MSTRG.1467.25.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1467.25.p1
Unique NameMSTRG.1467.25.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000007_pilon:565440..575949-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1467.25.p1 ID=MSTRG.1467.25.p1|Name=MSTRG.1467.25.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10510bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:565440..575949- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTTGTTTTTTCTGAAAGCTAGATTTCCTAGTGTGACTAACTGACTGATG CAAGTTACCCAATCTCACGGTAGACAATAGACAGATAGAATAGATAGCCA GTTATCTGGTCTGGGAGATTGAAGAATCTCAAAAAAGATCTACTCACCAA ATAAAAAAGTCAAAAAGTTTAACCAAGGATAGATAAAGTATAATATAACC ATCAAAAAATCAAAAAATTCGTGCTGCTGATCTGGGTGTCTTGTGATGAA GTACTTGACCAACAATGAACAAGTAATAAGGGTTACTCCGCTGAACGTAT GACGCTTTTGAGTCTAGATACGCACCAAACTCTTTGACTGGACGTACGGC GTTTTTAGCCGGTCAAATTTGGAACGGGACTTAAAACTCTTCAGAAAATA CGTTACAGTTTAGTCAAAGTGCTCCTTACTGTATATACTTTCGCTTCCGA GCACTAGAGAAAAACTGTGTGGGTGTGAAAATTTCAAGGAAAAAGCAAAA TCGCCGTTTTTATTTAGTACTCTTAACTAAGCCATTAGAATTTTTGCTGA GATGACACTTTCAGTTTGTCGACTTTTGTGGCAAACCCAGTTAAAAAAAA CATGACAAATAGGAGGAGATGATTGATGAAACCTTCTCTCTGTCATGTTG CAAAGCAGACACAATTCATTTTGGAGAGGTAAGTTGTTTGTTATTGATAC GGTACAAGTACAAGGTAGTCTTATTATAGAGAGAGGGAGGATGCATCATA TTCATGTTTGTGGCTCCTGTATTTTCTGGTAGAAACACGTAGAAAATTAA ATGGTAGATTTGTTTTCAGATTCTAAGCCTTAAGTTTCCATTTAAAGCAA AAGTAAAGTCTATATCCCAATTTACCTTCTCTCACCCTCATGTTTTTAAA AAAGACCTCAACCGTAAGTTGGTCTAATGTCAACATCCCTCTTCTAATAA 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TTGTAACACACAGAGTTTCAGTTTGGTATGAAGATCATTCAACCAAAAAT CCTAATGGAGTTGTCCCTGATCCGAAGATGACTAGGATAGTGAAAGGGTC AAAATTTGATGAGGACTATGTCACTGTTGTAGGTTAAGAAACCCCTTGGT TATCAACTCTTTGTGTGATTTTTGAAAGCTCAATTTGTATTTAGGGTTAT CTCTAAATTTTTTATTGCCTAGAATAAATGAAATTTTTTTTGTATTTTAT GGCTTTTTTTTAGACCAACTATGAACTAATTGCAAGAAAATCATGCCATT TTATGGAGTATTATGTTATGTTAATAAAGTTATGTTTAAAAAACTGGAGA TTTTGAGTAGTCAAAAAATGACAAAATTCATGCCAACTATACTGATGCGC CTTAATTTAAAGTCTTAACCAATGGTATAACATTTATTTTTTGCATCAAA GATTTTGACCCAAATTTGGGGGTCGAGAGTTCCTTTTGTAATGTCAGTCT TTCGACTATAAAAAGTTTTGTCAGGTGTAATTTGCAAGACTTCTCTCCAA