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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000123_pilon:196883..204885- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14614.1.p1 ID=MSTRG.14614.1.p1|Name=MSTRG.14614.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8003bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:196883..204885- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTATCTTTGTTGAAAATCGAAAGTGACAAAGTCCACATTTTATCAGATT
TGACTTCTTTTGCAAAAATCTTGCCAAACACCTAAAGTCTTTGTAGACTG
AAGAAAATAAACAACAGTTTTGGACTCTCACACAGTCACACAGCATTCTG
TCAACAAGCAAGAAGTGAAGCAGCCAACAATCTTGTTTATAATGACAACT
TTACCTGGTAAGAATAGATTATTGATAGGACAGGTTCAGGGGGGGGTCAA
AGTTTTCTGGGTATAAAAAAGCTGGTAGCCGTCACCCAACCAACCCTACA
GCCCTATTTTTTCGCAATTACAATGCAGCCAGTAGCTTTAGCAGACTTTC
ATTTGAATTGAGCCCAAAATCCAGTTTGTACCAATTTTTTCTCCCGATTG
CTGGCAGGCAGGCTAGCTAAAAGTAGGGATTCAAACTTTGAATGAATTTT
TCAAAAAATCTAATTAACTTACGACTTTCAAATAAAAGGAATATGGTAGA
CTAGATATAGTCATCTGGGGTAATTGCGGGACGATTTTGACTTATTTGGG
CATTACTCTGAAAAAGTATTTATCCTCAAGATCCGATCTTTTGATATTTT
ATTCATCAAAAAGTATGACCTTGACTCTACACACGATTTATTACAGTGAA
GTCGGGTAACTTGCATCAGTGGAGGCAAACATGCATAGCCCTCAAAGAAT
GACCTGTCTGGCAGTTACATCAAAATGCCTCGAAAATGTCAATATGAAAA
TTGCGTAATCAGGGAACGTATGTCTCGCTCATTATAAAAAGGCCGAGACA
AACTTTCAATAATTGGATTGTAACATCGAGTTAAGTCTCTTTTGTTAAGT
CACCAGGGGTAAATAAAACAGACCTTGATACATTTATCCTTCGTTTCAAC
TTGACGATTCGTTCAAAACTCAGCCTCTTAAATATTTGGGGTAGGTAAAA
TAAACAATAAAATATAATTACCCTTTCCAAATAAACCTCTTCGGTGACGA
GCGCAGTCTACTCTGACTTAATTATAAAATTTATGTGATGGGAGTTTGAC
GTACTCTCTGTGTATTTACATTCGTTGTAATGTAATGTTGTTTGGGGAAT
TATGAAGTTCTCTGGAATTTCGATTGCATTTATTCAGGTTGATTTTTTAT
GACTTCTAATGGTATTTTTTCTAACGAGTTTGATTACTCTGTTCTCACAC
TTATGTCTTTTTTTTTGCGTCCTTTTCCGTGATTACTTTTATTTATATTT
TTAAAGACAGATAAGAAGGCATATTGATGTAACTGTCTGGTATCATTAAA
ATTAAAGTTAAATGAAAACAAAAATTGTAGAGTAGAGCCCATCTGCCCCT
TTCTGACAAAAAGAAGTAACCCACATGAAGTCAAATTGAGAAAATCAACC
AAACGCGTTTAATGCTGGCATCGAATGCAGATAGTATATATCAAAAAACA
AATGACTGATTATTGTTCTACTCATTGAAGATTAGCATCACTGCTTTTCT
CACAATGCTCACTGTTGCAGAGGAAAACAAGACCCTTGTTTTGTCAGTAA
