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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000122_pilon:680633..704700+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14590.1.p1 ID=MSTRG.14590.1.p1|Name=MSTRG.14590.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=24068bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000122_pilon:680633..704700+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTTTATGAAGTGTTTCTAAAGCCCGTTTTTagattatatttcaaaata
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ATATCTAGTATTAAAGTAGAGTTAATTTTTTCCTCTGCATTTCTGCATTT
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AATCGAATCATTCGTACAAGAAAACGGCAAGTAAAACAAGCATTTAACCT
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AAGCATCGAAGAAAAGATAGAAGAAAAATCTCTCCCACTCATAATCTCTA
ATGAAATCACAAACGAAAGACCCAAAACAGCAAATCCTCCGTAAAAAACT
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CACGCAGTTGAATCAGCCAAGTGGGAATGGGTGATAAGGATTGAAGTGAA
TCTCCTGTTTAGGATTTGGATTGAAAAAAGGTGGAGATGCTCTATAATCA
TTCGAAAATCCTGATGAAAAGTTATCCCATTGGGCAGAAAATGGATTTGA
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TCATTTTCCGTAAGCGCCCTCACGACATTAAAGGAGAAGATTTCCAGAGA
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GAGGAGCAGAAATGGAAAGCCGAAATTCTTCATTCTTTGAATGTCGTCGa
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AAGGTTGCTTATTTAATAAAGTTTGGAATTGCTAAATATTTCCAAGACGA
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CGACTACATCACAGACCAAAAAGCAATATGACGGGTATGTCAGGTTTTAT
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TGGAAGATGCAAAGCGAATGATTTGTTGGATCATctacacatattcttca
aaaagaacaaTCTTAACGTGAACATGTTGCTCAACTTGGGCCTGGATGGA
CCCAATGTCAATCTTGCCTTTATGGAACTTTTGAAGAAGTCAATTACTTT
CATTGACATAGGAACGTGTGCTTTACATGTATGTAACAATGCATTTGGAA
GGTTAGTAAAAGAACTAAATTGCATTGTCGAGCTTGATCAGATGGCGATC
gattttcatttcttcttcaAGTACTCTGCTGGAAGACGAGAAGACTATTC
TAAAGTCACTGAGCTAACGGGTGTTCTGACGCAACACCTAGAAAAACATT
GTGCATCAAGATGGATTAGCTTGGACAGAGTTTTAATTAAACTAATCGAA
CAGTTccttaacttgaaaaattacttcatgAAAAAAGTACCTGAACTACC
CGGATTTAAAGGCAAGTCAGGAATTGCTGCCACGAGCAGATACAAACGCA
TCAAACAATATCTCACTGATGAAAGAGTTTTGATCGTCATGCATTTTGTT
GCTAGTGTTGCACAAGATTTTCAAGCTTTCATTAAGCCATTGCAAACGAA
AAGTCCAATGATCCACATTCTTCATTCTAAATGCACCAAATTAATTCACA
