MSTRG.14349.1.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.14349.1.p1
Unique Name	MSTRG.14349.1.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000119_pilon:259410..305813+
coding sequence from alignment at sc0000119_pilon:259410..305813+

mRNA from alignment at sc0000119_pilon:259410..305813+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.14349.1.p1 ID=MSTRG.14349.1.p1|Name=MSTRG.14349.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=46404bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:259410..305813+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAAAGAAGAAACCTTTATTTATTGTTCAAATTTCGAATGCTACAACTAAG
CAACGAGATTCAATTTCTGCTCTTCATCATCAACTATATATTGTACGTAC
AAATCAGCCTGCTAAAGAACCTGATGTCGCACAACTGGCTGAACTTCAAA
CCGTTCTCAAAAATCATATAAAGCTCTATCTTCTAGACAACCGCTACTGC
TTTAAGTTCTCAATCCtttactgaaaaatttgaattgactGGTCATCCTT
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TCTAAAGAGATATCTCCCTTCCTAAAAAGGATATATTGATACCTTGGAAT
GCAAAGAAGTAGAAGTAGAAGAAGGAACACCTGCCATATATGAAACACGA
TACTGGGTTcgcacacttttttataagagtgttTTTATTGGTTATGCTAA
TGGTGAAGCATTCATATATAGAAATTTAGCTAAATAAGGATGACATACTG
TATACTATGCTCTTACAGATGATTtgtttgtttataaataaagcaGTAAT
TTCTGATTCGTACCTATGTAAACTAGGAATGACattatgaaattatatat
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CAACaagaaagctggaaaagaaagaaagaaaaagaaaattttcgaagttg
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TCGCCTTGTTTGCTTAACCTCTTTTTACTCTATGCCGTGAAGCTTTAGGA
ATCAGGCTAAAACGCCTCGGATCCAGTCTAAaatctcacgtaatagattc
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TCGCACTTCAttgcagaggtctccgtacgggaattttttatcagacagac
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TAATCGGGAAAATGCTAGCACTTGAGTATCCAGAACTAGAACCTTTAGAA
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ATGCCTGATAAACTTTACTCCATAACGCGAAATTTCATGAAGTatgttcg
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tctgacattaaaATCACGCTAAGTGACGTAAAATGattcaatacgtcact
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000119_pilon:259410..305813+

>MSTRG.14349.1.p1 ID=MSTRG.14349.1.p1|Name=MSTRG.14349.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=70308bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:259410..305813+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGGATTTGAATCATCAACCCAAGTCAACCATGAAGAGACTAGCTC
ATTTATTTCGTTACTCTTGGATCAAGAGGAGAGTACTTTGGAGTTTGGTG
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ACGGAAGTAGAATTCAACAATTGTCCTTCACTACCACTCGAAGAATTATG
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ATCTGGTATTGAATCGATTGCTAGAAACTGCTCATCACTTTTatcgttat
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CGATAACCGTATCTTTCCGGCTCTTATTAATAACATGACGTCtaaattac
gtcatttttcgtTATCTGGTTTTAGCGGGTTAACGTGCGAAGGAGTGgag
aaatttttgttgcattttcaCAGAACGTTACGCTCtattgattttagtga
