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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000119_pilon:834760..846503+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14404.3.p1 ID=MSTRG.14404.3.p1|Name=MSTRG.14404.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11744bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:834760..846503+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGAAAGACTGTTGGTCTGGTTTTGAAGAGCTTGCAGCTTATTTCTTTGTA
AATTGTTTCTTAATTTGTCAATATAGACAGCACAGGCTGATGGCAGACAA
AGGtcatttgaagatattttcagttctaatccaaggtagaacaaactaaa
catagtatagaaagggggtatttttagtgctctatactacagtgagaaag
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AGAGCTGCGAGCGGAGCTGCGTATGTGTATTTTAATGACCAGCCAGGTCA
ttcatttgagggctatgcatgttagcctccactgatgcaagttacccttt
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ggagggaaacttgcatagccatcaaatgactgaccaatcaaagcagcaaa
atttcaaaacaaatgaagaaTGATTTTACGGATTTACTTTTAACCTCACt
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aagcggaatcgacgatcgaaccagtcgaacaacaatcgaaccagtcgaac
aacaatcgaaccaatcgaatattacccagaattttgacgttcaattgaga
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gttcgactggtttgatcgtcgattccgttcgattgagatcgtctggacta
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atttattacgattttgaggttttatagatttccactttttttgagaattt
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tctccaaaaatcagttatgtccgcaacaaaaagTTACGTCCGCAACAAAG
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Tttcatgttgcggacataactattttgtctaaaatgttgctgataaagtg
tatttgcaagctggcatgatgttttattatatggaaGTAATGCTTAGGCT
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aaattttaacagaaaaataaactttttgtttctttgaaaatgatggttct
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AATCCATTGTGTAGTGTTCACACAACATAATCTACTACACATTCACTTAC
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tggattctcttttacagataaatcttcaattttcaggaaatcatagttac
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Atagccagttttcttttcatgaagtcaaactttatgggaatattttttag
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GACTGAAATCTAAGACAAGTATTAGATTATGCATATTTTATCTCAAATGA
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ttttacgaggaagtgaaaaaatgccctattagctatttacccctcaAAAC
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agattttgaacagtgattcgcTGCAAAGTTACAAATGTTATGATTAGATC
ATTGGTacctgaatattttcaaaactgcatgttaaaatcaaattacacct
taaaacctacactattacaccttaaaacctacaaacattgacCCCTTGAT
CACAACTTGCCGAAATATTAAAATTGCAATATAGATGCTGAACCTTGATt
aaattgatcaaatacttgctataaatccattcccaaaacaaaacaatatt
