MSTRG.14421.6.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14421.6.p1
Unique NameMSTRG.14421.6.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000120_pilon:43990..71315-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14421.6.p1 ID=MSTRG.14421.6.p1|Name=MSTRG.14421.6.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=27326bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000120_pilon:43990..71315- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000120_pilon:43990..71315-

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TAAAATGTCTGCTCCTGCAACTCCCACACCTGCATCACAATCAATACCAG
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CATGCTTCTATCAAGATGAAGGGGAAAAAGGAAAGAGGCTTGGAAATCGA
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GCTTATCTTCTCATCAAACTGACTGCCAACATCGTCCAGACTGCAGCTAC
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CAAATGAACCATTGGATAAAATAATAAAGAATTCCTTGAGGGTGAAATGC
AAGAGTGCCGACGAATGTAGCTGGATTGGAACAATTTCAGAATATATAGA
GCATTGCTGAGCTATCATGTCCAAAGTGCAAAGAAAGATTTCATCCAAAT
CAGATGGCAGTAGCTGCAAATTTCTACGATACGGGTGTTGTTTATGGTGA
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TACTGCGCCTGTTAGAGGTGGATTGTATAATTTTCCAAATAATGGTATGC
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CTGCAAAGCGAATACAATACGATCGAGATTTCTTACTGAAATTCCGTTAC
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TCTTGATACTGCTCATCAACCAACTAAACCCTTAGCTCCTTGTCAAAGGT
TGGTAAGAAGAATAAGAAGAGTGTACATTGGTTAGAATTGGTTAATGAAG
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AAGACGAGGGCGAAAACCAAGTCGATTTTTTTCGATGAAGTTGACGAATT
CGCGGGTGTTCTTTTCGTTCGACAGGTTTACTAACAATGATTTTATGCCA
AACTTTATGCGACAATCCATCAAAGACAGTTCATCAAAGAGTGACAGAAG
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AATTAGAAAAACTGGAATTAAAGCGATCAGAAAATGCTTGGGTCCTACCT
AGTGACCAAGACAAAGACTTACCTGGTCAAAGTTGTAGACGACCTTGCAG
AATGGATAACGCAGGATAACGCAGAACGAATACAATACGATCGAGATTTC
TTATTGAAATTCCAATTCAACCCAATTTGCACCTCAAAACCAGCCAACTT
ACCAAACATTGATATCGTTCTTGATACTGCTCATCAGCCAACAAAACCCT
TAGTTCCTGGTCAAAGGTTGTTAAGAAGAAAAAGAAGGATGCATCGGTCA
TTGAAGAAGTTGATGATGGTGCAGCCACTTATCAGCCTGTCCAACTCCAA
GCACAACCAGTGCAACAAAATGTGCAACAAAATATTCCGCAACAGCACCA
GCAGCATCAACAACAAAAGAATACTCAAGTTAAAATGTCTGCTCCTGCAA
CTCCCACACCTGCATCACAATCAATACCAGTTGATAGTGATGAAAAACTG
AAACAGAATAAGGCTAATGCAGAGTTTGCGGCAAAAGTTGCTGCCCAAGT
TGCTGCAAGACAGATGAAACAGTCAGACCTGTTGTCACACTTTGATACCA
ATATACATTCCCACATGAAACTCATGTTCATTGAAATGGATCAAATGAAA
AAGAAGTTTGAAAGTGATCTCAAGTCAACAACACAAAAGGTGGAAAAACT
GCAAAACAGTGAAGATCTACTGAATGCGACCATAAAAACTTTACAGACAG
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GAGCTTTCTTCAAAAGGTTGAATATCACACTCAACATGAGTGTAACAATA
GAGTTGTGCCATGTGGTTTTGTAAGAATCGGCTGTCGAGAAGAGGATCAT
TATGCTATATGTCCAAAATATCCAGTGGATTGTCCTAACGGATGTTGTAT
TGTACTTCAACAGAGTCAGGTTCATTCCAAACGATGCCACTTCTTAGAGT
TGAAATGTATTTTTGTTGGCTGCAATAAAAAGTTAAAGAGAGTCAGCTTA
TCTTCTCATCAAACTGACTGCCAACATCGTCCAGACTGCAGCTACTGTAA
