MSTRG.14655.31.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14655.31.p1
Unique NameMSTRG.14655.31.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000123_pilon:754229..776708-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14655.31.p1 ID=MSTRG.14655.31.p1|Name=MSTRG.14655.31.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=22480bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:754229..776708- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAACGCCGTACGACCCGGCAATCGTCCGTACGGGGACGTCCTGCAGCGT ACCTTGCGCGGCCCGTAGCCCGACGACCGGTAACAGTGGAGTGATGAAAT TTGGCATGCTCCCCCCTTCGATATGCTTGACGTCTCCAGAAAGTTTCAAT TCGTGAGACCTACCCAGTCCGGCGCTAGGGGAGGGGGTCATTCACGGTCC CGTACGGGTCCTTTACGGTCTCATACGTCATAGCGCCCTTCCGTCAACTT TTCAGGACTTCAGACCTATTTTTTCGGAATCTGCACCCAAAAAAACATGA AACATCAAAACCTGGATAAAAATTTTAAAGGTGACTTTGACCCGCTTCGA TCCGGGGACCTAACCCCTAATGCGTGAAACCAACGCTTTAAACCACTGGA CCAACTTCTAGCCGTGCTTTACAGAAATTTTTCAGCGATGTCATACCTTC GTTAGCTTGACTTGGCCCAGATGGAAAAAAATATATAATCATATTCCGCG GAATACAAAATATAAAAAAAAACATTATTCCGCGGAATAGCTATTCCGGC CGGAACAGCTATTCCGGTTCCGGCATTCCGTCGTTCCGCCGTTCAGCGTT TTGTCTCTACCCAATATGTGTTGAATAAAAAATCACTAGAAATATCTCGA GAAGATAATGGAAGAAGTCAAAAATAAAAGATGAGTATATTGTTTGTTAA TTTTACCATATTGTTAAACTTTTAGTTTTAATGGTCTCTTTGCTATGTCA TTTACCATATGATGTTCTAATGTGGTAAATCTAACATGCGCTTAACATAG TAAATTAAAGCTTTTTGATTGCCAATAAATTGCCTTGCTTTTTATTTTGC TCAACTGCTCAAACAGTCAAAGTTTTTCCCCTAGTAAAAATCTCCTTGGC TCTTATTATTGGCCATTCAATAGGTGGAACAAAGGATTATGGGTTTTTTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000123_pilon:754229..776708-

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AGAAAGATGGTGCCTCTAGCTGATGGAGATGAAAATATTCCAGACGAAGA
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CTGATGTCGCTGCAAGAGCCAGGGAAGCTATCTACAATCATCCTGATTCG
CTGCGCAACAACAAGAAACTTGATGTTTGCTCTCTTATGTCAAGAAAATG
AAAAACTTGAACGCTCCAAAAACTGGGATGTTATTGAAAGTCATCTTTGC
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TGAAAGCAAAAACGTCCTTCTTCACGCAGTTGGGTCAAAAAGAGGTGGTC
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GAAATGTTCGATGCGAGTGATGACTCTAAAAATGAAATTGATCAAAATGG
CCTCATCGTTGCTTTCTTAATGAAGCACTTCCAACTTGGAATTGCCGATA
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GAATCCCGAACATCGTTGTTAACAACAGAGGATAAGGCCAAAATAATGTT
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CCAACTAACCTTAATCGACTCGACGTTTCGTGTTTAGAGGACTATATGAG
