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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000119_pilon:834730..846503+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14404.2.p1 ID=MSTRG.14404.2.p1|Name=MSTRG.14404.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11774bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:834730..846503+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAGGGAAAGAAGGCAAATTGTATGATGTATGAAAGACTGTTGGTCTGGT
TTTGAAGAGCTTGCAGCTTATTTCTTTGTAAATTGTTTCTTAATTTGTCA
ATATAGACAGCACAGGCTGATGGCAGACAAAGGtcatttgaagatatttt
cagttctaatccaaggtagaacaaactaaacatagtatagaaagggggta
tttttagtgctctatactacagtgagaaagggtaacttgcatcagtggag
gctaacatgcatagccctcaaatgaaAGGCCCGGCTGGTCATTAAAATAC
GAAAATAAATCGAAACAAAAATGGTAGAGTAGAGCTGCGAGCGGAGCTGC
GTATGTGTATTTTAATGACCAGCCAGGTCAttcatttgagggctatgcat
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aacggaatcgacgatcgaaccagttgaaccaaatcgaacacaatcgaccg
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gattccgttcgattgagatcgtctggactaGTATCCGActtttagcaagc
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taaaggataaaaatatgccgaaaattcgatatttattacgattttgaggt
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ccaaaattcacaaaaatcgcgaaagtttctgcttacGAGCATGAATCTGG
TAATGTGGCCCACTTATCGATTTATTAATTTTCCTACTTTAAGGCTTTGG
TGAAATCTCTATAGGTATATAGTCATATCAAATCTTATTGTTTCTGGTCA
ATCTTGACATGGGCAAGCTTAAACAGTCATTTTTTCTGATATAACAGGTA
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AAGGGTTACATTTGGggtcattttatacaaatttgaagtctcaaaggcta
tttgttgggagacggtgaaacaaaacagtttctccaaaaatcagttatgt
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TTAAGTTGGTTACAActagaaaaaagtttcataattttccattggcaaGA
TTTCCAGTTTATTTACCTCTTTCATATGTATttcatgttgcggacataac
tattttgtctaaaatgttgctgataaagtgtatttgcaagctggcatgat
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AACACTTTGACAATACTAAAGAGTTACATTTGTAAGTACCATGCATTTCc
ttgcttttttcaattttttgtgtcctctaGAGTCGTTCTTCTACTAGAAA
TATTAGAAAGTTTTAATATCATTGTTGagtcttcttttgttcttttcaaa
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attagattatgacaaaaaatgacatatgattggattctcttttacagata
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aatttcaatgattaaattttggttcaagtacagcaaagtattaaaagcca
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tcaactgaaatatagcaaacttttggtttttttgaaAGCTTATAATGGgt
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gaagtcaaactttatgggaatattttttagtattttagattttcttctgg
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ATTAGATTATGCATATTTTATCTCAAATGAAGTGTAAActaaaaagagtt
ttttgccaaatttgtctgATCATAACTACTCTAGGTCAAATTTCTGGACC
AAGCCAGTTTGATTAAGCCCTGATATTTATGTTTTCTAGAATTGAAGTCA
TTGATAAAAAGATTATCcaggaataaaagtgaaattcaaaactttatttt
