MSTRG.14354.1.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.14354.1.p1
Unique Name	MSTRG.14354.1.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000119_pilon:361491..380699+
coding sequence from alignment at sc0000119_pilon:361491..380699+

mRNA from alignment at sc0000119_pilon:361491..380699+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.14354.1.p1 ID=MSTRG.14354.1.p1|Name=MSTRG.14354.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19209bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:361491..380699+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGCATCTGAGAAAAGAAAAGGATTCCAAGACCATACCAAGCACTGCCTTC
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attttttcaaaatttaagtttaaacTCTCACCTTATTTATCATTTAGACT
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ATTTTGCACGGAAGCATGATGACATCAAACTGACCAAAGAAGAAACAGAA
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GTGGTGCGTCAGGAAGGCAAGCAGATGGGAGTGATGGTTCTAATCACGAA
ACTGCTACACAGGGTAAGTGAGTCGTATCTAATTCAGGACGAtttttttt
GGCGAAATTTCACAACAAATCTTTTTATAGGAATAGGAAGCAGATGACAA
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AAGAACAATCAAAATGGAAGAATAAGCAAAACCAAACAACGAATCATGCC
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TTTGCTCTGATGATTCTATTGTTCGCATTGAAGTTTCTATGGGCTGTtag
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TTGATTCATTAATTTGTGtctttatttattaaagtaGTGCCAAGGAATGG
ATCTTGGATACTGTACGATCAGAATTTCTGTCCTTTTAATACTATTTCTA
GAGGACCCATCATCATTTAATTGTACTGTACATTTTAAAAACTAAATCTT
TTCACTTTTACTTTTACAGTCTTTTGGGATTTTGTATGATGATAAACCAA
CGCTACCAAATCATCACCAAGCTCATCAAATTTACCAACAATGCTTTAGA
AGTTATTCATCTGGTCCTGGGAATAGATCTCAAAGGATGGTTTCGTCGCC
GTGGTAACAGATCTTCAACAAAATCGACTTTTGATGATGGCCCCCCTCCT
CCTTtgccagaaaattctgaaaatgctatacagtttttattgaaagaaaa
cccAGAGCGACCATACAGGTGTCATATAATTTTCATATATTGATAGCCCC
TAATAAAAGATCTTCTTTTTAagaaagtgaattttctcgagaaTTGAGTT
GTAGATGTGTcatcttttttggacctacctcggaggtccaataaattaac
cgatgtccgtccgtccattcgtccgtcgtcgttcgtccgtctgttaccag
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tcatactattgttgtcatttttcgATTGTcatattacatcaatcttcagg
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ttaattttgattggttattttATGATATTCTTAGGTTGTTCTCAAATGAG
TAAAATAGTTTTAGATGAGTGCAAAAAGGTCGAATTTTGACTCCAATCAA
atgttttcttattaaaaaaagttttcatcgAAATAATAtttcacttgttt
gcaggattCTCCCTTAGATCAAGGAACTTTAAAGggttatttttacataa
gtgttcccgtttcatatcagacacatatttcatatcaggacagtgtttgc
ctattgttatattatgctgatataaacaaaacaaatttattttttcatct
ttctgaccaatcttgctccacatccgtttcaatccaatgtgaaaaagctt
aattaagattgatgagtaagcaaacgatatcaaccTTGTTTAAAAATTAA
ACctttaatttgcatcttcttcattgctttctttttcttaaattcttgat
tttcgattttctttcaggattctttGTGTAAGCAATACAGACAGTGTTGA
TCAGATTCGAAACCATTATCGAAAGTTGGTGCGGCTGGTCCACCCTGACA
AGTGTAATCTGCCACAAGCTGAAGATGCTTTTAAAAGTAAGCATCTTATT
ATTTTTGGACCCTTTCCTACAAAATCTCCCATTTTTTCTATGATGCATGT