GTAATATTTTTTTTCTAATAAATCAATTGTGGTAATTTCCATTATTATTT CATGAATCCCAAGGGCCCGCAGTCCCCTACTATTTGATATTTTTATGGAT TTAACATCTCTGAAAGCATTCTTGTTTTTGATATTTTTACGCTATTTTTT TTTACTATAATCAAAACTTCTTCTCAAACTCTGTCAGTCTTGAACAGATA TATAGATTTCTAAAACAAACGTTCAATTATCAAAAATCGACTAAATTTTT GCTTACAATTCTGTAGCATATAAAAATACTAAAAATCGTTTTTGAGCTCG GCAAATATTCTTCTAAAAAACTTTTGACAGATATAACCTAAATCTCTTTG TGATACAGACATCACTGCATTCAAGCTTTTATAATTGTTTACTTTTTTTT GCTTTTATATGAATATAATTATTTATACTGTATTTTATTAGAAATCTTTT TGTAAAGAAAATTTTATGACCTACCTGGAGGTCCTTTAATTTGACCGTTG TCCGTCTGTTCGTTTGTCTGTTATAAGCTTACCTCAGGATTGCCTCATTA GTTTGTTTTTATTTTTTGTACAGTGATGCAATGCCTTAAAAATGTCACGG AGCCCAATTTTTGAGAAAATAAATTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAACTGC CTAAAGATATGGTTTTTTGTACTTTGCGCAAAATGGCTTCATTAGCTTTA CCTGATTTTTTGCAGAAAGATCGAGTGCTAGTTGGCTTAAATGTGGGTGA AGTGGTTTTCCTCAGAAAATTTTTTTTCGTCGTAAGGCAATTACTTTTTT ATTTTCTGGTTTACGGAATCGCCGACGGTTTTTTTTGCAAAAATAAAATA AAAATAAAATTGGATTTTACAGTATTTTATTTATTTATGCTCTTCCGACC TTGTACTGAACAGCCATAAAAAGGAAACTTTATAGAAAATTACATTTTAT AAAAGCAAGAAGGGCAAGTAAAAGGGTCAGTGTCCAGTTCTTAATAACTA ATAACTTAAACACAATTTCCCTACTAAAAACGTTCTTTAATGTATGTAAG TTTTCTCAAAACATATTTTTTTTAATTTTTTACAACATTAAAGTTTGAAA AGAGCAATTTTATTTTTATTTTTTTTCCATCCTCCGGTCCAAAAGATCAT CTCCAAATGTCCGTAAACCAGAAAATAAAAAAGTAATTGCCTAATATACG GATTTTTGTTTTTTTGGGAAATTCCCTTTTAAATTTTTCCTGTTAACAAG CTTATCTCGGGATCGGCTCATTAGCTTTTTCTGACTCTTAGCACAAACAT ACAAAATGGTAATTCCAAAATGTAACAGAATCAAAAAAACGCTTTTTCTT TTTTTCGGGGGTGGGGGGAGAATTTGGGCCAAAAATGCCTAAAAATAGGG TTTTTTGGACTTTAAGTAGTTTTTTTTTTCAGGAAAATTTTTTTACCGTA AAAATCAGATTTTCTTATTTAGGGAAATTGCCTTTAGTCACTTTGAGGGG AAATGAGCATTTCTCGCGATTGGCTTGGTATATTTTTCTAATATTTTCCT TAGTGATATAAAACGGTAATATTTATATCCTGGAAATGTGATTCTCGAAA ATATAATGTTTTTCTTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAAAGTGCCTATAAA TGGGGTATTTTGGACTTTTTGTGAACTGAAATTGCTTCATTAATTTTTTT CTGATTTTTTTTGCATAAACATAAATGGGAAAGGTTTTCAGGAAATTTTT TTCTTGCCATAAAATTCCGATTTTCTTATTTTAATGAAACAAAAATACCC TTCAGTAAATTTATGGGGAAATGAATATTTCTCGCGATTGGCTTGGTATT ATTTTCTGATTTTTAGTTAGTCTGACAATTGTTGCCATTTTTTCTATTTT