MSTRG.14499.4.p3 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14499.4.p3
Unique NameMSTRG.14499.4.p3
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000121_pilon:215125..234712-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14499.4.p3 ID=MSTRG.14499.4.p3|Name=MSTRG.14499.4.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19588bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121_pilon:215125..234712- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GAATTTTTGTAGCAGGTGGAATTTTAGTCATTGTCTGGTCCCAAGAAACT TCGAAAAATACCCTCTTAAAACTCTTAAACGTGAACTATCTGAATTTAAA GTATATAGATAGGGAGCATGAGTTAGAATCAGGAATTTGTTAGGTAGAGT ACAATTAATATTTTTTCGATTTTTATTCTCATTTTCAGATAGTTTCTACA TCCCGATGAATTCGAACATGTATTACGCAATCGATAAGAAATTCGATTTA TGTTTTAAAATTTCCAAGAAGAAGCTAGCCAAGAGTGACAAACGAAGAAA AGACTTTAATTCAAAATTCGCATCACAAAATAAAAACAATAAAGAAATCC CAGTTTTCAGTATAAGTACCACGTGACAACTTGTATGACGTAATAATAGA TGACGTATTCTTTATACGTATACGTCATCTTTCTTTTAATTTAGTTTTCT GTTATAATAAATATTTCGCGGGGATTGCGTATTTTCAGAACTCGTGAAGG TTTTACAAAATCTTATGGTTCTTTAAGGTTTTCTATCACACACAAATATA CTTCAAACATTTTTCAAAACCCTGGAAGCCAAGGAAATTGCGCTACTTAC TTCTAATCTACACTCAATACTCAAGTCAAATATACACGAATACTCAATTT TCACATCGAAAATAAGAACTCTCGCATTTTCCGCGCAAATAGATTTTCAA AAAAAATAAAAGTTTTTTTATATTACATATTTTATTATTTGCCATGTAAA TATTTTCGTTACCGTAGGATTTGGCTCTCCAATCACGAATGCACGCTTTA GCATCAATTTTAGAAAGTGGTTTTATCATTTTTATGTTGCTACCCTTCTT ATGATATGCACGACGTAATCTTCTGCACTGAAAATCACTAAGACTACTCA ACGCGAGATATCTAATACTTTCTAAATCACAAATTTTCCGCTGAGAATAC AATTAAACAATGAGAAAGGCCGTTTTAAAACAAAAACTACTACCTTATCG GGGAAAACTTCGTCGGGGAAAAGTGACGAATATTTTTCCAACTACCAGTT AGTTTACCAACTACCAGCAAGTGACGAATATTTTTCCCCGACGAAAATTT TTCCCAACGAAGTTTTCCCCGATAAGGTATACTGAGTGTGTTTCGTCATT GAATTCTCAACGATTTTTTGTCTCTTGCGGCTAGTTCAGTTTTCATTTTT ACGCCTTCGCTTTTATATTTCTTTTTTCCCCAGGTTTCGAGTTACTACAT ATTGCTTTTCGTTTTTATGTCGTCGCATTTTTTTTCTTTCTTTTCCAGAA TGTTCGAAACTTTTTTTCGTGTTCTGAATTTTTCTAAACACAAAATTTTC ATCATCCTTCACAGTTAGGTAAAAAATGTGAAATTATTTAGGGGGCAGAC TAGATGTTTATATTCTAGTTCCCTGGCGGAATCTAGATTTGTACATATAT TTTCGCAGTGTAAATAGGCCATAATTATATATTTTTGCAATCAATTTTAA AAATAAATCTAATTTAATAATTTTCAAATTCGATTAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000121_pilon:215125..234712-

>MSTRG.14499.4.p3 ID=MSTRG.14499.4.p3|Name=MSTRG.14499.4.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1197bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121_pilon:215125..234712- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATAGTTTCTACATCCCGATGAATTCGAACATGTATTACGCAATCGATAAG
AAATTCGATTTATGTTTTAAAATTTCCAAGAAGAAGCTAGCCAAGAGTGA
CAAACGAAGAAAAGACTTTAATTCAAAATTCGCATCACAAAATAAAAACA
ATAAAGAAATCCCAGTTTTCAGTATAAGTACCACGTGAATTAAACCTAAT
CACAGAGCATGTGACGTCATCTCTCAAACGTTAGAAAAGACACACTCGAA
GAATAACGTTATCGAATACTCCTTATTTCAAATCAAAGGAAACAGGAGCT
CCTTTCATACAACGTACGATCAAGTTGATAAAAAAGATGGGTGTTGTGGC
GCGTGTTTTCTTGGAGGGCGTTCGTGAAGTGCAATACAAAAGTATCGTAA
TAGTTTCTACATCCCGATGAATTCGAACATGTATTACGCAATCGATAAGA
AATTCGATTTATGTTTTAAAATTTCCAAGAAGAAGCTAGCCAAGAGTGAC
AAACGAAGAAAAGACTTTAATTCAAAATTCGCATCACAAAATAAAAACAA
TAAAGAAATCCCAGTTTTCAGTATAAGTACCACGTGAATTAAACCTAATC
ACAGAGCATGTGACGTCATCTCTCAAACGTTAGAAAAGACACACTCGAAG
AATAACGTTATCGAATACTCCTTATTTCAAATCAAAGGAAACAGGAGCTC
CTTTCATACAACGTACGATCAAGTTGATAAAAAAGATGGGTGTTGTGGCG
CGTGTTTTCTTGGAGGGCGTTCGTGAAGTGCAATACAAAAGTATCGTAAT
AGTTTCTACATCCCGATGAATTCGAACATGTATTACGCAATCGATAAGAA
ATTCGATTTATGTTTTAAAATTTCCAAGAAGAAGCTAGCCAAGAGTGACA
AACGAAGAAAAGACTTTAATTCAAAATTCGCATCACAAAATAAAAACAAT
AAAGAAATCCCAGTTTTCAGTATAAGTACCACGTGAATTAAACCTAATCA
CAGAGCATGTGACGTCATCTCTCAAACGTTAGAAAAGACACACTCGAAGA
ATAACGTTATCGAATACTCCTTATTTCAAATCAAAGGAAACAGGAGCTCC
TTTCATACAACGTACGATCAAGTTGATAAAAAAGATGGGTGTTGTGGCGC
GTGTTTTCTTGGAGGGCGTTCGTGAAGTGCAATACAAAAGTATCGTA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14499MSTRG.14499Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14499.4.p3MSTRG.14499.4.p3-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14499.4.p3.exon16MSTRG.14499.4.p3.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon15MSTRG.14499.4.p3.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon14MSTRG.14499.4.p3.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon13MSTRG.14499.4.p3.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon12MSTRG.14499.4.p3.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon11MSTRG.14499.4.p3.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon10MSTRG.14499.4.p3.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon9MSTRG.14499.4.p3.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon8MSTRG.14499.4.p3.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon7MSTRG.14499.4.p3.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon6MSTRG.14499.4.p3.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon5MSTRG.14499.4.p3.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon4MSTRG.14499.4.p3.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon3MSTRG.14499.4.p3.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon2MSTRG.14499.4.p3.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14499.4.p3.exon1MSTRG.14499.4.p3.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000121_pilongenomesc0000121_pilon:215125..234712 -