CTTTACAAGTacattgaaatgtttttaagcCTTATTATTCATTGTTCTTA
ATTCCACCATTTTGTGtgtatttttgttcaatttttttaaaaattgggtg
ttttagtgTTCATAAAGCCTAGAATcttctaaaattgttcttaatatttt
ttccatCGAAGCCTTGAACAAGACtcagtcaaaaaaataaattgtaaCTC
GAATTCTCGTTGATCAAACTAACGATATTCGATTGAAGATTTCTAAATGT
AATCAAAATCCTCTCCAGTTTTAGACACAGCCTTCAAGAAACTAGCTGAC
CCTGAAAAACGCGAAGAGATAAACTCGGAGATGGAGCGTCAGAAAGCCTG
GGACGAGTTCAACAAGAACATGTCTGAAGACTACAAAAATATGTTTGAGG
AACTTCTAAATACGATACAATGTTCGTCTTGCGAGAAACGTCATaaaaaa
aCCTTGGTTGAAAAGCGCACTTTCATGGAAGCTCGGTTTTGTGCCGAATG
CAATACAAAACACCCAGCCGAAGATGGCGATGTTTGGGCGGAAGTTGGAA
TGTTGGGCGTTAACTGGACTTGTTATGCTTGCTTTGATGGAGAGGTATTG
TCTTACTTTTTTCATATCAGGAACCTTTTTGAATGGTGAGGTATAATCAA
TCTTTAACGAATTTTCAGTGAAAAGATTCTCtttcaaaataataatgaaa
taaCGTTCTTGCAAAAAACATCCAGATGATACTTGGGTGACTATTACGTC
CTTGACTAGACTTTCTTCtatttcaagcaattttagaACATCATTAATAA
AGGGACATCAAAGTAGTAAAATGCAAACATTGCGCGAACATGTGTCAtca
aagagaacaattaaaatcacgtgtccaaaacaaacttgtaaaacaattga
acaatcaaaattagccatatttggtttgattttttattttgacatgtgac
atttgttttgattttgtatccgctgcatacagtttgtttacaaatttcga
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tacttttccatttttcaggTTTATGAGATAACAGATTGGGGaaagtgtca
gaatttgaaACAAGCCATCCCTGTCAACCATCACCGTGTCTTTTGTCACG
TTGGAACGCAAGCAGCGAACAAAAGTGGACGCTCAAGAACGCCACGCAAC
TCGGAAGAAAGGTATGTGTTTTACTGTTTGGTAtattctattcatgatat
gcaacactggagagtgttctgagaattttcaaaaagttcaacccaatacg
tcacttaaacaatagaaaaagtgacgtattgggttgaactttttaaaaat
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ATTCTTTCACTAAGGCcaaattgaaaagtggtcaaccaaaacacaaaatc
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AAATGAATGTGTTTTAAACAATACATACCCTAGTTAGTTAATAGGtttgt
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CTACAAGGTGAAATTATTGTCCTTCCGTGCACTTTCACCTGTCCTTCCTG
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aaccctgtatggagctcagaataagcttaactaaggctccagtacagcgc
tgtaagcttacagcgtaagcccaggcggctctggaggcctaaaaaccggt
tttctgacaaaactactgttcccacAGGgGGGGGCACGCAGTTAcTacaa
gacagtatgacacttactaccgtggtggtactgtattcagaagttatgaa
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TAAACGAtcaaaatcgcttcagcaccatggaaatatgctaattagagtCT
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TAAAATAGGAATTTTTCCTTCCGTGACGGTGTCCTTACGTGACACGACCT
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tttaaaattctctttaaattcacaggaatctgaatcagcatacttttgtc
ttttttaatgtctttgctgcgttccttccgtgacagaaccttcaaagttc
aattattcaacgaggaaaaacttttatgaaatttatattGGTTTGGAAGT
AGTAGTACTATGAAGGCTTTAATTCAGGACTAATACTATTTTCATTaagt
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tcttttaaaaatttaaaaaaagaaaaaaaacccgCGGTGAGATAAGATCC
AATGTGATGTGAAATTTCCTTGTGTTAATTTAAGCTTCtgctctttaaaa
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GAATCTGGTCGTCCAACTTATAAAAGGATTACTGCTAAATTGAGTCAATT
CACTTCTTGTGCAAGGACTATGTCAAACTGTCACTGTAAGTTTGGACAAA