TTTATTACACTATAGCCTTTAGGTAGGGATGGCTATTCAGTATGTAACTT GTTATTTTTGAAATATCTATTTCTCCTGTAATTATTTTATCTTCATTCTT ATTCTTCTCACAAAACAAATCATAAAAGTGATCGAATTCGAATTTTCGAA TCATGGAAAGAAAAATGTTACAATCTAAATTTATTGGTTTTACATTGTTT CTTTACTTTCTATGATCAAAGAAAATTAAGTTAATTTTTTTATTTGTGTA TACAAAAAAGAAAGAAACAAACAAAAGAATATTAAAAAACAAATTTGATT CAAGACCCTTCAACATTGTAATGGCAGAATTAGATAGAAAAATGGATGAA TTGAAGTTAGAAAAAAAGAATCCAATAAACCCTGTGTTGCACACCATTTT ACAAGGTGTTGCTGATGAGAATTGTCAATTTTCTAAACTTTATGGTATGC CTCATGTTGTCAAGTTGATATGGGAAAAAGTTTTGGTAGCAATGCATATG CATATTAAATTTGGAAAGGATGAGAATTATGTGGAAACTTACAACCCACC TCCACCATTCATAGCCCAAACTGGCTTTCGGCTTCGATTTGATGTGAAAT TCCCTAAACCAACTGATATCAATATCAACATGATGCCTTTTGTCATGGCA AAGAAATTTGAAAACATGCAATTGCCAGATTATCTCAAACCATATGCTGA TATGATTGAAACTTCGTTTTTTAACGAACTTCCCTTTTTTGACATAGAGG AATTTGGTAAAATCGGTTATCTAACAATTCATGAGAGTTTGGTCGAGGAA GGTAAATCTCAGCGGAGACCAGGTCTACATACTGAATCTCCTGGTTTTAT TTATGTTAAGAATGATTTAAGTGATGAAAAGTGTGAGGAGTTATGCATTG AAAAGGGTTCTGGTCATGACAAAATCATGGCTCTTGGTGTTTGGTGGGGA AAGCATGGATACAACAGTCATCATTTCCCTAATGGTGGTATTTATATGGC ATCCAATGTTGATGATTCTTGTAAAGTTTGGGATTGTCAGATTGTTGCTG ACAATAATGGTGAGGAGTTGATTCGCAAACATGGAGATATTGAGCATTTA CGATGTTTCTTGCCAGAATCAACACTTTTAAAATCTGATATTCTCTATTG GATCAATGACCGTACACCTCACGAATCTCTGCCATTGAAGAAAGGAACAT ACAGACAGTTTTTTAGGCTTGTAACACACAGAGTTTCAGTTTGGTATGAA GATCATTCAACCAAAAATCCTAATGGAGTTGTCCCTGATCCAAAGATGAC TAGGATAGTGAGAGGATCGAAATTTGACGAGGGATATGTCACTGTTGTAG GATAATAATCTTTGTGCACTCATTAATAAAGATGTCACTGTAAACACCTC TCACTCCATTGTTTCAATGTTGATGGGATGCCAGGCTATATCAAGATTTT CATGTTATTTTTTTCTTTACATAAAAACCAAAACATACCTTTTATTTTAC ATTTTTTACTGTCCAAGTTGGTTCATAAGTAATTTGGTGTTCTTTAATTT TATCAATTTTGGAAATAACTTAATTAAAGAATTTGTTAAAAAACTGGATT GCTAGCCCTTTTCCCGCCTAACATTTTTGGTTTCTTTGCCTATGGGGGCA AATACCGACATGAGTACCTTCCATTTCTTTACTGTTTTTTTTTTAAGTTT ATTAAAAGTTTGATATTGCACTTTGCAGATTTCATTAAATGGCAAAGTTG AATAATTACGATTTTTTTAAAGACATTTTTTAACTCAAAGTAAACACATA CCACTTATATTTCTGATCTTATTCAGAAGATAAAAGCTAAATGTGATAAA TGTGATAGTTGCTCATGTTGGAATAATGGACATTTGGCAAATAGGTCCAA CCTTTATTTTTTCCCCTGCAAATTGGTAAAACCTTTATTTTCCCCGCGGC AAAAAAAACGCATGGCAGTTATAAAAGGGTTGATAAAAATATTGAATTCA