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cgaaagtttgtacgcctaaagtacactGTTTATGGCTTTCTACCCTAACA
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atgccctattagctatttacccctcaAAACCTACATAATGGTTTTTCTCA
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cTGCAAAGTTACAAATGTTATGATTAGATCATTGGTacctgaatattttc
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ataaatccattcccaaaacaaaacaatatttgtatttttataagtatttc
atgcccataatgcaattgcacCTGTTTTGTCAAAAAACAGCTTTGAAGgg
tcaaacttttattgacttCGTTTTTGACATAtggtaatgtttttctaaat
ctccatcaaatttgtgattttttggtatgcaatatgaccatgttttgaga
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AGCTGTAgcgctgaacgcactaaaagtcctttggatgttgaagctggctt
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ctccctcggagatctttttctcgctttcatagtgtcctccccccccttta
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gtttaagcaataaaatcagccaacctttttaaataaaccaacttttcaat
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TTgcattaaatacgccgtccagttttcgacaatttgagaaaatgtcatgg
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aaaacatttcaaacaaaagaaaagagaaaagcaGGATCGGgcaaagctgg
gcagaaattaaaattactacgGTTATTAATAATATAGATTAGATTAAGTT
TCGTAGCTAAGAAAGAGAGCCCAAAGTGCAACTTTgtaggggtatgtggt
tttaaggggtatccactggtaatagaaaaattttcaagcagtttttttga
aaaatcaaaacttagtTTTTACTTTTAAGTCTCCTTTTCCCATTTAATAT
CTAGAAGAAATTCCAGCTCAAATAAACCAAGAGTATAGAGGCTTCAATCG
TTTGTGAAGGAGAAAACgttttaaaataattataaacacGAAGAAACTTT
GAAACAAATGGTTTCCTTAATATAAAAAGGTGGAGGTAAATTCAAAAAAG
TGGAAGGGGAGAATGGTCgaattttgacaatatttgaGCGTACATAATTG
TTGAATGGTCCCAtataaaagatttaaaatccAAAGCCAAGTTTTGATCC
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TCTTGtgtaggaaaataaaaaaagaaatgactGCAGTGATTGCTGGAGAT
TTCCAGTCATCAATTAATAATGATGAATCAGATGACTTGCCCTTAGGACA
GTCAGAACGTGCAGTCTACTTGTCAAACCACTCTATCAAGTTAAAGAAAA
CACTTGGATTTTCTCATGGCTTTTCACTCATTGTTGGGCTCATTTTGGGT
AGTGGTGTCTTTATATCCCCTGGATTAGTGGCAAAGGATACCAGTTCTCC
AGGAATGGAACTTGTCATGTGGGCAGCTGCTGGCATAATTGCATTACTTG
GTGCTTTATGTTATTGTGAGATTGGCTGTATGTTCAAAATGTCTGGTGGA
AATTATgcaaacattttcaatatttatggAGATGCACCAGCTTTCCTGAC
AGCTTGGGCAACATGCTTAGTAATCGATCCTTCTAGTGTTTCAGCAATTG
CTTTAACAATTGGAACATATTTTGTAAAACCCTTCTATGCAACAGATGCT
GAGGGTGAAATACCTGCAAAATTGATTGCTTTTGGGCTTATCATCCTCTG
CTTCATTATCAATAGTTCCAGTGCCAAAATAACAAATGTGATCCAAAGAA
TTTTATCTGTTATTCAAATCTTGTCAGTTGTTTTTGTGATTGTCATCGGA
ATATGGCAACTGGCTAAAAACAAAGCTGCGAACTTTCATGATATGTTTTC
AGGAACGATCGTTGATAAACACAGCCCGTTGCATATTGGGATTGCACTGT
TTGGTGCATTATGGTCCTATGATGGATGGGCACAGATGAGTAATGTTATT
GAGGAAATCGACAACGTGGAACGAAATTTACTTTTGATTATAGTCACTGG
AAtaccttttgttatattttgcTACATCATGGcaaacatttcatttttat
cagtATTGACACATCATCAGATGGGCTCTTCAGATGCTGTAGCAATTGAC
