MSTRG.14655.18.p3 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14655.18.p3
Unique NameMSTRG.14655.18.p3
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000123_pilon:753961..776708-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14655.18.p3 ID=MSTRG.14655.18.p3|Name=MSTRG.14655.18.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=22748bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:753961..776708- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAACGCCGTACGACCCGGCAATCGTCCGTACGGGGACGTCCTGCAGCGT ACCTTGCGCGGCCCGTAGCCCGACGACCGGTAACAGTGGAGTGATGAAAT TTGGCATGCTCCCCCCTTCGATATGCTTGACGTCTCCAGAAAGTTTCAAT TCGTGAGACCTACCCAGTCCGGCGCTAGGGGAGGGGGTCATTCACGGTCC CGTACGGGTCCTTTACGGTCTCATACGTCATAGCGCCCTTCCGTCAACTT TTCAGGACTTCAGACCTATTTTTTCGGAATCTGCACCCAAAAAAACATGA AACATCAAAACCTGGATAAAAATTTTAAAGGTGACTTTGACCCGCTTCGA TCCGGGGACCTAACCCCTAATGCGTGAAACCAACGCTTTAAACCACTGGA CCAACTTCTAGCCGTGCTTTACAGAAATTTTTCAGCGATGTCATACCTTC GTTAGCTTGACTTGGCCCAGATGGAAAAAAATATATAATCATATTCCGCG GAATACAAAATATAAAAAAAAACATTATTCCGCGGAATAGCTATTCCGGC CGGAACAGCTATTCCGGTTCCGGCATTCCGTCGTTCCGCCGTTCAGCGTT TTGTCTCTACCCAATATGTGTTGAATAAAAAATCACTAGAAATATCTCGA GAAGATAATGGAAGAAGTCAAAAATAAAAGATGAGTATATTGTTTGTTAA TTTTACCATATTGTTAAACTTTTAGTTTTAATGGTCTCTTTGCTATGTCA TTTACCATATGATGTTCTAATGTGGTAAATCTAACATGCGCTTAACATAG TAAATTAAAGCTTTTTGATTGCCAATAAATTGCCTTGCTTTTTATTTTGC TCAACTGCTCAAACAGTCAAAGTTTTTCCCCTAGTAAAAATCTCCTTGGC TCTTATTATTGGCCATTCAATAGGTGGAACAAAGGATTATGGGTTTTTTT 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ACACTATTGTTTTAGGGAAAGATACCAGTAATAGTAAAGATTGCCAAACA ACGGAGCTGACTCTACCAGCACCTGCTTTGTCTATTCCATCAAAAGGTTT GTTTGGTTTTCAAAGTTAGGAACATTTTTGAACGTACTAAGTATTAAAAA TGTCTAACAGAGACAACAGATTACCAGAATTCAAGTTCTAAAACCCCCTA GATCGGGCTGAAAAACTTCAAAACCATATACTCATCCAAAGATAGCGTTA AATTTTTACACCTGTTATGTTAGATAATTGTAGCAGAATACCAAAAGTGC AAAAAAAACGAGGTGATGAATATTTTGAAAATTTTATACTCTTTCAGACT CTTTTAGCATTTAATGGATTCGACATTTACGTTAAACAGTAACCATTAGT CATTCAGAATATCAAAACAGAATTTCAAAATATCTTTATCCGTTTGGTTT CGATATTTATTTATTTGTGGGTAATACTTTTTCCCCTTAGTTCTACTACT TTTGAAAAAGGTCCAGCGTAGTTAGGGTTAAAATAATATGTAGTTTATTT TTAGGACTGAGCCCTTACACTATTTTTTAATTTTATCTTCCAGGCTTCTC TTGTGCAGCAACTGAAAGAAATAGCAAGATTACAAGCAATCCTGAGGTAT GTCATCAGATTTCCCTTTTCAACGGTGACATTTTATGTTTTACATTTGAA CTTCTGCCACCCAGCTCAGACGCTCCCATCACACTACTGCATTTCTTTTT TTATTAATGGGCTTATTTTTAGCTGGGATCTGGATGTCTCAGATGGAAGA TGGGAATTCTAAAATTAGGCGGGACCTCAAGTTTTAGCTGCGACCTGAGT AACCCTCTTGCACTCTACGGAGGTTTAATGTTGTCTTGCGCCGGAGAAAG