MSTRG.14662.4.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14662.4.p2
Unique NameMSTRG.14662.4.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000123_pilon:872015..903155-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14662.4.p2 ID=MSTRG.14662.4.p2|Name=MSTRG.14662.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=31141bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:872015..903155- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGTTTGATGTGTGTACTCCGTCTTCGTGGAATTTCTTAATGGCATGAAA ACAGAATATGCAATGTCTTTAAGAACAAATTCCTAAATGGCTTTTGTTGT TCTGTAAATATTTCCTTTTGGATTAAGAAATTCCATCTTTTATTGTTCTA ATGATTATAATATTTATTTATAAGATGCTTTGTTGTCTTTTTAATCTTTG TGTAAACTTGCATATGTTTTGCATATATTCCAACTAAATCCAACCACGGC ATTTTCGTTCCTGTATTTTTGCATACAATTCAATATGGCGGACGCAAAGG CGAAAAGGTCTATCAAACGCAGTCGAACAACAATCAAACTACCAATCGAA TATTACCCAGAATTTTGATGTTTGATTGAGATCAATTGCGTTCGACAATC GAATTTCAATCGGTTGATTGCATTCGATTTGGTTTGACTGGTTTGATCAT TGATTCTGTTCGATTGAGATCGTCTGGTAATCAGAAAAGAAAGTAAAAAA CTAAATTTTCTTGATATACAGCGCGCGCCCTAAAGCCTATTTCGTAACAC AATCACGCATCTTTGTTGTCTCTGCTGCTAGTCCTTTTAGAAGAGCGCGG CCCTTACAATTTTGAGAAAGCATACCTATTTGTCAGATTGTTTTGTTTTC ACCCATCCCTTTACACAGCAGAAAACAATCATGATCTGAGCACACAAAGG TTAACCATCATATCAGACCATGGCTTATAAGCAGGTCCTAGGTCCCCCCT AAGAATTTAGGTGCCCCCTAGGATTTAGGTGGCCCCTATTGGAAAAATAT TCTAGGTGGCCCCTAAAAGTTCAAAAATCGAAAAAAGCTAAAAATTGAAA TCGTAGATATACTTTTAGAAAAACTTTCTTTTTTGTCAAGTGTAATTAAA TTTAGCCCCAGTTCATTATGTAAAAAATTAGGTCCGCCCTAGCTCAGTAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000123_pilon:872015..903155-

>MSTRG.14662.4.p2 ID=MSTRG.14662.4.p2|Name=MSTRG.14662.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6360bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:872015..903155- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGGCTTTTGTATTGCTCATTATCTGTTATGTAACCATTGATGTCAAGAAA
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AAGACGGTGGTCTAATACCGATTAATAAAAATCTATGGCAGCTCGTATGT
TATTCATGTATTCACGACCGAAAAGTCATATTAAACGTTGGATGATTTGG
GCTGTTATTATGCACCCTTATAAATGTGGTCCACATGATCCCGAAGGTTT
TCTTGGTGTCATCCCATCAATTCTGATGACATACTTTGGTTTAATGTGGA
TACCTGGGACCAGGTGGTTTATCCGACAATGGAACGCACAGCGGTTGCAC
GGGCGGAGCAGCTGCTTACATCGATCGAAAAATATTTGGCTTGAATCATA
TGTATAATAGCCCAACATGCAGAACACTTACGATTGGAGAGACAGCTTCC
GTGGTTTCCATTGCAACATTTCATAATGCTCATTTTGTTAGTGGTTTACC
TGTGTTTGACTTTCTTGTTACCCGTCCCAGGCTGCAAAACATGTGTGGTG
TTCGCCTGAAGAAGAGACTGTCAACGAATGAATGCTATCATGTTATATTG
CGGACATGAGATACTGTCCGGTTATTTCCCGTTTGACTTCGATAATAACG
GACAACATGACGAGTTAACACAAGCGGCGGTTGGAACCGGTGTATGGCTT
GTTATTGCGTATTCGTGCTTCAAAAGTGATATTTTTTGGAAAGTTTGAGT
CAATTTCATTTATATGTGCGACTGCAGCTATGGCTTTTGTATTGCTCATT
ATCTGTTATGTAACCATTGATGTCAAGAAATGGTGGAGTGGTGGTCCATT
CTATTTCGCTGGGTGCTATTGCTATCGGTTTGTGCGGTGGCAAAAAAGAC
GGTGGTCTAATACCGATTAATAAAAATCTATGGCAGCTCGTATGTTATTC
ATGTATTCACGACCGAAAAGTCATATTAAACGTTGGATGATTTGGGCTGT
TATTATGCACCCTTATAAATGTGGTCCACATGATCCCGAAGGTTTTCTTG
GTGTCATCCCATCAATTCTGATGACATACTTTGGTTTAATGTGGATACCT
GGGACCAGGTGGTTTATCCGACAATGGAACGCACAGCGGTTGCACGGGCG
GAGCAGCTGCTTACATCGATCGAAAAATATTTGGCTTGAATCATATGTAT
AATAGCCCAACATGCAGAACACTTACGATTGGAGAGACAGCTTCCGTGGT
TTCCATTGCAACATTTCATAATGCTCATTTTGTTAGTGGTTTACCTGTGT
TTGACTTTCTTGTTACCCGTCCCAGGCTGCAAAACATGTGTGGTGTTCGC
