MSTRG.14662.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14662.2.p1
Unique NameMSTRG.14662.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000123_pilon:872015..903155-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14662.2.p1 ID=MSTRG.14662.2.p1|Name=MSTRG.14662.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=31141bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:872015..903155- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGTTTGATGTGTGTACTCCGTCTTCGTGGAATTTCTTAATGGCATGAAA ACAGAATATGCAATGTCTTTAAGAACAAATTCCTAAATGGCTTTTGTTGT TCTGTAAATATTTCCTTTTGGATTAAGAAATTCCATCTTTTATTGTTCTA ATGATTATAATATTTATTTATAAGATGCTTTGTTGTCTTTTTAATCTTTG TGTAAACTTGCATATGTTTTGCATATATTCCAACTAAATCCAACCACGGC ATTTTCGTTCCTGTATTTTTGCATACAATTCAATATGGCGGACGCAAAGG CGAAAAGGTCTATCAAACGCAGTCGAACAACAATCAAACTACCAATCGAA TATTACCCAGAATTTTGATGTTTGATTGAGATCAATTGCGTTCGACAATC GAATTTCAATCGGTTGATTGCATTCGATTTGGTTTGACTGGTTTGATCAT TGATTCTGTTCGATTGAGATCGTCTGGTAATCAGAAAAGAAAGTAAAAAA CTAAATTTTCTTGATATACAGCGCGCGCCCTAAAGCCTATTTCGTAACAC AATCACGCATCTTTGTTGTCTCTGCTGCTAGTCCTTTTAGAAGAGCGCGG CCCTTACAATTTTGAGAAAGCATACCTATTTGTCAGATTGTTTTGTTTTC ACCCATCCCTTTACACAGCAGAAAACAATCATGATCTGAGCACACAAAGG TTAACCATCATATCAGACCATGGCTTATAAGCAGGTCCTAGGTCCCCCCT AAGAATTTAGGTGCCCCCTAGGATTTAGGTGGCCCCTATTGGAAAAATAT TCTAGGTGGCCCCTAAAAGTTCAAAAATCGAAAAAAGCTAAAAATTGAAA TCGTAGATATACTTTTAGAAAAACTTTCTTTTTTGTCAAGTGTAATTAAA TTTAGCCCCAGTTCATTATGTAAAAAATTAGGTCCGCCCTAGCTCAGTAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000123_pilon:872015..903155-

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GTTAGTGGTTTACCTGTGTTTGACTTTCTTGTTACCCGTCCCAGGCTGCA
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CATCAAATTGTTTGCACTTGGATTATTCATAAATAATGAATCAGCATATT
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CGTTGCTGATTTAGTTTTCCCTTGGTTCATCTTCATAATGGGTGCATCTA
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GGTTGCACGGGCGGAGCAGCTGCTTACATCGATCGAAAAATATTTGGCTT
GAATCATATGTATAAACACTTACGATTGGAGAGACAGCTTCCGTGGTTTC
CATTGCAACATTTCATAATGCTCATTTTGTTAGTGGTTTACCTGTGTTTG
ACTTTCTTGTTACCCGTCCCAGGCTGCAAAACGGAAAGATTATGAGCATT
GGAGGATACCAGGTGTTTTGCAACGTTTCGCTTTATCATACTTGGTAGTG
GCCATCTTGAATGTGTGGTGTTCGCCTGAAGAAGAGACTGTCAACGATTG
ACCGTTGCTGATTTAGTTTTCCCTTGGTTCATCTTCATAATGGGTGCATC
TATTTTCATTTCTTGCCGGAGCATACGTAGAAAAACAATTCCAAAGATAA
CAATCACGAAGAAAATAATCGTTCGATCCATCAAATTGTTTGCACTTGGA
TTATTCATAAATAATGAATCAGCATATTGGTCATGATATTTGTTAATTAT
GGTGGTGGAAAATATTGGTTCTTTAATCACTCTAAATGGAATGCCAACTG
ACGATTTGACAGAACATTCTTTTACAAGAAGTAACAGCTCGCATAAAAGT
TATGGTAGCGTTCATAGCAACAAGCAGTCTATCAGTGTTGGAAATAATAG
CGGAAAATATCAGAACTCTGGAAAATATATGGGAGCAGTAACCTTAGACA
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AGAGGAAAATATAACTCGACAAGGATGATTAGCTATGAAAGTATTATGGT
ATCTTTCGTTTTATTGAATTTGGCTATACATGGATACCTGGGACCAGGTG
GTTTATCCGACAATGGAACGCACAGCGGTTGCACGGGCGGAGCAGCTGCT
TACATCGATCGAAAAATATTTGGCTTGAATCATATGTATAAACACTTACG
ATTGGAGAGACAGCTTCCGTGGTTTCCATTGCAACATTTCATAATGCTCA
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TGCAAAACGGAAAGATTATGAGCATTGGAGGATACCAGGTGTTTTGCAAC
GTTTCGCTTTATCATACTTGGTAGTGGCCATCTTGAATGTGTGGTGTTCG
CCTGAAGAAGAGACTGTCAACGATTGACCGTTGCTGATTTAGTTTTCCCT
TGGTTCATCTTCATAATGGGTGCATCTATTTTCATTTCTTGCCGGAGCAT
ACGTAGAAAAACAATTCCAAAGATAACAATCACGAAGAAAATAATCGTTC
GATCCATCAAATTGTTTGCACTTGGATTATTCATAAATAATGAATCAGCA
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AATCACTCTAAATGGAATGCCAACTGACGATTTGACAGAACATTCTTTTA
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CAGTCTATCAGTGTTGGAAATAATAGCGGAAAATATCAGAACTCTGGAAA
ATATATGGGAGCAGTAACCTTAGACAATGAACAAGAAGGGAAATCTACTA
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ATGATTAGCTATGAAAGTATTATGGTATCTTTCGTTTTATTGAATTTGGC
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TGGCCATCTTGAATGTGTGGTGTTCGCCTGAAGAAGAGACTGTCAACGAT
TGACCGTTGCTGATTTAGTTTTCCCTTGGTTCATCTTCATAATGGGTGCA
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GTTATGGTAGCGTTCATAGCAACAAGCAGTCTATCAGTGTTGGAAATAAT
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TCGATCCATCAAATTGTTTGCACTTGGATTATTCATAAATAATGAATCAG
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TAAACGATTGAGATCGTTGGATACTTTCAGAGGAAAATATAACTCGACAA
GGATGATTAGCTATGAAAGTATTATGGTATCTTTCGTTTTATTGAATTTG
GCTATACA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14662MSTRG.14662Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14662.2.p1.exon18MSTRG.14662.2.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon17MSTRG.14662.2.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon16MSTRG.14662.2.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon15MSTRG.14662.2.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon14MSTRG.14662.2.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon13MSTRG.14662.2.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon12MSTRG.14662.2.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon11MSTRG.14662.2.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon10MSTRG.14662.2.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon9MSTRG.14662.2.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon8MSTRG.14662.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon7MSTRG.14662.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon6MSTRG.14662.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon5MSTRG.14662.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon4MSTRG.14662.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon3MSTRG.14662.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon2MSTRG.14662.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14662.2.p1.exon1MSTRG.14662.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14662.2.p1MSTRG.14662.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000123_pilongenomesc0000123_pilon:872015..903155 -