MSTRG.14341.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14341.2.p1
Unique NameMSTRG.14341.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000119_pilon:123617..152501-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14341.2.p1 ID=MSTRG.14341.2.p1|Name=MSTRG.14341.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=28885bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:123617..152501- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTCAATTTCAGATTTAGATACAAATCTGCAAAAAATTTATAATGTGTACC CGATCAATCGGAACATCAATCGCAATGGTCTGCATCTTCTGCCTCATAGC ACAAAGTGTAAGTTTCTATAAATCGCTTTCTCATCTTCTATACTCTATGC TTTGAAATTAATATATTGCTACTTATCTAAGCCTAGCCAACCTCGTTCCC TGCGTATTATCACCTTTTGATGCTTACTGATAGCGCTAGATATTTTCTCT GACGTCAATTAATAAAGCCTGGGATACACGAGAACGAGGTTGATCTAAGC CTTAATCTTAATACTGAGGAATATTTCACCTAGACCTCATTTGCCTAGAT TCACAATTTTGAAAAGATTAGAGACGAAAGCAGCCGGCGAGGTGACCTTT TTCCCCGATGTGTTCTGAGAGCATATTTCAGCTAGAAATTTTGATATGTT GTGATCAGATCTTTGAAAATTAATCAGCTAGAAATAATGATGTGTTCTGG TGAGACAAGGTTATAATCAAGGTCATCTACCGTGTAACCCTAGAACTTTT CAGAACACATCTTTCGTGGAGCAAAATAAATATCTTACAAGTTTATTTTG GCAAACTGTTTTTCCTAGATTTTAGAACACATCAAACCATAAAGTAATGA TAAGTTTAAGGAGACGAGTGCGATAAACGTTTCTTAGAAATCAGAACACA TCATTTGTATAAAAAATTGAATGGTCATAGCATTTGGTCTCCTAGAAGAT AAGAACACATATTTCTAAAAAAAATCTTCACCGGCTACTTCTATAGTGAT GTCAATCTCGTCGTTGTTTGATTCTTCCATAAGTCAGCCTGGAGTCACAG CCGAGAGGATTGGGTATGGATGAGTGTTGCTGGCCAGGGTCCCTATTTTA AACTTTTTGATATCTAACTGGGTCACAAATTCACTATTTCGAATGTGACA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000119_pilon:123617..152501-

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GGATTGGATTGCTCCTCCGTGCTGCTTCTGCATCGACCAGGCTGTGACAT
TCTCGACCAAGTTGTTCGCGATTTGTTACAAATATTAAGCTGTTATGATA
TCACCATTGAATGTCCCTTACTAGAAATGAGCCATATCGATGCTCAAGGA
GGCTTACAAAATGTCATTCGTAATAATGTTGAGAAATGTAGTGTTATTTT
GCTGTTCATTACTGAGACAGTCGAAGGTATAAAAACAGAGAAGAATTGAG
TAGTTTATACGTCTATTGGGTACCTATAACCATCTTCTGTGTCATCATTA
TTGTTGCTGGTTTAGTGTCACAAAAATATCGCAAGAAATTCAGCAACAGC
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TGAAGAAATATCCAACGAATTGGAGAGAACACAAAGCCACGAAAGAAGGA
AAAAATTGTCCTTTATTTTATGAATGCGAAATGGAAGCAATGTGGTCTGC
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CTACCGACCTATTTAAGGACATGTTATAATTACCGACCAATTGAAACGAA
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GCTTACTTCGCAAGACATGCAAATGCGAAAAAATATCCGAAATATTGCAA
CACTACGTACCTTCTAGAAGAATATCTAAAGAAAAGATGAAATTGAAAGT
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TGGTCTGCATCTTCTGCCTCATAGCACAAAGTGGTCAGCTGACGGAAGAC
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GAATCTAAACAATCCAAATGGATTGCCATGTCCTGGTTTATTACCAACAA
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ATCAATCGCAATGGTCTGCATCTTCTGCCTCATAGCACAAAGT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14341MSTRG.14341Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14341.2.p1MSTRG.14341.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14341.2.p1.exon13MSTRG.14341.2.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon12MSTRG.14341.2.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon11MSTRG.14341.2.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon10MSTRG.14341.2.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon9MSTRG.14341.2.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon8MSTRG.14341.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon7MSTRG.14341.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon6MSTRG.14341.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon5MSTRG.14341.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon4MSTRG.14341.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon3MSTRG.14341.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon2MSTRG.14341.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14341.2.p1.exon1MSTRG.14341.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000119_pilongenomesc0000119_pilon:123617..152501 -