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AAGTGCTTTTTAAATGATATTGCTGTGATTAGGTGTCCAATAAATAGGGG
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CAAATAGCCGCCATCCGTCCAACCCCCGTTTAACAAAATTTGACCCCACG
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GTATCTTGGCTTCATagtgatatgaaaatcttttggaggcacgcGGTGGC
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CACCTATATAAAGCTGGATAAACGCGCCTCGATTTTGAATGAGAATTAAC
AGAGAAATTTCCTTAGAATTTTGCTTTTAAGGATAGCTATCATTATGTTA
TTTTTTGTCGATCATggcattttcagaattttttttttatcttctatAGA
AAGAAGGTTTTTGCGGGATCTCTTCTATCTACCACGTAATATTagggttt
cttttttgttcgttttttatTCTCGACCTAAATAAATGGTGCATGGAtta
tttgtaaaatatgtaaaaaataattgggatatcatttaaatttttcgcgg
taatattttctttgaacttttttttaaagaatgaaaaatataaagtagtt
attatacatttcaaattttctacaCAATTatcttgtatatatttttttca
cgtcaatatttttcagttttttttctaaaacgctaaatttagtttttttt
ccttttcgc

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000119_pilon:361491..380699+

>MSTRG.14354.1.p1 ID=MSTRG.14354.1.p1|Name=MSTRG.14354.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5868bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:361491..380699+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTCTATTGTTCGCATTGAAGTTTCTATGGGCTGTtagtaaaaagat
tttgaagtaCACGTTGCTGTTGATTCTCTATGTTGTGGCAACTCTTTTGG
GATTTTGTATGATGATAAACCAACGCTACCAAATCATCACCAAGCTCATC
AAATTTACCAACAATGCTTTAGAAGTTATTCATCTGGTCCTGGGAATAGA
TCTCAAAGGATGGTTTCGTCGCCGTGGTAACAGATCTTCAACAAAATCGA
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atacagtttttattgaaagaaaacccAGAGCGACCATACAGgattctttG
TGTAAGCAATACAGACAGTGTTGATCAGATTCGAAACCATTATCGAAAGT
TGGTGCGGCTGGTCCACCCTGACAAGTGTAATCTGCCACAAGCTGAAGAT
GCTTTTAAAATTTTAGACACAGCCTTCAAGAAACTAGCTGACCCTGAAAA
ACGCGAAGAGATAAACTCGGAGATGGAGCGTCAGAAAGCCTGGGACGAGT
TCAACAAGAACATGTCTGAAGACTACAAAAATATGTTTGAGGAACTTCTA
AATACGATACAATGTTCGTCTTGCGAGAAACGTCATaaaaaaaCCTTGGT
TGAAAAGCGCACTTTCATGGAAGCTCGGTTTTGTGCCGAATGCAATACAA
AACACCCAGCCGAAGATGGCGATGTTTGGGCGGAAGTTGGAATGTTGGGC
GTTAACTGGACTTGTTATGCTTGCTTTGATGGAGAGgTTTATGAGATAAC
AGATTGGGGaaagtgtcagaatttgaaACAAGCCATCCCTGTCAACCATC
ACCGTGTCTTTTGTCACGTTGGAACGCAAGCAGCGAACAAAAGTGGACGC
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cagcaaaaaaaacaaacgaagAAAATGAATGATTCTATTGTTCGCATTGA
AGTTTCTATGGGCTGTtagtaaaaagattttgaagtaCACGTTGCTGTTG
ATTCTCTATGTTGTGGCAACTCTTTTGGGATTTTGTATGATGATAAACCA
ACGCTACCAAATCATCACCAAGCTCATCAAATTTACCAACAATGCTTTAG
AAGTTATTCATCTGGTCCTGGGAATAGATCTCAAAGGATGGTTTCGTCGC
CGTGGTAACAGATCTTCAACAAAATCGACTTTTGATGATGGCCCCCCTCC
TCCTTtgccagaaaattctgaaaatgctatacagtttttattgaaagaaa
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GATCAGATTCGAAACCATTATCGAAAGTTGGTGCGGCTGGTCCACCCTGA
CAAGTGTAATCTGCCACAAGCTGAAGATGCTTTTAAAATTTTAGACACAG
CCTTCAAGAAACTAGCTGACCCTGAAAAACGCGAAGAGATAAACTCGGAG
ATGGAGCGTCAGAAAGCCTGGGACGAGTTCAACAAGAACATGTCTGAAGA
CTACAAAAATATGTTTGAGGAACTTCTAAATACGATACAATGTTCGTCTT