gttaTCATTGGTTAACGATTTAGTATTAAAAACACTGGGAGATCATTTCG
TGAATTTATTTGTTATAAAGTTGAAccattgtaaaaaaataacaaataaa
ggAATTGAGCATTTGTTTCCACGGAGAACTAGCCTGGAAGTATTGGAATT
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GAAGTCAGTCTAAAACATTTATCGATGAATTGTAAACGACTCTCATATAT
CTCAATGCGAAGTACTGGACTAAAATCGCTTCCTTGTAGCTTATCAAGgc
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CCggataaaaacattattgataaagGATTAACATCGATCATAAAGACGTT
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GTCGCTGATGGAATGACTTTTGGTGTTCCGGTACACATGTGGTATCCGCT
GCAAGACAGCTCTGttgTCGATAGTCTACCGGAGAaagctcaagaaaaat
tttcatcGCTTTCGCTTGAATTATGGGATGCATCAGGTCGGAAGgCTTTA
GAAGGTATACACAGTCAGTTCATGTGTAAACAATGTATCTATTTGGTTTG
CTTCAATGCTGCTGTTTACAACAATGCTGAGAAAGTTCCCAAATGGATCA
ATACAATCCAAGGAAAGCATCCTGGTTCAAACATCGTTATTGTAGCTTCC
CATTGTGATCTAGCGCCGCAAGACCGTGTGACGTCACAATGTGAACGTGT
GTTGAAGAAAGCTTTGGAAGAAGAAACGACACAAGTTCGTGAAATTAAAG
AAGAATTACTTTTTCTAGAcGATTTAggtttattttcaatgattgGTTCA
AAACGAAGGAAACTGGAACGGTTGTTAGATAAACGACCTCGTATCCACCC
ACAGGTTGTTCAGATCAGCTCTATAACCGGTGATGGTATGGAAGAGTTAC
GAAATTTAATCTTAAAATTGGTTATGAACTCGACGAACAATAATGTATCC
CATACAAAAGAAATCGAACAATTTTATTACGAAATCATGGTTCGAAAGAA
AAATCATACTTTGTTCATGTCATGGAAGGAGATTCAACTTTGCACAGATA
AATATGGTATCACTGATAAGAATATTGTCTACTCAATGTTGGATCATCTA
TGCGATCTGGGTTGTATCATGATGCTTGAAAATCCTAACGCGCCCAGATT
AACGCCTCAGCAGAATGGCGTAGAGCATCAACACTTACACCCTCCCGCCC
ATGAGAGCGCCTTGTCTTGTATCAATCCGCCCTTACTAGCAGAAGCGGTG
GCGTTGTTGCATCGGAACGAGAAACAAGTTCAAGATTTGGTGCTCAAAGT
TCAACGGGAAGGTCACTTGGACGCGTTATGGCCAACCAGTAAGCCGAACG
ATTGGACGTTGAGAAACACATTCTTACACATTACAGAAAACGGGATGATT
CGTGAATCCATTATACCTCTTCTAGTGAATAAACTGAAAATTCCAATGGA
CCAGATGGAGATGTTGGTTACCGAATTACGTCGAATGCTTTTCCTCATCG
AGGGTGCACCAAACGCCAATTATGATGTTGAACTCATTCTACCCAACATG
AAAAACTTTTCTgtattcaaaagatttttcatgcCTTTGCAAGGGTTGCT
TCCAGTTATCCCTCAGGTGAACGCTTGGCTTCCAAAATGTCCGCCAACCC
ACATTCAAATTGGATGGGATTATCGCTTCGTTTCCGCTGTTCCGCCTTAC
CTGTTCCTTAGTATTATTTCCGCTTGCACTGTCGCGCGGCCTGGTTCGGA
AACGCTCAGTTATTGGCAGGGTGGTGTATATGTGAGAAACGGAAAGATTG
ACGTCAGCGTGTGTCAATGGAAAGATAAGCTAGTCTTGCAGGTGCTAGCA
CGCGCACAAGTTACGAATGGAACAAGACAGGCTGTTAATAAAGCTTGGTC
TACACTTTGCAAATACTTGATTGTTATCGAACAAGTTCTTAACAAGTACC
CAGGGCTTTATTACGAGGTTTTAGCGTTATCAAACTCCCAGTGTAAGCCG
GTCCTTGAAGTGGTGGATGAATTTGAGGCTGGAGATATTACTGAAAACGA
GGCTCTTATGGATATTCCACTTAAAGCCTCGACAAAGAGTGGTGTTAGAG
GTTATACAATACTTCCAAATTATATGAGCTGGTTACAATCTATTGCAGAT
CAAACGAAAATTCATATCAGCCATGCGTCAACCATCGCAAAAGAATTGAA
TCCTATGCTTGGTTATTTGAAAGGATCGGGAGGGTTTGAAGTGACCACAG
ATCTGGACAATCCTGAAGCATCCATGGACTCACGTCTTATCATTTGTCTC
ATGACTGCaagttatttcGACGAAAACTGTATAtccaaattgaaaaataa
caTCAAGGACAAGAAGATTATTTTGGCGACCTTTGAACAagacatttcac
tggatgcgcACACCAACTTGAATGATTTGTTGTTAAATAAAGTCAAAGTT
GATATCTCATCTGGCAAAGGATCTGGATCAGCTTACCAACCGGATACAGA
AGAATTGAAGAAACTTGTTGAACTTTGTAATACGGCTGTTTTTGGTCATG
GCAGCCTTGGTGATGTAAAACGAAaTTCTCTTGCCACAGCACCGTTAGCC