CTTTGCTCCGACGGTTTATTCTGGAAAACAAAATCAGCAACTCAAAGACC
AAAAAACCAATTGGTACAAATAAACTACTTGATCTTGAAGTTAAAGACTC
AACAAATCAAACAGTAAGaagaataatcaaaattttcgcACCTTTCTGAC
ATTGAAAATAGCTCTTGTTTTATAGTACTTACTCCAACTTACTCTTTTAC
ATCATGTTTTGATTTAAGAAAGGTAATGCGATTAcagttattttgaaatt
ttatttaaaataaaatacttcACTCTCTAAAATTTAGCTTGACTGTAATT
TTGGTGACGGAGCAAAGAAGCTGTTGGCTAATTTGGatgcacttgagaaa
aagaAGCTTTCTGAAACCTTTGTAGAAGCGCTTAGCACCTCAGCCGAGTA
TCTCATCGAGGAATTGCCATTTACAGTTCAAGTGGTTGCTGATGCAAGGT
TTTTGCATCCTCTTATGCGTACCTCAAAGGTTGCACCTGAAGCTATTAGA
AGATTGTGCTCGACAATACTCCCAGCGCTGCCAGACGATTTCATCAAAAA
GAAGTTTCAATCGATATCCAGTGAATCTACATTAGTAACAGATCTGGTAA
TGAGCGAGTTTAAAATGTATCAGTTGGAGTCCATACCAAAATCATTCTAC
GAAGAGCAGAGTAAAAAGAAAACGTCATCAGATAGAGAGCAATCCTCTTA
TTGGAAGTATGCATATGGCATCGCTGATGTCCAACGTGCAGAACCAGACA
CAGATTCGGCTTTCATAAGAGTTGATAAGTATTGGAGTAAGGTAAGGTTG
TAACTGTAGGTTAATTTAAAACACAGCCCAGTAGACTTACATAGATATTA
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TATTTGAATAGATCAAGTGTCTCTATTGAAATACCATTGATGTTTGTTAA
AAGTATCACTCTTTCGTTTTGAAGGTAGGGGCAATCTGTGGAATTGACGG
tacgaaaaagttttcaaagttAACTGCGCTGGTCAATTGTGTTCTGATTC
TTTCACATGGCAATGCTGACCCTGAACGAGGATTTTCAATTAATAAACAT
CTATTACAAATTCATGGCAGCAACACAGGCGAGGAAACATTGGAAGCGTT
GAGGATCGTCAAAGATTCCATCATTCGGAAAGGGGGAATTGAGAATGTCC
AAGTTACAAAAGCTTTGATTCAGTCTTGTAAAAATGCTCATTCGCTTTAT
ATGGCAGAGCTTGCTGAGAAGAAAAGACAAGAGAAAACCACTTTATTAGA
GGCAAAAAATGCTCAGGAGAAAGAAGATCAGTTGAAAGTCGTTAACGAGA
TTGACAATGATATGATTCTGATTCAGTCTGGTATAGAAATAGCTGAGGCA
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GTTAGATCGAGAACGTTTAGCTCAAGCTCATCAGAAAATCAATATGGGTG
TTAAACGAAAAGCTGAACTTCAAATATCATTACGAGAGGCAGAGgccaaa
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CTTTAGATATTCGTTGATATTGATATCTTTGTTATACTTTGTATATGCTT
TTGTTTGCTCTTACTTCTTTGAGGTGCTCATGACTCCTTTGAATCTAGTT
ACATTTCTTTAGGATCACAGTTTTATGAAGAATGATATCACTAGGAGAAT
CTTGAACTTGCCTTTAGGCTGTTGCTGATAGGGATAGGGTTTTCTATAAT
CTGAACACTGCAGTAATAGATATCATTTTCTTCATTTGTATATACTAACG
TTATTTTCATATATTATCAGATACTTGTACCCTTTGCTgtctgttttttg
aaaaaaagttttttaaggttttcaCCAAGACCATTCCACTTGGTTTTTCA
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ATAATTCAAAGTAAATTATAATGAATGTATTGGTATTGGTTTAAGTAAAA
GAAGAGACTAaaactttaaagattttgaaaatggcattttcatgtttttg
ggattgaaaatggcattttttcatttttttcagtgctagaatggcatttt
ttagcatttttttcgggaatttttggcattttttcatgcatgttttttta