GCGAGAAACGTCATaaaaaaaCCTTGGTTGAAAAGCGCACTTTCATGGAA
GCTCGGTTTTGTGCCGAATGCAATACAAAACACCCAGCCGAAGATGGCGA
TGTTTGGGCGGAAGTTGGAATGTTGGGCGTTAACTGGACTTGTTATGCTT
GCTTTGATGGAGAGgTTTATGAGATAACAGATTGGGGaaagtgtcagaat
ttgaaACAAGCCATCCCTGTCAACCATCACCGTGTCTTTTGTCACGTTGG
AACGCAAGCAGCGAACAAAAGTGGACGCTCAAGAACGCCACGCAACTCGG
AAGAAAGtggTAATCGTGGAACTAAAcgcagcaaaaaaaacaaacgaagA
AAATGAATGATTCTATTGTTCGCATTGAAGTTTCTATGGGCTGTtagtaa
aaagattttgaagtaCACGTTGCTGTTGATTCTCTATGTTGTGGCAACTC
TTTTGGGATTTTGTATGATGATAAACCAACGCTACCAAATCATCACCAAG
CTCATCAAATTTACCAACAATGCTTTAGAAGTTATTCATCTGGTCCTGGG
AATAGATCTCAAAGGATGGTTTCGTCGCCGTGGTAACAGATCTTCAACAA
AATCGACTTTTGATGATGGCCCCCCTCCTCCTTtgccagaaaattctgaa
aatgctatacagtttttattgaaagaaaacccAGAGCGACCATACAGgat
tctttGTGTAAGCAATACAGACAGTGTTGATCAGATTCGAAACCATTATC
GAAAGTTGGTGCGGCTGGTCCACCCTGACAAGTGTAATCTGCCACAAGCT
GAAGATGCTTTTAAAATTTTAGACACAGCCTTCAAGAAACTAGCTGACCC
TGAAAAACGCGAAGAGATAAACTCGGAGATGGAGCGTCAGAAAGCCTGGG
ACGAGTTCAACAAGAACATGTCTGAAGACTACAAAAATATGTTTGAGGAA
CTTCTAAATACGATACAATGTTCGTCTTGCGAGAAACGTCATaaaaaaaC
CTTGGTTGAAAAGCGCACTTTCATGGAAGCTCGGTTTTGTGCCGAATGCA
ATACAAAACACCCAGCCGAAGATGGCGATGTTTGGGCGGAAGTTGGAATG
TTGGGCGTTAACTGGACTTGTTATGCTTGCTTTGATGGAGAGgTTTATGA
GATAACAGATTGGGGaaagtgtcagaatttgaaACAAGCCATCCCTGTCA
ACCATCACCGTGTCTTTTGTCACGTTGGAACGCAAGCAGCGAACAAAAGT
GGACGCTCAAGAACGCCACGCAACTCGGAAGAAAGtggTAATCGTGGAAC
TAAAcgcagcaaaaaaaacaaacgaagAAAATGAATGATTCTATTGTTCG
CATTGAAGTTTCTATGGGCTGTtagtaaaaagattttgaagtaCACGTTG
CTGTTGATTCTCTATGTTGTGGCAACTCTTTTGGGATTTTGTATGATGAT
AAACCAACGCTACCAAATCATCACCAAGCTCATCAAATTTACCAACAATG
CTTTAGAAGTTATTCATCTGGTCCTGGGAATAGATCTCAAAGGATGGTTT
CGTCGCCGTGGTAACAGATCTTCAACAAAATCGACTTTTGATGATGGCCC
CCCTCCTCCTTtgccagaaaattctgaaaatgctatacagtttttattga
aagaaaacccAGAGCGACCATACAGgattctttGTGTAAGCAATACAGAC
AGTGTTGATCAGATTCGAAACCATTATCGAAAGTTGGTGCGGCTGGTCCA
CCCTGACAAGTGTAATCTGCCACAAGCTGAAGATGCTTTTAAAATTTTAG
ACACAGCCTTCAAGAAACTAGCTGACCCTGAAAAACGCGAAGAGATAAAC
TCGGAGATGGAGCGTCAGAAAGCCTGGGACGAGTTCAACAAGAACATGTC
TGAAGACTACAAAAATATGTTTGAGGAACTTCTAAATACGATACAATGTT
CGTCTTGCGAGAAACGTCATaaaaaaaCCTTGGTTGAAAAGCGCACTTTC
ATGGAAGCTCGGTTTTGTGCCGAATGCAATACAAAACACCCAGCCGAAGA
TGGCGATGTTTGGGCGGAAGTTGGAATGTTGGGCGTTAACTGGACTTGTT
ATGCTTGCTTTGATGGAGAGgTTTATGAGATAACAGATTGGGGaaagtgt
cagaatttgaaACAAGCCATCCCTGTCAACCATCACCGTGTCTTTTGTCA
CGTTGGAACGCAAGCAGCGAACAAAAGTGGACGCTCAAGAACGCCACGCA
ACTCGGAAGAAAGtggTAATCGTGGAACTAAAcgcagcaaaaaaaacaaa
cgaagAAAATGAATGATTCTATTGTTCGCATTGAAGTTTCTATGGGCTGT
tagtaaaaagattttgaagtaCACGTTGCTGTTGATTCTCTATGTTGTGG
CAACTCTTTTGGGATTTTGTATGATGATAAACCAACGCTACCAAATCATC
ACCAAGCTCATCAAATTTACCAACAATGCTTTAGAAGTTATTCATCTGGT
CCTGGGAATAGATCTCAAAGGATGGTTTCGTCGCCGTGGTAACAGATCTT
CAACAAAATCGACTTTTGATGATGGCCCCCCTCCTCCTTtgccagaaaat
tctgaaaatgctatacagtttttattgaaagaaaacccAGAGCGACCATA
CAGgattctttGTGTAAGCAATACAGACAGTGTTGATCAGATTCGAAACC