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CAAAAAACAGCTTTGAAGggtcaaacttttattgacttCGTTTTTGACAT
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attgaaattcttgaaattaggtattttatgaaagtgaATTATATAcaata
ctagccggtacccggcgttaAGCTGTAgcgctgaacgcactaaaagtcct
ttggatgttgaagctggcttaaaaaacgatcaaatgaataaaaagatatc
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aaataaaccaacttttcaatacaatttcattttcccagcactttcaaggc
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aaaaaagaggggggaaccgaaaaattttgaaatatggtgggggaaagaaa
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ggaggacactatggctTTGCTTgcattaaatacgccgtccagttttcgac
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gcaGGATCGGgcaaagctgggcagaaattaaaattactacgGTTATTAAT
AATATAGATTAGATTAAGTTTCGTAGCTAAGAAAGAGAGCCCAAAGTGCA
ACTTTgtaggggtatgtggttttaaggggtatccactggtaatagaaaaa
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GAGTATAGAGGCTTCAATCGTTTGTGAAGGAGAAAACgttttaaaataat
tataaacacGAAGAAACTTTGAAACAAATGGTTTCCTTAATATAAAAAGG
TGGAGGTAAATTCAAAAAAGTGGAAGGGGAGAATGGTCgaattttgacaa
tatttgaGCGTACATAATTGTTGAATGGTCCCAtataaaagatttaaaat
ccAAAGCCAAGTTTTGATCCAAAACTGTTTCTTGATCTTAAACTtctatc
attttaaaaattatgattgCTCTTGtgtaggaaaataaaaaaagaaatga
ctGCAGTGATTGCTGGAGATTTCCAGTCATCAATTAATAATGATGAATCA
GATGACTTGCCCTTAGGACAGTCAGAACGTGCAGTCTACTTGTCAAACCA
CTCTATCAAGTTAAAGAAAACACTTGGATTTTCTCATGGCTTTTCACTCA
TTGTTGGGCTCATTTTGGGTAGTGGTGTCTTTATATCCCCTGGATTAGTG
GCAAAGGATACCAGTTCTCCAGGAATGGAACTTGTCATGTGGGCAGCTGC
TGGCATAATTGCATTACTTGGTGCTTTATGTTATTGTGAGATTGGCTGTA
TGTTCAAAATGTCTGGTGGAAATTATgcaaacattttcaatatttatggA
GATGCACCAGCTTTCCTGACAGCTTGGGCAACATGCTTAGTAATCGATCC
TTCTAGTGTTTCAGCAATTGCTTTAACAATTGGAACATATTTTGTAAAAC
CCTTCTATGCAACAGATGCTGAGGGTGAAATACCTGCAAAATTGATTGCT
TTTGGGCTTATCATCCTCTGCTTCATTATCAATAGTTCCAGTGCCAAAAT
AACAAATGTGATCCAAAGAATTTTATCTGTTATTCAAATCTTGTCAGTTG
TTTTTGTGATTGTCATCGGAATATGGCAACTGGCTAAAAACAAAGCTGCG
AACTTTCATGATATGTTTTCAGGAACGATCGTTGATAAACACAGCCCGTT
GCATATTGGGATTGCACTGTTTGGTGCATTATGGTCCTATGATGGATGGG
CACAGATGAGTAATGTTATTGAGGAAATCGACAACGTGGAACGAAATTTA
CTTTTGATTATAGTCACTGGAAtaccttttgttatattttgcTACATCAT
GGcaaacatttcatttttatcagtATTGACACATCATCAGATGGGCTCTT
CAGATGCTGTAGCAATTGACTTCATTGAAAACGCACTAGGAATCAAAACA
TCATATCTTATGATGGTGTTAGTTGCATTATCAGCTTTTGGGACATTAAA
TGGTACCTTTTTTGCTTGTCCTCGTTTGACAATGTCTGCTGCACGTGAAG
GTCATATGCCTTTCATTTTCTCTCTACTTTATAAGAGAAATGAACTACCG
GTTCCTGCTTCAACCCTTATTCTGGTTATATCGTCATTAATGTTGTTACC
TAAAGCAAGCAATCTCAACACCCTGATCTTACTTTTCAGTCAAGCTCAAT
GGGTCATTTACACAGCTTCGATCTTTGGTGTGATCATATTGAGGTATCGG