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TTTGGAAGACTTCCGAGAGCAATGAGATTTGCAGAGTTAAAATGTTGGAT
CTTCCGGATGACTCGTATTCTACTGACGATGATGATTCCAATGACTTGCC
AACGACCTCTGACGTTTTAAATGGTGATGACATACCATAGTGGTGTAATT
GAAGCGAAGTTTGATGGTAAAAATTGGTCTGATGGCTTCTCTTGTGCAGC
AACTGAAAGAAATAGCAAGATTACAAGCAATCCTGAGGGAAAGATACCAG
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TGTCTATTCCATCAAAAGATTTCGTGGAAAGTGAAATAAATGGTGCTACC
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CGACTCGTTCACCAGGACCTGCTATGTATATTCCATCAAAAGAAAAAGGA
CCTGTTCGTCTAGCTTCTACTTTAACGGTTCCTTTGTCAAACAATACTTT
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AAGATCTTCGAAAACGTGGGTTTGGTTTTTTTATGTATGGTGCTTGGGCT
TGGGAAAACGCAAGACGGAATGTTCTACCATCTCATTTGATAGAGTTTGT
TAAAGTTCACCACCCATCCTTTATGGTAGATCACAGTTGCATTGATTGTT
TCCAGGGCTCAGATTCTTGCTCCCACGAATGCTGTTATTTTAAGGCGAAA
GACTTTGCTGAAAGAACAGGCTTGCAAGTGGTTAAAAAGAAAGATGGTGC
CTCTAGCTGATGGAGATGAAAATATTCCAGACGAAGAAGTAAATGATGGC
AACGTTATGAATTTGACCAAAGTGCTAAACAATGTTACTGATGTCGCTGC
AAGAGCCAGGGAAGCTATCTACAATCATCCTGATTCGCTGCGCAACAACA
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TGCAAATCCATCTTTGAACTAGGTAACTGTGATGATTTTTGGAAGACTTC
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CGTATTCTACTGACGATGATGATTCCAATGACTTGCCAACGACCTCTGAC
GTTTTAAATGGTGATGACATACCATAGTGGTGTAATTGAAGCGAAGTTTG
ATGGTAAAAATTGGTCTGATGGCTTCTCTTGTGCAGCAACTGAAAGAAAT
AGCAAGATTACAAGCAATCCTGAGGGAAAGATACCAGTAATAGTAAAGAT
TGCCAAACAACGGAGCTGACTCTACCAGCACCTGCTTTGTCTATTCCATC
AAAAGATTTCGTGGAAAGTGAAATAAATGGTGCTACCAATAACGCAACCG
AAAAGATGTATGATCATGATTACTGTGTTAATACTGATGGGAAAGATACC
AGTAATAGTGAAGATCAGCAACACCAAACAACGGAGCCGACTCGTTCACC
AGGACCTGCTATGTATATTCCATCAAAAGAAAAAGGACCTGTTCGTCTAG
CTTCTACTTTAACGGTTCCTTTGTCAAACAATACTTTATCGAAGAACGCA
CCATTGGCCAATTTCATCACCAATCAACGGCCCACACATTTTGTTTTGCC
GAATATCGTTGATGATGGATCGCCTGAATCAAAGAACAAGAAAAAGAAGC
CACAACCAACAAAAAAATCACGACCAACGAAGAATTCACAACCAACGAAA
CCAGCTAAGAAGGCTCTGAATTCAATAAAAAACGTGGACAAAACCCGAAT
TAAACTCAACAAAACGCAAACGAGCCAAAAAAACAGCAAAGCCAACACAC
GATGAAGCTGAGCAGGAGCAAGAAGATGAATCCAACCAGCAGGTACTTTT
TAGCATTGGACAATGAACTATCAGCGACGTTGTCTTCAGATAATGAGCTC
ACTGACCAACTATCACTTCAGTCAGATAAAATCATTGAAGATCTTCGAAA
ACGTGGGTTTGGTTTTTTTATGTATGGTGCTTGGGCTTGGGAAAACGCAA
GACGGAATGTTCTACCATCTCATTTGATAGAGTTTGTTAAAGTTCACCAC
