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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000119_pilon:59518..65934+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14337.1.p1 ID=MSTRG.14337.1.p1|Name=MSTRG.14337.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6417bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:59518..65934+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGACTAGATCTAGATTAattgatattgaaaaatatgTCTCTGATATTAT
TGTAAGAAAGTAAAATTGGatacaaaattgaaagttttgatgaaaatgaa
aaagtcaaATTATGAGAAATTTGGAAGATTTTCGTTATAATTAcgtatat
atttagaaaaacatgaagaaaaatttgattgaagtGATAAGACATTTTCA
TTGAATTACTCAATATTCATCATTATTATCTGAAGTTTattaaaagaaat
atttggGGGATTGGTACCAAgtgaagaagaaggagaaaaaggaaaatgga
TGACATGAGGAACCATTCACATTCTGAATGCACACATCACGTAAGTATAT
TTGGTTCTATTGGTCTCCCCCAGCTgatacacaacgttgtttcaacgtta
atctaacgttatattgacgttatgaacattagatagaTAAATATTGACAC
AACGTCGTGTGTCAGCTGCGTTAGATAAGGGGTTATTTAGCAAGCATAAA
ATAAGAAGCCTTGCAACTAGTTAGATACGCCTGATAAATTTTGTTAGTCT
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AGATACTCAGGAAATCAGGAAAATGGATCTTGAGCCGTACAAGCAGTGTC
GGTCTGAAAATATAATGCGAGAGGGTTACGAAAAtgataaattctaaaaa
tgtaCTTAATATGGTTGAATAATATACCAGTCAAGAATAGAGACAAACTT
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TTGgcattttttgtgaaagtattgaGCCTTACTGAGgaatattttacaat
ttacagttaaaaaggGGTACtcagtaaaaaaagaattagacTCCATGTCA
CTAGtcagacacccctgtctcagtcacagccccggtggaacttcttccaa
tagtgggaatgaaaatttctatcgaagtCACAATTGGGATATAAATTCTG
TATTGTTCCCCCAGGTCAAAAAATCCATTTGGGGATGGTTCATtttaaat
ggggatgaaaataaatacaattttccagtgggacttagactggagtcgtt
tataatgcgtgtaatactaataataccaatactaatgataataatacggg
atttagtttgtataaacgactggaagaatccagaagccttatagataccc
cggctagctacgcagaaacttgcgtagcgagaaaacaatttatcaagcaa
taacaaactctcaaaacaaaatcaactcaaatgataaactttcaatacac
aaataatccacacacattttttttctcaagaattattttgagcgggaaaa
aaatataattgcaatattgacacttttcttttgtttggagttagtgcaca
aaggtttctagacgactaaaattgttcccttcattactttttgctttatt
tctactatgtataaattactcgtctagcttgctagactaagtGGGGCTGA
GATTGTagtgaaattttaccactggggagtagatttttgcaaaatcgTCA
TTGAATGGGATGAGGGTATCACCGgttttgtgacacaggggtgtagttAG
GGTCTCTTTTGATTAGGTTTAAGATATTTCACACCCCCTTTTCAGAGACC
AACtggaaccccttcccactggcAAAATTATGCCAAAATAACGTCCCCGG
TGGAAGATTTTCCTCTAACTTTTCTCccatcctcactgcaaaatatttac
tattttttcatccccactggattttcggatttgaaaacaaaaaaattgaa
atctccagtcataaaaaatatggggaACAActtgctgaaaaaatcctacc
gggtctgtgagaagggggtgttgttTCAGGTTTTCTAGAAATTTTTTAAG
TAAAACATATTGTGAAAtaaatgaaatcaaaagtgaCGTACCCACTGACT
TAATCTAAAAGGGATAATTTTCCTATCAAAATCAAGACAAAATAATTGTT
TATTCTAAGTTAATGAAAAATTCATGAATATTATATCCTTCCCAAAAGAA
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AAGACAAAAATTTTGCCTCCAACCCCGATATCTGTAGGACTTACAATTTA
GTAATAGACAAAATAATTTACATAACttttaatcaaaattaaaagaaaaa
gactttgatttattatttagaactttaagtttcatgccgcCCGTATGGAG
GACAATCATCAGCTAGAACAatttcataacttttaattattttcctgAAA
ACATATTTCAGACCAATGAAACGCTCTAGTTAGTATAAGCTTGTCCGAAG
ATTTGTAGTAGGCTTATAATTGGGTTGAGAGCTCAGCTTAGAGACTTTAC
GGTCATAAGCAATTTATTCATCAACAGAGACCATAGTACAGCGAATTCTT
TATAACTCGAAAACGCACAAGGAACATAATTAAACTTGTTCGAATGGTGG
