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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000121_pilon:260061..270656- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14501.1.p2 ID=MSTRG.14501.1.p2|Name=MSTRG.14501.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10596bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121_pilon:260061..270656- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAAGAAATTGTTTACCAAACAGAATTTTTGGCTGACAAATATATTTTACT
TGATCTGATCATTATGTTTTCTTTCCAGTGCCTCTAAAGGGGGTTGATTA
TTTTACTGAGTGGAGGGGAAAACCAGTCTCACATGAACCATTCATATCTT
GGACTAATGAAGTAATTTGATGATAGAGACTCGGTTACTCTAAATAACAA
GATGTCAGTTGTCAAGCTTGTAGCGAGAGAGAGGTAATTTGGGAGACCCA
ATGGATGGTAATTATGATAATCTTTCCTTAATTAATTACATGTTTGTTCT
TTTTAATTTGATTTCCATATACAGGGTGACCAGACAAGTCAATTAATTGA
GGCCTACATGATGCCTGATGCATGTTTCCCTTCCGATTTCACGATATCTC
TGAAAAGAAGGGTGTAGAAATTAGATGAGGGATGTCAACATTAGACCAAC
TTGGTGTAAACCAAACCATGGTGCAACCATAAAATCACCAATAATTCCTA
AATTCGGAGGATTTTTGTACGACCCACAGTATGACCGGAACTTTGTCGGG
CCACTTGGCGTTTTGGAACTTGAAAAAGTCTTGAACCTAGCCCAAACCTA
GTCTGATCATGTTCGGAAAACATTGAAGGGTGCTTTTATTGGGGGATTTT
CTTTAAAAATGTTTTCTCGAAGGGCGTTTATTCGAAGTAATACTGGAATT
GGAAGGTTGGAATCACTGAACAAAAAAGTTGTAAGAAAAATCTAAAAGAG
TTTTTTTCATCAGCAGTATTTCCAGAAGCAAGAAAACAATTTTTATTTTG
GTCTCTAATTAGTTAAAAAGAGTACAATATTATATTTTATTACACACAAA
CTTGCAAAAAGATCTGATTGCACTGAATAGTATCTAATTTTTAGTTTGGT
GTTGAAAAGTTCAAGCTTGGTCAGAGAAAATAATTCAATTATAATACTTG
GTAAGTTATTTAAAGGTATTGTTGCTTGTGAAAGATGCTTTTTCCCCTTT
TAGAGAAGCTAATCACTATATAAAATGTTGTTTTATTCCTTCTTCAAATC
ACTTGTCGGAAAAGAAGTCATTGTAGAGCTCAAAAATGATCTGAGCATAT
CTGGTGTACTTGATTCTGTAGACCAATACCTGAACATTAAACTAACTGAT
ATCAGTGTAACAGACCCAGACAGATACCCACATATGTTGTCAGTTAAAAA
TTGCTTCTTGCGTGGATCTGTTGTTCGATATGTTCAACTACCGCCAGAAG
ATATTGATGTACAACTACTTCAAGATGCAGCACGTAAAGAATCAGAACAA
CAGCGCAAACAAAAAGAAACAAAGGATAAAGACTAATTGTTATGTTCTGT
CAATTTGACTACTAAATGGTTTGAAAACGAAAACTTATGCGGTCATTGTT
GTGTTACAAACTTGAATGCTGGTGTCAACATGATTCATACCGTTGCAAGA
TATGCAGGGAATTTTATTGTTTTTTATGACAAGGGAAATTTGGAACATCT
GTCTCTTTTTTTATTATTTATAAAGTGTTGAATTTTATCATTACAAACAT