CAAATTTGTTTAGAAATCTTATATAAATAACATATTTATTCACATATCTT ATTGACACAATACATTTAGACTATTTATTTTTTTGATATAATAACTTTTT GTATATAGGGCCGTCCATATGGTATATACGCACTAAGGGGGGAGGGGGTT TCTTCTCAGGGGGAGGGGAGGGGTCAAATGAAAATGTACGTACACAGAGA AAATTTTTTTATAGCTCTTTTTCGCTTGTTTTTTTGTCGACTTTTACGCT TATTATACGCATCAAGGAAAAGAAAAAGTATCTTGATAAACATCGAGTTT CATGCATGAAATAAAGATCCGAACCAAACTATTAATTCGAAATTCTTTAT AACCGAGGGGGGGGGGTGAAAGAAAAAGTATGTACTTACCAGATGGGGGT ATAGCCATTTGCGTACGCTTGTGTACAGGGGGATGGGTACTCTATTTTCG ACATTTTAGTGTGTACATATGTGGACGATACCTTTGTATGATCTTTGTAA TTACATTCATATTTTTATTTTGTTTTTGTGTAATATTCTTTTAAATGATA TTTAATACCTAAGCACTGTGTATTTGTATTTTTATACTTGAAGCTTATCT TGTTTTTCAACACATTAAAAAATGCAGTTTAATATTGATAATTTTCACTC CAAAACTCAATATTCAATCAAACTACAAATAAAGATTTTGAGCAAAAACA TTCAATTAGGACCTGCTTTTTTGACCAATCTTAAATTGATTTCTCAAACA TAATCCTCAGAATTGAGGCTCTAGCCTCTAGCTCTTTTGCTAGAGCAAAA ATAACTTACATACTTCTCAAAAGATTTTGGCCCCATATTGCGAAATTACA TTTAAAATTTGCCATACATTTGAAATTTTGAATTTAATTTACTTTCTTTT ATTTTTAAAATGTAGATATAGATTTAGAAAAACTTATAAACATCCCTGAT CAGACACAATGGAATATCAAAGATTACAACACATTCAACTCGATCAACAT TTGAACCCAATCGCCAGAGCCATTTTACAAGGAGTTAACGATGAAAACAG TCCATTTTCAAAACTCAATGGTATTCCCCATGTTCTACAAATGATTTGGC GATATATAATTACAACCATGAAGCAGCATATTAAATTTGAACCATCGTGG ATAGATTATTTAGAAGATCCAGTTGATCCAAGTATTGGTGTTTGTGGCTA CATAGAATGTGAACCTATTTCTATATCTTTTCCTGAATCTACTGATATCA ATATAAATATGATGCCCTTTATTATGGAACAAGAATTTGAAAAGACTAAA TTACCAGAATATTTGAGAAAATATTTTGAAACGTTTTTGAGCCCTCTTAT ATCAGAGTATGAGGAAATGGGAAAAGAAATTGATAAAATTTGTTATCTAA CTATACATGAGAGTTTGGTTGAAGAAGGAAAATCACAGAGGAGACCAGGG CTACACACAGAATCACCTGGTATAATTTACGTTAAAAATGGAATGAAAAG TGAGAAAATTAGAGAGCTGTGTATTGAAAAGGGTTCCGGTAGGGGTGATA CAGAAATTCCATGGGTTGTTTGTTGGGGTGGACAATACGGTATGCATGGT GAAGTTTTTACTCCTTCTGGGGGAATCTACATGGCATCTAATGTACCTAA TTCATGTGAAGTTTGGGATTGTCAAATTGTAGCGAATGATAAAGGAGAAG AAATTATTGGGAAGTTTGGAAATATTGAGCACTTGAGGGGCCTTCTGTCT GGCTCCAAGATTATGAAATCTGATAAATTGTATTGGATAACCGATCGTAC ACCTCACGAATCTCTGCCATTGAAGAAAGGAACATACAGACAGTTTTTTA GGCTTGTAACACAGAGAGTTTCAGTTTGGTATGAAGATCATTCAACCAAA AACCCTAATGGTGTTGTCCCTGATCCTAAGATAACAAGAATTCTAAGAGG ATCAAAATTTGATGAAGGTTCTGTAGCCATTGTTGGCTAAAATAACTTTG