGTCATCCATCTTAACATTCCTTGATAGCCACTGTGAAGT
GAACGTCGGTTGGATTGAACCATTGCTAGCAAAAGTTGAACAGAAAAAGA
TGGTGCTTTGTTGAAAGACCTACCCAAAATTGTTTTGATGCGGAACGACA
AACGAGAAGCGTACTGGATAGAACACCACCTCGCCTACTAATGGAGATTA
TCCTGGTTGATGATTTTAGTGCCAATGATGTTTAGAGGAGAGTTATGACA
AGCGGGTGTCCAGCACTTCGATTATCATCACTTTTCATAATGAAGCCCGG
TCAGCTTTGCTACGGACTATTAAAAGAACACTATATTAGCTTCAAGTACA
TTGGACGAGACAAGTTATATATCAAAAACAAAATTATCTGAATCAGAGGA
TCCATACCATAGACACAAATTCAACCAACAAATCAGTGATGAGTTGGACA
GCGATAGGCCAATCCCTGATACGCGCCCGCCACACATTGGAAGTTTATGA
TTCGTGAACGGTTACGTCATCAAGCAACAAATCTATGCATCGAAAGGAAA
TCGGATGGCTCGTTACTCTTAGCAAGATGTGAAAATTTCAGTCCACAACA
GAAATGGTCTTTTACTACCAAATTTCTCTTCTAACAATGGGTAATGTCAG
TAACAGGAATGATTCAAAACGAAAAAGACAAATGTTTATATGCTTCAAAG
AAGAGTAAAAGAATATCTCTCAAAGATTGTAACAACTCCGATTTTAATCA
GGGTTCCAAATGTTGACGAGTTAGCTTATGGGGAGATCAAGCAAATTTAT
AAGGGACAATCGTATTGTTTATCTGAGTCTAAAACTTCAAAGGTTTTAGC
TGTAAAATGTATTCCCAAGGATAAGAAAATGAATCAAAGAGCGACGTTTA
ATCAGAGAAAGACTGAAATGTCGTCCTTTCGATTGGTATCTGATGGAAGT
CTATCCAGAGTTGAGGAACGTGCGACGTGTTGCCGAAGTGTGGATGGACC
GTTATAAAAGAATATTCTATCGAGCACGTGGTGGAAATATGAACGAACCC
TTACCGAGAAATTTCATTCAAAACCTGGATGTGTGGTGGAAGTTTGAAAA
TCATCCCTTGCTCACGAGTTGGTCATATCTTTCGTAAATCTCATCCTTAT
GAGTTTCCTCTTGGTAATGGACACACGTACCTTATTACACCAGTAATTGC
AGGTGGTGTATTTGCTGTTCAGAAACAATGGTTCAATCAACTTGGACAAT
ACGATTCTTTGCTAGAAATATGGGGTGCGGAAAACTTCGGATTTGACTGG
AACATGCATTTTATTTGGGAACCATTACTTGAAAAAGAAATGAAAGAACA
AAAAGCTGATTCAACTCACCCAATCAGGATCCACTTGCGATAGCTTCACC
GGTGATTGACATCATCAAAACGGATACGTTGGAATATAAAGCCTCTTCAA
ATTACTTGAAAGGAGGGTTGATTCGTTCACGTTTGAAAGGTGTGAGCGTC
GCCAAGTCATCCATCTTAACATTCCTTGATAGCCACTGTGAAGTGAACGT
CGGTTGGATTGAACCATTGCTAGCAAAAGTTGAACAGAAAAAGATGGTGC
TTTGTTGAAAGACCTACCCAAAATTGTTTTGATGCGGAACGACAAACGAG
AAGCGTACTGGATAGAACACCACCTCGCCTACTAATGGAGATTATCCTGG
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TGTCCAGCACTTCGATTATCATCACTTTTCATAATGAAGCCCGGTCAGCT
TTGCTACGGACTATTAAAAGAACACTATATTAGCTTCAAGTACATTGGAC
GAGACAAGTTATATATCAAAAACAAAATTATCTGAATCAGAGGATCCATA
CCATAGACACAAATTCAACCAACAAATCAGTGATGAGTTGGACAGCGATA
GGCCAATCCCTGATACGCGCCCGCCACACATTGGAAGTTTATGATTCGTG
AACGGTTACGTCATCAAGCAACAAATCTATGCATCGAAAGGAAATCGGAT
GGCTCGTTACTCTTAGCAAGATGTGAAAATTTCAGTCCACAACAGAAATG
GTCTTTTACTACCAAATTTCTCTTCTAACAATGGGTAATGTCAGTAACAG
GAATGATTCAAAACGAAAAAGACAAATGTTTATATGCTTCAAAGAAGAGT
AAAAGAATATCTCTCAAAGATTGTAACAACTCCGATTTTAATCAGGGTTC
CAAATGTTGACGAGTTAGCTTATGGGGAGATCAAGCAAATTTATAAGGGA
