MSTRG.14370.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14370.1.p1
Unique NameMSTRG.14370.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000119_pilon:530050..561073-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14370.1.p1 ID=MSTRG.14370.1.p1|Name=MSTRG.14370.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=31024bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:530050..561073- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TATTGTAGTAAAGGGAAAGATAAAAGAGGTAAGAGCAGCCTAGTCTAGTT TCTAATCCTGATATACAGGTATATGTACCACAAAACCCACAGGTACCTCA AAACCAACAATTTCATTTCAGGAGTTCTAGAAAAATCTAAAATGTTTTTA TCATCATAACTTTTTAAGATTATGTTGGTATAATAGTTTCTTTATTATTT AAAACAAAATTGAGCATTATTGATTGGGTAAAAGTTTTTTATCAAGATTT AACGCTAGAAATCTAACTTCAAAATTTTTGATTTTTTTCAAAAAATGGTC AGATAAGTCACTTGCTATTGACTAACCTATCAATCTTTTGTTTTCTATTA CGTCTAGGCATAACACAAATATAGGAAAAAAGTCTAAGTGTTGTAAGCAA TGTGTTTATTTTAATTGCTCTCAAAAAACTCACTTTTTAATTGTGGGTTT TGAGGTACATATGAGAAAAATTGCGAGTTTTAGAATTTTTTGATGTTGAA CACAAAAATATTTATCTATTTCTCAAATATACTTCTGGAATACAATTTTG TGAAACATTTTCAAGAAAAACTATGCAAAAATACAACAATAATGTTTAGC ATATATAACTCAAAAGCTTAAAAAAGTATGGATATTACATCATATTTACT AAAGCTAGACGGTTTAGTCCTGATACTTTGTTAAACATATTTTCAATTAA ATTATAATCTGGAATGTTCATTTTTTTCCTCGAATGGGAATGACCTTTAA TGGCCCAGCTATGATGTCATGAACTGGGAAAATGCTTATATCTGGAAGAT GGTCTGGGGTATTTTCAAGAACAGTACCACTCCTAACTTTAGGCTTTAGA CAGTGTAACTGAATTGAGTCAACAGCGCTATCTTCATCTTTTAAGAATCT CTTCAACAAACGACCAATATACAACCTTTTTGTTTTCTTGGTGGTGTAGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000119_pilon:530050..561073-

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CTATGCTGTAGCATTGATTCTGTTAACATTAACGGTTTTGGCGCCAATAT
TTCGATTTTTACCTAATGAGTTGTATGCGTATGGCTTTAGTAATATCGTA
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GCTTCAAGAACAATTGGGTAGCACACAGAATGCCACCAATTACATATCCT
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AGCTTTGGTTAGTTACGCTATCAGTGTATCCATATCTAAAGCGTTCGCCA
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TTATCATATGGTTTTGATTTTCATCATAGATATGATGTCATCATATTGAA
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CCAGCTGAACTTATTGTTGTGATATTTGGTCTTCTTCGTTTTGGCTTCAT
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GACATCAAGATTTCTTAACATAGATGAGTGCCGGAAAAGTACCAGATTCG
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ATCTTGGCTACCGAAATATAAGAAAGATTATATCACTAAAGATTTGGTTG
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GTAAGGCTTTCTTTAAAATATTGTGTGGTCGTAGCATATCATTATTCATG
AGAAATCTGCTTCAAACACTTGAGCATGGTGGTTTCACCTCATTGTGCAA
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TCAAATATCATGTTTGCAACGAATATAGAAAACATAATGTGGATGTTCTG
TTATCGCATTGTCCAGACGAGTGGTGATATTTCACTTATGGAAGACAATG
CAAATGGCCACTTACCAAACGAAAAAAGAACGGAATCAAAGATCAGTATT
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GATGTCTCATAGCAATCAACGGTTATGTACCACCTAAGAATCCCTTGGAT
GCAGATAATGCCAACGAGATGCCAGGTATCAAAATCTTCCGCTTCCACGC
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TTATGGTCTCGGTATTGGATTTGTTCTCAATCTCTTAGCCACCGTTGTAA
GGGCATCTAGGCAATTCTAGCTTCTATCATCATGGTTGCGTTGAAGGGAT
TACTACGTCAATTTGGTGTTGTGAAAGTCTTGTTCAAAGTCTCCAAAATC
GATGCTGTTGCCAACGTCTATGCTGTAGCATTGATTCTGTTAACATTAAC
GGTTTTGGCGCCAATATTTCGATTTTTACCTAATGAGTTGTATGCGTATG
GCTTTAGTAATATCGTAAGCAGCTTCTTTTCATGTTTCGTATCTGCTGGT
TCATTGTCAAGATCCTTGCTTCAAGAACAATTGGGTAGCACACAGAATGC
CACCAATTACATATCCTTCATTCAACTCGGATCTGATCAAAGAAATGTTG
GTGGACTCGCTAACCATAGCTTTGGTTAGTTACGCTATCAGTGTATCCAT