CCAGTTGTTATTAAAAACCCCTTTAAAGGTCACCTCAAATGAACCATTGG
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TGTAGCTGGATTGGAACAATTTCAGAATATATAGAGCATTGCTGAGCTAT
CATGTCCAAAGTGCAAAGAAAGATTTCATCCAAATCAGATGGCAGTAGCT
GCAAATTTCTACGATACGGGTGTTGTTTATGGTGACCAAAAGCAGCCTGG
CAATGAAGAAATTGATTATGACTTTGAACTAGATGGGCAAAAAGTTGATG
AATATTATTGTTTAATATGTTTCCTCCTACTGAGAGATATTGCGCAGATG
CCTTGCAAACACATGCTTTGTAAGCATTGTCTAGATGACTGGGGAAAATA
CACGTACCAGATTCAAATCAAATGATGCAGGCTGGTACTGCGCCTGTTAG
AGGTGGATTGTATAATTTTCCAAATAATGGTATGCAAATTAGAGGAGGTT
ACCCAAATGGACCTCGAATGCAATATCAAAATCAACAATATGTACAAATG
CAACAGCAAGATGTAATGCACCAACAAGGTTATATCCAAAAATACAATCA
AAATGTTTATGGAAGCAGTCCAAACTATCATACTCAACAATTCCAACAAT
CCAACAATACATCGCTTTTTTAGTGAAGATCATGCTTCTATCAAGATGAA
GGGGAAAAAGGAAAGAGGCTTGGAAATCGAAAACAAAGCAGACGCTCCTA
TTCAAGGAGCTTTTCAACCAAGACCTCAGAGGCTACTGCAAAGCGAATAC
AATACGATCGAGATTTCTTACTGAAATTCCGTTACATCCCGTTTTGCATC
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GAAGAGTGTACATTGGTTAGAATTGGTTAATGAAGGTCAAAGCTGAACTC
CGGAATAGGTCAAACTAATCAAGCAGTCGACAGACGAGATGACAAAAGAA
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AATGCAGAGTTTGCGGCAAAAGTTGCTGCCCAAGTTGCTGCAAGACAGAT
GAAACAGTCAGACCTGTTGTCACACTTTGATACCAATATACATTCCCACA
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TCTACTGAATGCGACCATAAAAACTTTACAGACAGAACTAAGCACTACCA
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AAAGAAGGATGCATCGGTCATTGAAGAAGTTGATGATGGTGCAGCCACTT
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TAAAATGTCTGCTCCTGCAACTCCCACACCTGCATCACAATCAATACCAG
TTGATAGTGATGAAAAACTGAAACAGAATAAGGCTAATGCAGAGTTTGCG
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GTTGTCACACTTTGATACCAATATACATTCCCACATGAAACTCATGTTCA
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CCGCTGAAAAGAACATTGAAGAGCTTTCTTCAAAAGGTTGAATATCACAC
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CCAGACTGCAGCTACTGTAACCAGTTGTTATTAAAAACCCCTTTAAAGGT
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ATAGAGCATTGCTGAGCTATCATGTCCAAAGTGCAAAGAAAGATTTCATC
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GGTGACCAAAAGCAGCCTGGCAATGAAGAAATTGATTATGACTTTGAACT
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TGAGAGATATTGCGCAGATGCCTTGCAAACACATGCTTTGTAAGCATTGT
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GCTGGTACTGCGCCTGTTAGAGGTGGATTGTATAATTTTCCAAATAATGG
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GTTACATCCCGTTTTGCATCTCAAAACCAGCCAACTTACCAAATATTGAT
GTCGTTCTTGATACTGCTCATCAACCAACTAAACCCTTAGCTCCTTGTCA
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TGTATTGTACTTCAACAGAGTCAGGTTCATTCCAAACGATGCCACTTCTT
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AAATACACGTACCAGATTCAAATCAAATGATGCAGGCTGGTACTGCGCCT
GTTAGAGGTGGATTGTATAATTTTCCAAATAATGGTATGCAAATTAGAGG
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GCATCTCAAAACCAGCCAACTTACCAAATATTGATGTCGTTCTTGATACT
GCTCATCAACCAACTAAACCCTTAGCTCCTTGTCAAAGGTTGGTAAGAAG