GTTTCAGGGATAAATATTGATAAATAGAAAGGTAGAAGTCATTTGAAAGG ATTAAGAAACTCATCTATGATTCAAAACTATAAATTTAAGTGATATATTA TAAAGCTAACTTAAGTTATATCAAATGATCAGCTCAATCTTATATACTCG ATGGTATTCACTTTCATATGTACTTTGAATTTGCATTTCAGTTTGCAATT GACATATACTGAATTTTCCCACTTTTGCCGTTTTTCAAATAGAATACTTT ACCAAAGTGGGGTTAATCATATGCATTTTGCCTGGGTGTAAAACAGTTGA ACAAATGATAAACAAAATAGTCTAATTTGCATCATTTTATAATGATTTTA TAGTTTGAATCATTTTATAAAATTTGATTTCTTACGTTTGTATTTATTTT CATGAATTTAAATCTTTTCAATAGTTTTTACAGTGTGGTAAATTTTGCAA AATTTCATCAAAATTCTCACGAGAATAAAGTGTGCCAGCAAAAAGTAAAT GCCTTTTAGATACCTTGGCCTTTGATAGATACTTATTATTGTAAGGTGTG TCCCTTGAACCTATTTTTTACGTGTCGCACATTCTCGCAGTTTTCCTTTT ACACTGCTTAAAATTTATTTATTTTTGTAAAATTCGCCATTATAATACCA ATAATACACATGTAATTCTAAAGAGTTTAGAATGGAAGAGGAATACATAA CTTCAGCTATCATGCTTTAAATTTGGTCCAGAAGTTCAAAAGTTGTAAAG ATTTCTTTGAAGCACCGATGCGCGATTTAATAGTTTTCTTTGAACTTGAT TTTTGTTGTAAATAAGAATATTATGTATTTTATATTTCATTTAAAATTGT CTGGCTTTATTGTAAATTATTAATAGTAAGTGTATCTGGCCCATCTTCAA AAAATAGAAATTTATTTATTTTCACTTTATTTTTATACCTTGAACAGGTT TACGTAGTCAAATATAACAACATAACAATATGTTAAAAACACTAAAAGAG TATAAAAATATTAAAATACAGTAGACAGCTTGCATTGACAGTAGGTTTTG ACATCCTGGACTTCTGACATCCTCGACTTCTGAAACAAATCATTTAGTGT TCCAAGTGATCTTATTACCTTTGTGGTAATTTGCTTCATGCCGAACCTGA TCTGAAGTCAAAGGAGTTAAGGCAGACTTTATTTTTCGGAAAAGGAAGTT TATCCCTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:565440..575949-

>MSTRG.1467.25.p1 ID=MSTRG.1467.25.p1|Name=MSTRG.1467.25.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2310bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:565440..575949- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAGAAACAAACAAAAGAATATTAAAAAACAAATTTGATTCAAGACCCTT
CAACATTGTAATGGCAGAATTAGATAGAAAAATGGATGAATTGAAGTTAG
AAAAAAAGAATCCAATAAACCCTGTGTTGCACACCATTTTACAAGGTGTT
GCTGATGAGAATTGTCAATTTTCTAAACTTTATGGTATGCCTCATGTTGT
CAAGTTGATATGGGAAAAAGTTTTGGTAGCAATGCATATGCATATTAAAT
TTGGAAAGGATGAGAATTATGTGGAAACTTACAACCCACCTCCACCATTC
ATAGCCCAAACTGGCTTTCGGCTTCGATTTGATGTGAAATTCCCTAAACC
AACTGATATCAATATCAACATGATGCCTTTTGTCATGGCAAAGAAATTTG
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TGGTCATGACAAAATCATGGCTCTTGGTGTTTGGTGGGGAAAGCATGGAT