ATCTAAAGCGTTCGCCAAGAAAAATGGTGATATCATTGATGTCAATCAGA
TATCACTGGGACTTGGTTTATCATATGGTTTTGATTTTCATCATAGATAT
GATGTCATCATATTGAAAAATGTTCCTAAAGGATTTACGGCTATATATTT
TACAATATCAAACAAGCGAATTACGTTTCTTTTTTGATTGGGTTGGTTGC
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CTTCGTTTTGGCTTCATCACCATCTTTTTGTCAGATGCATTGATCAGTGG
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TGTCTTTTTTTCCATTTGTATCTTGGCTACCGAAATATAAGAAAGATTAT
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ACAAGGCGGAAGGTATTTGTGGTGTAGAACAACAAGACAAAGAAGAACAT
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GCTGTCAATTTTGCATACCTCAAATATCATGTTTGCAACGAATATAGAAA
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TCACTTATGGAAGACAATGCAAATGGCCACTTACCAAACGAAAAAAGAAC
GGAATCAAAGATCAGTATTACTAAAGTGACCATACCGCAAAGCAAGCCAC
CTTTTTGTCCAATACATACTATCATCTTAGATTGTTCACAGATTTCATAT
GCAGATTCGATGGGTGTCGGATGTCTCATAGCAATCAACGGTTATGTACC
ACCTAAGAATCCCTTGGATGCAGATAATGCCAACGAGATGCCAGGTATCA
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CAGAAGACATTATACAAAGCCACTGTTTCTCCATTACATTGCATTAAATG
GGCAGTTCCAAAATGCTACCAGTTACATACACCGAATCCTAAAGATCAAA
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GTTCAAAGTCTCCAAAATCGATGCTGTTGCCAACGTCTATGCTGTAGCAT
TGATTCTGTTAACATTAACGGTTTTGGCGCCAATATTTCGATTTTTACCT
AATGAGTTGTATGCGTATGGCTTTAGTAATATCGTAAGCAGCTTCTTTTC
ATGTTTCGTATCTGCTGGTTCATTGTCAAGATCCTTGCTTCAAGAACAAT
TGGGTAGCACACAGAATGCCACCAATTACATATCCTTCATTCAACTCGGA
TCTGATCAAAGAAATGTTGGTGGACTCGCTAACCATAGCTTTGGTTAGTT
ACGCTATCAGTGTATCCATATCTAAAGCGTTCGCCAAGAAAAATGGTGAT
ATCATTGATGTCAATCAGATATCACTGGGACTTGGTTTATCATATGGTTT
TGATTTTCATCATAGATATGATGTCATCATATTGAAAAATGTTCCTAAAG
GATTTACGGCTATATATTTTACAATATCAAACAAGCGAATTACGTTTCTT
TTTTGATTGGGTTGGTTGCATTTATTATTCTACTTGTGGTGAAACATTTC
GCTCAAAAGTATAAAGAGAAGATCAAAATCCCTATACCAGCTGAACTTAT
TGTTGTGATATTTGGTCTTCTTCGTTTTGGCTTCATCACCATCTTTTTGT
CAGATGCATTGATCAGTGGCTTCACTACTGGTGCAGCATTTCACATTGCC
ACCAGTCAAGTCAAACATTTAGTGGGAATGAACATACCAAGAGCAGACAC
AAGTGGTTTCTTCAGTTTATTTAAGGAACCTTTGCGATTATCTCACTAAT
GGTTGGCGAATCGGTGCAGGGACATTTTCAGAACTACCCTGTGACTTTGG
ACAGGCCGAACGCAACGCTTTTCGACCAACAACAGTATCTTATAACACAA
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ATGGCGTATGGGATGTTAACAACATTACCGGCAATTTATGGTCTTTATAC
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ACCTCGGCGACGAGTGACAATCAACAGACCGATATACACTGAAGAAGATG
TCGGGGCACTTGCCGCCGAAAAAGACAGTACAAAAGAGCCACTTCTCACT
CGAACAGTGTCTAAATGGAAAGAAAAAGCTTCAAAATGCTCATGTACTGA
TGTAGGGAAACGAATGTTGTCTTTTTTTCCATTTGTATCTTGGCTACCGA
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GGTGTTTTTCAAATTCCACAAGGCGGAAGGTATTTGTGGTGTAGAACAAC
AAGACAAAGAAGAACATTCAAATTGGGAGATGGTCCATGTGGAACCTTCC
ACATCAAATACTGCTACCACATCCTCAGAGGGAGAGGTAAGGCTTTCTTT
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AGACGAGTGGTGATATTTCACTTATGGAAGACAATGCAAATGGCCACTTA
CCAAACGAAAAAAGAACGGAATCAAAGATCAGTATTACTAAAGTGACCAT
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GAATCCTAAAGATCAAAATCAGGCCAAGTAGTTCATTGATGGGGAATATA
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TTGGATTTGTTCTCAATCTCTTAGCCACCGTTGTAAGGGCATCTAGGCAA
TTCTAGCTTCTATCATCATGGTTGCGTTGAAGGGATTACTACGTCAATTT
GGTGTTGTGAAAGTCTTGTTCAAAGTCTCCAAAATCGATGCTGTTGCCAA
CGTCTATGCTGTAGCATTGATTCTGTTAACATTAACGGTTTTGGCGCCAA
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CTTGCTTCAAGAACAATTGGGTAGCACACAGAATGCCACCAATTACATAT
CCTTCATTCAACTCGGATCTGATCAAAGAAATGTTGGTGGACTCGCTAAC
