MSTRG.14432.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14432.1.p1
Unique NameMSTRG.14432.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000120_pilon:233293..243664+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14432.1.p1 ID=MSTRG.14432.1.p1|Name=MSTRG.14432.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10372bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:233293..243664+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tttTAGATTGATGAAAAacactaaataaaaaattgcaCATGAATTTCTTC AAACAAACAGTCAGGAAGAATAATTTATCGTTGTAAAGATATTGGAGAGT GGAGAGTAGAATCTTTATATCAACATGGACGCGATGATGTGTCAAATGGA TGACTTGTCAAAAGTTAATAAACAGGAAAAGTAAGATGCCTACCAACTCT TACCTAAGACTAAGAAAAGTAGTATAGTCTATTTATCTGTATTAAGCTCT TTCAGAAAAGTTTGCACATATGGGCCATGCATTTTTAACCCACTCCCCAT AATGATTGTAGGCCTAGTCTTAAAATGGAAATAGAAAGGGAATCAGTATT AACCATACTATCCCGTAACATTTATCGTATTACTGTATAACACCAATATT GTTAGTATAACATCATTATAAGCGATAATCCAAGGTAAACAAAGATATTT CTCTTTATCGACTCGCACACCTACGCAAAACTAATGATTTCTACTATAGC TCAAATGTGAGGAGGTACTTATGTGTTTTGAGTATTTCAGTCAGTCATTG CCTCGTGTTTATAATTGCCATTTTATGTTATCAGTAatccatggcttggc agcaggttttaggtgccccctaagaattcaggtgacccctacgatttagg taacccctggttgccaaatattttaggtgacccctaagccaatgacacgt caaattttttcgaaaatccttttcaaacaatcaaacaaatacaacagtta gtttagcttattgctaaatagaataaatgccctaagaaataagagataag ctaactactgaaggttcatgctacattatcaaggttttgtaagtcagggt GCAGATCCCTagccagacagattttttatctaagtaaatgcaacaggatt aaagaatttttacagatcagtgccgtaagaagcattttcatattaggggg 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000120_pilon:233293..243664+

>MSTRG.14432.1.p1 ID=MSTRG.14432.1.p1|Name=MSTRG.14432.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=34380bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:233293..243664+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTATGGAATTATTGTGTtcgacttttcaaaaaagtaatcAACAATACAAG
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ATCCCCGCGCGACCTCTGGTCGATGAAGAAACAAAACGGCGACAAGCTAA
CATCATGGGTGACCTACAACTAGCTGATATGCTCAGCGAAACTGGTCCCC
TACCACAGATTGATAACCCGTTCCCCGACAGTCCTGAATCGTATGATATG
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ATCCCATCGTCATGAATGAAGTCAATACGTTTTTCAACGAGATGTCGACA
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ATCTTTCACCCAAATACGAAACCCCGTCTCCAGAATATCCCGCCCAAACG
AATGGTGGCGGTAATTGCTCTCCCCCTTACATGGCGCCCGTTGGAAAAGA
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TCGTACGCTACTCCCTCTACTGAAGAAGCAGCAGATAAAGAAAGTTACTT
GAAGTCTATCGACTACCATAACATGACGAACGGACATCGTGCGATCGTTT
CTGACGAACCTGTCAAACCAAATCCTGCTGTTTTCACCCACACTCCTAAC
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GCGAAACTGGTCCCCTACCACAGATTGATAACCCGTTCCCCGACAGTCCT
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ACAACTAccaaacgaaaacaaaaatttcggCTCGCGTGAGGTTTTCTCTA
TGAGCAACACCATGAATTTCCACCACGCGGATAACAATaattctttccaa
attcaacaaacATCAACTTCTATCTACATGGAGCAACAGATCTCCCCACC
TCTTCCACGACAGACACAACAACAAGCGAACAACAGTATGTCTCCACAGT
ATCAACAGCCGCACGATCCCATCGTCATGAATGAAGTCAATACGTTTTTC
AACGAGATGTCGACAGCTTCAAACAATTCTCCTTACCCacaacatcaaca
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TAACAGAATGCATTTCAACCCACAAATGGAGAGTCCTTTGGAATTCAACA
ATTTCAATACTATCATCAAAACAGAACCACCCAACTATATGGGATGTGGC
GCTCAATATAGGAGTAATAATATGATCAATAGGGGTAATGGTATGACCCA
GCAACAGCCACTTCAAACTCAATGTATACcccagcaacaacaacaacgac
agaATCAAATGAACAATATACCACAATGTCAAGGTGGTCATTTCGATACC
AATCTCCCCAACGGTGGCGGTGTACTGAACCAAGGACAATTCAATCCAGA
TATCCCTCCTATAGAGGTGCTTGATAATTTGGACGATATTGAAGATATAA
TTTCTTCCTGTATAGAACAAGATGAAATCCAAAATCAGGACTTTCAACAA
AGGTTATTGATTCAACAACAGCAGGAGcaacaattgcaacaacaagcttt
tgttgaacaacaaatgaactttcagaaccaacaacaaaacGGACAATTAC
CATATAATGCTCCTTTGAGGTGTAATACAACGATACCAAACAAGTTTGGT
GGCTATAATAACACTAATTCCatattctaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14432MSTRG.14432Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.14432.1.p1.exon7MSTRG.14432.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14432.1.p1.exon8MSTRG.14432.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14432.1.p1.exon9MSTRG.14432.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14432.1.p1.exon10MSTRG.14432.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14432.1.p1.exon11MSTRG.14432.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14432.1.p1.exon12MSTRG.14432.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14432.1.p1MSTRG.14432.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000120_pilongenomesc0000120_pilon:233293..243664 +