ACCTCAACCAAAAGAAATTGAAGAAAGAAGTAAATGACCAGTTTTTTGAA
GAATATTTCTGACAAAAGGAAGTAAGTGATACCTTTTTCTGACAAAAAGA
AGCAAAACAGTCATTTACTTCTTTTTGTCAGAAAACATTCTCCAGAAAAC
TGTCAGTTACTTCTTTATTCACCCTTGGGAAGAAGTTATATCGGATCGCC
CAAAGTTACCTTCATGTTTTTATTTTATTTTCTTATCTCTGATCCAGTCT
TTCTTTTTTCTGACTGTCTGAGTTTCTGAGACTTAGTTTTCAATTCTGAC
TAAGTTTTCATACCTGTATCATATTTTGACCAACCACATCATCGCACCAT
GCGGGGTTTGAACCACCATCAAAGAAAGACCTTCGGATTCGGATACCAAC
GCCTTATCTGTTGAGCCATCGTCGCATAGCAAAACCACGCAATTCATAAC
ATATTATACCGAACTGGCAAAAGACGGGGGCAATGATATTATAATATGGG
TAAAAGTACCCCTTTTTTAAACCTGACTGAAATTCGAGCCGTTACTAGCA
ACCCTGCGAGGCCCAAGGCGCCGAGTATGCACCCGGCACAGTGACAAGCC
GTAACTAGCAACCCTCTAACTGTTAGTTAATCAATTCCAAACAACAAAAC
CCCCAGAAACACAGTGGGGTGACCATCAGCGATCCGTGGATAAGAAAATG
AAATAAAAAAGTGAAGGTAACTTTGGGCGATCCGATATAACTCACTCCAC
ACCCTTGGGGTAAATATGGGACAGGTATAAAATGTTATTGAAAAATCCAG
ATATATATATTTCCAAAAGGTCATGATATTTGGGGTTTTGCATCCACTTG
ATGACTTCAAATCCAAGTGCTATCATTTAAAGGAGTTTCAACAAAATTGG
TGACAGTGTCCCATTTTTACCCCAGCTTTTTCCCCATTTGGGAGTAATAA
CAGGACACTTCAAACAGTGATATTTGTATAGAGCAATCTAGACCAACTGA
AGTAAATTAGATGCAAACCTTTGCAGGTTTTGAAAGACTTAGAGTGTAGT
TATGATTCCATCAAGCTAGAAAATCAAGTTTGTAGTTTTCTTATAAAAAA
TAAGCACTTTTTTAAACTCAAACTTTAGTGTCCCATAATTACCACAAGAT
TAAGATTTGACTACGGGGTAAATATGTTCTTGTTTGATAATGAGACTATT
ATGATCTCAAACCATAGTATCTTGATGTCAGAATTCAGTCAAAATTATAA
TCAAAGTGATTGCAGCTCTTCCTGACACTAAAGCTTGAAAAAGTTCCTTC
TAAAACTACAAAATTTTATTTTTATGATCACATGTGAAACTTTTGTTGAA
ACATCAAAAGTATATGCTAGAATGATCTAACTAGACATTTTTCTAGCCGC
TAGAATGACCTGGTCAAATAAAAAATAGCTTTTTATTAGCTGTAAGGTTA
AAAATATTTATAAGTTTTTCCATTCCTTATCCATTATTTTCATGAGATTT
GTTAATTTGTTAATATTTAAAAGTTCAACAGAAGTCTGCTCTCCTCCACA
CAAGTCAGAGTTGTTCACTCGGTGGCGATTTCGCGAACCCCTAATTCGAC
AGTCTGTCATTTTTACAGCTCGAACACTGCGATGGAGAGCGATTATCTTT
GGTGGAAATGAAACTTGAAACATGTTTTCTACCATATTCCTTTTATTTGA
AAGTTGTAAGTTAATAAAAAATTTTGAAAAATTCAATCAAAGTTTGAATC
CCTAATCCCTAATTGCGAATCCCTAATCCCTAGTTCCGAATACCTAACCG
AGTTATTTTTAATAATAAAAACGTGATAGATTATCTTGTCTCTAAATAAT
TGTTGTGGGGTAATTAGTGATTTGATAAGCTGTAGTGTTCTCCAAAACAA
CTATATAGTAAGCAGGTTTCATGAGCTTTTCTATGGTATAAATGAAGACT