CATAGCTTTGGTTAGTTACGCTATCAGTGTATCCATATCTAAAGCGTTCG
CCAAGAAAAATGGTGATATCATTGATGTCAATCAGATATCACTGGGACTT
GGTTTATCATATGGTTTTGATTTTCATCATAGATATGATGTCATCATATT
GAAAAATGTTCCTAAAGGATTTACGGCTATATATTTTACAATATCAAACA
AGCGAATTACGTTTCTTTTTTGATTGGGTTGGTTGCATTTATTATTCTAC
TTGTGGTGAAACATTTCGCTCAAAAGTATAAAGAGAAGATCAAAATCCCT
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CATCACCATCTTTTTGTCAGATGCATTGATCAGTGGCTTCACTACTGGTG
CAGCATTTCACATTGCCACCAGTCAAGTCAAACATTTAGTGGGAATGAAC
ATACCAAGAGCAGACACAAGTGGTTTCTTCAGTTTATTTAAGGAACCTTT
GCGATTATCTCACTAATGGTTGGCGAATCGGTGCAGGGACATTTTCAGAA
CTACCCTGTGACTTTGGACAGGCCGAACGCAACGCTTTTCGACCAACAAC
AGTATCTTATAACACAAAAAGTTGAATATGCTGTTACTCTATCATTCATG
GTCGGCATCTTCCAGGAATGGCGTATGGGATGTTAACAACATTACCGGCA
ATTTATGGTCTTTATACATCACTCGTTCCTGTGATTGTTTATTTCTTCAT
GGGGACATCAAGATTTCTTAACATAGATGAGTGCCGGAAAAGTACCAGAT
TCGATCGAGAACTTTACACCTCGGCGACGAGTGACAATCAACAGACCGAT
ATACACTGAAGAAGATGTCGGGGCACTTGCCGCCGAAAAAGACAGTACAA
AAGAGCCACTTCTCACTCGAACAGTGTCTAAATGGAAAGAAAAAGCTTCA
AAATGCTCATGTACTGATGTAGGGAAACGAATGTTGTCTTTTTTTCCATT
TGTATCTTGGCTACCGAAATATAAGAAAGATTATATCACTAAAGATTTGG
TTGCTGGGTTCACACTAGGTGTTTTTCAAATTCCACAAGGCGGAAGGTAT
TTGTGGTGTAGAACAACAAGACAAAGAAGAACATTCAAATTGGGAGATGG
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GAGGTAAGGCTTTCTTTAAAATATTGTGTGGTCGTAGCATATCATTATTC
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CAAAATGGATAATATCTTCCTCACCACTCACGATGCTGTCAATTTTGCAT
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CATTGATGGGGAATATAAAAGACACAGAAATTTACACAACTATTGGCATT
GAACCTGCCATCTGGATAAGCAGTTTCATTGCCGTGATATGTTGTGGTGT
TGATTATGGTCTCGGTATTGGATTTGTTCTCAATCTCTTAGCCACCGTTG
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TGGCTTCACTACTGGTGCAGCATTTCACATTGCCACCAGTCAAGTCAAAC
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CACAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14370MSTRG.14370Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14370.1.p1.exon19MSTRG.14370.1.p1.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon18MSTRG.14370.1.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon17MSTRG.14370.1.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon16MSTRG.14370.1.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon15MSTRG.14370.1.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon14MSTRG.14370.1.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon13MSTRG.14370.1.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon12MSTRG.14370.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon11MSTRG.14370.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon10MSTRG.14370.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon9MSTRG.14370.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon8MSTRG.14370.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon7MSTRG.14370.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon6MSTRG.14370.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon5MSTRG.14370.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon4MSTRG.14370.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon3MSTRG.14370.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon2MSTRG.14370.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14370.1.p1.exon1MSTRG.14370.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14370.1.p1MSTRG.14370.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000119_pilongenomesc0000119_pilon:530050..561073 -