TGTGAAACAGTCTTAAATGTTGTTATAGTATCGTAACTTTTTCGAAATGT CATTATAAGCTTTAATATCTTCTAATAAAGTCACTCCAGGGCACTCAAGC ATTATTGGCGTGATGTTTCATAGTTTGTCCTTTCCCTTTCCTGGGGGTGA CACCTTCTGGAATTCTGGAATACCCAAGAAGGGGGAGTGCAAATTTTCTA GTGGAAAGGGAATCAGTCAAAAAAAGGGCGAATCGACATTCTTCTTTGGT CAGAAACGACTTTCTTTTCTCTAACTTGAGAAAGTGTCCTCGCAATTTAC TCGATTCTTAATGATGAAAAAAAAAATTTATAACTTTTTAATACCCTTTT TAACTATTGTTTGTTTGACATTAAAATGATTGTCAATCATTTTCCTTTCA GAGACCACTGCAAAACGAACATTTTTCGTATATACAAATGTGTTAAGAAG AGGGGAGAAAGCAAGAAGGATCATTTAAGAAGGGGGGAATAAGACCCCTT TCCAAACTATAATATTTTGAAAAAGGGAAATGTTTTGCCATGGAAAGTCA TACAAATACATGTTATACAAAGAAAGCAATAATTATAGTGTATATTTAGA GCTAGCTTGCAATACTTTTATTGAAATTTGTTTTCAAAGGTGATGACATA CCATAGTGGTGTAATTGAAGCGAAGTTTGATGGTAAAAATTGGTCTGATG GTATGTTTAATTAAATTTGAATAAATTTACAAAGTAACGATTACTTTATT TCAAATCTAGTAAGCTTCTTAACTAGATTTTATTTGAAGGTTTTCCACTA AAGAAAATATTATTCACAACTTCTCTCCCCTGTTGACGAAAAACCTCAAA TTCAAATATCTAAAAACTTTGAATAACGAAATTAAATTAAATTTCTAACA AATTATATACATAGGAGGAAATCTCATAAATCGTTAGAGATATATAAATA CTACTTAATTTTATACCTAAGACTCGTATTCTACTGACGATGATGATTCC AATGACTTGCCAACGACCTCTGACGTTTTAAATGGTACAGTTTTTATAAA TTACAGTAATAGGACTTTTTTAATCTAGAGTTCGCTCACATTTCCTATAT TTCATGAGCAGTTGAAAAGAAAGGCTTTTCTGACCTACTGAAGGTGTTAT TGAACATTTTCTGTGATCTTGTTTTGATGTTACTGTGAGTTCTTCAAGAA CTAAGAAAGTAGCACAGATTAGAGGCGTCATTATTGAATTATTTTCTTTA AAAAGCATTTTACTTGAATTTAAAATTCAGGTAACTGTGATGATTTTTGG AAGACTTCCGAGAGCAATGAGATTTGCAGAGTTAAAATGTTGGATCTTCC GGATGGTAAGGTTTACTTCTTGGACCTTATTGGAAGAGACAATTTGATCC GTAGAATGGATCACGTTAAGCCCATACCCTCCTCGTAATATGTTGGACTA CCGCCTTACTTTTTGAAAACACATTTTCTTGAAACTTGCCCCTTCAGTTC TGTTTGATTCCAACCCCCTTTTGGGATTCTCTTTACCATTGAAAAAAGTG CCACCTCCCCCTTTTTTGAAAAAAATATTTTCTTACATTCTGCCCTGAAA AAATCTCAAATATATCAAAAGCTCAATATGCTGGAAAAATATTTTTTGTC TTCAGCCTAAAGTTATACTTAACTATATGTTTGAGACTTAAACCGTATTT AATGAGAATTTTCAATGTCTTGTTAAAAAGCTGAAATAGGACAAAGATTT GGGATATTATTGAAATTGGTTGTTTGAATTTTGACTTTTATACAAAAATT TATACCAAAAGCTTGCTGAAAGAAAAAAGAAATCACAAATTTTATGCTTA TTTTTTTCAAATTTTAGCTTACATATGCCCATAAGCTTTATGCTTAAAAA AAGAGTTTACGTGAACTTGCACAAACAGAAAAATACAGGGTTTTTAAATC CTATGACTTTTTAAAAGGATTAACAATTCCTTTTTAAGTGGGGGCTATTT CTTATTCATTCATTTATTATTATTTATTAATCATTTATTCTTTCTCTTAG AATCCCGAACATCGTTGTTAACAACAGAGGATAAGGCCAAAATAATGTTG ACAGATTTGTTTAACTTTGAATTCGCGAGAGACTGTCTTGCTCAAAACGC AAGTGTTGGAGACGAGGAGTTCGGTCGTCTGAAAACAAAGAAATGGCTTC CAACTAACCTTAATCGACTCGACGTTTCGTGTTTAGAGGACTATATGAGT GAGGAGCATCTTAAACAATTTAAGGAAATGGTTGGAAGTACGTGGTCGCA CAAATCCCTATGCGATAAGTGTCACAGAAAGGTGTCAGAGCCAATTGAAT GTGACATGTGCTACAAACAATTTCACAAAACATGTTTTGGTGCTGAAAAA