MSTRG.14649.8.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14649.8.p2
Unique NameMSTRG.14649.8.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000123_pilon:704310..742988-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14649.8.p2 ID=MSTRG.14649.8.p2|Name=MSTRG.14649.8.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=38679bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:704310..742988- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGTAAGTTAGAAAACATAGAAAATAACTCACAAAGAAACAGAAAGTCAG AAAAACTACGAACAAGAGACTGGAAAGTACGAAATAAGTCCAGATCTGTC TTTCGTCTTTGTGAAGAAGCCACGACCGTAAGGTCTGGTGGAAAGTGACG AGTGTCAAGACCCTATTCTCTTTTTATGAAGGACTTTTGGTATAAAAACA TATAAAAATGAGTAATCGTAATAGAAATAACCTTCCTAACAATCTTGCAC AACTACAGAATCTCATCAAAAGAGATCCAGAGTCATACAATACAGGGAAG AATTTCTACAACAATGGAAACATTTTCAATCCAATTTGGAAATTTTCAAA CTGGATCCAACCAGGGAGGCTGAAGCTGTAGAAGATGTCATGAAATTCAT TGCCCAGGTATAAATTGTAATCAGTTTGAGGCTGAGAATTTTTTTTTAGA AATATTAATTTTATCATGATGACAAAATGTTATAAAATCCAGACCCGATC AATCAAACAACCAGACGGTGTCAATCGAACAACTTCGAACAAAAATCGCA ATCGAACTAATCGAACGTAATCGAACGCGATCGAATAATTGCGATTCGAT CGTCAAACGTAATCGAATCTCAATCGAACGGTCGATTCCTGGGTAATATT CGATTGCGTTCGAGTAAGGTTAGATTGGTTCGATTGATTGTTGACCATGT TCGATTGGTTCGATTGATTGTCAGTTACATTGGATTAATCTTCGATATCG TTCGATTACGATTATGTACGATGAGTTTGATTGCGATCAAATTAAATTTG TTCACTCTGTTAGAGCTTCTTAGCGTGCGCGGCGGAGCGCTTAAGTACCA TACTAAGGCGAATAAAATCTAATACAATTGAATCAATCGAACGTAATCGA ATACAATCGAACGTAATCGAAGCAATCGAACAGCAAATCCTGGGTAATAT 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CGAATAAAGTATTCTGAAATAAAAAATTTTTTAGCAGTCATTTTTTAAAT TTCTTCAACAATTATAATTGACACTTCTTTAGACATTTTCAAGCATAATA ATTTCAATTCTGGTACTGTATCTTTCTTTCATTTAGAGTATTTTTTTTAA GAAATGAATGAGATTGAAGAAATAAAAATAAAAATTGAAGAAGAAGAATT TCATGATTGTGACGAAACGAATCATGAACATTTGGAAATTGTTATCAAAC TGGAAGATGAATCAATCGGATATCCAGACAAAAAAAATTTGGAAACATTC AAAAACTGTGAAAATGAACTATCGATAATTTCTTGTAGAAATGAAAAGGG GAACGATGTTACATCACCCGAAAAAACTGACCCCAAAAATTATGATATCA CCATTAAACTTGAAGACGAGTCAAAGTCTCAAGATGATAATAAGAATCAA AGTGCACAATTAATGGATATTTTAGAAAATAGAAATTCGGTAAATATTAA CGATGGAATGAATTGTTTTGATCAGTTTTCATTGATTGAAGAAATTAATT CACAGATCGGAGAGGAAATCACTATTAAATTTGATGATGAATTGCAAAAG TTTCAAAACAATGAAAATGAAAGTCTACATGAAGGTATAAAGGCAATTGA GTGTCAGGAATGTGGTGAATCTTTTGCTACAAAGAGAAATTTGGTGATGC ATCAAGTAACAGTCCATGAGGAAATAAATCTTTTTGAGTGTCAAGAATGT GGTAAGTCTTTCGGAAAGAAATCGAACTTAACTTTGCACCAACGAACTGT CCATCAAGGTATAAAGGCCTTTACATGTCACGAATGTGGTAGATCTTTTG