CTCCAGAGTATTGGCGATGATGAAGAAATAGAAGAAAAATTAAGAAGTGA
ACCCTTGGACAATAGCTAGATTGTTTCATTTTGTTCAATTACAAACACTT
GTGAAAGCGCCAAATATACTTTTAGGCAGTGCTAAATTTCTGGATTTAAC
TGTTTTACAATGATTTCCTAAGTGAAGAAAATATGGTGAGGCAGGGTAAT
TTTGGGCCTCGAAAAATATTTTTTTCAAGAGTATTTTGGCCCTTTAGAAG
GTCCGAAGGTGGGAAGAGAGCCTCAGGTCCAAGTCTTTAAAGTCTTTAAA
AAGCAAATTGCCTTCAGTGGACGTTGATGGCAGCCCTTTACAGACAGAAG
CTTCATATGTAGTATATTTCATGCTCTAATGAATTTAAAACGAAAATTCA
CATGCAAGATTTCTACATCAAATCAAGGACAATCCTTGGTTATCCTTTGG
ACAAATCAAGAACAAAACAAAGTACACCTTGGGAGCAAAAATCCCTGGAT
ATCAGGGATAAACTGAAATGTACTAGAATTTTACTTGATTAAGAAAACTC
TATCCAAAGTTGTCCTTGATTGTACTTAGCTTAGATTTTACAAGTTTGTG
CTGCTCCAGATTGTCCATAGTTTATACCTAATTTCTTTTTTTGGTTACCC
TTAAAAATTTAGGTATAATTAAATCAATACACCCTGGTTGTGTACTTAGT
TTTGTCCTTGAATACCAGGGATAATTTGTGTAATTCTTTAACTTTTTTTT
AATTCTTGTAAATGTTTTTGTTTTATTCAGAGAAAGCGACAAAGTTCTTC
GAGAATGTGTCTCAACTTCAATCATTTCCTGTATTCATTGGATACCTCCT
GATGATATTATTGATCCCAGTTTGGAAGCGCATTCTTCCAGTTGCGAACA
ATTTGAAAATGGTAAGGATTTTTTCATTTGGGAACTGTTTAATTTTGTTA
CTAGTTACTACTTATTGCTAGTTGTTATTCTGTTAGTTAAAATTCCCCAA
AAGAAAAGGAAAAAATAAACAAGAAATAGTACACGTTTTTTTATAAAACA
TTCAAAATTTTTGAAGCCTTTGGATGTTCTTTAACTTTTAGGGCTTTAAG
CCTAAAAACTTTCTTAAAATGTTCTTAATTTCACCATTTGTGACCATTTT
TACCATTTTCCTAAGAAATCGGTTGTTTAGAGTTCACAAAGCCTTAAAAT
GTTTTTAACTTGTTCTTAACATTTTGGCCATCGAAGCCTTATGTTCTTAT
ATAGTTTGTTCTTATAAAAAACGTGTAGACTCTAATTAAAAAGTAGCTAT
GATAATTTTGAATTAAAAAGAGATTTGGCTAGTTCGTCATGCTCGTGGGA
TTATTCCAAACTAGAAGTACAACTTGGTGGTTTTAAAAAGCAATATGACA
TCCCCTTCTTTATCAGCCAGTAGGGGTAAAATAACGGACAAAAGTTCGAT
TGGGATTGATATTCCCATGTTTTTTTTATGGCTGGGGATTTGAATTCCAT
TGTTTTCTGCCCAGACTATTCAGTGGGGATGGAAAAAAAGCACAATATTT
TGCAGTGAGGATTTTCTTATCTGACTATTTTCAATGGGGCCAAAAATTAG
AGTTTGATTTTCGACCCCCCCCCCCCCCCCCACTTTCCATTTGGGCCGGT
TTTTTGGCCAATTTTGCGGCTAATCTTTGTTTTTCTTTTGATTAAAAACA
CGGCCATAACTGGATGAAAAGTGTCTTGGTCAATTTTTTGTTCTTGAATC
CGTTACATGTTATTTTTTAATAAGCATAACGCTTATAAGCATATGAAGGC
TCAGATTTGCAGAATTCCTACGCATAACATAAGCATATTATGTCAGCCTG
AAATATTTTTCAAATTATCTATTTTTTATCTGTTTAAAAAGATATGGTAG
AGGTTAAGTAAAAAAAAAAGACATTCTACGGCTAGCTACATTCCACTGCT
