MSTRG.14370.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14370.2.p1
Unique NameMSTRG.14370.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000119_pilon:530385..549581-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14370.2.p1 ID=MSTRG.14370.2.p1|Name=MSTRG.14370.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19197bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:530385..549581- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGCGTTTTTCTCAATATTCCAGATGACTAACTAATACTTGATGGTATTAA AAACACATTATGAGTGCCGGAAAAGTACCAGATTCGATCGAGAACTTTAC ACCTCGGCGACGAGTGACAATCAACAGACCGATATACACTGAAGAAGATG TCGGGGCACTTGCCGCCGAAAAAGACAGTACAAAAGAGCCACTTCTCACT CGAACAGTGTCTAAATGGAAAGAAAAAGCTTCAAAATGCTCATGTACTGA TGTAGGGAAACGAATGTTGTCTTTTTTTCCATTTGTATCTTGGCTACCGA AATATAAGAAAGATTATATCACTAAAGATTTGGTTGCTGGGTTCACACTA GGTGTTTTTCAAATTCCACAAGGTATATTTTCTTTTAACAGTCGTTTAAC TTTTAACATACAGCAGACCAATCTCGCACTTATTTCTACCATATGTGTAG ATATGTAAAAATCGTAAATCTACAATATGTGTAGATATTCGAATTCGTAA ATCTACTATATGTGTAGATATTGTAAATCTACCATATGATATGTAAAAAT CCACAAATCTACCATATTAGTAGTTACGGTATAAATACTATCCAAACAAT CTAAAAAAGAATGACAAATAACTATTAAAAAGCGACAAAAAGAACGACAA GCCTTAACCCTAACTATCAAAGAACGACATATTTCAAACCCTAAACCCTA ACTATGTAACGTTTTCAGACAATTTAACATTAATTTAATCCTAACCCTAA CTATCAAAGAACGAAACGACTATCAAAGAACGAAACGACATATTTTGCCG TCCACAACCCCGACCGAAAGTGACTGTACCACCCCTTTCATTCCTTTTTG TTTATCACGGGAATTAACTGCGTGTGGTTTAAAAGAACGATAAATTACGC ATGCGCATAAGTAGAAATAAGTGTGAAGATGTGTTGCATACAGAGGTATT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000119_pilon:530385..549581-

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ACGCCAACACAGAATTCTTCCAGAAGACATTATACAAAGCCACTGTTTCT
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CAATTCTAGCTTCTATCATCATGGTTGCGTTGAAGGGATTACTACGTCAA
TTTGGTGTTGTGAAAGTCTTGTTCAAAGTCTCCAAAATCGATGCTGTTGC
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CCTATACCAGCTGAACTTATTGTTGTGATATTTGGTCTTCTTCGTTTTGG
CTTCATCACCATCTTTTTGTCAGATGCATTGATCAGTGGCTTCACTACTG
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GAACTACCCTGTGACTTTGGACAGGCCGAACGCAACGCTTTTCGACCAAC
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GTATTACTAAAGTGACCATACCGCAAAGCAAGCCACCTTTTTGTCCAATA
CATACTATCATCTTAGATTGTTCACAGATTTCATATGCAGATTCGATGGG
TGTCGGATGTCTCATAGCAGCCAACGAGATGCCAGGTATCAAAATCTTCC
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GTGGTGTTGATTATGGTCTCGGTATTGGATTTGTTCTCAATCTCTTAGCC
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TTGAAGGGATTACTACGTCAATTTGGTGTTGTGAAAGTCTTGTTCAAAGT
CTCCAAAATCGATGCTGTTGCCAACGTCTATGCTGTAGCATTGATTCTGT
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GTGTATCCATATCTAAAGCGTTCGCCAAGAAAAATGGTGATATCATTGAT
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TGATCAGTGGCTTCACTACTGGTGCAGCATTTCACATTGCCACCAGTCAA
GTCAAACATTTAGTGGGAATGAACATACCAAGAGCAGACACAAGTGGTTT
CTTCAGTTTATTTAAGGAACCTTTGCGATTATCTCACTAATGGTTGGCGA
ATCGGTGCAGGGACATTTTCAGAACTACCCTGTGACTTTGGACAGGCCGA
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ATGAGTGCCGGAAAAGTACCAGATTCGATCGAGAACTTTACACCTCGGCG
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CATGGTGGTTTCACCTCATTGTGCAAAATGGATAATATCTTCCTCACCAC
TCACGATGCTGTCAATTTTGCATACCTCAAATATCATGTTTGCAACGAAT
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AAGCCACCTTTTTGTCCAATACATACTATCATCTTAGATTGTTCACAGAT
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TGCCAGGTATCAAAATCTTCCGCTTCCACGCTCCATTGTTTTACGCCAAC
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GTTTCATTGCCGTGATATGTTGTGGTGTTGATTATGGTCTCGGTATTGGA
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GCTTCTATCATCATGGTTGCGTTGAAGGGATTACTACGTCAATTTGGTGT
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GTGAAACATTTCGCTCAAAAGTATAAAGAGAAGATCAAAATCCCTATACC
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CATTGCATTAAATGGGCAGTTCCAAAATGCTACCAGTTACATACACCGAA
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GAGAAGATCAAAATCCCTATACCAGCTGAACTTATTGTTGTGATATTTGG
TCTTCTTCGTTTTGGCTTCATCACCATCTTTTTGTCAGATGCATTGATCA
GTGGCTTCACTACTGGTGCAGCATTTCACATTGCCACCAGTCAAGTCAAA
CATTTAGTGGGAATGAACATACCAAGAGCAGACACAAGTGGTTTCTTCAG
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GCAGGGACATTTTCAGAACTACCCTGTGACTTTGGACAGGCCGAACGCAA
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GATTGTTTATTTCTTCATGGGGACATCAAGATTTCTTAACATAGATGAGT
GCCGGAAAAGTACCAGATTCGATCGAGAACTTTACACCTCGGCGACGAGT
GACAATCAACAGACCGATATACACTGAAGAAGATGTCGGGGCACTTGCCG
CCGAAAAAGACAGTACAAAAGAGCCACTTCTCACTCGAACAGTGTCTAAA
TGGAAAGAAAAAGCTTCAAAATGCTCATGTACTGATGTAGGGAAACGAAT
GTTGTCTTTTTTTCCATTTGTATCTTGGCTACCGAAATATAAGAAAGATT
ATATCACTAAAGATTTGGTTGCTGGGTTCACACTAGGTGTTTTTCAAATT
CCACAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14370MSTRG.14370Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14370.2.p1.exon17MSTRG.14370.2.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon16MSTRG.14370.2.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon15MSTRG.14370.2.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon14MSTRG.14370.2.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon13MSTRG.14370.2.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon12MSTRG.14370.2.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon11MSTRG.14370.2.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon10MSTRG.14370.2.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon9MSTRG.14370.2.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon8MSTRG.14370.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon7MSTRG.14370.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon6MSTRG.14370.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon5MSTRG.14370.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon4MSTRG.14370.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon3MSTRG.14370.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon2MSTRG.14370.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.2.p1.exon1MSTRG.14370.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14370.2.p1MSTRG.14370.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000119_pilongenomesc0000119_pilon:530385..549581 -