aaaaagccaGTGGGATCTCTGGATTTCTTTTGACCATTCAGCAAAAAACA
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AGGAAATTCCATTGTTCCAAGCTAGAAAAATCCAGTGAGGATTGTTTTag
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AATCTTCTATTGGGGCTGAATTGCAAGGTTTTATTTCAccggggaagaaa
ttttggccatgtcTTTCCAGTCTAAAGTAAGCTCCGATTTTTAACGCCAG
TTAAAGAATGAACAATTTCAATTATTAGTGCCAAAATCACGCCTTGACTA
TTGTCCAGTATTATCTTTATATTGATCTCTATTGATCGGAACAGCAATGT
CAAAACTCGGCTGACAGgcataaaggttttttttagtTGAGCTGCCCTTG
CTGATAGTATAGGATAAGTGGAAAATAAGATCTAGTAGCTGATCATCTGA
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CTTAAACATCACCATAACCAACCATCATGACGTCCACGAGGAATAGAAAT
ACTCCAAATCCGCTTTGCAGTCCTTCATCCTGTGCTGACGACCAAAACGA
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CAAGGCTACCACCCTACATGATTGCAGTCTGTAAAGACGGGAGAAGAACT
GCGAACGCATGCAAATACGTGTGTCAAAATTGTGTGAAAGTAAATAAAGA
TCTTTTGGTCCTCTCCCCTCAACCATCCCTGCGAACGGCCGCCgagcttg
caaaattaaatgagacgattaaagaaaacgaaaagacaATTAAGAAATTG
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GCTCACTAATCTAGAGAAGAAATTGTCTAATGACCCGGCGTTTCATACTG
TCGAATATGTTGAGAGTAAACTGGAAAAGAAACTAGAAACCTTCCGAACG
GAAATCTTAACATCATTGAAAGAGGAATGTAAAAAATCGTATtgttgaaa
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gcataaattataaatttagaAGTTTTCTAGTATTTATGAagtgcaaattt
tatagcaCGTCCCTTCTTCTCGTGGACCTTAGTGAATATAGATGTAGATA
TTTTTGAACCCGCAAGAACTGTTTAAGAAACATTAAACCTTGAGTAGTTT
ATTGGTTTTTTACATGGCGCCCGATGAGGGACACGAGAGAAGAAATTATT
GATCAAGTAGCTGAGCTGAGTTCCTGAAATTTACGTTTGTTGCTGAATTT
TGGAGAATTGAAGTTTTGGAGATCCAAGATCCATAAATGAACAATAATTG
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tttgagaaatttacgattttttaactgttttgaagcatttttgagaactt
tttagactgaatctttttctctctttctcgaGCGTActgattcttgattt
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GGCATaagattttaaagatattttgacTGACGAACCCGTGACAGTATTTT
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TTTTTGGACGATATTTTTTCttgacagaattttttttgaactgATTTAGA
GATTCACTCTTattctcattttgatttgagtttttggAGCACGTTTTTTC
TAGGAGCCTAGAAAAGAGAAATTTGCTTTGtttgaattgcaaaataatAG
AATTCGATTGGCCGCGATAATTTATGCGATTTTTCCCTCTTTATGTTGAG
ACGCGTGATTGGTTTGAGTTTTGTGTTGAATTActgaacaatagattttc
ttttttgactttaTAGCGGCGGCGCACGTCGTTAATTGAATTAATTATTT
GTTGAACTTGAGAACAAAAGAAGTTTTGTGAAGGGTGCGTGCCCTAAATT
