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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:3421607..3434748+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1438.1.p1 ID=MSTRG.1438.1.p1|Name=MSTRG.1438.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13142bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:3421607..3434748+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atccatcaattattttgtttattatatttgttatatgttctttatatttt
tcagtaaaaataAGCAAAAcCtaattcaaaaataattcaatatgCCTCCA
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CGCTTCTGTAACTCTTATAATAGATAAGTTTTGATTCTAAAATCTTGATG
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TTTTATCTGTTAAACTTATCTCTAATTTAGatggcccacttttcgcccta
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gtagatatcaattatatatgtgttaaatgcataaccaggtaggtccataa
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TTAGGTATTTGATGGATGCAGTGATGAGGCGTCCACTGAGCACCAGAGAT
GCGGTTGTGATTGGGATCATAATGAGTGCGTATATTATGGTCAAACCCTT
GCCAATCATCGACTTTGCCACGTTTTCTCCGTAGCCTGTAAAATAGATTG
TGAAACTTTCAAATTATTATTCTTCTGCGAATGATATTTTTCACTCTCAC
CCGCCtgcaagattttattttattacattaaaggaagaagtTTTGGtgag
aagaaaatttggcggatttggccaaaaTCCACCAAAATCTTTTTCCGCCT
Agtcgccaacaaaaatcataaaaaaagaaataagtttatacctaaactat
tTTCCGCCTAgtcgccaacaaaaatcataaaaaaagaaataagtttatac
ctaaactattttccgccatccgccaaatttaaattgctcTATTTATTTCC
CCGAATGTGTGCTATTTCgggctttaaaacaggtttttacttttttaatt
gcgttttttggacaaaaatgtccttaatccgccaaattaaattccctctg
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TCTTATCAGCGTCAATTCTTCAAACTTTTTCGTGCCTTAAAAAGTTCAAA
TCCAGCGACTTCTTCTATGATTTCATACGAGTACAAAGTACTAAAGAGTG
TTATTAAATAtagacaaaatgaaaattagaaaagggacaaaataaatttt
cttcaagATTGGCATTTTTGTTTTCCGCTGGGTTAAAGGTCGCACGTCCA
CCAACCAGCTTACCGACTCTATAGAAGCTTCTCTATCGCATTGactttta
tgaaaaatcttaaaacggTGTCCTAAAGAGTGTTATatagacaaaataaa
aattagaaaagggaaaaaataattttcaaccaGCCAGCCTACCGGCTCTA
TAGAAGCTTCTCTAttattgatttttatgaaaaatctttaaaaaatctta
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TAGGTTCATCATTGTCAGCAAAGTCATAAATATTTGTCTCCTTGTCTGAA
CACCATTTTGTCATGTTTCGCAATATGTCTCCAACCATTGAGGTTTTGAC
TGTACCTGTTACGTTCAATTGTGTTAATCCCTGGCATAGTTCTTCTTTAG
TCTTGCTGTTTGAGTTTGAAGAGTCATCGGTGTAAAAGTAACATTCCTCA
ATATAGAAGAACATTAACGCACCAAGGACTAGACTGGACAGAACGATAAC
GAAAAATATCAGGAAACGTTTCAagattttcttgatttctttgatcAGTT
TCTTTTTAGCTTGTGGTATGTTCTCGATAATCATGGTTTAAGCAAGCTCT
