MSTRG.14471.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14471.1.p1
Unique NameMSTRG.14471.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000120_pilon:868829..891836-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14471.1.p1 ID=MSTRG.14471.1.p1|Name=MSTRG.14471.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23008bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:868829..891836- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGTCGATAAAACAATAAAATAATAGAAACAATCTTTTATTTGGGATGGCA TCAAATCCTGCTTATGGTTTTCGTCTGTGTTCTGTTGGGAAGAACATAAT CAAAAGAAGTAAACCAAAAAACGTATGTTTCCACCTTGTTCACTATTTCA TCTAAAATATGATACCAAAGGGGAGTTTAAGCATGCGGGGGTTTTCGAAG TATGTAAATTTATTAGGCAGGATCATGAGTTGGTTTCAGACAGGGTTAGC AGGTTTTTTTGAGGACGGGTTGTCAGGCGCCTTGAGACAGAGTCATTAGG AGTTGTGAAATAGGGATTATATTTGGCTTAGCATTTTGTTGTGTTTCTAT CACAAAAATGTCTATAATAATCATTCTGAAAAGAGATTTAGAGTGGTTAG ATGTGAATTTTTTTAAACTTCTTATGACGCCGAGAACTGCTGAGGGAAAG GTCAAGTAAAGTCTATTTCAAATTAGCTGGCAGTGTTTTTTCAAACCTCA TTAACTTTAGATAGAATTTGAATTGGTTCGCGGTTTTGTGCTCGTTAAAA AGATAAGCCGGAGTGGAATATTATCAAAATAATTCAATCATAGAACGTCA TAAATGCTAAAAAGATTAAAAAAATATTCATTCAATCAAAAAATACAGCA TAAAACTTTGCCCTGGTTGACTTAAAAAAGGGCTCTTTTTTGTTGTTTTT TGATGATTTTTGAAGTCAATCATTGATAAGCTTTGGACTATAACTTTCGA TGGAATAATTTTTTTTGAAATTTTTTTCACTTTAATGATGTTCTAAGATC AAAGAATCACTCGTTTGAAAATGAAAATTACAGCACAATTATTGAAGAAG TTTATTTTCTTCTTCTTCTTCATTTTCAATCTTCATTTTCAATCTCCATT TCCCGATCTTTGAGTTTTTCTCTATAACAATATTCCACTCTTGTTTGTCT 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TCAGATTTGCAGAATTCCTAAGCATAACATAAGCATATATGTCAGCCTGA AATATTTTTCAAGTTGTCGTTTTTATCTGTTTAAAAAGGTTACTATACAG TAGAGGGATTTTTTGTAAAATCGCTCGATTGTTTTGATCAAAGCACTTGT TATACATTTTCGGACACTTTGGTGTGATTTTTGAACAAATATGATGGTCT CAGGCAAAAAGCATAGGGTCAAAAATTAATGAAAATTTTAGCTTGAGTAA ACGGAGACCTGTTGTATACATATTGAGCTTCAAAAAGCGCAAAAATTGGA CAAAACAGCTGTTTCTGGCTTAAATGTGGCTGGCTGTCTCTGTCTTTAAG GGTTAATATCTCAAGTTAGGTACAGAAATCACCTATACTTGTAATATATC TCTAATCTAAATTTTTTGAGAGCTTTCCAAAAATATACAACAGGTCTCCG TTCTCAAGCTAAAATTTTGATTAATTTTTGACCCTATGATTTTTTCCTGA GACCTCAAAAAAACGAATGAATTTCCCCCTACTAGTACAGGTCAAGTAAA AAAAGACATTTTCACTAAAAACTTGGCTCGGGCTGAGCATATAATAAGCA TAAGCTATGCGTGGACGCTTTGAGAACTTAAGCATACACGAGCTTGACCA AGGGGCATATACTTGCTTATAAAAAAACATGTAATCGTAAAGAAAGTTGT GGCCATCAGAACCTTAAACTTCATTTTCATCCTGACCAGAGGAATGTAAA GAGATGGAAAAACAGCTTCTTGAAAACAATGGAAAAACGGCTCGTCATAT ACCAGGTCTCTTGCCCTTAAGGGAGTTTATGTCGAGTAAATAGGTTTCTT TTGTTGTCGCTATAAAAAATCTGCATAATTAGCGTGTTATGACAAAATTC