CCATCCTTTATGGTAGATCACAGTTGCATTGATTGTTTCCAGGGCTCAGA
TTCTTGCTCCCACGAATGCTGTTATTTTAAGGCGAAAGACTTTGCTGAAA
GAACAGGCTTGCAAGTGGTTAAAAAGAAAGATGGTGCCTCTAGCTGATGG
AGATGAAAATATTCCAGACGAAGAAGTAAATGATGGCAACGTTATGAATT
TGACCAAAGTGCTAAACAATGTTACTGATGTCGCTGCAAGAGCCAGGGAA
GCTATCTACAATCATCCTGATTCGCTGCGCAACAACAAGAAACTTGATGT
TTGCTCTCTTATGTCAAGAAAATGAAAAACTTGAACGCTCCAAAAACTGG
GATGTTATTGAAAGTCATCTTTGCAGATTTCTCAAGGATGGTACGTTATT
GGGCTGGGTGAATGATTCCGCTGATGAAAGCAAAAACGTCCTTCTTCACG
CAGTTGGGTCAAAAAGAGGTGGTCACTATGGTAAACGTGTGGATGAAATC
CTTGCGAGTTATCCTGCCTTCAAAGAAATGTTCGATGCGAGTGATGACTC
TAAAAATGAAATTGATCAAAATGGCCTCATCGTTGCTTTCTTAATGAAGC
ACTTCCAACTTGGAATTGCCGATAAAAACAATTGTCGACTGTCTTACGTC
AAAATGATGGTTATAAACAGCTTGTTGAAAGGTGTAAAATAAAAGAAAAG
GATCGCCTAGAATACGAACAGAAAGAATCCCGAACATCGTTGTTAACAAC
AGAGGATAAGGCCAAAATAATGTTGACAGATTTGTTTAACTTTGAATTCG
CGAGAGACTGTCTTGCTCAAAACGCAAGTGTTGGAGACGAGGAGTTCGGT
CGTCTGAAAACAAAGAAATGGCTTCCAACTAACCTTAATCGACTCGACGT
TTCGTGTTTAGAGGACTATATGAGTGAGGAGCATCTTAAACAATTTAAGG
AAATGGTTGGAAGTACGTGGTCGCACAAATCCCTATGCGATAAGTGTCAC
AGAAAGGTGTCAGAGCCAATTGAATGTGACATGTGCTACAAACAATTTCA
CAAAACATGTTTTGGTGCTGAAAAAAATTGCCTTTTTTGCAAATCCATCT
TTGAACTAGGTAACTGTGATGATTTTTGGAAGACTTCCGAGAGCAATGAG
ATTTGCAGAGTTAAAATGTTGGATCTTCCGGATGACTCGTATTCTACTGA
CGATGATGATTCCAATGACTTGCCAACGACCTCTGACGTTTTAAATGGTG
ATGACATACCATAGTGGTGTAATTGAAGCGAAGTTTGATGGTAAAAATTG
GTCTGATGGCTTCTCTTGTGCAGCAACTGAAAGAAATAGCAAGATTACAA
GCAATCCTGAGGGAAAGATACCAGTAATAGTAAAGATTGCCAAACAACGG
AGCTGACTCTACCAGCACCTGCTTTGTCTATTCCATCAAAAGATTTCGTG
GAAAGTGAAATAAATGGTGCTACCAATAACGCAACCGAAAAGATGTATGA
TCATGATTACTGTGTTAATACTGATGGGAAAGATACCAGTAATAGTGAAG
ATCAGCAACACCAAACAACGGAGCCGACTCGTTCACCAGGACCTGCTATG
TATATTCCATCAAAAGAAAAAGGACCTGTTCGTCTAGCTTCTACTTTAAC
GGTTCCTTTGTCAAACAATACTTTATCGAAGAACGCACCATTGGCCAATT
TCATCACCAATCAACGGCCCACACATTTTGTTTTGCCGAATATCGTTGAT
GATGGATCGCCTGAATCAAAGAACAAGAAAAAGAAGCCACAACCAACAAA
AAAATCACGACCAACGAAGAATTCACAACCAACGAAACCAGCTAAGAAGG
CTCTGAATTCAATAAAAAACGTGGACAAAACCCGAATTAAACTCAACAAA
ACGCAAACGAGCCAAAAAAACAGCAAAGCCAACACACGATGAAGCTGAGC
AGGAGCAAGAAGATGAATCCAACCAGCAGGTACTTTTTAGCATTGGACAA
TGAACTATCAGCGACGTTGTCTTCAGATAATGAGCTCACTGACCAACTAT
CACTTCAGTCAGATAAAATCATTGAAGATCTTCGAAAACGTGGGTTTGGT
TTTTTTATGTATGGTGCTTGGGCTTGGGAAAACGCAAGACGGAATGTTCT
ACCATCTCATTTGATAGAGTTTGTTAAAGTTCACCACCCATCCTTTATGG