TTTGTGATTGAATTAGTGGAAGatttggtttttccctctttctttatttg
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ATGACTACTTCTGTCATTACCAAGATTAAAGCCCAACTGCTAAATAAAGA
TGTTACTCATGTAAAACTGCTTGGTTTACAAAATAACCTTGTCAGTAAGC
TTGAGCGACTAAATACTTTGGATGAGGAAGTTTGGAATTTTATGGAGGCT
GATGACATAGAAAGGGATGCAACGGAAAGTTTAGAGTTTGTCGATGATAC
GCATGAACTTCTGGCTGAAGTTACAATGAAGATTCAATCTTTATCTGTTA
CTCCAAGTCCAGAAGGTGCACGACCTGAAAGTGTGAGTTCTAATAAAAGT
TCTGTTTCCCGGTGTCGACTGCCTAAGTTTGAGTTGCCAATATTTAAGGG
GGACCCTTTAGTTTGGCAAGGGTTTTGGGACCAATTTAAGACTTCGATTG
ATGAAAACGATGATATTACTGACATTGACCGTTTTAATTACCTCAAAAGA
TATCTTGGAGGCTCTGCTCTTGAGACGGTGTCAGGACTGAGTTTGAATTC
CAAGAATTATAAAGAGGCCGTTAGGATTTTGAAAGAGAGATATGGCAATT
CTCAAGTATTGATATCTGCACACATGGATCGGTTGATTGGGATGCATAAA
GTATCTCGAAAAGAAGATATTCAAGGACTCAGGAAGTTGTATAACAGTGT
GGAAAACTGTACACGAAACCTGAGTGCCTTGGAGTTGGATGTGTCATCGT
ACGGAAGTTTACTGATTCCCCTTCTCAAAGGTAAGTTGCCGGATGAGTTG
ATTATCACCATTGCAAGGAGATTTGGTAGTGACGTTTGGACATTAGATAG
ATTGATGAGCTATTTCAATGATGAATTGACGGCGTATGAAAATTGTAAAT
CCCTCATTAAGCCGTCAGGTTCTGATGAAAAAAGCAAGAAGAAATCTGAC
ATGGGTTACTCGGCTAGTTGTTTGCATGGTCATGGAAACACTCCAAATCC
TCCTAAGAAGCAATGTGTTTATTGTAATAGTGATTCTCATCTTGCATCTA
AATGTACATCTGTGACAAACGTCAAGGCCAGGCTTGAGATCATCAAAAAG
CAAGGCCGCTGTTTCTTGTGTTTGAACAAAGGTCATCTTCTTAGAGATTG
TCAAAGTAAGTATTCGTGTAACAAATGTAAGCGAAAACATCATGTCTCCT
TTTGTTCAGGCGAAGAGCAGTCAGCGCATACTATCTTTGCTTCGGTAACG
AAAAGTGTTCTTATGCAGACTGCTTCCGCTAAGATTTCCAACTTGTACAG
TGGTCACGAGAGCGATTCACGAGTTCTTTTCGATAGTGGTAGTGACAGAA
GCTACATTTCACAAGAGTTGTGCGATCGTTTAAAACTGACTCCAGTGAGA
AAAGAGCCCATAATTATTAATACCTTTGGGACGAACGAGGGAAAACGTCA
GCTTCTAAATGTTTATAGATTTAAAGTTCTGAGCAAAGTTGGGAATGAGT
TTAATGTTGTTGAGGCGCATGGTGTACCTGTTGTTTGTAATCCATTGAGT
CGCCAGAATATTGACTTTGTGAAGAGGAGTTGTCCTCATGTACAAGGATT
GGTTTTAGCTGACAGCAATGTTGATGGTGAGAAAATGACTGTGGATGTAT
TGATCGGATTAGATTTTTATTACGACTTCTTTAAAGGAAACCTTAGGAAA
GGCGATGGAGGCCCTATTGCTTCTGAGACCACGCTTGGGTGGGTTTTGAG
tggcaaatttcaattttccgaTGAACAATCAACAGTTTGTCTTCAGGCTC
ATGCTATGAAAGCACATGTTGAGAGGGAAATTGATCTAAGGGAGGAATTG
GGAAAGTTTTGGGAAATAGAGTCTGCCGAGGGAAAAGAGGAATCGTCTGT
GATTAATGAATTTGAGAAACACATTTTTCACGATGGCACACGTTATGTCA
CGAAACTGCCTTTTAAGCCAGATCATGATCCTCTGTCTGACAATTTCAAT
GTAAGTCAGAGGAGATTGAAATCCAACATCAGAAAACTGAAGTCTACAGG
AATTTTGAATGATTATCACGAAGTATTTAAGGAGTACGAAAGCGagaaaa