AGACCAAACCTTGTGAGACCTTTTAAAGTCTTTATTGGTGTGCCAATCCT
TATCTCATTGATTGGTGTTTTTCTTGTCATTATGCCCTTTTTCAGAGACT
TTTGGTTATCCTTGGCAATGATGGGCTTTATATTATTAGGAATTCCTGTC
TATCTTGTATGTGTCAAGTATGCACCTCGACAGCCTATATGCTGCTTAAA
CTTCATGGATGCTTTGAACATGAAAGTTCAAAGTCGCTTTAATTTTGTAC
CTTGCTCGAAAGCATCTTGAATATGTAATATCTAGTAAAGTTGACGATAG
TAAAAAagattttagattttttaacaaaataatcataaaattacttgaat
tatatatatttttatatcttttatatcataaccttaatatatattaaaaa
taCCGAGATTCCTAAAACGATCATTTATGTATTGCAACCACCAAGAAATA
GACTATCATGAAGCTTTTAAAAGTACTAAAAATTACACagtgtatttttt
aatgtttccaaCACCTGGGGGCGGGGCACTCAATTTCTAAATGACTGCAT
GTGCCGCCATTTCTAAACGACGCAATGTGCCgctaaaaaattgactttca
aaatcGGGCCGTTGCAGTGCAgctcttgagcagtgaaaatgtacccttac
agtgcatttttccgAACtttttttacccttacagtgtagtttgaatTCGt
gtcttattttgctgaagctaTGCCCGAAAATAACCCTGAGACACCACCTG
ACACGATGTGTgcaaaagtaataaaaaatgtgaaatagGTTTAAGTCAAA
ACTTTAAAGATACATATCTTTACTGTCAGACTTACATTTCAAGGGTCTTG
AAAAACctcccttaagggcggcacatgccgtggaTCGAAAGTTATGAGTG
CCCCTCCCCCCGGGGTTCCAACGTAAACAGAGCTTTCATCAAGAATCTTT
GGCATACGGAAGATTTACTTCTATCAAGgaactttaataatttttattta
agtttcttgGTTGGGTCTATGAATGGCGGGGGATACTACAGATAATTCAT
TTGGTTCATACATACACTTTGTTTAGCTTTTTTAAACGTATTTACAACCT
TGGAAATTTTAtataataaaaattcattgacATTAAATATATACACTTTG
ATTTTAACAAACATAGGTTGGGTGTATTGTGCAAGAGTGCCTACTATTTT
AATAAGTTTTGTCAAAACACGAGGTCTGATtgccaaaacaaagagaaaca
TGAAATATAACACTTTCTGTAATTTCATCCAGATTACAATAACCCCGATA
ACCAAAGTGCAATACGCGAGAGAAAGTTACACAATTTTAATCGCTAGCTA
GATAGGAATTTTCTCATTTGCAGTGCAATATGTGGCGACTTTTTTATAAC
AATGATactcaaaaattccaaaatataataacaatttaagaacaatgctg
agcctgaaattgtgaAGTTTTAAGCAAATTTATGGTCAGAGTATTAAAAT
TAGGGTCGGATCATGTTATATCCAAAAATACAGTTTGATGCTCGAAGTGC
TATaaaaaaaTCAGTAGAGCCTCAATAAGATTTACTATATGAAAAAATAG
TGAATCTCCCTGAATAAAATAGTGGAATTTGGTTTGCTTGCATTTCAAAG
TCTGTCTTACAACGGACATAGGATGAAGTGGCATGCTTTCACCTCGTGTT
AAAGTACATATTCGATTTCAATCTATTTTCAGAAATATATTATTGTATTT
ACTGTATCGTTGCTTGTAAAATGCTAAGCTCTTAAatgaaatattgagaa
aaaatgCCTTGTTTTAAACAATGCTCCCAATTATTTTAATACCTCTTTCG
CTTCCATTGAAATCTTgaataaaacatttttagaaaaattcaaaatgacc
tGTACCATCAGCATCACATGTGACCTTCAATATTTTGTAGAATCTTATCT
TTTCTTCGAAGAAGATTTTGGTACAGGGTCGAATTCATCATTTCTTTTTA
GACAACTTCTCCTCTGAAAAGACACTGTctctttccctctttctgaaCTA
ATAGCCCAATATCTGCTAATTTTTATCCTTGATTACAGTATGTCCGCTAA
TAAGTAGAGGAGAGTGCACCTTTTTAGTTAACTAGTTGCGACAGTTGCGA
AAAAGAActctaaaatatattttttttattttttcagtatGTTATGGAAA
CTCATATAGAAAGCCATGGCAACAGCAATGCTGGTACCAAACGTAAACAA
GGCAAACTCACTGACCAATATCCAGTTGTCAAGAGGAACCGTTTTAATGG
AATGACTGAAGAAGAAGTCATGAAGCGGGGACTACCGGATTATTTAAGAG
ATTCTCTAGATATTGTGTTCGTCGGAATCAACCCTGGGTTAGCGGCTGCA