TTAATTTACATAAAATTTGTATGCTTTGATTCATTTGGAGAACCTTTCCT
GTTGCTTACCCAACTCAACTGATTTGAATCATTTGACATATACAGTATAT
ATCATCACAAGCAATTTGAAATACAAATGAAATGGTGCGGTCTTTAGATG
TTCATGAATGTTCACGAGCGTCCCAAAGCGCATTAGAAATTTCTTGGTCA
TTCCAGAACATTCAGGAACTTTCCAGAACTTTCTAAGATAATCCTAAGCT
AGTAAATACAGAGATCCATTGGGAACGTTCTTACAACGTCTCTGAACGTT
TGTAGAGCGTTCCGTATCATTTATTTCACTAGAACATTCCATTTTATTTG
TATTTTAGATTTGCTTGTGAATGTCATTCCTGAGTAATGGAAACACCTTC
AAATTTTAAAATTTTAATACCTTTTTAAATTGGAACAGAGGTTAGCTTAT
TCCTAATGACAGTGCAAAAAAGGTTATGATGGACTACTTTTCTAAATCAT
ATGAATTACTTTATACACTTTAGAAAAATAACTTCCATTTATTTTAGGAA
AAATGTAGAAATGAAAAAGAAGCAAAAAAATCAAGATATGAGAGGGTTTT
GATAAAAAAATGAGTGGAAAGGAAGATTCTTTAACTGGTTTAGTGCCAAA
CAAAAATCTCAGTTTCAGATCCTTAACAGTTGATACAGACTCAGATGTTG
ACCCACACGGATCAACTAAAAGCACTCCTGATATAAACTGCTTAGACAAA
TCAGTTGGAAGAGAAGCATCATTCTTCATTAGGGGTGGTGGTATAGCGGG
AAACAATCTTGCTGGAAAGAAATCTCATATTCTTTGCACCCCATCACCAT
CAACGCTGACAAGAAATTTTGGTCAACGGCGTAAAACTATATTAAATACT
TTTCAATTATCACCAAGGACTAAGTTCAATGAGAATGATGTTTATCAATT
GTATCGACACACAATCAATGAAAAAGGACAAGAGATGTAAGTTTGAGTAT
TTTTTATTGTGATGGATCTTTTGAGAATTTATATTTTATTGAATCTGTTA
TACGCTTTATCTGTAACTGTTACGATGCTGTTAATTTCCTTCAAAATACT
CTTAAGGTCCCATATAGTAGGGAAGTCTGAATCTGAATAAAAAGGGGGGG
GGGGAATCTTTTCAAAATATATTATAAATGATGGACCTAATTGTCGGGGG
GTTGAAGTTATACCTCTAAAAATCCCTTTAAAAATCAGGTACGGTAATTA
AATACTGAAAACACCAGAAAACAGGCTGTTTAGAGCAATTCAGCTTATGA
AAGCTGAAAATATAAATAGAATAAATTAAATAAAATATAATATAAGATAA
ATAAAAGAGGGGGATGTTTATTTGGAACCTTAGAGTCTATCTTTAAAATT
CAACTTATGAAAGCTTTCACACACACAATATTCCAATGTCTAGGTACAGA
GCTGCATGGGAAGCTTATGAAGAAGACCGGAATGAAGATGCACTCAAATG
TATCAGAAAAGCGTTGGTTGTGATGCCTGAAGAAGCAGACTATTTTGTTC
TACGTGGTGACATATATCTACAAATGTGTGACTACAAGTCAGCCATTATG
GATTACAAGCATGTGTGTATCTTGAGCCCAGACAATGCTGAATACTTGTC
AAAACTGGCATTTATTTATTATTTGCAAGGTCAATGTTATTATGATGAGG
AGTTGTTTCTAGATGCTTTGGAATGTTTTACGAGGGCAGCTGAAATGCAA
CCTGAAAACTCTGCTTACCATTCAAGAAGGTAAGATATATTCAATTTAAA
CACCAGACTCATTTCTTGGTTACCTTATAGTACTGTTCACATTTCACTAG
GTTATCATAATCAGGACTCATAGAAATAGAGGGACTAGTAGGATTCCTCT
GGCTTGTCGTGAATTTAGCTTAGAGCCTCCATAAAGGCATTGGTCGTCTT
AAGAGATATTTGTAATTCGTTTTTTTGGACCTACCTTTGGAGGTCCTATA