ACAACAGTCATCATTTCCCTAATGGTGGTATTTATATGGCATCCAATGTT
GATGATTCTTGTAAAGTTTGGGATTGTCAGATTGTTGCTGACAATAATGG
TGAGGAGTTGATTCGCAAACATGGAGATATTGAGCATTTACGATGTTTCT
TGCCAGAATCAACACTTTTAAAATCTGATATTCTCTATTGGATCAATGAC
CGTACACCTCACGAATCTCTGCCATTGAAGAAAGGAACATACAGACAGTT
TTTTAGGCTTGTAACACACAGAGTTTCAGTTTGGTATGAAGATCATTCAA
CCAAAAATCCTAATGGAGTTGTCCCTGATCCAAAGATGACTAGGATAGTG
AGAGGATCGAAATTTGACGAGGGATATGTCACTGTTGTAGGATAAATGAT
TGATGAAACCTTCTCTCTGTCATGTTGCAAAGCAGACACAATTCATTTTG
GAGAGAAAGAAACAAACAAAAGAATATTAAAAAACAAATTTGATTCAAGA
CCCTTCAACATTGTAATGGCAGAATTAGATAGAAAAATGGATGAATTGAA
GTTAGAAAAAAAGAATCCAATAAACCCTGTGTTGCACACCATTTTACAAG
GTGTTGCTGATGAGAATTGTCAATTTTCTAAACTTTATGGTATGCCTCAT
GTTGTCAAGTTGATATGGGAAAAAGTTTTGGTAGCAATGCATATGCATAT
TAAATTTGGAAAGGATGAGAATTATGTGGAAACTTACAACCCACCTCCAC
CATTCATAGCCCAAACTGGCTTTCGGCTTCGATTTGATGTGAAATTCCCT
AAACCAACTGATATCAATATCAACATGATGCCTTTTGTCATGGCAAAGAA
ATTTGAAAACATGCAATTGCCAGATTATCTCAAACCATATGCTGATATGA
TTGAAACTTCGTTTTTTAACGAACTTCCCTTTTTTGACATAGAGGAATTT
GGTAAAATCGGTTATCTAACAATTCATGAGAGTTTGGTCGAGGAAGGTAA
ATCTCAGCGGAGACCAGGTCTACATACTGAATCTCCTGGTTTTATTTATG
TTAAGAATGATTTAAGTGATGAAAAGTGTGAGGAGTTATGCATTGAAAAG
GGTTCTGGTCATGACAAAATCATGGCTCTTGGTGTTTGGTGGGGAAAGCA
TGGATACAACAGTCATCATTTCCCTAATGGTGGTATTTATATGGCATCCA
ATGTTGATGATTCTTGTAAAGTTTGGGATTGTCAGATTGTTGCTGACAAT
AATGGTGAGGAGTTGATTCGCAAACATGGAGATATTGAGCATTTACGATG
TTTCTTGCCAGAATCAACACTTTTAAAATCTGATATTCTCTATTGGATCA
ATGACCGTACACCTCACGAATCTCTGCCATTGAAGAAAGGAACATACAGA
CAGTTTTTTAGGCTTGTAACACACAGAGTTTCAGTTTGGTATGAAGATCA
TTCAACCAAAAATCCTAATGGAGTTGTCCCTGATCCAAAGATGACTAGGA
TAGTGAGAGGATCGAAATTTGACGAGGGATATGTCACTGTTGTAGGATAA
ATGATTGATGAAACCTTCTCTCTGTCATGTTGCAAAGCAGACACAATTCA
TTTTGGAGAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467MSTRG.1467Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467.25.p1.exon2MSTRG.1467.25.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1467.25.p1.exon1MSTRG.1467.25.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1467.25.p1MSTRG.1467.25.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007_pilongenomesc0000007_pilon:565440..575949 -