GACAGAAAGCGAACTTAACTTCTCACCAAAGAACTGTCCATCAAGGTATA AAGGCCTTTTACATGTCACGTTCACATTTGAGTGTCAGGAATGTGGTAAA TCTTTTGGACAGAAAAGAACTTAACTTCTCGTTTAAGAACTGTCCATCAA GATATTATGGTGTAAATTGTCGAGAATTTGGTAAATCTTTTAGACAGAAA ACGACCATGACTTTGCATAAGAACTTAATTTCGCATTATAGTACTGCCCA TTGAGGGATGAAGTCTTAAATTTCACGAATATGTGGTAAACATTTCTAAG AAAAAGAAACGGAACTTCTCATCAACGATTTGCCCATAGGTATAAAGATT TTAAATGTTCTTAATTTTTTAAATTGTTGTAGAGAAAAGAAACTTGACTT TTCACCAAAGAATTGTTCATGAAGTTGTAAAGGCTTGGTAATGTCAAGAT TGTGGTAAATTTTTTGGATGAAATATAGACTACTCATCAAAGAATTGCCC ATCAAGGGATAAAGGCATTTGATTCTCATTAATGTTGTAAATATTTCGGG GGTAAAAGTAACTTTAAGGGATCTTCTCAAAAATAAATTCGCTTAAATAA TCGAATTTAAGCGAAAAATTTGCTTAAATAATCGAAGTACTTCGATTATT TAACAATCGAAATTCGATTATTTAGTCACCTCAGTTCGATTATTTAGTCC CCTCAGTTCGATTATTTAGTCCCCTCGGTTCGACTATTTAATCTTATTAT TCGATTAATTAATCCTTTTGATTCCAAAATATAATCGAATTTTTTCCGAA ACATAGGTCGAATATCGGTTATTTTTTCTTACGTAGATCGAAAACAGCGA AAACAAGCCTTTGTCTACTGTGGATTTGAAAGACAGAAGAAAAAATATTT TCAAAAAGCCGTAGTCAAATCAACCAATGACTGCATAATTCTTCTTACCT TTAAGGATTTTTGATCTACCAAGGGGCATCATAAATTATGAAATGATAGA ATAATCCTTTTGTGAATCACATTATCGCATCATCTTTAAGTTTCTTAATG TTTGGATAACAATTCCACGATCTCTCCACGATAAAGTATTCGAAAATAGC ACTTCATCGTTGTGTTCATGTTCAAATCAAAAAGGGCAAAACAAAAAAAA AGATAAAAGGATAAAAGGGAGAGCGCTCACAAGATCAAGAATACGTCATT ACGTCATATATAAAAGCAGGAAGAAAACAATCTTTTGCTCTATTGTTCTG TTCGCAAACGTCAATCATGGCGTTTTGATTGGTCAATGCAACATTTTTTT CTTACAAGTTACGTCATGCTCTATTATTCTGTTTGCAAAAATGGATTCGA ATTTTACATCCAGGTTTTTTTTAATGGCTAGATAAGAGATCGAATCATTA CAGAGAATTGATGCTACTCTTTTTGTCATCTAAAAAATGAAGTCGTTGCA TTGTTTTTCGCGCGAGTTCTATTTTTTGCCAATCAAATTGCGTCACGCAT TCGAAAAATTCGAAAATGTTGCAATCAAAACATTGAATTCATTTGTGAGT TTGGTTTTGAGAAGAAAACATTTTCTAAAAATTAAACTTAAAACATTGTG ATTTTATTCATATTTTGAAAAGACTTTGAAAACAGAAAGTTTTAAAATTT ATTACATTGAGATATGGTTGTAAGAGGTATGTATGTATGGAAATGGAATG CTTTGTTTGCTTCAGTTTTCACTACAGACTTTCCTCCCTTCGAAATTCAG TTTTCGATGGGAGCCTTTATTTATCTAAACTTTGTTTTTATTAATGGTGA TTCATTTTTGGATATCAAAAACTCCCAAGGATAACCAGTAAGTTTTTTAT TTTGGAGGTAAAAAATGCTAAAGAGAATGAGTAGATATGTGTCGGTGATT TGTAAAATAAAGGGATTTCTTTTTTCGAAATTGCGCTTCCATTGAAACGT GAAGTTAAAATTGACGTTACAGTACAGCATTTGAAAAAAGATATAACTTC AAGGCAAAAATATCGATAAAAATTGGATTACAACCTGTACTTTTTTATAT ATCATTTTTTAGCATTTTTTATCCTCTTTCACTTGAACTTGCGATGGGTA GGAAAATTGTCCAAAACAAACAGCCGAATTTAACCGAAAACTATTTTACC GAAATTCGGTATTTTTGAGAGGATCCCTAAGATATAAGCGAAAAAGGATT AATTAATCGAATACAAGGATTAAATAATCGAATAAAGGAGATTAAATAAT CGAATATAGGAGATTAAATAGTCGAAGCTATTCGACTAAACGACGGCAGC