TAGATCACAGTTGCATTGATTGTTTCCAGGGCTCAGATTCTTGCTCCCAC
GAATGCTGTTATTTTAAGGCGAAAGACTTTGCTGAAAGAACAGGCTTGCA
AGTGGTTAAAAAGAAAGATGGTGCCTCTAGCTGATGGAGATGAAAATATT
CCAGACGAAGAAGTAAATGATGGCAACGTTATGAATTTGACCAAAGTGCT
AAACAATGTTACTGATGTCGCTGCAAGAGCCAGGGAAGCTATCTACAATC
ATCCTGATTCGCTGCGCAACAACAAGAAACTTGATGTTTGCTCTCTTATG
TCAAGAAAATGAAAAACTTGAACGCTCCAAAAACTGGGATGTTATTGAAA
GTCATCTTTGCAGATTTCTCAAGGATGGTACGTTATTGGGCTGGGTGAAT
GATTCCGCTGATGAAAGCAAAAACGTCCTTCTTCACGCAGTTGGGTCAAA
AAGAGGTGGTCACTATGGTAAACGTGTGGATGAAATCCTTGCGAGTTATC
CTGCCTTCAAAGAAATGTTCGATGCGAGTGATGACTCTAAAAATGAAATT
GATCAAAATGGCCTCATCGTTGCTTTCTTAATGAAGCACTTCCAACTTGG
AATTGCCGATAAAAACAATTGTCGACTGTCTTACGTCAAAATGATGGTTA
TAAACAGCTTGTTGAAAGGTGTAAAATAAAAGAAAAGGATCGCCTAGAAT
ACGAACAGAAAGAATCCCGAACATCGTTGTTAACAACAGAGGATAAGGCC
AAAATAATGTTGACAGATTTGTTTAACTTTGAATTCGCGAGAGACTGTCT
TGCTCAAAACGCAAGTGTTGGAGACGAGGAGTTCGGTCGTCTGAAAACAA
AGAAATGGCTTCCAACTAACCTTAATCGACTCGACGTTTCGTGTTTAGAG
GACTATATGAGTGAGGAGCATCTTAAACAATTTAAGGAAATGGTTGGAAG
TACGTGGTCGCACAAATCCCTATGCGATAAGTGTCACAGAAAGGTGTCAG
AGCCAATTGAATGTGACATGTGCTACAAACAATTTCACAAAACATGTTTT
GGTGCTGAAAAAAATTGCCTTTTTTGCAAATCCATCTTTGAACTAGGTAA
CTGTGATGATTTTTGGAAGACTTCCGAGAGCAATGAGATTTGCAGAGTTA
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TCTTGTGCAGCAACTGAAAGAAATAGCAAGATTACAAGCAATCCTGAGGG
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AATCAAAGAACAAGAAAAAGAAGCCACAACCAACAAAAAAATCACGACCA
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AAAAAACGTGGACAAAACCCGAATTAAACTCAACAAAACGCAAACGAGCC
AAAAAAACAGCAAAGCCAACACACGATGAAGCTGAGCAGGAGCAAGAAGA
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CATTGATTGTTTCCAGGGCTCAGATTCTTGCTCCCACGAATGCTGTTATT
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TAAATGATGGCAACGTTATGAATTTGACCAAAGTGCTAAACAATGTTACT
GATGTCGCTGCAAGAGCCAGGGAAGCTATCTACAATCATCCTGATTCGCT
GCGCAACAACAAGAAACTTGATGTTTGCTCTCTTATGTCAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14655MSTRG.14655Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14655.31.p1MSTRG.14655.31.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14655.31.p1.exon19MSTRG.14655.31.p1.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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Position
The following features are aligned
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