ATTATCGAAAGTTGGTGCGGCTGGTCCACCCTGACAAGTGTAATCTGCCA
CAAGCTGAAGATGCTTTTAAAATTTTAGACACAGCCTTCAAGAAACTAGC
TGACCCTGAAAAACGCGAAGAGATAAACTCGGAGATGGAGCGTCAGAAAG
CCTGGGACGAGTTCAACAAGAACATGTCTGAAGACTACAAAAATATGTTT
GAGGAACTTCTAAATACGATACAATGTTCGTCTTGCGAGAAACGTCATaa
aaaaaCCTTGGTTGAAAAGCGCACTTTCATGGAAGCTCGGTTTTGTGCCG
AATGCAATACAAAACACCCAGCCGAAGATGGCGATGTTTGGGCGGAAGTT
GGAATGTTGGGCGTTAACTGGACTTGTTATGCTTGCTTTGATGGAGAGgT
TTATGAGATAACAGATTGGGGaaagtgtcagaatttgaaACAAGCCATCC
CTGTCAACCATCACCGTGTCTTTTGTCACGTTGGAACGCAAGCAGCGAAC
AAAAGTGGACGCTCAAGAACGCCACGCAACTCGGAAGAAAGtggTAATCG
TGGAACTAAAcgcagcaaaaaaaacaaacgaagAAAATGAATGATTCTAT
TGTTCGCATTGAAGTTTCTATGGGCTGTtagtaaaaagattttgaagtaC
ACGTTGCTGTTGATTCTCTATGTTGTGGCAACTCTTTTGGGATTTTGTAT
GATGATAAACCAACGCTACCAAATCATCACCAAGCTCATCAAATTTACCA
ACAATGCTTTAGAAGTTATTCATCTGGTCCTGGGAATAGATCTCAAAGGA
TGGTTTCGTCGCCGTGGTAACAGATCTTCAACAAAATCGACTTTTGATGA
TGGCCCCCCTCCTCCTTtgccagaaaattctgaaaatgctatacagtttt
tattgaaagaaaacccAGAGCGACCATACAGgattctttGTGTAAGCAAT
ACAGACAGTGTTGATCAGATTCGAAACCATTATCGAAAGTTGGTGCGGCT
GGTCCACCCTGACAAGTGTAATCTGCCACAAGCTGAAGATGCTTTTAAAA
TTTTAGACACAGCCTTCAAGAAACTAGCTGACCCTGAAAAACGCGAAGAG
ATAAACTCGGAGATGGAGCGTCAGAAAGCCTGGGACGAGTTCAACAAGAA
CATGTCTGAAGACTACAAAAATATGTTTGAGGAACTTCTAAATACGATAC
AATGTTCGTCTTGCGAGAAACGTCATaaaaaaaCCTTGGTTGAAAAGCGC
ACTTTCATGGAAGCTCGGTTTTGTGCCGAATGCAATACAAAACACCCAGC
CGAAGATGGCGATGTTTGGGCGGAAGTTGGAATGTTGGGCGTTAACTGGA
CTTGTTATGCTTGCTTTGATGGAGAGgTTTATGAGATAACAGATTGGGGa
aagtgtcagaatttgaaACAAGCCATCCCTGTCAACCATCACCGTGTCTT
TTGTCACGTTGGAACGCAAGCAGCGAACAAAAGTGGACGCTCAAGAACGC
CACGCAACTCGGAAGAAAGtggTAATCGTGGAACTAAAcgcagcaaaaaa
aacaaacgaagAAAATGA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.14354	MSTRG.14354	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.14354.1.p1.exon1	MSTRG.14354.1.p1.exon1	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14354.1.p1.exon2	MSTRG.14354.1.p1.exon2	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14354.1.p1.exon3	MSTRG.14354.1.p1.exon3	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14354.1.p1.exon4	MSTRG.14354.1.p1.exon4	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14354.1.p1.exon5	MSTRG.14354.1.p1.exon5	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14354.1.p1.exon6	MSTRG.14354.1.p1.exon6	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14354.1.p1.exon7	MSTRG.14354.1.p1.exon7	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14354.1.p1.exon8	MSTRG.14354.1.p1.exon8	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14354.1.p1.exon9	MSTRG.14354.1.p1.exon9	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.14354.1.p1	MSTRG.14354.1.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000119_pilon	genome	sc0000119_pilon:361491..380699 +

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MSTRG.14354.1.p1 (mRNA) -