TTCATTGAAAACGCACTAGGAATCAAAACATCATATCTTATGATGGTGTT
AGTTGCATTATCAGCTTTTGGGACATTAAATGGTACCTTTTTTGCTTGTC
CTCGTTTGACAATGTCTGCTGCACGTGAAGGTCATATGCCTTTCATTTTC
TCTCTACTTTATAAGAGAAATGAACTACCGGTTCCTGCTTCAACCCTTAT
TCTGGTTATATCGTCATTAATGTTGTTACCTAAAGCAAGCAATCTCAACA
CCCTGATCTTACTTTTCAGTCAAGCTCAATGGGTCATTTACACAGCTTCG
ATCTTTGGTGTGATCATATTGAGGTATCGGAGACCAAACCTTGTGAGACC
TTTTAAAGTCTTTATTGGTGTGCCAATCCTTATCTCATTGATTGGTGTTT
TTCTTGTCATTATGCCCTTTTTCAGAGACTTTTGGTTATCCTTGGCAATG
ATGGGCTTTATATTATTAGGAATTCCTGTCTATCTTGTATGTGTCAAGTA
TGCACCTCGACAGCCTATATGCTGCTTAAACTTCATGGATGCTTTGAACA
TGAAAGTTCAAAGTCGCTTTAATTTTGTACCTTGCTCGAAAGCATCTTGA
ATATGTAATATCTAGTAAAGTTGACGATAGTAAAAAagattttagatttt
ttaacaaaataatcataaaattacttgaattatatatatttttatatctt
ttatatcataaccttaatatatattaaaaataCCGAGATTCCTAAAACGA
TCATTTATGTATTGCAACCACCAAGAAATAGACTATCATGAAGCTTTTAA
AAGTACTAAAAATTACACagtgtattttttaatgtttccaaCACCTGGGG
GCGGGGCACTCAATTTCTAAATGACTGCATGTGCCGCCATTTCTAAACGA
CGCAATGTGCCgctaaaaaattgactttcaaaatcGGGCCGTTGCAGTGC
AgctcttgagcagtgaaaatgtacccttacagtgcatttttccgAACttt
ttttacccttacagtgtagtttgaatTCGtgtcttattttgctgaagcta
TGCCCGAAAATAACCCTGAGACACCACCTGACACGATGTGTgcaaaagta
ataaaaaatgtgaaatagGTTTAAGTCAAAACTTTAAAGATACATATCTT
TACTGTCAGACTTACATTTCAAGGGTCTTGAAAAACctcccttaagggcg
gcacatgccgtggaTCGAAAGTTATGAGTGCCCCTCCCCCCGGGGTTCCA
ACGTAAACAGAGCTTTCATCAAGAATCTTTGGCATACGGAAGATTTACTT
CTATCAAGgaactttaataatttttatttaagtttcttgGTTGGGTCTAT
GAATGGCGGGGGATACTACAGATAATTCATTTGGTTCATACATACACTTT
GTTTAGCTTTTTTAAACGTATTTACAACCTTGGAAATTTTAtataataaa
aattcattgacATTAAATATATACACTTTGATTTTAACAAACATAGGTTG
GGTGTATTGTGCAAGAGTGCCTACTATTTTAATAAGTTTTGTCAAAACAC
GAGGTCTGATtgccaaaacaaagagaaacaTGAAATATAACACTTTCTGT
AATTTCATCCAGATTACAATAACCCCGATAACCAAAGTGCAATACGCGAG
AGAAAGTTACACAATTTTAATCGCTAGCTAGATAGGAATTTTCTCATTTG
CAGTGCAATATGTGGCGACTTTTTTATAACAATGATactcaaaaattcca
aaatataataacaatttaagaacaatgctgagcctgaaattgtgaAGTTT
TAAGCAAATTTATGGTCAGAGTATTAAAATTAGGGTCGGATCATGTTATA
TCCAAAAATACAGTTTGATGCTCGAAGTGCTATaaaaaaaTCAGTAGAGC
CTCAATAAGATTTACTATATGAAAAAATAGTGAATCTCCCTGAATAAAAT
AGTGGAATTTGGTTTGCTTGCATTTCAAAGTCTGTCTTACAACGGACATA
GGATGAAGTGGCATGCTTTCACCTCGTGTTAAAGTACATATTCGATTTCA
ATCTATTTTCAGAAATATATTATTGTATTTACTGTATCGTTGCTTGTAAA
ATGCTAAGCTCTTAAatgaaatattgagaaaaaatgCCTTGTTTTAAACA
ATGCTCCCAATTATTTTAATACCTCTTTCGCTTCCATTGAAATCTTgaat
aaaacatttttagaaaaattcaaaatgacctGTACCATCAGCATCACATG
TGACCTTCAATATTTTGTAGAATCTTATCTTTTCTTCGAAGAAGATTTTG
GTACAGGGTCGAATTCATCATTTCTTTTTAGACAACTTCTCCTCTGAAAA
GACACTGTctctttccctctttctgaaCTAATAGCCCAATATCTGCTAAT
TTTTATCCTTGATTACAGTATGTCCGCTAATAAGTAGAGGAGAGTGCACC
TTTTTAGTTAACTAGTTGCGACAGTTGCGAAAAAGAActctaaaatatat
tttttttattttttcagtatGTTATGGAAACTCATATAGAAAGCCATGGC
AACAGCAATGCTGGTACCAAACGTAAACAAGGCAAACTCACTGACCAATA