tcattgaaaaggTTCCTGTGAATGAGGTTTACAAAGAACGTGGGACAGTA
CACTACCTTCCGCATAGAGCTGTTGTGCGCGAAGACAAACTCACCACAAA
GATTCGACCTGTTTTTGATGCTTCTTGCAAGATCAATGGACCTTCTTTGA
ACGAGTGTTTGTATTCCGGACCGAATCTTTTGTCCAAGATCTTTGATGTT
CTTTTTAGATTTCGTTTGAATAAGATTGGGATTGTTGCTGATATTAAGAA
AGCCTTTCTAAACATAAGTATAGCTCCTGAGCAtcgagattttttgaggt
tcaTTTGGGAGGAAAATGACGAACAAGTTATCTACCGCTTTAGAAGACTT
GTCATGGGTTTGACTTGTAGTCCTTTCCTTTTGAATGGAACTGTACGGCA
GCATCTTCAAAACGAAAAAGGTAAGTATACAGCTGATGTTTTAGATCGAT
TAGGTGAAGATTTGTATGTTGATGACATTACGAGTGGTTGTGAGTCTGTG
GAAGAAGGGAGAAAGTTTCAGAAGGTTGCGAATAGTGTGATGAAAGATGC
TGGATTTGATTTGAGAAAGTGGATGACGAATGATAAGCGATTGCAGAGAT
TTTTTGATGGGGGAAGTGAGAGTGACATGGGTGATGCTGAAGGTGATGAT
GTGACTTTTGCGAAAACTGTTACAGGGATGTCGGTTGAGAATGGTTATCA
CAAAGTTTTAGGTTTGGAATGGGATAGAGATTCGGATGAATTGTTATTTG
ACTTTAAGAGTTTGATCAAAAAATCTGGAGATGACGTTTTGAcgaaaaga
aagattttgagCTTGTCTGTTTCCATGTACGATCCTTTAGGTATCATATC
ACCGGTTACAGCACAACTTAAAACTCTTTTTCAGCTTTTGTGTGTTGACA
AGGCAAATTGGGATGATGTAGTGTCGGATGAGATCGCTTTGAAATGGAGA
GTTTTGATGGAGAGGATTGAGGAACTAGGAGTTGTTCGGATACCGAGGTA
TGCTTTGGTTGATAGGAATGAAATTGTGTCTGTTGAATTGCATGGATTTA
GTGATAGCTCGTTGATTTTGTACTGTGGTGTTGTTTATTTAAGAGTTATC
ACTAGATCTCATGCTAAAGCTTTCTTTTGGACTTCTAAGACGAAAGTCGC
TCCTTTAAAGAAGACTTCTATTCCTAGACTTGAATTGTTGGCTTGTTTGC
TTCTTACGAAATTGATATCGAATGTTGATGTGGCGTTGTGTGAACGACTG
AAGATTAATCGTATTGTCTGTTGGTCGGATTCAACTGTTTCGCTTTGTTG
GATTAGAGGTAAAGAGAAGACTTGGAAAGCTTGGGTGGAAAACAGGGTTG
TTAAGATAAGAAAGGTTGTTTCTAGGGAGTCTTGGTTTCATGTTGCTGGT
ACTGAAAATCCTGCCGATGCTCCTACTAGACCTGTTGAGGATTTCTCTGC
TCTTTTTCAAGACAAGTGGCTTTCTGGTCCTTCCTTTCTTTCTAATCTTG
ACATTGACTATGACAAAAGACGTGACAATAAAACCGAAATACCAATTGAC
GCACAAGTAGAACTTAGACGAACTGACGTTAACGTTATGACTGTGACTTC
AGATAAGAAAGTTAGTCTGAGTGATGTGATCGATTTCTCTCGTCATGGAT
CCTTACGTAAGCTTGTAACTGTTGTAGCTTTCGTTCTTCGtttcaaaaac
aactttttggcGAAGAAGTACAAACACGATAAAATGCTAACAGAACTGAC
CGCAGAAGAAACTACCAACGCACTTTCCATGATTCTACGCGATGAACAAG
AACGAATGACGAACCAACCAAACTTTGAGAAGACGAAATCAAACTTGAAC
GTATACAAAGATGACGAAGGATACCACCGTGTCAAGAGTCGATTCAACGA
GTCTTCGCTACCAACAAAGAAGAATCCCTTACTGCTGCCTGAATCAACCG
ACTTCACGAAATTGCTCATCAAAGATACGCATGAGAAGTGTTTGCATTTT
GGTATTGAAACCACACttgccaaaattcgcgaaagatATTGGATAATTCG
TGGAAGAAAAGCTGTCAAGAATGTGCTTCGCAAATGTGTTAGTTGTAAAC
GGTTTCAAGGGAGAACGATGAAACCACCGGAATCTCCTGAACTGCCAGAA
TTTCGAGTGAACTATAACAACCATCCGTTTTCGTCGACTGGACTTGACTT