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AACTCCGGAATAGGTCAAACTAATCAAGCAGTCGACAGACGAGATGACAA
AAGAAACACAGACCTGTCGCCACCTGCCAATGATAAAGATAAGACGAGGG
CGAAAACCAAGTCGATTTTTTTCGATGAAGTTGACGAATTCGCGGGTGTT
CTTTTCGTTCGACAGGTTTACTAACAATGATTTTATGCCAAACTTTATGC
GACAATCCATCAAAGACAGTTCATCAAAGAGTGACAGAAGAGGTCCACCA
TCAATGGGAGGAAAACCTTTAAAGATCATCCAATTGCCACAATTAGAAAA
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ACAAAGACTTACCTGGTCAAAGTTGTAGACGACCTTGCAGAATGGATAAC
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TCCAATTCAACCCAATTTGCACCTCAAAACCAGCCAACTTACCAAACATT
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TCAAAGGTTGTTAAGAAGAAAAAGAAGGATGCATCGGTCATTGAAGAAGT
TGATGATGGTGCAGCCACTTATCAGCCTGTCCAACTCCAAGCACAACCAG
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CAACAAAAGAATACTCAAGTTAAAATGTCTGCTCCTGCAACTCCCACACC
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CAGAGTCAGGTTCATTCCAAACGATGCCACTTCTTAGAGTTGAAATGTAT
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AAACTGACTGCCAACATCGTCCAGACTGCAGCTACTGTAACCAGTTGTTA
TTAAAAACCCCTTTAAAGGTCACCTCAAATGAACCATTGGATAAAATAAT
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ACGATACGGGTGTTGTTTATGGTGACCAAAAGCAGCCTGGCAATGAAGAA
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ACATGCTTTGTAAGCATTGTCTAGATGACTGGGGAAAATACACGTACCAG
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ACCTCGAATGCAATATCAAAATCAACAATATGTACAAATGCAACAGCAAG
ATGTAATGCACCAACAAGGTTATATCCAAAAATACAATCAAAATGTTTAT
GGAAGCAGTCCAAACTATCATACTCAACAATTCCAACAATCCAACAATAC
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GCTGAGCTATCATGTCCAAAGTGCAAAGAAAGATTTCATCCAAATCAGAT
GGCAGTAGCTGCAAATTTCTACGATACGGGTGTTGTTTATGGTGACCAAA
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AAAGTTGATGAATATTATTGTTTAATATGTTTCCTCCTACTGAGAGATAT
TGCGCAGATGCCTTGCAAACACATGCTTTGTAAGCATTGTCTAGATGACT
GGGGAAAATA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14421MSTRG.14421Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14421.6.p1.exon20MSTRG.14421.6.p1.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.14421.6.p1.exon9MSTRG.14421.6.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14421.6.p1.exon8MSTRG.14421.6.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.14421.6.p1.exon6MSTRG.14421.6.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14421.6.p1.exon5MSTRG.14421.6.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14421.6.p1.exon4MSTRG.14421.6.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14421.6.p1.exon3MSTRG.14421.6.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14421.6.p1.exon2MSTRG.14421.6.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14421.6.p1.exon1MSTRG.14421.6.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14421.6.p1MSTRG.14421.6.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000120_pilongenomesc0000120_pilon:43990..71315 -