TCCAGTTGTCAAGAGGAACCGTTTTAATGGAATGACTGAAGAAGAAGTCA
TGAAGCGGGGACTACCGGATTATTTAAGAGATTCTCTAGATATTGTGTTC
GTCGGAATCAACCCTGGGTTAGCGGCTGCATACACTGGGAACTACTACAC
TGGCCCTGGTAATCATTTTTGGAAATGTCTGCTCTTGTCTGGCTTTATAG
AACAACCTATGACTGCTAAAGATGATACGCAATTATTTCGAGACTATAAT
ATCGGATTTACAAACATGGTAGCACGAACTACGAAAGGGAGCAACGATTT
ATCGAAGAAGGAGCTTGAGGAGGGTGGTAAAATTCTGACCGTCAAAATGC
AACAGTATCAACCGAGAATTGTCGTTTTTAACGGGAAAGTCAGTTATCaa
gttttttcaaagaaaaagaaattccatTTCGGTTTACAAGAGGAGTGTGT
TGAAGGGACCAACACACGTATTTGGGTGATGCCTTCGTCTTCTGCTCGTT
GCGCCCAACTTCCTAGGGCGTCTGACAAAGCGCCCTTTTTTGAAGCTTTG
AAACGATGTCGCAATTATTTGAAAGGTGAATCTAATACTGTGGTGGATGA
ACAGAAAGAATTCGTTTTCGCTAATTTGACTTTAAAAGGATTTCCAAGGA
AATCTACTGTGACATCAACGTAGGGATAACAATATCTTTTATTTATTATA
TCAGTAGAGTTTTATTCTACTCACAACCTAATGAGTATGCTTAGATAGGT
TCAGgatatatattttaaattttaaagaaaagccTTTGATTGTTAAAGTA
AATTTAGATTGTCATGGGTAAGTACGGTAGTGTTTGTTATCCTCTGGAAT
caatttagttgaaagttttttgaaaaataaatgaaatgacTTCCCGCGGC
GAAGAATTTAAACAAACTACAGCTGTTTTAAATGCCCAAACAAAGTCCAC
TTTTAGTTGAGTTACtatgtattatactgaaattaatttatccttaattt
ataatattgtattttatcttttatttacgaatcctaatttatactttaat
gaaaatgtcaatttttaaattattattttttattagcgATAATTGGCAAT
ATTGGCTTTTATGAAATGAATCGATTTTGAATCTTTCTTTGGAACATGAA
TGTTGCTTTTAAGATACGATTGAATTTGAATCATTAGTGCCCGTACTACT
TCCGAATCGAGGCCCTATTCATGCAATGAAATACATTATGATAAAATTAA
TTATATTACctgttttcaattttaataTCAGGGAACCCTCGAATCCTCAG
CTCTTttggtattatttttttttt Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000119_pilon:834730..846503+ >MSTRG.14404.2.p1 ID=MSTRG.14404.2.p1|Name=MSTRG.14404.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=750bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:834730..846503+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAACTCATATAGAAAGCCATGGCAACAGCAATGCTGGTACCAAACG
TAAACAAGGCAAACTCACTGACCAATATCCAGTTGTCAAGAGGAACCGTT
TTAATGGAATGACTGAAGAAGAAGTCATGAAGCGGGGACTACCGGATTAT
TTAAGAGATTCTCTAGATATTGTGTTCGTCGGAATCAACCCTGGGTTAGC
GGCTGCATACACTGGGAACTACTACACTGGCCCTGGTAATCATTTTTGGA
AATGTCTGCTCTTGTCTGGCTTTATAGAACAACCTATGACTGCTAAAGAT
GATACGCAATTATTTCGAGACTATAATATCGGATTTACAAACATGGTAGC
ACGAACTACGAAAGGGAGCAACGATTTATCGAAGAAGGAGCTTGAGGAGG
GTGGTAAAATTCTGACCGTCAAAATGCAACAGTATCAACCGAGAATTGTC
GTTTTTAACGGGAAAGTCAGTTATCaagttttttcaaagaaaaagaaatt
ccatTTCGGTTTACAAGAGGAGTGTGTTGAAGGGACCAACACACGTATTT
GGGTGATGCCTTCGTCTTCTGCTCGTTGCGCCCAACTTCCTAGGGCGTCT
GACAAAGCGCCCTTTTTTGAAGCTTTGAAACGATGTCGCAATTATTTGAA
AGGTGAATCTAATACTGTGGTGGATGAACAGAAAGAATTCGTTTTCGCTA
ATTTGACTTTAAAAGGATTTCCAAGGAAATCTACTGTGACATCAACGTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000119_pilon | genome | sc0000119_pilon:834730..846503 + |
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