TATTCGATTAAATAGTCGAATCATTAATCGAACTTAATAATCGAAAATCG ATTATATTTTTGAGAAGATCCCTAAGGCTCGTAAAGAAAATGTTCACGAA AGAACACTTTTTAAATGTCAAGAATGTGGTAAATCTTTTGCACGGAAAAG TCATTTGAAAGCACATCAAAGAACAGTGTATAAGATATAAAATCATTTTG AGTAACAATAATGTGGTAATTGTTTTGGAGACAAAGGTTTGATAAAGAAA CATAAAAAACAGTCTATGATAAAACTATACCTTTTAAATGTCGTGAATGT GGTAAGCGTTTTGCATTTGTCTTGTTTTGGATGGATACCAAGGAGATGAT TAAATTTTCACCAAAAATACAGCCTATTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000123_pilon:704310..742988-

>MSTRG.14649.8.p2 ID=MSTRG.14649.8.p2|Name=MSTRG.14649.8.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=951bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:704310..742988- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATGAGATTGAAGAAATAAAAATAAAAATTGAAGAAGAAGAATTTCA
TGATTGTGACGAAACGAATCATGAACATTTGGAAATTGTTATCAAACTGG
AAGATGAATCAATCGGATATCCAGACAAAAAAAATTTGGAAACATTCAAA
AACTGTGAAAATGAACTATCGATAATTTCTTGTAGAAATGAAAAGGGGAA
CGATGTTACATCACCCGAAAAAACTGACCCCAAAAATTATGATATCACCA
TTAAACTTGAAGACGAGTCAAAGTCTCAAGATGATAATAAGAATCAAAGT
GCACAATTAATGGATATTTTAGAAAATAGAAATTCGGTAAATATTAACGA
TGGAATGAATTGTTTTGATCAGTTTTCATTGATTGAAGAAATTAATTCAC
AGATCGGAGAGGAAATCACTATTAAATTTGATGATGAATTGCAAAAGTTT
CAAAACAATGAAAATGAAAGTCTACATGAAGGTATAAAGGCAATTGAGTG
TCAGGAATGTGGTGAATCTTTTGCTACAAAGAGAAATTTGGTGATGCATC
AAGTAACAGTCCATGAGGAAATAAATCTTTTTGAGTGTCAAGAATGTGGT
AAGTCTTTCGGAAAGAAATCGAACTTAACTTTGCACCAACGAACTGTCCA
TCAAGGTATAAAGGCCTTTACATGTCACGAATGTGGTAGATCTTTTGGAC
AGAAAGCGAACTTAACTTCTCACCAAAGAACTGTCCATCAAGGTATAAAG
GCCTTTTACATGTCACGTTCACATTTGAGTGTCAGGAATGTGGTAAATCT
TTTGGACAGAAAAGAACTTAACTTCTCGTTTAAGAACTGTCCATCAAGAT
ATTATGGTGTAAATTGTCGAGAATTTGGTAAATCTTTTAGACAGAAAACG
ACCATGACTTTGCATAAGAACTTAATTTCGCATTATAGTACTGCCCATTG
A
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14649MSTRG.14649Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14649.8.p2MSTRG.14649.8.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14649.8.p2.exon5MSTRG.14649.8.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14649.8.p2.exon4MSTRG.14649.8.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14649.8.p2.exon3MSTRG.14649.8.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14649.8.p2.exon2MSTRG.14649.8.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14649.8.p2.exon1MSTRG.14649.8.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000123_pilongenomesc0000123_pilon:704310..742988 -