AAGAAGAGTTTTCATTAATTGTTTTGTTAACAAGCGCATAGTTAAGTTAA
AAAATCATCATGTTCTTTTCATCTTGAAAGGCTACATTTTCAGTAAGTCT
TCTCCAGAAATTTGACAGATGACTAACAGCCAAAATCAATTATTCCCTTA
ACTCGATCGATCAATTATTTATAAGGTCAatataaaatctattttatcaT
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tttttcgaaacATTTCGCCCTCAACAGAGTACCATCATCAGTGAACAAAT
TGTTGTAATGTAAATGTATGTTCGTAATGTAtttttttCACTGATGATGG
TACTCTGTTGAGGCCGAAacgttttgaaaaataaatttcaaaatgaacca
aaagcagCTTCTGTTATTGAATCTTTTAAggtcgctacccactcagcatt
ttattgtCGTCGAACAAGGCGCAAATCTCGGGCGCTTTGGTCGCTGAACG
CTTTTCCTATTCCACTGATCcgcacattttttattttttctattgttgat
atctttttgcacacggtacaagaaagttaaatgtctcttctgattggcta
tttaaaaaagaacaataggaaAGCCGCACAGCCTagcgaaaaaaagttga
aaagtttcaactcttggTGCACTCAAGGCGACAGCCTTTGAAggcttgat
ttatgtaatttatgcaataattaagcTGCGTGAGTGGGTAGACCTTCACT
GAAGATGTATAGAAagatttatttaatattttattattacTCTCTTTAAA
AACCATGATATCTTTCGCCTTCGATggttattttgaaataagcgaTTTTC
TTAATTATCTGTGAAAAATACTGGTATATTGTATTCATATTCTCTTCAAC
GATTTGGGAAACCCCtttttagaaacctgtttgttttttatattttttat
catgatgaaaatttttCGACCTGCAGCTGGTTTTTCCTATACATTAAAAA
TATTGCTTCTTGATATAAAAAACCGtcttgccaataaaaaaaaccatctt
gccaataaaaaagtttgttgtCATGAAGTTTCTCTTATGAAAAGTTAAAT
AAAGGGTATAAATTGTTAGATGAACAACCCTTCAAATTAGGAAAGTACTA
CCATCACCTAGTAGAAGGTGAATGGGCGAATCGATTCAGCCGGGAGGGTg
agaaaattctaattttttctAAGATAATCAATATACTGCACTTCAGTTCG
GTCATTGTAAGATCAAAATTTACCCCTACGGTATAAGACAAATTTTCTTG
GAGGAGCTAATGTAAAAATTTCCTCTGCTTCAgctcaaaatataaaattc
tttatatttttatagaatcaattttataagaacagcaGGAGGctcaaaaa
acaagaacaacCGAGTGTCGAAAAATTTACTAcaaaggttcttataaaaa
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tatgtccttcagggtctcttttGTGTCTTCAAATCTCATTAGGGGTCgta
aaaataacataataattCCAGTCCCCTTAAAAACAGGTTGTAAAAACAGC
TCAAATTCCATATCGTGACCCTCAAAAGCCtaaatttctataaaatagTT
CCTGTAAGTCTAAGGGTCGGCTTTGGTCCCTATAAGGGCCAGACCGTCAA
AATTCGGGCGGCATATACCCGTCATCCCGCAGACCTAGTACTCCCCCAGC
gaaatttcacttttgatttGTGTTTATTTCTACAGATCGAAGTGAAAGGA
GAATCAGCTGCCATGATAATGGATTGTTTGAACAGGCTGAAGAAAGCACA
CCAAGAACTCAAAACCATCCTTGTAAGTACACCTCCTCTGTTTGATTGTT
TCTAACGCGTTGACGAAGTCTGCTgtacacacgtttttttataagaacaa
actatataagaacataaaggcttttaatggccaaaatgtcacaaataaat
taagaacattttaaaactttgtagACTGTTAAACACCGGAATCCTTAGGA
TTGAtttttttACATTATTTCCTTGATCTCCaaaaatattggttcttctt
acaaaaaaagtgttATGTATACGCTGTGTGTACCTTAGTTAGaactcttt
ttggacctaccccggtgtaggtcctataaattaacctgtgtttgttcgtc
cgtccgttcgttcgtctgttaccaacttttctcaggattgaatcatagga