TCCAAAACCTGAACCAACTTTTACAAAATTTCTGAAATTTCACTAAAAAC
TTGGCTCGGGGTGAGTTATAAGCATGATTCATAAGCATATGATAAGCGTC
AGCTATGTCTGGATGCTTTGAGAACTTCAGCATACACGAGCCTGATCGAG
GGGCAGACACTTGCTTATAAAAAACATGTATTGCTTCTTTCTTTAAGATC
ATGATACCTTACAACATCATCTGTGTATTGTTGAGTTTGGCTGCAACATT
TCTTCTCTTCTATGGAGCTTTTTTGGGAAGTCATCTTTATGCATACGAAG
AGAACCAATACATTGTATATGGCATGGCAATTTACACTATCTCAAAAAAT
GTTGAATTGCTTGACACTGTTTTCATGATTCTACGACATAAATATCGACA
AATTTCATTCTTACATGTAAGTGGGAGGGAGGGTATGCTTTTTTTCATCA
ATCAATTATATCAGTAGAGTTTAACTTGGAAAGGGACATTGCTATAAATT
GATTTTGGTTTAAAGGGACATAAAAGTACTGACGAAATTTGTAAACAAAC
CGTATGCAGCGGGATACAAAATCAAAACAAATGTCACATGTCAAGATAAA
ATATATAAAACACACATGGCTGATTTTGATTGTTTTAATTGTTTTACAAG
TTTGTTTTGGGCACGTGATTTTAATTGTTCTCTTAAAATGACACTTGATT
TGCGCAATGTTTACATTTTACTACTTTAATGTCCCTTTAAATGCCTCATC
CAGTTTATAAAGGGGTATCCCCGAATCCACCATTTTGTCAATCTTTCCCA
ATTTATATCACAACTTCGAACCGAGAACGAACGAAATTTTACCACAGAAA
ATTTCTTTGAAATCGAAGATTTTGATAGAAAACTTGTATAAAATTATTTT
GATTATTTTTTAATTTCAATTATTAGTTCCCCGATGAACTTGATTAATGA
CAGATTCTCCCACTTTCCACTTTTAGGTATTCCATCATTCCACCATTCTT
GTTTTGGGTAATTATGCATTTGTTTACACATGTTACCCACCCATAGCTGT
ACCAGTCGGGCTCAACTCACTTGTACACGTCCCCCTTTATGCATATTATG
CTAAAACAGCTATCTCACCTTCACTGCAAGTTTCATGGAAAAAAGCGCTA
ACCATTTTTCAAATTGTCCAATTTTTATTTGACTTGGTTTTCGCGACTAT
AGGGTATTTGTATCATGGGTTTTGTATTTATTCAATCATGTATGGTGGTT
CTATGCTGGTTTTGTTTAGTAATTTTTATTATTTTGCTTACATCAAAAAG
AAGAAGACTGTTTAAAGAAATACGTTTTAAAAATATGATTTTTGTTGATT
TGATAAACGACGGTATAATTCGTAGTCTCAATCGCAGACCTGGCCTCTAT
AAGAAACCTTTTTCGCTAGAGGATGAGCAGAAGCCTATATAAGGGGGGGC
GTACGGGATTTGCTATTTCCGAAATACCGAATAATTTTGCTAAAATTTCC
GAAATTCCGTAAAAAAAATACAGGGTCGATTTCCGAAATTCCGAAATACC
GAAATACCGTACGCCCCCCACATATAATTCGATACTTTGCTTGGAGAGCA
GTTTATTTACTTCTTTGGAAGTAGTTTATTATCATAATGTACCTATCAAA
CATAAAGTATTTTCAACGATATCACTATGAAGGACTTACTATTAAGTGCC
AACACGTATATATGTGCGCATTGACCTCAGTTTGATAGAGTATTATTCCA
AGTATTCAGAGGACCAATTGTAATAGCAATGAAACACTCGTCCCGGGGCT
CCAAAAGTCAAAACCAGGATACTTATATTCATCCAAGTAATAGAATAAGC
ATGCCAAAGTTCAGTCATTACCCTAGGTTGGTGTAATGTCGACATCCCTC
TTCTAATTTCATCACCCTTTTTTAGAGATAGGAATAATAGGAAGGTCGGA