CTGAAGAAGAGACTGTCAACGAATGAATGCTATCATGTTATATTGCGGAC
ATGAGATACTGTCCGGTTATTTCCCGTTTGACTTCGATAATAACGGACAA
CATGACGAGTTAACACAAGCGGCGGTTGGAACCGGTGTATGGCTTGTTAT
TGCGTATTCGTGCTTCAAAAGTGATATTTTTTGGAAAGTTTGAGTCAATT
TCATTTATATGTGCGACTGCAGCTATGGCTTTTGTATTGCTCATTATCTG
TTATGTAACCATTGATGTCAAGAAATGGTGGAGTGGTGGTCCATTCTATT
TCGCTGGGTGCTATTGCTATCGGTTTGTGCGGTGGCAAAAAAGACGGTGG
TCTAATACCGATTAATAAAAATCTATGGCAGCTCGTATGTTATTCATGTA
TTCACGACCGAAAAGTCATATTAAACGTTGGATGATTTGGGCTGTTATTA
TGCACCCTTATAAATGTGGTCCACATGATCCCGAAGGTTTTCTTGGTGTC
ATCCCATCAATTCTGATGACATACTTTGGTTTAATGTGGATACCTGGGAC
CAGGTGGTTTATCCGACAATGGAACGCACAGCGGTTGCACGGGCGGAGCA
GCTGCTTACATCGATCGAAAAATATTTGGCTTGAATCATATGTATAATAG
CCCAACATGCAGAACACTTACGATTGGAGAGACAGCTTCCGTGGTTTCCA
TTGCAACATTTCATAATGCTCATTTTGTTAGTGGTTTACCTGTGTTTGAC
TTTCTTGTTACCCGTCCCAGGCTGCAAAACATGTGTGGTGTTCGCCTGAA
GAAGAGACTGTCAACGAATGAATGCTATCATGTTATATTGCGGACATGAG
ATACTGTCCGGTTATTTCCCGTTTGACTTCGATAATAACGGACAACATGA
CGAGTTAACACAAGCGGCGGTTGGAACCGGTGTATGGCTTGTTATTGCGT
ATTCGTGCTTCAAAAGTGATATTTTTTGGAAAGTTTGAGTCAATTTCATT
TATATGTGCGACTGCAGCTATGGCTTTTGTATTGCTCATTATCTGTTATG
TAACCATTGATGTCAAGAAATGGTGGAGTGGTGGTCCATTCTATTTCGCT
GGGTGCTATTGCTATCGGTTTGTGCGGTGGCAAAAAAGACGGTGGTCTAA
TACCGATTAATAAAAATCTATGGCAGCTCGTATGTTATTCATGTATTCAC
GACCGAAAAGTCATATTAAACGTTGGATGATTTGGGCTGTTATTATGCAC
CCTTATAAATGTGGTCCACATGATCCCGAAGGTTTTCTTGGTGTCATCCC
ATCAATTCTGATGACATACTTTGGTTTAATGTGGATACCTGGGACCAGGT
GGTTTATCCGACAATGGAACGCACAGCGGTTGCACGGGCGGAGCAGCTGC
TTACATCGATCGAAAAATATTTGGCTTGAATCATATGTATAATAGCCCAA
CATGCAGAACACTTACGATTGGAGAGACAGCTTCCGTGGTTTCCATTGCA
ACATTTCATAATGCTCATTTTGTTAGTGGTTTACCTGTGTTTGACTTTCT
TGTTACCCGTCCCAGGCTGCAAAACATGTGTGGTGTTCGCCTGAAGAAGA
GACTGTCAAC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14662MSTRG.14662Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14662.4.p2MSTRG.14662.4.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14662.4.p2.exon17MSTRG.14662.4.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon16MSTRG.14662.4.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon15MSTRG.14662.4.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon14MSTRG.14662.4.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon13MSTRG.14662.4.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon12MSTRG.14662.4.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon11MSTRG.14662.4.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon10MSTRG.14662.4.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon9MSTRG.14662.4.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon8MSTRG.14662.4.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon7MSTRG.14662.4.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon6MSTRG.14662.4.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon5MSTRG.14662.4.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon4MSTRG.14662.4.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon3MSTRG.14662.4.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon2MSTRG.14662.4.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.4.p2.exon1MSTRG.14662.4.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000123_pilongenomesc0000123_pilon:872015..903155 -