atcttttaacttttggtacaaaggtgcaaaatggtggtggccaaaatgtg
acggagcccgattttcaaaacaaaatttttgggcaaatttgagccaaaaa
acggctaaaaaaagggttttttggacttagtgaaatattggatcattgtt
ttttttcagattttttgcatgaaactaaagtctattcacgataagtgtgc
actcttttttcatttacctataacttttgaaggaatccttcaatcttcat
aaatttggtatcattggaaagatattagcgagtggaacaatttgaaataa
aaaaatctttaaaaaaattctgaaattgatgatatcaaacaaaattataa
gCTGATTTCTGCTGTATTCTGCtcttttttggggtcaatcacttatcaac
tttgtatcataactttatattgaataaatatttttagtgacatttcttca
cagtgatgacctcctaaaatcaaagaatctctccagtgaaaatgaaagtt
atagcacttctctacaagatcttcattttttttttcttcattttcatctt
caatttcagaatttttttaaagatttttttatttcaaattgtttcactcg
ctaatatctttccaatgataccaaatttataaagattgaagaattcattC
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ttaggtaAAAGATGCATAcagattttcgtaaaaaaataatttttcaaatt
ttttgcatgaaagtagggtaccatcataggtaaaagatggctgaagcaga
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acaaagatgcataactataaagcCTCGAATGTggcggagcccgattttcg
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ttttggactttgtgaaatattggatcattgtttttttttcagattttttg
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CGTGTTTCCTGCTCAATAATACCTTCCTCTACTGCATGTTGGTTAACGGA
TTCGTCTCGTAATTTTTTATCTCGAACTTTCATTTCTTCCAAGAGTTGCA
ATCTTATGGTCCATTTAATTTTCTCTACTTTtgcttcttttaaaaatcgt
tCTGGCAGAAACGGCGCGTCAAAGATAGCTTTGTTCAGTTCTTCCCATAG
CTCCTCATAAACGTGTAAATTCTTACAACGCGCCATTCTCAACATTAATA
ATTGGAATTCTCTGGACTGTTGCAAGTGTTCGTGCCATTGATTGGCTGGT
GACAAAAAAGCCTCGATGGAGGACATCAAAGCTGCCAGTGCTGCTACAGC
TGAAATAATCATTTGGTCCAGCGAATGAATCAATGTCAAAAATGTTGTAA
TTGACGTTAAAGTGACTATAATGATCTGCAATGTCTTTTCTAAGCGATTC
CAGTGCTGAGCTGCTCTCAGATGAGCTTTACTTTTTGTAGATGTTTTACG
AATGAACTCCTCCCAATTCTCTTTACCCATAGTTCTTGCTTGGTAGTCGA
ATTTATTTATCTCAATATTTACCGTTCactgtttgtttttaaaatcctTT
AAACGGGTTAATCAGATGGTTCTAGATTTTCCTATCTACTAAAAATTTGT
TACTTAGGAAATATTCCGAAATCCTTTTGCctaaactattttcaaaatcg
TAATAATATGACCATTTGAAATCTATTAAAATGATCTCAAACATGGTCGT
TACGCGAAACTATAATTTTCTTGCCGAAAGTTAAAAGTTTAAACATACAA
TATTATGCAAtgtatttggcttaaaaaaatgttaagtTGAAAGctatgaa
attttcctcagaCAGTAAAAGGAATCTGGAATCAAGCCGAAAATCTTAAC
CATCTGATTATCGTCTTTCATTTCAGAACAAGTTTCTCCTttcttgtttg
ttgttgttttttttcactcataaaTATTATTCAGCATGATTTCACTCAGT
TAAGTTTTACCAATGTACTTTCaatatgaaaatgttttgaaataacAATA
GTATTGAAAGGCGCTGTCTTATCAGAATTGGTAAAATgggtaggctacgt
catatcttccttcatttcgagcgtaaaactcctactcttcgtgagtaagg
cctaaaagcctggagctgtctattgtgtagactataaAATGGGTTTTTCC