TTTTGTTTCAAGCCTGATTATGCGCAAACTTTTAGGGCTTATATTTTGGG TACACCTCTCCTATACGAAAAGGTACCTATATCTTCTTGCTCAGGATTTC CTAGCGATTCTATTGATATAACCGCATTATGACCGCATCATTATATGGAA AGCTAGAGCGCGAGAAAATTTTAACTTCATATTGACTTTACTCGACTTCT GACAGTTTTACAAGAACCAATTTAATATCATTGCGTTAAGAATTTCTTTT GCTATACATTAGTAAAAATATTGCTCCTTATTCTTAAAAATTGAACTAGT AATCGGCAAAAAAGGAAAAACAAATTTTCATTTTTATCGTCAAATCATGT AGAAACCGTCCGATTTGTATGGCGAGCCGTCTTTTCTGGACTTTCATTTA ATGACCTAATCAAAGTTTTTACAATAGAATTTTCAATAGAAGTGATCGTT GAACTTTGAGTAATCAGAAAAGCTGTTTTTCCATCTCTTTACATTCCTCT GTCCTGACTAATGTAAACCGTCATGCAAATGCAATGAGTGATTCTTAACG ATCGCAAATTAAAGATGGCTTACCTACTTTTTTCGGCGTCAAAAATAAAC CTTAATGACCCTAATGATATGTATAGTAGAAATCATTTATTGTCTTTTGT CTTTTTACAGTGCGTTCAGAAAAGTGAAAGACATTTTCATGATTCAGATA CTATTACTTATTGCGAACTTATACTAATTTTCAATAAAATGAATACAGTC TGATGTTGTCTTCTGATCAGCCACCAGAACCGTTGGCCAACGAATACGAT GAGACCACAGATCTGTAAAGCCCGAAGGGCTAGATTTGCGGCCTTGGTCA AAAAGTGAAGCTCATCTTTGGAAGGATTTCCTACCAGAGTCACGTGACTA AAATATGCAATTTCACCGGCTTGAGAGATGTGAAATAGCGTTTGCCGCCT ATTTTTTTTATCTCGCGCTCCGAAAACAATTAAAATGCTAGATCCTATCC ATCGGCACGAAATTTAAAAAGTCAAATTTTTGCTTCACTTTTTTTTGCTG GAGAAAGCTTAAAGTTGCCTATCTAGCCCTTCGGGCTTTACAGATATCTG TGGATGAGACTCGAACTCACAATCATGCCATTTGCGGCCCTTTGCTATAC AATTGAGCTACTAATTTTCATTCTCCTACTAGTATATCTTTAAATATTAT TTCTACTTTCTAAAACCGAAACCTACATATCCAGGCTAGATACATCCATA CTTTGGAAAGTACGATCAATTTGACCCAGCTATTGATTTCAATCCTCGTC ATATCAATTCGGTTTTTGTGGTTAGCTTGGGCAATGAAATGTTCTTAATG ATCGAAATCTTTCAACCCACCTTCAACCCACATGTCTATGAAAGTATAAT TTGTCGCCTTTGATATTTAATGGGTAATGATAGTTTCATTATACAACTTG TCTATGGATGAAAAAACCTGGGGCGGGGGGGGGGTTACTTCGGCAAAAAG GGGTACGGGGATGTGCTGCTGGTCAAGGTACCTTTTTCCACCTTCACGAG TCCCTGGTAAGGTCGCAAAAACACTAAAATAAAAAAATCAGTAGAAAATT TTGAGAACATTTGAGAATTTAACTCCCATTCAGGGCCACTTTATTCGCAA ATTTGTCAATAAACGAGTCCCACATAGGGTCCATTTTTCGAACGGCAGCG TTACACCCCCGTCGGTCAGCAAGGGTAGCACCCCCCCCCCCCCGGATGGA AAAATGGAACAGAATCAGCATACAGACTCTACTCTCTTTACATACTATAC CTTTTCGGTGGATGTCTATTTTGAAAACTAGTGTAAAATTAGATTACCTT GTGAATCAAATATATATTAACCACGCAAGCTCGCTAATGCTTCTTACTCT ATGTCTTCATCGTAGCCATCGAGGGCGAAGCAAGCGAACATTCAGCTTGC TTTGCTAATTATCTATTGAAAAAATGGAAAATTTAGTACCAAACTAAAAT ATCAGGGGGGATCGGGTTCAATAATCCGAAATGATAGGCCGTCGTCGGGC ATAGAGGTCGTCGTCGCCGGGCATAGAGGCCGTGGTCGGACATAGAGGTT GTTGTAGAACATAGAAGTCGTAGCCGGACATAGAGCTCGTCGTCGCACAT AGAAGCCGTGGCTGGAGGTAGAGGTCGTCGTCGAACATAGAAGTCGTCGT CGAACATAGAGGTCTTGGCCAATTTTTTTCGGTCTTTATAAGTTTCTTTT ATAAGTTCTGGTCTGGAAATTTAACAACACAGTCTGTAAATTGTGCTTGA TCCATGTTATGTTTATTTAAAGGGACATAACAGTACTGACAAAATTTGTA