ATCGCTGGTTGAAACTAATTTTCTTTGCTTATCAATCAGTCGATGAGTCC
ATCAGTGATTCCGACCTTCCTATTGTTCCTATCTTTAAAGAGGGGTGTCG
AAATTAGAAGAGGGATGTCGACATTATAAAATTGAGAATTTTCACATTAA
AAATGGCTCAAAAGGACAAATACTTCTTGTATTTGCTTGAAACATTTGTC
CTTTAACTTTCAGCAGGCTAAAAAAAAGTGCCATAAAAGTTACATCTTAT
TCAAAAGTTTGAAGTTTTAAAGATTTTCTATTTTGTCAAGAATTTTTCGC
GAGCATAAACTTTCGCGAATGGCCCTTCCTAGAATTTTTAAAGACATTTA
CTTTCGCGAAAGGGGCCTAAAGTAGCGTGCATTTTTTAGTCGGTGCTGAT
GCTAAGTAGATCAACCTTTGTTGAATTTTAGGATTAGGGATTTACAATAT
ATGAATAATTCACTTAAAACTTTTGTATATATTTTTCTATATACAGTGCT
AGGAAGAACTTTTTATACTCAGACTGTTTTTAAACATAACAGGATTTTTA
TAAAGGACAATTTTTGAAGAGAAAGATTCACAATAAAGAAGAAAAGAAGA
AAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000123_pilon:196883..204885- >MSTRG.14614.1.p1 ID=MSTRG.14614.1.p1|Name=MSTRG.14614.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2820bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:196883..204885- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTATTCCATCATTCCACCATTCTTGTTTTGGGTAATTATGCATTTGTTTA
CACATGTTACCCACCCATAGCTGTACCAGTCGGGCTCAACTCACTTGTAC
ACGTCCCCCTTTATGCATATTATGCTAAAACAGCTATCTCACCTTCACTG
CAAGTTTCATGGAAAAAAGCGCTAACCATTTTTCAAATTGTCCAATTTTT
ATTTGACTTGGTTTTCGCGACTATAGGGTATTTGTATCATGGGTTTTGTA
TTTATTCAATCATGTATGGTGGTTCTATGCTGGTTTTGTTTAGTAATTTT
TATTATTTTGCTTACATCAAAAAGAAGAAGACTGTTTAAATCATGATACC
TTACAACATCATCTGTGTATTGTTGAGTTTGGCTGCAACATTTCTTCTCT
TCTATGGAGCTTTTTTGGGAAGTCATCTTTATGCATACGAAGAGAACCAA
TACATTGTATATGGCATGGCAATTTACACTATCTCAAAAAATGTTGAATT
GCTTGACACTGTTTTCATGATTCTACGACATAAATATCGACAAATTTCAT
TCTTACATAGAAAGCGACAAAGTTCTTCGAGAATGTGTCTCAACTTCAAT
CATTTCCTGTATTCATTGGATACCTCCTGATGATATTATTGATCCCAGTT
TGGAAGCGCATTCTTCCAGTTGCGAACAATTTGAAAATGATGACAACTTT
ACCTGGTATTCCATCATTCCACCATTCTTGTTTTGGGTAATTATGCATTT
GTTTACACATGTTACCCACCCATAGCTGTACCAGTCGGGCTCAACTCACT
TGTACACGTCCCCCTTTATGCATATTATGCTAAAACAGCTATCTCACCTT
CACTGCAAGTTTCATGGAAAAAAGCGCTAACCATTTTTCAAATTGTCCAA
TTTTTATTTGACTTGGTTTTCGCGACTATAGGGTATTTGTATCATGGGTT
TTGTATTTATTCAATCATGTATGGTGGTTCTATGCTGGTTTTGTTTAGTA
ATTTTTATTATTTTGCTTACATCAAAAAGAAGAAGACTGTTTAAATCATG