AATTAACCCGTGTTCGTTCGTTCGTTCGTTACTAGCTTTTCTCGGGATTG
GCTCATTAGTTTTTCCTAATTTTCGGCACAAAGATGCAAAATGGTAATGC
CCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAATTCATTTCCGGCCGAA
AATGCCGGAAATATGCCGGAAAAACCGTTTTTTTGGCATTTTCTCGAGAT
TTCATCATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATGCGTATTAGCAAT
GCCTAAAACATGGATTAGTCCGATTTTTGAGAAAAATTCTATTCCGGCTG
AAAATGCCGGAAATATCCCGGAAAATCGCCGTTTTTGCAGATTTTCATTG
GACTTTTCCCTTATATTCGTTGTTTTTTCACACAAAAACATTATTTGTAG
CAATGCCCCACCACCATCAAGCATGGTTTAATTGTCAATAAAAGTGATTT
TTGAAGCCGGAACTTTCTAAAAATCGCCGGAACAGCCTATTTTCGCCGGA
AAAACGGTATTTCTTGAATTTCTCGAGCTGTACTTTATATTTTTTCATGA
AATTTTGCACACTGATGCAAAATGGCAATACCTAAAATATGACAGAGCCT
GATTTTCAATTAACGTACTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCTGG
AAAAACCGGTTTTTTGACATTTTCTCGAATTTTCATCCTTAGTTTTTTCT
GACTTTTTGCCGAAAGATGCATATTCGCAACGCTCAAAACATGGCCGAGT
TCGATCTTTAAGAAAAAGAATTTTCCGGTTGAAAATGCCGGAAATATGGC
AGAAATCGCCGTTTTTCTGGGTTTTCATTGGACTTTTTCCTTATAATTGG
TTGTTTTTTTATTCAAAAACATTATTAATAGCAATGCCCACCATCGAGCA
TGTTTCAATTTTCAATAAAATTGAATTTTGAAGCCGGAACTATTTAAAAA
TCGCCGGAACAAACTATTTTCGCCGGAAATCGCCGTTTTTGCAGATTTTC
ATTGGATTTTTTCCTTATATTTCTATGTTTTTCACACAAAAATATTACTG
ATAACAATGCTCACCATCAAGCATGATTTAATTGTCAATAAAATTGATTT
TTGCGACCAGAACTTTCTATTTATTTTTTTATCTACAACTTCCCCCCCCC
CCATCAACAATCAATGATGAATTTATTGCGTTATATGCATTTTCGCTAAA
ACGCTATATTTTCTGACTGATTTCTTTTAATTTTTCTCCTCGCATTGCTA
TCTAACTTTCATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATCTAGCTTGTTTTAAG
ACATGTTACCTGAGAAATACAATAATTCTAATGTGCAAAAGTCTTTCTTT
TATATTTTGATATTATATTTTTAACGTTTTCCTCGTTATGTTTTTCAGCA
TTGCTTGTCTTCTTTCACTAAAACGTCATAAAGATTGTATGAAAATGATC
AATGAGAGAATCGATGTTGAAACTGACAACCCTGATTTGCTCATCCTTCG
AGCACGTCTGCATTTGCTATTTTCAAATGTAAGAAATCTATCTAAATTAT
TATGATTCGTAATAATCCCAATGTATGTTTGTTAATGATTCCTTTTAAAG
AACTTAAGATTTAAACTATGTACTTGAATAGACAGTTATTTGGATAAAAT
CAGAAAACTAGAACACTCAATCTCATCCTCGTTATTTGACCAACACATGA
AAAGCATTTATTATACCTCAACAAGAATCTTTATTTAATTATCCACAGCC
TACACTAGCATTCTTTGACATCAAAGATGCACTTGAAATGGACCCTGCTA
ACGAAGAAGCTGATGTAATGAACACAAATCTCGAAACGAGAGCAGAATTC
TTCAAAGAGCGTGTATGTTATTCTTTAGCTTTTTATCTTTTGGACTTTTA