CAATCGTATTGTTTATCTGAGTCTAAAACTTCAAAGGTTTTAGCTGTAAA
ATGTATTCCCAAGGATAAGAAAATGAATCAAAGAGCGACGTTTAATCAGA
GAAAGACTGAAATGTCGTCCTTTCGATTGGTATCTGATGGAAGTCTATCC
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AGAAATTTCATTCAAAACCTGGATGTGTGGTGGAAGTTTGAAAATCATCC
CTTGCTCACGAGTTGGTCATATCTTTCGTAAATCTCATCCTTATGAGTTT
CCTCTTGGTAATGGACACACGTACCTTATTACACCAGTAATTGCAGGTGG
TGTATTTGCTGTTCAGAAACAATGGTTCAATCAACTTGGACAATACGATT
CTTTGCTAGAAATATGGGGTGCGGAAAACTTCGGATTTGACTGGAACATG
CATTTTATTTGGGAACCATTACTTGAAAAAGAAATGAAAGAACAAAAAGC
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GCACTTCGATTATCATCACTTTTCATAATGAAGCCCGGTCAGCTTTGCTA
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TTGACGAGTTAGCTTATGGGGAGATCAAGCAAATTTATAAGGGACAATCG
TATTGTTTATCTGAGTCTAAAACTTCAAAGGTTTTAGCTGTAAAATGTAT
TCCCAAGGATAAGAAAATGAATCAAAGAGCGACGTTTAATCAGAGAAAGA
CTGAAATGTCGTCCTTTCGATTGGTATCTGATGGAAGTCTATCCAGAGTT
GAGGAACGTGCGACGTGTTGCCGAAGTGTGGATGGACCGTTATAAAAGAA
TATTCTATCGAGCACGTGGTGGAAATATGAACGAACCCTTACCGAGAAAT
TTCATTCAAAACCTGGATGTGTGGTGGAAGTTTGAAAATCATCCCTTGCT
CACGAGTTGGTCATATCTTTCGTAAATCTCATCCTTATGAGTTTCCTCTT
GGTAATGGACACACGTACCTTATTACACCAGTAATTGCAGGTGGTGTATT
TGCTGTTCAGAAACAATGGTTCAATCAACTTGGACAATACGATTCTTTGC
TAGAAATATGGGGTGCGGAAAACTTCGGATTTGACTGGAACATGCATTTT
ATTTGGGAACCATTACTTGAAAAAGAAATGAAAGAACAAAAAGCTGATTC
AACTCACCCAATCAGGATCCACTTGCGATAGCTTCACCGGTGATTGACAT
CATCAAAACGGATACGTTGGAATATAAAGCCTCTTCAAATTACTTGAAAG
GAGGGTTGATTCGTTCACGTTTGAAAGGTGTGAGCGTCGCCAAGTCATCC
ATCTTAACATTCCTTGATAGCCACTGTGAAGTGAACGTCGGTTGGATTGA
ACCATTGCTAGCAAAAGTTGAACAGAAAAAGATGGTGCTTTGTTGAAAGA
CCTACCCAAAATTGTTTTGATGCGGAACGACAAACGAGAAGCGTACTGGA
TAGAACACCACCTCGCCTACTAATGGAGATTATCCTGGTTGATGATTTTA
GTGCCAATGATGTTTAGAGGAGAGTTATGACAAGCGGGTGTCCAGCACTT
CGATTATCATCACTTTTCATAATGAAGCCCGGTCAGCTTTGCTACGGACT
ATTAAAAGAACACTATATTAGCTTCAAGTACATTGGACGAGACAAGTTAT
ATATCAAAAACAAAATTATCTGAATCAGAGGATCCATACCATAGACACAA
ATTCAACCAACAAATCAGTGATGAGTTGGACAGCGATAGGCCAATCCCTG
ATACGCGCCCGCCACA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467MSTRG.1467Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467.3.p1MSTRG.1467.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467.3.p1.exon14MSTRG.1467.3.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.1467.3.p1.exon1MSTRG.1467.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007_pilongenomesc0000007_pilon:488491..560558 -