MSTRG.14561.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14561.1.p1
Unique NameMSTRG.14561.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000122_pilon:125011..143779+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14561.1.p1 ID=MSTRG.14561.1.p1|Name=MSTRG.14561.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18769bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000122_pilon:125011..143779+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aaaaaatgatcttaaaaagtttttaaacaatGAAAGATTTCACAGTAAAA CATCGAAAGATTTgccgtgatttttttttttaatttacaccatgatttat tacgactacagatttttatttagtaaaagttatttattaCTAgcataaag aatattttcaaaaataatttatagaTAAACCAAATCGAGAATTTCTgccc aactatattcactcaggagatttgggtagCAGAGCAGCATATACATTTCT CTATAAACCAAATACAAGATCAAAAATGAAGTGGataccaattttttatt tatatatgaTGCAAATATTACTTTGTAAAGCTGAGGACACAGCAATCCAA TATCAACGGTATATACCTGGACAATCGACCGCGTCATCAAAAACTAAAGA AAGAATTAAAATCACATATACAAGAGTtatcctgaaaaaaaataaaattc ttgatATTACACCGTACCAAAAAATCGTGGTTTCAAAATTATTGCTTTGT TATGATAAATGTTTTGAGTCTGATGGCCAATGTTTAAGTTTAAACATTAA GGATTTAGGACTTCATGGATTCGAATGTCAGTTGTTAAATACTGATAGTT TCTTGCGTCCTAATTCACTTATTTCCCAAACTGGCACTCAACACGTGATC ATAAAGgtgagattttattttattttatatagcTTTTAGAATGAAAAAAC AAGCCTTGCTTTCTGCTTAGCTTGTAGAAATTTCCGTAGTGCGAATGAAA GCAAGAGAAAATTCGTCCGTGCGTCGTCGTGATGTATCCATCGATACTTA ACCTTACTAAAGGCCGgtatccactttcgcgcgacatgagcgaaaacttt tagacgtttttgtaaggtcggaggaaaaatgaagcaattccattggtcga aattgatgtaacggatgaaaaaagtagaaattcCTTTAGTCTCCCAATCA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000122_pilon:125011..143779+

>MSTRG.14561.1.p1 ID=MSTRG.14561.1.p1|Name=MSTRG.14561.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4476bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000122_pilon:125011..143779+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTATTTCCCAAACTGGCACTCAACACGTGATCATAAAGGATCTTTGTTCA
ATTCCAACACCGTGCGAGAATGGTACTCGATGTGTACCAAATTACACCAA
CAGGACACGTCAATGCATTTTTCATCCCActTCTTGCAAATATTGGGAAG
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GATCCTTCGGCAATTAAGATTACAGTTTATTGTGATGTGTCTAACGGAGG
TGGCTGGTTGATGATCACTAATGTCACTATTACTGCTAATAACCTCGTTG
GAAATGTTAATTTGGGTGGATCTATCAACGAAATGACACAAGAAATAATG
CAATCTGGTTACTGGACACTGGACGGAAGACATTTAACATATTTCAACAG
GGATATGTTTAAAATAACACAAATCAGGTATTATTGCTCCAAGCCAATTG
TTGGTCGAGTTGTTCATGTAATCTCCAATGCTACCAGTATCTGTGGACAA
AATTTTGTTGGAATCGTGATAGGCTCGCAAGATAGGAGCGAAGCTTGCAT
TGGAAATGCTCTCACAAGATTGGAAGATGATACAAGCCTCGTTCTGAGTA
ATCCATCTAATACTAAATTATTCGTTGGAAATGCAGTGAATAAAAATAGG
TATTACTGGGTACCATTTTGGGTACCGGGCCtacatcatttttcatttgg
agGTAACCGTTATCACTGTGATGATAATATGCATGTAAATGATTTTGTCG
GCCAATGGGAAATATACATTCGATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14561MSTRG.14561Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14561.1.p1MSTRG.14561.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14561.1.p1.exon1MSTRG.14561.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14561.1.p1.exon2MSTRG.14561.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14561.1.p1.exon3MSTRG.14561.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14561.1.p1.exon4MSTRG.14561.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000122_pilongenomesc0000122_pilon:125011..143779 +