AATACCTTCAGCTCCTTTGGGAATGCAAGTCATGATTCACCGTCCTTGTT
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TGAGTTCAGAAAcacaaatcaaaatggtagcctcGACTGCGGTGGCAGCT
GCTGTCGCCAAGGCAACTGCTGAACACATTGCTAAACAATCAAACCCAAC
AATGGGCGCTAAGGCGGCTGCCCGGGCGGCAGAAGTCGCCGATGCAGTCG
CGAAAGGGGATTCAGAACGCGCTTCCAAAGCGGTCATCGCGACTGCCAAA
GCTGTTGACGAGACTGTTGCTTTCTCGGCGAACCGACAATCAACTTCTTT
GCACCCGACTAATAAACGAAACTCGTTGTCGTCGATCGCCGAAAATGGAA
ATGGCGGACGAAATAAATCGAACACAAACAAAAGTACAATGTGTGTTATT
ATTTGAATGGCAGGATTTGAATCATCAACCCAAGTCAACCATGAAGAGAC
TAGCTCATTTATTTCGTTACTCTTGGATCAAGAGGAGAGTACTTTGGAGT
TTGGTGAAAACACAACTCTGGCTATGATTAAGgagAAACTTGACACGGAA
ACGTATACGGAAGTAGAATTCAACAATTGTCCTTCACTACCACTCGAAGA
ATTATGCGAAATTATTCCCAAGATGAATTCTAATCTACGTTCTCTAATCA
TTAAAAACACGTCATGGTTGAATGATGAAACATTGGAACTTTTCACAGCG
ATTTGTCATAAAATGATCAAAATCGAATTACAAGGATGTCTAATTAATAT
TACTCGATCTGGTATTGAATCGATTGCTAGAAACTGCTCATCACTTTTat
cgttatcgattatatcgactGACGAGTTTAGTACGCCTGACCATGATTCG
ATTGAAAGCGATCAAGATGGCCAAGAGAGTGTGACCAGTACACAATCATG
GAATCTCGATAACCGTATCTTTCCGGCTCTTATTAATAACATGACGTCta
aattacgtcatttttcgtTATCTGGTTTTAGCGGGTTAACGTGCGAAGGA
GTGgagaaatttttgttgcattttcaCAGAACGTTACGCTCtattgattt
tagtgagttaTCATTGGTTAACGATTTAGTATTAAAAACACTGGGAGATC
ATTTCGTGAATTTATTTGTTATAAAGTTGAAccattgtaaaaaaataaca
aataaaggAATTGAGCATTTGTTTCCACGGAGAACTAGCCTGGAAGTATT
GGAATTGAACGGTTGCGAGGCTGTAACGGATGGTTGTTTTGAAACACTCT
CAAAGAGCGCGCCCAAGCTAACTATCATTAAACTAGACTGGTGTTTCCGT
ATAACGGAAGTCAGTCTAAAACATTTATCGATGAATTGTAAACGACTCTC
ATATATCTCAATGCGAAGTACTGGACTAAAATCGCTTCCTTGTAGCTTAT
CAAGgctaaactttttaaattttctcgaTATTTCTGACTGCGTTAGTATA
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GACGTTACGTAAATATGATATTGAGAATCGGTTTCGAGTTTGCGCACTGG
GTGGATCACAAAGTGGGAAGACCAGTATGTTGCTATCGTTACAGTCTGAT
CATAACGTCGCTGATGGAATGACTTTTGGTGTTCCGGTACACATGTGGTA
TCCGCTGCAAGACAGCTCTGttgTCGATAGTCTACCGGAGAaagctcaag
aaaaattttcatcGCTTTCGCTTGAATTATGGGATGCATCAGGTCGGAAG
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GTTGAACTTTGTAATACGGCTGTTTTTGGTCATGGCAGCCTTGGTGATGT
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GCTTTGGAAGAAGAAACGACACAAGTTCGTGAAATTAAAGAAGAATTACT
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GTTGTATCATGATGCTTGAAAATCCTAACGCGCCCAGATTAACGCCTCAG
CAGAATGGCGTAGAGCATCAACACTTACACCCTCCCGCCCATGAGAGCGC
CTTGTCTTGTATCAATCCGCCCTTACTAGCAGAAGCGGTGGCGTTGTTGC
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ATGTTGGTTACCGAATTACGTCGAATGCTTTTCCTCATCGAGGGTGCACC
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GTATTATTTCCGCTTGCACTGTCGCGCGGCCTGGTTCGGAAACGCTCAGT
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GTGTCAATGGAAAGATAAGCTAGTCTTGCAGGTGCTAGCACGCGCACAAG
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GTATACACAGTCAGTTCATGTGTAAACAATGTATCTATTTGGTTTGCTTC