AAACCGTATGCAGCGGATACAAAATCAAAACAAATGTCACATGTCAAAAT AAAAAATCAAACCAAATATGGCTGGTTATGATTGTTTTAATTGTTTTACA AGTTTGTTTTGGACACGTGATTTTAATTGTTCTCTTTAATGACACGTGGT TCGTGCAATGTTTACATTTTACTACTGTCATGTCCCTTTAAATTGTAAAG TTGTCGAACATACAATAAAGGTCATAATATTTTGATAATTCTGGTTATTT TAACGTTTTTCAAGATTTAAAGTTCCGGCGAGAAAGTCGATTTTGGGCTA TCTCTTTAATTTAATCGAATATTTCAATTCGGAAGGGGTTGGCAGACTTA CAGGCTATATTCTGAGCCTTGTTGGACTATTTTTGCACTTTTGGATCCTC AGATCCTCAGGTCTTAAGTCTCATGTTAAAACTCAGAGTTAGAACTCTAC CCTTCCAACCTACTTTAGAGCACTTACAAATGGCTTGTGGTTCAAAAACT TCCCGGTGTATTTCCCTTTTTTCTCAAATATTATGACCTTGATTGTAGAT ATCGTGGCCGGACAAAGAGGTCGTCGTCGGACATAGAATTCTCCGGGGCG GTTCGCATCAACGAAGGCGGTTTATCCGGCGGATTGGTTCTTGCTCAGGG TGGTTTTCCCCTTTTCCCGTTTTCTCTGCCATCCTTTGGATGGAGAAATT TTACAAACTGGTCCGTTTAGTACTAAATATCACGTAGAACCGTTTTTCGG TATATTTTACTTTAATTTAATTTGGCAAATAGACTGAATTTCCAGGGTGC TGAATTTCAACAAATACGAAATAGGTGGCTGAACTAAAATTTTGTAGATC AACTTATTGGTAAGCCCAGGAAAAACAGCGGGTTGATCTTGAAAAAAACT TGCAGCTACTAGAAAAATATTTTTGAAAAGTTAGCCAATGACCTCGTTGT TCGACGGCGACTTCTATGTCCAGCCAAGACCTCTATGTTCGGCCATTACC TCTATGTTAGACCAACGACCTCTATGTCCAGCATCCACGGCTTCTATGTT CGACGAAGACCCCTATGTCCGGCCAAGACCTCTATGTTCGACGACGACCT CTATGTCCGGTGACGACGTTCGGCCGTGACTTTGCTATACACAAATAAAT ACGATGAAGGTGTATTTTGAAGACTGTGTTGTCAAATTTCCAGACCAGAA CTTAAAAAATAAAGACCAAAATAAAATTGGGCCAAGACCTCTATGTTCGA CGACGACCTCTATGTCCGCTCTATGCGCGGCGACGACGACCTCTATGTTC GACCACGGCTTATCATTTCGGATTATTGAACCCGATCCCCCATGATACTA AAATAATTTAAGACCCAGCTGTTAAAAATAACTAGAACATACAATGTTAA TGGGGCCGGCTCATTGTGTTTCTTAAGGAAAATGCTAATTTTATTTCTTA ATGAAAGTGATGTGGGTTCATTGTTTTTCTCAGGGAAAATGCTGGATTTT GTTCATTGTATTTCTCAAGAAAAAATTACGTCCTCGCAAAAATTTATAAT TAATGTACTTAATTTTCATGTTTCCAGAAATAGCATTTAAGGGCATATCT AATTGAGAAATATTCTCAACTTTGCCGTAATAATTCATGGCTTTATAGGC CTTGATAAGGTCGTTAGAACTCATCAAGGAAAATTTGATGAGAGTAAAAG AATTTAAAAAATTTGACGGAAACACTAAACTTCTCATTGTTCTCTATCAG TATTTAAAGTGAATTCACTTTGACAAATTTTAATCAAACGCTAATTGAAT TGCGAAACGCTAAAAGGAAATAAGTTGAACAACGTACGCACGGAGCGCTA AAATGAAGAGTCGTGGCTTTACTTTTGTTATTTCTTTAGTTTACGTGACA CACGCCGTCCTTACGCAAGATCTATCAACCAGCACCAAAATAACACGCCG TGACGGCAAATTTCATGTCAAGAATAAAGACAATACAGAAATGGTTTATA GTGCTTACGAGCTTCGCGCGATGATATACGGAAAGAAAATCGGTTGCCGT AGTTTTCTGATTACAGAAGTTATTATCCCTTTCAAAGATGACGAAACGTT AAGCTGTGATAAAGAAGTCAAGTTCCAAACCATGATTTGTGGAGGGCATT GTAGTGGTTTAAAATATCATCCAAAATTAAGCGATGGTAATTTATTGAAG ACTACGTGCCAAGCATGCGGACCAAGTCCTGGGGCGAGGAAAGTATTGGA GAAAGTTGTTTACTGTAAGGACAAAAACACTAAAAAGATGATTCAAAAAA CTTTGAAGTTTCGTATTGTGAAAGCTTGTGGTTGTCATCAGTATAAATGC