CATGTTTTTTTATAAAAACAAACTATATAAGAACATAAGGCTTTGATGAC
CAAAATATTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAGGCTTCGCGGACTCTAA
AACACAATTTCTTAGGAAAATGGACAAAAAATACTCAAAAATGGTGAAAA
TAAGAACATATTAAGAAAATTTTTAGGCTTAAAAATCAAAAAGTTAAGAA
TATCCAAAGGCTTCAAAATCTTTGGATATTCTTATAAAAAAACTTATAAG
GGGTGAGCCTCTTCTTGAAAATTGCAGAGCTTTTAAGTTGAATAAAGGGT
TTTCTAACATGAAAATTGCAGAGCTTTTAAGTTGAATGGCACAAAGGGTT
TTCTAACAATCTCTGAATTTTAACATAATATGCGTCCACTTCACAAATCT
AACAATGATTCATTTGCAATCACTTTCTTGATATTAGGCAATCAAACTTG
ACATGGCTGGGAAGACAAAAGAAGCCATTATGAAGATTACCATGGCAACC
GATACTAATCCTGAAGTACTTGAGTATCATATTCTTAGGTAATCATTGAT
AAGGTTAACTACTTTCAGCTGTTTTCAGAGGGAAAGTGTTAAATAATAGC
TTTTTCCAATCGCAGAATTGATTTTTAAATTAGATCCAGAATGAGTTGTT
ATTTTGTAGTAGTGGCAAGAAATTTGACTTATTAAAAGCCAAATTGTAGG
CCCTGTTTGAAAATGATGAAATATAAATCTACAAAGTTAATTTACCCAAA
ACTAGGTAAAGTCAGAGAAAACTCCCTTTCCAATTTCATTTTACCATTAT
ATTCAAACCAATAGTTTATTGGTTGCGTCAAAAATCTTTTTACAGGTTTG
TCAAGATATTGTCAGCATACGGCCAAAGATTTTGTGGTGATTCTTTGTTC
ATTCGATGGAGTAAAGTTTGATTTATATTTTGGTATATAAAACTTTAAAA
TCGGTCCAGTCAATCAATAGTTGTGTCAGAAAAACTGAAAATTTTGACCT
ACCCAAAACGACAAAATTCATTGAAAACAGTGTAGCAAACCCGTTCTCTC
TGTTAATTACCACTTAAATAGTCGAAAAGCCCTAAAACGATCATATTTTT
CAATTGCTAACTGTGAAATGGCTGAATTTAGGTCTCTGAAGCTAAAAATT
TACTCAGAAAGCTTAAATTCACGTTAAAAGTTGGAAAATTCTAGAAAGAT
AGCTAAAACACAAAGAAACTTAGAAAATCTAATAAAATCTCACTATATCG
ATACTTAGTTTTTTAACATAACTTTTGATTGACTTAACCGATTTTAAAGT
TTTATAAATCAAAAGTTAAGTTAAATTTTCCTCTACAGAATAAGAAAAGA
ATCAACAAAAAGTCTTCAACCTTATGCTTACAATATTTTGAGAAACCTGT
TTACTTTTTTTGATGCATCCGGTACGAGTTTCTTTTCCATCCTATTTCAT
GATACCATGACATACTATGTTTTTTTATTATTTTTGTTACCAATCGTTAA
AATCAACCACTCTCTTTCCTAGAGCTGGTATGCATCGTCGTAATTTTGAT
TTCAATGCTTCAGTGGATGACCTGCTTTTGGCGATGGATAAGTGTAACTA
TGATGTGAAAAGCCCCATCTTCATCCGAGCACAAAAACAATTGTTGTTGA
CATTCAATGATTTCGCTGTAGACTGTTTTAGGTAAGTCTATTTCCTCTTT
TTGTTGCGTTATAAACAACCTGTATTGATCTAATTTTGTTAAAGTTTTGG
GAAATCGTGAAACCTTCAAAGGAGCTTTGAATCATTCAGTGTACTAAAGA
GTGTATTCTTAACAAGTCCGTTGTTGTCTGGACTTGCGGTAAGGGCTGAA
AAATTACTCGCCCAATGATGAATTTAGCGAGTGCCTCTTCAAAAACAGGG
ACGTTTCTTGGCGAGTTAAACTTTTGCGATGTTCGGAAAAAAAGAACCCT