ATACCTTACAACATCATCTGTGTATTGTTGAGTTTGGCTGCAACATTTCT
TCTCTTCTATGGAGCTTTTTTGGGAAGTCATCTTTATGCATACGAAGAGA
ACCAATACATTGTATATGGCATGGCAATTTACACTATCTCAAAAAATGTT
GAATTGCTTGACACTGTTTTCATGATTCTACGACATAAATATCGACAAAT
TTCATTCTTACATAGAAAGCGACAAAGTTCTTCGAGAATGTGTCTCAACT
TCAATCATTTCCTGTATTCATTGGATACCTCCTGATGATATTATTGATCC
CAGTTTGGAAGCGCATTCTTCCAGTTGCGAACAATTTGAAAATGATGACA
ACTTTACCTGGTATTCCATCATTCCACCATTCTTGTTTTGGGTAATTATG
CATTTGTTTACACATGTTACCCACCCATAGCTGTACCAGTCGGGCTCAAC
TCACTTGTACACGTCCCCCTTTATGCATATTATGCTAAAACAGCTATCTC
ACCTTCACTGCAAGTTTCATGGAAAAAAGCGCTAACCATTTTTCAAATTG
TCCAATTTTTATTTGACTTGGTTTTCGCGACTATAGGGTATTTGTATCAT
GGGTTTTGTATTTATTCAATCATGTATGGTGGTTCTATGCTGGTTTTGTT
TAGTAATTTTTATTATTTTGCTTACATCAAAAAGAAGAAGACTGTTTAAA
TCATGATACCTTACAACATCATCTGTGTATTGTTGAGTTTGGCTGCAACA
TTTCTTCTCTTCTATGGAGCTTTTTTGGGAAGTCATCTTTATGCATACGA
AGAGAACCAATACATTGTATATGGCATGGCAATTTACACTATCTCAAAAA
ATGTTGAATTGCTTGACACTGTTTTCATGATTCTACGACATAAATATCGA
CAAATTTCATTCTTACATAGAAAGCGACAAAGTTCTTCGAGAATGTGTCT
CAACTTCAATCATTTCCTGTATTCATTGGATACCTCCTGATGATATTATT
GATCCCAGTTTGGAAGCGCATTCTTCCAGTTGCGAACAATTTGAAAATGA
TGACAACTTTACCTGGTATTCCATCATTCCACCATTCTTGTTTTGGGTAA
TTATGCATTTGTTTACACATGTTACCCACCCATAGCTGTACCAGTCGGGC
TCAACTCACTTGTACACGTCCCCCTTTATGCATATTATGCTAAAACAGCT
ATCTCACCTTCACTGCAAGTTTCATGGAAAAAAGCGCTAACCATTTTTCA
AATTGTCCAATTTTTATTTGACTTGGTTTTCGCGACTATAGGGTATTTGT
ATCATGGGTTTTGTATTTATTCAATCATGTATGGTGGTTCTATGCTGGTT
TTGTTTAGTAATTTTTATTATTTTGCTTACATCAAAAAGAAGAAGACTGT
TTAAATCATGATACCTTACAACATCATCTGTGTATTGTTGAGTTTGGCTG
CAACATTTCTTCTCTTCTATGGAGCTTTTTTGGGAAGTCATCTTTATGCA
TACGAAGAGAACCAATACATTGTATATGGCATGGCAATTTACACTATCTC
AAAAAATGTTGAATTGCTTGACACTGTTTTCATGATTCTACGACATAAAT
ATCGACAAATTTCATTCTTACATAGAAAGCGACAAAGTTCTTCGAGAATG
TGTCTCAACTTCAATCATTTCCTGTATTCATTGGATACCTCCTGATGATA
TTATTGATCCCAGTTTGGAAGCGCATTCTTCCAGTTGCGAACAATTTGAA
AATGATGACAACTTTACCTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000123_pilon | genome | sc0000123_pilon:196883..204885 - |
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