AGTAAAATCCGTTGGTgggaggtggaggatatattatccAGGGTTATTGA
GAAAATTACTCCTGGTAATTGGATTGACAAAGATTACCCGTCTGCTTTCA
TGGGATTTGAAGCCGTGTGGGATAGATCTTCCCATGCCACCAAAACCTCG
GACAGTATTATAGTAGTGAAAATTCGTGAAAAACCGTCTCACTGTttcat
taccgagtttatgtatcgggggatatcgagggcgaaggtaagtgaaatcg
atacaaaacaaagtcgatagttgatgtacggctctatatcgcctttgctc
acctaaacagacgacggtattttggtgtttttaccgtcgtcgagcaaagt
ggacggttaTTTCAGCtccatgtcaactttgctttataccgtctaaAATC
ATGGATTTATTGCTAAAAGTAAGGACACAGTCACGGTATAGATGATTTTT
CCGTTCGAGGTCGaatagacattttcataaattacgtcataaacatcact
tgcctcgttttgaaattattgccatggtgttaattcccagtggattttat
taaaactacttcctattcataaaaaaatcatgtctcaagagacataatta
CGATGGTAATTATTTGAATAAGAGGCAAGCGATGTTCGTGAggtgattta
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GAGCGAAGAATATAAAGCAGCTCAAGATGTTTACAGCGATGCCTCCTCTG
TTATCTCCGCCTAAGAATGCCATCGAAAAACTAAATCTTGCTGACAAAGC
AATTTTTAACGATTCTTAAAACACTAAAGACCTTGTTGGACTGTTAAATA
AAAAGTTGATTGGGATAAGGATGGTTGTTATGAAGATCGCCAGCTTAACT
GTCTCGTGATATTCAAGAATAACTGACACTAATGCTATCCTGATTTTCAA
GCGGGCATTTTCAACAATCTTGAATTCGAGATGATGTTTTTCGATAttag
acattttaaatttttgttcggTATAATGATACTTTATTGGGATAAACTtt
cacggggattaaatttcgcggatgaggagTTCCCTGATTTCTCGCGGATC
AGgattaaatctaatttttccAAAGTGATTCCAAATTTTGCAAACGGGGT
AGCGAacagaatttctcaaaaattcaaaattttgatatggtaGAGtgcga
aaattcgaaaaataacgAAGACATTTTCTTCAAAGCGgggtttaagggct
ctgacccattgagtttcaagcccgaagggctagaggtcaatctctttggt
aggatttgaagccaacaaatcctaccaaagttgcgcggccttgagcgacc
cgcctggtttttacacaaatgacagattgaaactaaaatttaccgcttaa
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tcatcaaaaatacggcgcatattttaaggcttcaatttttcttgcctgag
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gaccatagtccaaaaattgattttggtatttgaacataaaagttatattt
caggttccttaacacttttaacaaagaattgcctttataaattgcttttt
aatcgaatcccttaagagtaattaagaatttaattgcaaaaatgacgtta
tgaactttaaaaagatgttaataatatgttgcatcaccctcttttacaaa
aagtgcttagttttaatgggtaattaatttttttgtttcaaaatttcttt
acactgtccgcaaagaattgaactatttcaaattttgcggaaaatttttc
taaaaagatgtgtcaaaagttatgactgtttttttaagcaaaatccagat
gaaaaattgatgaaaaaccactattttgaagatttcgagacaaagaagta
tttacaaaaattttccgcaaaaatttttattgttcggtaaaagatacacc
atctactgcgaaaaaattttcaaaatgttttttcttcgccgaatctaagc
tcttcaaagttgaaatactcttcctcgcaaaagtcttcattttcttcttc
atcaaattttttcaatgcaatttttgaattttcagattcaagaatagttt
gtctaacagaaaatgtataacatgccatagttttgttggttacatcagtc