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AAGAAAGCTTTGGAAGAAGAAACGACACAAGTTCGTGAAATTAAAGAAGA
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TGTTGCATCGGAACGAGAAACAAGTTCAAGATTTGGTGCTCAAAGTTCAA
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AATCCATTATACCTCTTCTAGTGAATAAACTGAAAATTCCAATGGACCAG
ATGGAGATGTTGGTTACCGAATTACGTCGAATGCTTTTCCTCATCGAGGG
TGCACCAAACGCCAATTATGATGTTGAACTCATTCTACCCAACATGAAAA
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GTTATCCCTCAGGTGAACGCTTGGCTTCCAAAATGTCCGCCAACCCACAT
TCAAATTGGATGGGATTATCGCTTCGTTTCCGCTGTTCCGCCTTACCTGT
TCCTTAGTATTATTTCCGCTTGCACTGTCGCGCGGCCTGGTTCGGAAACG
CTCAGTTATTGGCAGGGTGGTGTATATGTGAGAAACGGAAAGATTGACGT
CAGCGTGTGTCAATGGAAAGATAAGCTAGTCTTGCAGGTGCTAGCACGCG
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CTTTGCAAATACTTGATTGTTATCGAACAAGTTCTTAACAAGTACCCAGG
GCTTTATTACGAGGTTTTAGCGTTATCAAACTCCCAGTGTAAGCCGGTCC
TTGAAGTGGTGGATGAATTTGAGGCTGGAGATATTACTGAAAACGAGGCT
CTTATGGATATTCCACTTAAAGCCTCGACAAAGAGTGGTGTTAGAGGTTA
TACAATACTTCCAAATTATATGAGCTGGTTACAATCTATTGCAGATCAAA
CGAAAATTCATATCAGCCATGCGTCAACCATCGCAAAAGAATTGAATCCT
ATGCTTGGTTATTTGAAAGGATCGGGAGGGTTTGAAGTGACCACAGATCT
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CTGCaagttatttcGACGAAAACTGTATAtccaaattgaaaaataacaTC
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tgcgcACACCAACTTGAATGATTTGTTGTTAAATAAAGTCAAAGTTGATA
TCTCATCTGGCAAAGGATCTGGATCAGCTTACCAACCGGATACAGAAGAA
TTGAAGAAACTTGTTGAACTTTGTAATACGGCTGTTTTTGGTCATGGCAG
CCTTGGTGATGTAAAACGAAaTTCTCTTGCCACAGCACCGTTAGCCAATA
CCTTCAGCTCCTTTGGGAATGCAAGTCATGATTCACCGTCCTTGTTaaaa
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TTCAGAAAcacaaatcaaaatggtagcctcGACTGCGGTGGCAGCTGCTG
TCGCCAAGGCAACTGCTGAACACATTGCTAAACAATCAAACCCAACAATG
GGCGCTAAGGCGGCTGCCCGGGCGGCAGAAGTCGCCGATGCAGTCGCGAA
AGGGGATTCAGAACGCGCTTCCAAAGCGGTCATCGCGACTGCCAAAGCTG
TTGACGAGACTGTTGCTTTCTCGGCGAACCGACAATCAACTTCTTTGCAC
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TCATTTATTTCGTTACTCTTGGATCAAGAGGAGAGTACTTTGGAGTTTGG
TGAAAACACAACTCTGGCTATGATTAAGgagAAACTTGACACGGAAACGT
ATACGGAAGTAGAATTCAACAATTGTCCTTCACTACCACTCGAAGAATTA
TGCGAAATTATTCCCAAGATGAATTCTAATCTACGTTCTCTAATCATTAA
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CGATCTGGTATTGAATCGATTGCTAGAAACTGCTCATCACTTTTatcgtt
atcgattatatcgactGACGAGTTTAGTACGCCTGACCATGATTCGATTG
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CTCGATAACCGTATCTTTCCGGCTCTTATTAATAACATGACGTCtaaatt
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gagttaTCATTGGTTAACGATTTAGTATTAAAAACACTGGGAGATCATTT
CGTGAATTTATTTGTTATAAAGTTGAAccattgtaaaaaaataacaaata
aaggAATTGAGCATTTGTTTCCACGGAGAACTAGCCTGGAAGTATTGGAA
TTGAACGGTTGCGAGGCTGTAACGGATGGTTGTTTTGAAACACTCTCAAA
GAGCGCGCCCAAGCTAACTATCATTAAACTAGACTGGTGTTTCCGTATAA
CGGAAGTCAGTCTAAAACATTTATCGATGAATTGTAAACGACTCTCATAT