AATTGCCTTTTTTGCAAATCCATCTTTGAACTAGGTATTCATTTTTGTCT ATTTTGTGCCTGTGTAGTTTAAGAATCTTTTGAAAAAAATAATCTGATAT TAGTGAGGTCGCTTGGTATAATTTGAAGGAATAAATGATATAAAGCTACA ACTTTGCCCTCTCTATAGGATGCTTATGTCACAGAAAAAACCCCGGCGGT GGAAACCCTTTTTTGGGCATTTTCTATTTTCCTTAGGCAAAAAAAAATTA CCCTAAGGACTAAGATTTTGAACCGATTTTCAAGAGATAAAAAAGGGTTT TCCACCACTGAGATTTCAGGGAAATTTTTGTCCTATAAATTAACCTGTGT TCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTC GTTCGTTCATTCGTTACCAACTTTTCTCAGGATTGAATCATAGGAATCTT TTGATTTTTGGTACAAAGGCGAAAAATGGTGGTGGCCAAAATGTGATGGA GCCCGAATTTCGAAATCTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAATACGGTTATA ATACGGGTTTTTGGATTTTGTGAAGAAATTGGATCATTAATATGACATAA TATTTATGTTTAAGCATGAAATTTTTCTACATTATGTTTTTTTAAGAAAC AAACTTCAACCTTCAATAGATCGTCATTATTTTGTGCTCTGAATGGTTGT TTTAATGGTCACGCTCACGTAAACATTAATTATATTGTGTTTTTATAAGT ACTTTTTACCCAAACAAATCTAGTATTATTTTTGATTTCGACCATTTTAT GTTTTCATTGTTTCAATGTTCATTGATTAGTTTTGATAATCAGGTAGGTC CATAAAAGTATCACTTATTCTTGTGATATAAGCATCATAGAGAGAGGGTC TATGCAAATTTCCAGCTTTGTGTTATTTTTTCCTGCGGTGCTTTCCTTGA CTACGCGACTCCACTATATTATGTATTTTAACCCTCTGATTCAGTTCGTC TTCCCTTTCTGTATTCATCTGAAGAGATTTTAAACTCTTTTATTTTAGTG TTAGGTTTTACTGTGTTTAAAACTTTGCTTTCTACTTTTACAGAAGAAAA GGATCGCCTAGAATACGAACAGAAAGGTGAGGGAGGAAGTTGTTTCTTTT TTGTATTATAGTCTGAGATACATCGAGAAATTAAATATCCTCATTAAGTT TCATTTCTTTTCCCTATACTTTCACTGCTTGGAATGCAATGTGCTTATCT TGTACTGAACATTACACTTTTTCATTATAGAAAATGAAAAACTTGAACGC TCCAAAAACTGGGATGTTATTGAAAGTCATCTTTGCAGATTTCTCAAGGA TGGTACGTTATTGGGCTGGGTGAATGATTCCGCTGATGAAAGCAAAAACG TCCTTCTTCACGCAGTTGGGTCAAAAAGAGGTGGTCACTATGGTAAACGT GTGGATGAAATCCTTGCGAGTTATCCTGCCTTCAAAGAAATGTTCGATGC GAGTGATGACTCTAAAAATGAAATTGATCAAAATGGCCTCATCGTTGCTT TCTTAATGAAGCACTTCCAACTTGGAATTGCCGATAAAAACAATTGTCGA CTGTCTTACGTCAAAATGATGGTTATAAACAGCTTGTTGAAAGGTGTAAA ATAATCTTTTTGTGTTTTTCTAAGACAGGTCATGAAATTTGGTTTGGGTC TGCCTCGATAAAATGTTTAAACAGTACATGGTTGCTACACTGAATTTTCA TGTTTACTATATTTTTGTCAGATTATAGGTGAAAAGTGGTAGTTGTCGAA TCCCTTCTTAATCTCAAAAAATAATTGAAAATGCTTCTGTTGCAACAAGG AAGCAGATATATTTTCACTTCCCTAGTTGCAATAGACACCCCTTTCTCAC AGCCCCACTGGGAACCCACTGGAAATATTGGCCAAAATATCGTTGGAAAA TTATACCCCAATTTTCATCCCCACTGAAAATAATCAAATAAATCAATCCT CATTGCAAAATATCATTCTGTATTTACCATCCCCACTGAGTTTTTTGACT CCCCATCGAGTTTCAGTTCGTTATTTTTACCCCCACTGGCTGAAAAAATT ATTATTTGAATTTTTTAATAGTTGTTTTTGAAAATGTTTTGAAAGAATGA ATTTATAGAGAAGTGCACAAATTTGAAAAAAAATGGCAAGTGGTTAAAAT TCAGCGGAGAAAAACCAAAAGAGGGGATCCTACCAATTTACTGGAGCTTG CTGAGTCTGAGCTTTGTAAATGAGAGCAGATTGAGTCGATGTTTTTAACA TCATACTCTTGGGTCTCTAGTCAATCTCTAATTTCAAACATAAGAGAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000123_pilon:753961..776708-