TTCAAGTCTTTTGACGCAAATACGATTTTTGCTACAAGAGCTTCGATAAT
TTAAAAGAGACGTCAAAAAATCTAATGTTTAGAGCCCTTGGCGTTCTAAA
TCTACTTCAATGTGGGGCATGGCGTTCTAAATTCAATTATTTGAAGCCGT
TGTATTGGCACTAGTGCAAGCAGGAATTATAATATAAAAAAGAGATATTT
GTTTTGTGTCAACCTGGGTTTGATTAGACAACACTGACGAATACTTGATT
TAATTTGTAGATTTAGAACGCCATGGTCATGGAAAAGCTCAAAAAACCTT
GGCAAAGTGCAACAGGCGTTACTGCCTAGAAGAAATTGGCGATGTCTATA
GAAATTTTTGAATTGATTTAAAAATTATTTTTAGGAAAGGCTATTACGAA
GAAGCAGTTGTTCTATTGGAGAAAGCAATTCAAGGGGAGAAACATGAACC
GTTGTTCTATATTAATAGAGGAGGTACGATGTTTCTTTTTCAAATGGTTT
GACTCTCCACTTGGTCGAAAATTAAATTACTGAAACAGGGAACTCTATGG
TGGGGTGTAGTTGCTTTAAAGTTTTGAACTTGAAGTGATTTTCTTGAAAT
ATGCAAAGAATGGTGACTGATTCTTCTCGGAAAATACCAAACAAAGATAG
TGCTTATTTATTCTACTTTTCTTACAGACTGTTTCTACAAGTTGAACCAT
TTACATTTCGCCATGCTGGACTATCAACAGGCCGAGGAGATTGACACCAA
TAATAAAAGTGTCGCTCTCAGGTTATCTGTCGTCTATAATCAAATGGGTT
TGAACGAATATGCTTCACGGAAGTACTATCGCTCTGAAGATTACTTCTCA
CTGGCCATTGCGCATGATTGCCGGAATGCAATCTTCTATTTGTCACGAGC
GAGAGCTAGATACATGCAAGAGGTAACGATGATATACTTTGAAGGATCTT
TCCTTTGTAGGAGACTACTTGCGTGATTTTTAGTTTAAATCTCGTCGATT
GTAAACTAAAATTGTATCGAAGCTGTCCTGACTACTACAAATGTTACAGC
TAAGAAGATAGTCAGATTGTATGAGATCTTTGTCCCTATTGTAAGTTTTC
AAAATATCCAAAGTTTTTGTAAGACTCGGAACCACAGTAGGTTAAGGTTT
CTGTAGGCTAAAATTCTCTAACCATCTTACTATCCTTTTGAAGATTGCAA
GATAATAAAATTTCACAAGGTGTTTATTTGAATCAAAAAGGTATCATTTC
CATACAATTAAGGAGTGCTCGAGACTAAACCTAACTTATTGCGTCTTAGA
TTTACTTAAATTTTCTTTTCACTTTGTTCTAGAAAGTATCAGAAGCGCAA
GTGGATGTGATATCTGGCTTAACATTGGATCCGTCAAATAAAGATTTCCT
ATCGATTTTTGGTCGTTTGTATCCACGAGAGAAAGTGCAGGATGTTTTAT
CATCACCGTTTGGACAACTCGTTCAAAAGGCTCTGGAAGAAGTTATCGAA
GAAAATTTTCCTGGTGAAGGTTTGAGAGCAAAAGGTAATGTAATGTTTTC
ACTACCCAGCTGTTTCCCTACTGATTTCTTGAATAGTTTGGACGTTTACC
TCATAGTCAAAGCTTGCTATAAGCTGGGATGTTGCTATAGTCTAGCATGA
TAGACGACTAACTTAAAAAAAAGAATTGGATAAGGTATAGTCTATGTACA
AACTGACATTATCCCGTAACAGTTATCGTATCAATAGTGCAAAAGATCGT
AAATTGTTTACCTTATCGGGGAAAACTTCGTCGGGGAAAAGTGACGAAAT
TTCGGCCAAGTGACGAATATTTTTCCCCGACGAAAATTTTCCCCGGCCTT
AATGCGTTTACCAAAACCAGCAAGTGACGAATATTTTTCCCCGACGAAAG
TTTTCCCCGATAAGGTATTCAAAAAACTCTTTCCATTGTAGATGTCGGGC
TGACAAAGAAGAAGAGTTTGCCACAAATCGATAGCGTAAGAGCGGCAGTT
