MSTRG.14401.3.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14401.3.p2
Unique NameMSTRG.14401.3.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000119_pilon:803711..818348+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14401.3.p2 ID=MSTRG.14401.3.p2|Name=MSTRG.14401.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14638bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:803711..818348+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttcttctgaaatcgaaagtgaagaaagaaatatttctaaaatggACGAGG ATTCTGACGAAGTCACAACAATTGAAGAAACAATGAcaaaaggtttcatt tttattcttgTTAAAGCCAACCTATACATCTTGCAGAACGTCCACAAGCT CCTGCCTCGTGCCTCGGAccacgctaaaaatggtagacctaTCTGAGACA GACATTTGGCTAAAGCTTCAGATGAATCCGGGtggacttagaattttttt caagttgaataGTGACCAAAGGGGGTCTCGAACCGGGAACCTATAGGTTT TGAAACCAATGCCCTATCCACTAGGCCGAAAATTCGTTATTTAGGGTTAT ATACGAAGGTCTTAGTACTATTATataccagacccccgcgctcgatagga tcgatcatcggaacggctcgatgacggatcgatatgtgatcgatggatta cttatcgatccggataggagatcgatggaagattcagccattaaaaagtc ttgagtatcgatccttcgttgatccattatcgagctagtatttcaatcga gtatatcgattcgtcatcgatcgttaatcgattcgtcatcgatcgttaat cgatttgtcatcgatcgttaatcgattcgtcatcgatcgttaatcgattc gtcatcgattataaatcgattatgcatcgatgacgaatcgattaacgatc gatgacgaatcgattaacaatcgatgacgaaGcgatatactcgatagagt cgatagggtcgataagatcgataaaagatcgatgatagatcgataactaa tcataagcttaaaaatatcttgagtatcgatcctctatcgatctcctatc cggatcgataagtaatccatcgatcacatatcgatccgtcatcgagccgt tccgatgatcgatcctatcgagcgcgggggtctggtatatataaataagt 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000119_pilon:803711..818348+

>MSTRG.14401.3.p2 ID=MSTRG.14401.3.p2|Name=MSTRG.14401.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=7371bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:803711..818348+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACAACAATTGAAGAAACAATGAcaaaagCTCCTTTGGCTTGGATTCATAA
TCAAATTGCAAATAATGCCAACCCTCGAGATATACTCAACCAGCTAGTGC
CTGAGTTGAACATTCCGGACCATGTAGACGACCTTTCATTGTGGAGACTG
GCTTTGGAAATTTTATCAGAGCCTGCACCACGTCAACGTCTTCAAGAAGT
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CGTTCACGTGATGGCATCTATGCCAGACTCAGTAAAGATTATCCTGATTT
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GCACCACGTCAACGTCTTCAAGAAGTCAACTCTTTGGAACATGTCAAGAA
CCTTTTACAAACATGCAAAAAGATCGTTGTTCTAACAGGGGCTGGGGTAT
CAGTTTCATGTGGTATTCCGGATTTCCGTTCACGTGATGGCATCTATGCC
AGACTCAGTAAAGATTATCCTGATTTACCGAACCCTCAAGCTATGTTTGA
CATTCACTACTTCAAGTCAAATCAGTGGCCGTTTTTCAAATTTGCTAAGG
AGATATACCCTGGTCAATTCACACCCTCCCTGTGTCACAGGTTCATATCC
TTCCTTGATCGAACTGGTCGTTTATTGAGAAATTATTCACAGAATATTGA
TACTCTTGAACAAGTTGCTGGCATCAAGAATGTGGTGCAATGCCATGGTT
CTTTTGCGACAGCTACCTGCATGAATTGCAAATTCACTGTCAGTTGTGAG
GAAATTAAGAATGAAATCTTCAACCAGAAAATTCCACATTGCAAGAAATG
TAGCGTGAATACAGTAGAGGATGGACGAATTAACGTAATTAAGCCAGATA
TTGttttctttggtgaaagtttacCAGAATCATTCCATCGTCAAATACAA
GATGATAAAGATAAAATTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14401MSTRG.14401Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14401.3.p2.exon1MSTRG.14401.3.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14401.3.p2.exon2MSTRG.14401.3.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14401.3.p2.exon3MSTRG.14401.3.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14401.3.p2.exon4MSTRG.14401.3.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14401.3.p2.exon5MSTRG.14401.3.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14401.3.p2.exon6MSTRG.14401.3.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14401.3.p2.exon7MSTRG.14401.3.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14401.3.p2.exon8MSTRG.14401.3.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14401.3.p2.exon9MSTRG.14401.3.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14401.3.p2.exon10MSTRG.14401.3.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14401.3.p2MSTRG.14401.3.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000119_pilongenomesc0000119_pilon:803711..818348 +