>MSTRG.14655.18.p3 ID=MSTRG.14655.18.p3|Name=MSTRG.14655.18.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1854bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:753961..776708- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCAAAAAAACAGCAAAGCCAACACACGATGAAGCTGAGGTTGGCTCTTTC
CTCTCAGAAACAAAAAGATTAGTGGTGTTTATTTGGCCATGAGTACTTTT
TAGCATTGGACAATGAACTATCAGCGACGTTGTCTTCAGATAATGAGCTC
ACTGACCAACTATCACTTCAGTCAGATAAAATCATTGAAGATCTTCGAAA
ACGTGGGTTTGGTTTTTTTATGTATGGTGCTTGGGCTTGGGAAAACGCAA
GACGGAATGTTCTACCATCTCATTTGATAGAGTTTGTTAAAGTTCACCAC
CCATCCTTTATGGTAGATCACAGTTGCATTGATTGTTTCCAGGGCTCAGA
TTCTTGCTCCCACGAATGCTGTTATTTTAAGGCGAAAGACTTTGCTGAAA
GAACAGGCTTGCAAGTGGTTAAAAAGAAAGATGGTGCCTCTAGCTGATGG
AGATGAAAATATTCCAGACGAAGAAGTAAATGATGGCAACGTTATGAATT
TGACCAAAGTGCTAAACAATGTTACTGATGTCGCTGCAAGAGCCAGGGAA
GCTATCTACAATCATCCTGATTCGCTGCGCAACAACAAGAAACTTGATGT
TTGCTCTCTTATGTCAAGCCAAAAAAACAGCAAAGCCAACACACGATGAA
GCTGAGGTTGGCTCTTTCCTCTCAGAAACAAAAAGATTAGTGGTGTTTAT
TTGGCCATGAGTACTTTTTAGCATTGGACAATGAACTATCAGCGACGTTG
TCTTCAGATAATGAGCTCACTGACCAACTATCACTTCAGTCAGATAAAAT
CATTGAAGATCTTCGAAAACGTGGGTTTGGTTTTTTTATGTATGGTGCTT
GGGCTTGGGAAAACGCAAGACGGAATGTTCTACCATCTCATTTGATAGAG
TTTGTTAAAGTTCACCACCCATCCTTTATGGTAGATCACAGTTGCATTGA
TTGTTTCCAGGGCTCAGATTCTTGCTCCCACGAATGCTGTTATTTTAAGG
CGAAAGACTTTGCTGAAAGAACAGGCTTGCAAGTGGTTAAAAAGAAAGAT
GGTGCCTCTAGCTGATGGAGATGAAAATATTCCAGACGAAGAAGTAAATG
ATGGCAACGTTATGAATTTGACCAAAGTGCTAAACAATGTTACTGATGTC
GCTGCAAGAGCCAGGGAAGCTATCTACAATCATCCTGATTCGCTGCGCAA
CAACAAGAAACTTGATGTTTGCTCTCTTATGTCAAGCCAAAAAAACAGCA
AAGCCAACACACGATGAAGCTGAGGTTGGCTCTTTCCTCTCAGAAACAAA
AAGATTAGTGGTGTTTATTTGGCCATGAGTACTTTTTAGCATTGGACAAT
GAACTATCAGCGACGTTGTCTTCAGATAATGAGCTCACTGACCAACTATC
ACTTCAGTCAGATAAAATCATTGAAGATCTTCGAAAACGTGGGTTTGGTT
TTTTTATGTATGGTGCTTGGGCTTGGGAAAACGCAAGACGGAATGTTCTA
CCATCTCATTTGATAGAGTTTGTTAAAGTTCACCACCCATCCTTTATGGT
AGATCACAGTTGCATTGATTGTTTCCAGGGCTCAGATTCTTGCTCCCACG
AATGCTGTTATTTTAAGGCGAAAGACTTTGCTGAAAGAACAGGCTTGCAA
GTGGTTAAAAAGAAAGATGGTGCCTCTAGCTGATGGAGATGAAAATATTC
CAGACGAAGAAGTAAATGATGGCAACGTTATGAATTTGACCAAAGTGCTA
AACAATGTTACTGATGTCGCTGCAAGAGCCAGGGAAGCTATCTACAATCA
TCCTGATTCGCTGCGCAACAACAAGAAACTTGATGTTTGCTCTCTTATGT
CAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14655MSTRG.14655Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14655.18.p3MSTRG.14655.18.p3-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14655.18.p3.exon31MSTRG.14655.18.p3.exon31Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon30MSTRG.14655.18.p3.exon30Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon29MSTRG.14655.18.p3.exon29Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon28MSTRG.14655.18.p3.exon28Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon27MSTRG.14655.18.p3.exon27Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon26MSTRG.14655.18.p3.exon26Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon25MSTRG.14655.18.p3.exon25Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon24MSTRG.14655.18.p3.exon24Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon23MSTRG.14655.18.p3.exon23Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon22MSTRG.14655.18.p3.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon21MSTRG.14655.18.p3.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon20MSTRG.14655.18.p3.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon19MSTRG.14655.18.p3.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon18MSTRG.14655.18.p3.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon17MSTRG.14655.18.p3.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon16MSTRG.14655.18.p3.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon15MSTRG.14655.18.p3.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon14MSTRG.14655.18.p3.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon13MSTRG.14655.18.p3.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon12MSTRG.14655.18.p3.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon11MSTRG.14655.18.p3.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon10MSTRG.14655.18.p3.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon9MSTRG.14655.18.p3.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon8MSTRG.14655.18.p3.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon7MSTRG.14655.18.p3.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon6MSTRG.14655.18.p3.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon5MSTRG.14655.18.p3.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon4MSTRG.14655.18.p3.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon3MSTRG.14655.18.p3.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon2MSTRG.14655.18.p3.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14655.18.p3.exon1MSTRG.14655.18.p3.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000123_pilongenomesc0000123_pilon:753961..776708 -