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TTCCggataaaaacattattgataaagGATTAACATCGATCATAAAGACG
TTACGTAAATATGATATTGAGAATCGGTTTCGAGTTTGCGCACTGGGTGG
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ACGTCGCTGATGGAATGACTTTTGGTGTTCCGGTACACATGTGGTATCCG
CTGCAAGACAGCTCTGttgTCGATAGTCTACCGGAGAaagctcaagaaaa
attttcatcGCTTTCGCTTGAATTATGGGATGCATCAGGTCGGAAGgCTT
TAGAAGGTATACACAGTCAGTTCATGTGTAAACAATGTATCTATTTGGTT
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TTCGTGAATCCATTATACCTCTTCTAGTGAATAAACTGAAAATTCCAATG
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TCTACACTTTGCAAATACTTGATTGTTATCGAACAAGTTCTTAACAAGTA
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TCATGACTGCaagttatttcGACGAAAACTGTATAtccaaattgaaaaat
aacaTCAAGGACAAGAAGATTATTTTGGCGACCTTTGAACAagacatttc
actggatgcgcACACCAACTTGAATGATTTGTTGTTAAATAAAGTCAAAG
TTGATATCTCATCTGGCAAAGGATCTGGATCAGCTTACCAACCGGATACA
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TGGCAGCCTTGGTGATGTAAAACGAAaTTCTCTTGCCACAGCACCGTTAG
CCAATACCTTCAGCTCCTTTGGGAATGCAAGTCATGATTCACCGTCCTTG
TTaaaaaaaCCTTTCGAACAATTCTCTGATATTGTTAAACAATACTCCGA
CATGAGTTCAGAAAcacaaatcaaaatggtagcctcGACTGCGGTGGCAG
CTGCTGTCGCCAAGGCAACTGCTGAACACATTGCTAAACAATCAAACCCA
ACAATGGGCGCTAAGGCGGCTGCCCGGGCGGCAGAAGTCGCCGATGCAGT
CGCGAAAGGGGATTCAGAACGCGCTTCCAAAGCGGTCATCGCGACTGCCA
AAGCTGTTGACGAGACTGTTGCTTTCTCGGCGAACCGACAATCAACTTCT
TTGCACCCGACTAATAAACGAAACTCGTTGTCGTCGATCGCCGAAAATGG
AAATGGCGGACGAAATAAATCGAACACAAACAAAAGTACAATGTGTGTTA
TTATTTGA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.14349	MSTRG.14349	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.14349.1.p1	MSTRG.14349.1.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.14349.1.p1.exon1	MSTRG.14349.1.p1.exon1	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14349.1.p1.exon2	MSTRG.14349.1.p1.exon2	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
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MSTRG.14349.1.p1.exon11	MSTRG.14349.1.p1.exon11	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14349.1.p1.exon12	MSTRG.14349.1.p1.exon12	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14349.1.p1.exon13	MSTRG.14349.1.p1.exon13	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14349.1.p1.exon14	MSTRG.14349.1.p1.exon14	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14349.1.p1.exon15	MSTRG.14349.1.p1.exon15	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
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MSTRG.14349.1.p1.exon17	MSTRG.14349.1.p1.exon17	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14349.1.p1.exon18	MSTRG.14349.1.p1.exon18	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000119_pilon	genome	sc0000119_pilon:259410..305813 +

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MSTRG.14349.1.p1 (mRNA) -