AACCCTTTGAAAGATATTTTGAAGTGAAACAGGGTGTAGGACTTGTAATG GTAATGTTATTTCACGGGCTGATAATATGCGCCCTTGGTCCGCCTTCAAT GGATTGGTTTTTCATTGGCTCTCTTTGTTATGAATTTCGAGTGTTTTGTT CGGCATTACTATATTTGAAGGAGGAAAATCATCTTTTTTCATTTTTTTAG GAGTTCTAGTGAATGAAAAACTATCAGTATTGACTTCTTTTAAACCTATC ATCAATCTATTGTTTGCCAATATAAATATATCTGTTTTGCGTAATTTGAA TAGCTAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000120_pilon:868829..891836-

>MSTRG.14471.1.p1 ID=MSTRG.14471.1.p1|Name=MSTRG.14471.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1236bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:868829..891836- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TACCCTGCAAAGAAGGTTGAACTTGGACAAACCATAGTGCGAGTGATAGA
TGAAAATTCCAAAATCCTTGTTCTCCACTACAATGCATTGGATGCTAAAG
ATTGGACAGACTTTCGTTACGCAATGAAACAAGAACAGGCTACAATCAAA
GTCTTCCCTAACAAATTAACATGCAAATTCTTATCGGACACTAGATATAG
AAACATGACTCCATTGTTTCGGACAGACACTTGTTTAGCGTACGGTAATG
ATTTTGATTTGAAGAAAATCTTGAAAATCTTAAACACTAATGATAAAGTA
CAATTGATTGGTGGGAAGTTTGACGATACTTTATTCAATCGACATCAGGT
TATTGATTATTCGAAACTACCAACTTTGGAGCAAGCTAGAGCAGAATTAG
TATCCATTTTACAACAACCCTCACAGGCTTTGTCAGGGCTTCTACAAACG
AATCAAAGTCAACTATCGATGCTCTTGCAAGGCTATGTTGATCAACAACA
AGAGAAGGGCGAAACAGACCCACCACCACAAGCAGAATAAATGGCATCAA
ATCCTGCTTATGGTTTTCGTCTGTGTTCTGTTGGGAAGAACATAATCAAA
AGAAGTAAACCAAAAAACTACCCTGCAAAGAAGGTTGAACTTGGACAAAC
CATAGTGCGAGTGATAGATGAAAATTCCAAAATCCTTGTTCTCCACTACA
ATGCATTGGATGCTAAAGATTGGACAGACTTTCGTTACGCAATGAAACAA
GAACAGGCTACAATCAAAGTCTTCCCTAACAAATTAACATGCAAATTCTT
ATCGGACACTAGATATAGAAACATGACTCCATTGTTTCGGACAGACACTT
GTTTAGCGTACGGTAATGATTTTGATTTGAAGAAAATCTTGAAAATCTTA
AACACTAATGATAAAGTACAATTGATTGGTGGGAAGTTTGACGATACTTT
ATTCAATCGACATCAGGTTATTGATTATTCGAAACTACCAACTTTGGAGC
AAGCTAGAGCAGAATTAGTATCCATTTTACAACAACCCTCACAGGCTTTG
TCAGGGCTTCTACAAACGAATCAAAGTCAACTATCGATGCTCTTGCAAGG
CTATGTTGATCAACAACAAGAGAAGGGCGAAACAGACCCACCACCACAAG
CAGAATAAATGGCATCAAATCCTGCTTATGGTTTTCGTCTGTGTTCTGTT
GGGAAGAACATAATCAAAAGAAGTAAACCAAAAAAC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14471MSTRG.14471Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14471.1.p1MSTRG.14471.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14471.1.p1.exon3MSTRG.14471.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14471.1.p1.exon2MSTRG.14471.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14471.1.p1.exon1MSTRG.14471.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000120_pilongenomesc0000120_pilon:868829..891836 -