TTGGAGAAGATTGCACACTGCATGGAAGACCAAGAATTTCATGTGGAAAT
CATCAAGGGGAAAAAGAAGGTAAAGTCTGTCTCAATATAATTTGCAGCGG
AGACAAAAAAAGGCTGTAACTTTTGATACAACTCGAATTAGAAAACGGTT
TTGTGCACGTTTAAAAGACAATTCAGAGTGGAATATTATCAAAAAAGAAA
AATCTTTAAAAAATGAAAAAAATAGATGAAAAATGAAGAAGAAGAAAATC
AACTTCTTATAGAATAATGCTATGATATTCATCTTTTATCAGAAATTCTT
CAATCTTAGAACGTCATAAATACGAAAAAAATTCTAAAAATATTTATTCA
GTCAAAAAATATAGCTTAAAACTTTGCGATGGTCAACTTTTTGCTGATTT
TTGGTGGTTTTTGAAGTCAATTGTAATAAAACTTTCGACTATTACTTCGA
TCGAAAAAAGGTTATTAGGGTTCTTTTATCTTGCTATATCTTTGGAACTT
CTCTAATCTTATCAACCTTCCATAGCGACATAATTTACCTAAAGCTCTGT
TAAGGCGTTTTTCACATTATCTCTCTTTTATTATCCAGGTCAATGAGTTG
GTGGAAACTGTCATTCAATCGCGAATCGATTTAGACTACGATGGTCCTAA
AATTGCCAAAGGTGTCAAACCGAAAACCAGGACTGTTTCTGCGAAGACGT
GACCGGAACGACGTGGCTCTTTTCAACAGCCTTTGAATACAATGATGTAT
TAAGTCATTAAAGCCTTTGACCTGATCCAGCGAAATGCTAGGGTTATTGT
CAGGGCATTGGCATTATCGGAAGGGAATGCCTAAATTAAACTACAGTATA
TAATTTGTACGCCTAAAGTATACCATGTTTATGATTGCTTGAGGTTTTCG
CAGTTGATTCAAAATCTTTTGGTGAAGCCAAGAATATTTCTCAACGATTT
TTTACTGATTAACTCTCTTGATGACTTGATTACCTCCTTAAATGATTACC
GCTAAAAAAAAAAACCTTTTTGCTTATTCTCGGTTAGGGAAATTTTTATA
TATGTACTGTAAACAATGAAATTGAGTGTTATATTGATTATATTTTTAAA
TTGTTGTTAATATTTATATTGCTATTTATAGTTTTAATTGTACATATTAT
TATCATAGCATGGCATGTAATTAACAGCTAATTCATTTGATGTGGC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000121_pilon:260061..270656- >MSTRG.14501.1.p2 ID=MSTRG.14501.1.p2|Name=MSTRG.14501.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=312bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121_pilon:260061..270656- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGTTTTATTCCTTCTTCAAATCACTTGTCGGAAAAGAAGTCATTGT
AGAGCTCAAAAATGATCTGAGCATATCTGGTGTACTTGATTCTGTAGACC
AATACCTGAACATTAAACTAACTGATATCAGTGTAACAGACCCAGACAGA
TACCCACATATGTTGTCAGTTAAAAATTGCTTCTTGCGTGGATCTGTTGT
TCGATATGTTCAACTACCGCCAGAAGATATTGATGTACAACTACTTCAAG
ATGCAGCACGTAAAGAATCAGAACAACAGCGCAAACAAAAAGAAACAAAG
GATAAAGACTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000121_pilon | genome | sc0000121_pilon:260061..270656 - |
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