TACACTGGGAACTACTACACTGGCCCTGGTAATCATTTTTGGAAATGTCT
GCTCTTGTCTGGCTTTATAGAACAACCTATGACTGCTAAAGATGATACGC
AATTATTTCGAGACTATAATATCGGATTTACAAACATGGTAGCACGAACT
ACGAAAGGGAGCAACGATTTATCGAAGAAGGAGCTTGAGGAGGGTGGTAA
AATTCTGACCGTCAAAATGCAACAGTATCAACCGAGAATTGTCGTTTTTA
ACGGGAAAGTCAGTTATCaagttttttcaaagaaaaagaaattccatTTC
GGTTTACAAGAGGAGTGTGTTGAAGGGACCAACACACGTATTTGGGTGAT
GCCTTCGTCTTCTGCTCGTTGCGCCCAACTTCCTAGGGCGTCTGACAAAG
CGCCCTTTTTTGAAGCTTTGAAACGATGTCGCAATTATTTGAAAGGTGAA
TCTAATACTGTGGTGGATGAACAGAAAGAATTCGTTTTCGCTAATTTGAC
TTTAAAAGGATTTCCAAGGAAATCTACTGTGACATCAACGTAGGGATAAC
AATATCTTTTATTTATTATATCAGTAGAGTTTTATTCTACTCACAACCTA
ATGAGTATGCTTAGATAGGTTCAGgatatatattttaaattttaaagaaa
agccTTTGATTGTTAAAGTAAATTTAGATTGTCATGGGTAAGTACGGTAG
TGTTTGTTATCCTCTGGAATcaatttagttgaaagttttttgaaaaataa
atgaaatgacTTCCCGCGGCGAAGAATTTAAACAAACTACAGCTGTTTTA
AATGCCCAAACAAAGTCCACTTTTAGTTGAGTTACtatgtattatactga
aattaatttatccttaatttataatattgtattttatcttttatttacga
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tattagcgATAATTGGCAATATTGGCTTTTATGAAATGAATCGATTTTGA
ATCTTTCTTTGGAACATGAATGTTGCTTTTAAGATACGATTGAATTTGAA
TCATTAGTGCCCGTACTACTTCCGAATCGAGGCCCTATTCATGCAATGAA
ATACATTATGATAAAATTAATTATATTACctgttttcaattttaataTCA
GGGAACCCTCGAATCCTCAGCTCTTttggtattatttttttttt Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000119_pilon:834760..846503+ >MSTRG.14404.3.p1 ID=MSTRG.14404.3.p1|Name=MSTRG.14404.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=750bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:834760..846503+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAACTCATATAGAAAGCCATGGCAACAGCAATGCTGGTACCAAACG
TAAACAAGGCAAACTCACTGACCAATATCCAGTTGTCAAGAGGAACCGTT
TTAATGGAATGACTGAAGAAGAAGTCATGAAGCGGGGACTACCGGATTAT
TTAAGAGATTCTCTAGATATTGTGTTCGTCGGAATCAACCCTGGGTTAGC
GGCTGCATACACTGGGAACTACTACACTGGCCCTGGTAATCATTTTTGGA
AATGTCTGCTCTTGTCTGGCTTTATAGAACAACCTATGACTGCTAAAGAT
GATACGCAATTATTTCGAGACTATAATATCGGATTTACAAACATGGTAGC
ACGAACTACGAAAGGGAGCAACGATTTATCGAAGAAGGAGCTTGAGGAGG
GTGGTAAAATTCTGACCGTCAAAATGCAACAGTATCAACCGAGAATTGTC
GTTTTTAACGGGAAAGTCAGTTATCaagttttttcaaagaaaaagaaatt
ccatTTCGGTTTACAAGAGGAGTGTGTTGAAGGGACCAACACACGTATTT
GGGTGATGCCTTCGTCTTCTGCTCGTTGCGCCCAACTTCCTAGGGCGTCT
GACAAAGCGCCCTTTTTTGAAGCTTTGAAACGATGTCGCAATTATTTGAA
AGGTGAATCTAATACTGTGGTGGATGAACAGAAAGAATTCGTTTTCGCTA
ATTTGACTTTAAAAGGATTTCCAAGGAAATCTACTGTGACATCAACGTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000119_pilon | genome | sc0000119_pilon:834760..846503 + |
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