agaaaacacattttaaacacggcaattatgaaaaattcactatggtcaga
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caatttttgcggatcgaagaaagatttcaatttttttgcgggtagttaat
ttcgcggatgaggcccttccaaatttccattgagacttaatttcgtggat
tttcgtggatgacacccaaatccgcgaaatttcatCCCCttgaaagttta
tcccattaaagtaaatattgataatttataTACATTGTAGTAATTTTTAT
TTACGTAGTTTCACTTACATGTACATTcgaaaattctagaaaaaaaaata
ctaaaactaTTTTATCAAGATACGAAATGCTTTCGCTTTTATTATACAAT
CCCAGACTTTATCTTATCGGGGAGAAAGAGGTTGTAGGGATAATTTTCAT
CTGAAAAATAGGAAACTTCAATACTTGTCACAATAGATTTgg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:3421607..3434748+ >MSTRG.1438.1.p1 ID=MSTRG.1438.1.p1|Name=MSTRG.1438.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1356bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:3421607..3434748+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgCCTCCAAAAGACCCAAAGCTTCGCAACATTACCATCAAAACTGGAGT
TGTCAAAAGGTTAGCAAAGGAGAAGACAATGTATGAAAAAGAGACAGCTC
AGCAAGAAGCCAAGATCGAGAAAATGAAAGCTGATGGAAAAGACGAATAT
GATATCAAGAAAATGATCGAAGTGAAAGGAGAATCAGCTGCCATGATAAT
GGATTGTTTGAACAGGCTGAAGAAAGCACACCAAGAACTCAAAACCATCC
TTgaCAACGATACAGATTACGCAGAGAGCGAAGAATATAAAGCAGCTCAA
GATGTTTACAGCGATGCCTCCTCTGTTATCTCCGCCTAAatgCCTCCAAA
AGACCCAAAGCTTCGCAACATTACCATCAAAACTGGAGTTGTCAAAAGGT
TAGCAAAGGAGAAGACAATGTATGAAAAAGAGACAGCTCAGCAAGAAGCC
AAGATCGAGAAAATGAAAGCTGATGGAAAAGACGAATATGATATCAAGAA
AATGATCGAAGTGAAAGGAGAATCAGCTGCCATGATAATGGATTGTTTGA
ACAGGCTGAAGAAAGCACACCAAGAACTCAAAACCATCCTTgaCAACGAT
ACAGATTACGCAGAGAGCGAAGAATATAAAGCAGCTCAAGATGTTTACAG
CGATGCCTCCTCTGTTATCTCCGCCTAAatgCCTCCAAAAGACCCAAAGC
TTCGCAACATTACCATCAAAACTGGAGTTGTCAAAAGGTTAGCAAAGGAG
AAGACAATGTATGAAAAAGAGACAGCTCAGCAAGAAGCCAAGATCGAGAA
AATGAAAGCTGATGGAAAAGACGAATATGATATCAAGAAAATGATCGAAG
TGAAAGGAGAATCAGCTGCCATGATAATGGATTGTTTGAACAGGCTGAAG
AAAGCACACCAAGAACTCAAAACCATCCTTgaCAACGATACAGATTACGC
AGAGAGCGAAGAATATAAAGCAGCTCAAGATGTTTACAGCGATGCCTCCT
CTGTTATCTCCGCCTAAatgCCTCCAAAAGACCCAAAGCTTCGCAACATT
ACCATCAAAACTGGAGTTGTCAAAAGGTTAGCAAAGGAGAAGACAATGTA
TGAAAAAGAGACAGCTCAGCAAGAAGCCAAGATCGAGAAAATGAAAGCTG
ATGGAAAAGACGAATATGATATCAAGAAAATGATCGAAGTGAAAGGAGAA
TCAGCTGCCATGATAATGGATTGTTTGAACAGGCTGAAGAAAGCACACCA
AGAACTCAAAACCATCCTTgaCAACGATACAGATTACGCAGAGAGCGAAG
AATATAAAGCAGCTCAAGATGTTTACAGCGATGCCTCCTCTGTTATCTCC
GCCTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:3421607..3434748 + |
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