TGCTGGACCCCTCTTTGTAAAGAATAAAGGACTTCCAAGCTCAAAGGTAT
ACATTTTGCTTTTTACTTGCGCTAGTAGTCGTGCAATCCATCTTGAACTC
ACTCCTGACATGAAATCTCCTGCGTTCATACGGGGATTCCAACGCTTTGC
TTCACGTCGTGGTACACCTGATGAAATCATAAACGACAACGCCAAGACCT
TCAAATCGAAAGAAGTCAAACGTTTGATGACTCGATTGAATGTTCGGCAA
CGATTTATTCTGCCTGCCTCTCCATGGTGGGGAGGTTTTTATGAACGATT
GGTTCGCTCCGTCAAGACAGcattaaagaaaattttgaaaaaggccctTC
TAACCTTTGAAGAGCTACAGACGGTCTTGAGCGAAATTGAGGCCACTATC
AATCAAAGACCACTATGCTACACAAGTGATGATGAGATTGGGAACACGAT
CACGCCTAATCATCTCATGTACGGTCGGCAACTCAATACGACCCCttctt
ttaacgtttttaaTACTTTAACAACACCTGACGATTGCACCAGACGAGCC
CGACATCTTATGAATTTGGTTAAAcactttcaaaaatgtttcaagagCAC
CTATTTGAATGAACttaaacaaaaacattcatATGATAAGACCAGAACTT
CCGAACTTAAGTTAACATTGAATGACGTTGTACTTATCAGAGACGATACA
CCAACACCGAGGACGCAATGGAGAATGGGAAAAGTTGAAAGCTTCGTAAT
TGGAGCTGATGGAAAGATACGTGGTGCACGTTTGAAAGTCAACACGACGA
ATGGTACCTCCACCATCCATCGACCTTTGCAGAAGATCATCCCATTTGAA
ATTGCGGACGACACACCCACCGACGATGACCCAGCTGATAATCCTTTAAA
GCCTTCGAGTTCAGGTAGTGCGCGCGGCTATGAGCAAACAGTAAGAAGCA
GAATACGCCGGCGAGCTGCGATTGAAGGACAGAACTTACGTCGAGCTAGA
GACTTAGAAAGATGATATTTTGAGATAAAACAGGACTTTTGATATATATA
TGATAATTGACTTGGAGTCAATTATGGGGGGAGAAtgttgaaaatacgaa
atttatgACGTGTTTGCATAAATTAGTATAATCTGTataatttgcataaa
ttataaatttagaAGTTTTCTAGTATTTATGAagtgcaaattttatagca
CGTCCCTTCTTCTCGTGGACCTTAGTGAATATAGATGTAGATATTTTTGA
ACCCGCAAGAACTGTTTAAGAAACATTAAACCTTGAGTAGTTTATTGGTT
TTTTACACGTATGCTGCAGCCACTTCTGCCAATGTCCAAGTGCCTAATGA
CAATATCAAGACCGCCGTTAAAGAGGTCCACGAGGAGGAGGCAGCAGAAG
AAAGGGATAAGATCAGAAGATCAAAgaacatcatcatccatggtGTTGAG
GATCCAGCAACAGAGGATGCTACCAAAAAAGATGAAGCATGGGTGAAAAC
ACTCATCGAAAAGCTCCACGTCAAAATTAACATCAAATATATCTCAAGAA
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GCCCTCACGACATTAAAg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000122_pilon:680633..704700+ >MSTRG.14590.1.p1 ID=MSTRG.14590.1.p1|Name=MSTRG.14590.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1494bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000122_pilon:680633..704700+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGCATCGAAGAAAAGATAGAAGAAAAATCTCTCCCACTCATAATCTCTA
ATGAAATCACAAACGAAAGACCCAAAACAGCAAATCCTCCGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000122_pilon | genome | sc0000122_pilon:680633..704700 + |
|