AAATCTCGAGTTTATGGAGTAAGGCTTAAGGCATTGTTTAATTGAGAgac
tagaaaacttgttcaagttaataagacattcgagttgtagaggttcgagc
AAAGAGAATATAACaacatttgttttttaaattctttgtgGTTCGAGGTA
TGAATACTCTATTACCGAGTTTAtctatcggaggatatcgagggcgacgg
taagtgaaatcgatacaaaacaaagtcgatagtcgATGTACGAGTCTATA
TCTCTCTATAGCtcacctttgctcacctaaacagacgaaggtatttttgg
tgtttttaccgtcgtcgagcaaagtggacggtgattttggagacatgctT
TATACCACCCCCCTCGATtcatctcgaatacataaactcgcaaTTGTATA
TGCATAGACGGTATTTGTATTTTTCGCTACCGAATTTAGATCCAACCTCT
GTAAATCTTTAATTGGTTAAGCGTCATATTTGCTGACATTATACTCTTAA
AAGATGTCCAAAATTAAGGTGAAGTTGGTCAGGAAATTGGTCCCCCGGAG
TgagggagggggtactagggcaaaaagGGTTACGAGGATGCGCCGCtcgt
cagggtaccttttttaacctccacgagtcccaggtagggttgcaaaaaca
ccaaaatagaaaaatcagtccctcgtagggtgcccttttttggaaaattg
tgggaaaaagtagaaaatttgagaaaactgtgaaatttcagtcccattca
gggtcacttttttcgcgaATCTCGAGTCcgacgtagggtccatttttcga
acctcagctgAGCACCCTCGTCGGTCGGCAAGTGTAGTACCCCTCTGGGA
TTGGTTCAAACTTTCTGAAACTAAAACAGAATCACATGTAATAGGAAACG
TTGAAAATGTTTCGCGtatcaaaatgttaagaaaaataatatttttcaca
aGGTCTTGTTTTGAGTTTGCCGTAACTTTCACAGAATATCGAtttttatc
tagttttcaatctatgtgggtgtttttttgaatttcttttccgttataat
tttttagccacgataaattttatttCCATTGGACTATCACCTTTCTTTTA
TAAGTTATACAAGAAAGATTCATTTCGAAGCATGTAGTTCTCAAGAGAAA
ATTTTCCACTGAAAATGATATAGACTGGATTTACGTTGAACAAATACTAA
TAAatctctctcttattcgattatTGAGAGGCTTAGAGAATTTTACTCGA
TTTATAGAGCATTCTTTTgaggatttttgaaatttgagctCTTTACGATT
GATATGATTACGTCATAATAGAGATCCTTTCAAAAGGTAGTAAGATGATG
TCATAATACGTCATATGTATATTTTACGGAAAGAAAGTCATTTTGACAGC
ATGAGAACTACTTCAGGCAGACAGTATGTGTTCTTTAGTCCTCAGTGTGT
GTTTTGATTTAGTATAAAGAAACGTGAAACCAGCGTGTTACAGGAAGGAA
GAGGCtgaacttaatttttgcaaATATATATAATGttgaatttgatacat
tttgaatttcaattttcttatttctatACTGATTGTATCACTTGTATCAG
ATATCACTGTTACAGATTCGCTTTTGAAAATAGCTTGATTGATGAGTTTC
TTGGGCTGGATTTCGACGTGTCAGACAAAACGGGATTCCTTTTAGCGGGT
ATTATAGTAGTTAGTCACATTGGCAAATAGTCAGTAAAACATGAGGTCAC
ATACTGTATTCTAGAGAAAATTCAAACATATGGCATTTTCATAGATCTAT
TGCCTGGAACCTAACTAACCTAACTTTACCTAACTTTACCTATTATAGCA
GTTAGTCAGTCACATTGACAAATAGTCGGTGAGATTTTTAAAACATGAGG
TCACAGgctatatctcggagaaaatcCTGTAGCATTTTCTTAAGCTTATC
ACCAGCCTGGAACCTAGACTCACCTACCTTTCTACAGCTACAATCTAAAT
TAATCTGGAGGAGGGGCTGGAGATTTTGAGTAATTCACATACAAAACGGT
GTTTTAAAAAGAACGTTATATTTAAGCGTTTAGTGTAGTTCAGTTTGTCC
TAAACGTCTGGTTTTGTCTAGTAGATGGAATGATATTTAGAATAACTTCA
TTTCCAGCAGGGAGTTTAAAACAAGTTTGATACAGAGGGGTATAACCACC
GTTGAGGTTCAACAAAACATCCCTGTcttacagccccggtggaacttttt
tttctcagtcgggataaaaattcctattgaaatcccgatgGGAATAGAAC
AATTATTGTTTCATAGTTAAAAGATGCAATAGGGATGGTTTTGTTGTAAA
ATCTTGTGaagcattgaatttcgaatgggcataaaatcaaaatcaatttg
ccAGTGGTGCTGAAAACCCCGGGTATTTTGCCACCACGGACAAAATCTTC
TTTCATTGGGGTAGGGGTTTAAgcgagtctgtgacacagggatgtatCTG
ATATATTCAGTTAAATTCAAATTGGTGTTTGGTCGCTGTAGAGTTTTTCA
ATCTATGGTTCTGAATGGTTAAGATTGAATATttccactttcactttctt
tatcTATTTCTTGTTATTTAGATAATTTGCAGCACCATGACGAACACACC
GTGCCCAGGATTTCATGCACCGCCGGCCCTGTCCGTATTCACATCGGTTG
TTTCCGCTGTTTTATGCATCTTGACTGTAATCGGAAATCTCCTGGTTTGT
TTAGCCGTTTTGAAAGATCCACAACGAAAATTACGAACACCATTCATGTT
TATTATCGTGAATCTGGCCATTACTGACCTCATTGTTGGCATAGTAACGC
TACCGATATCTGTGGTCACACATGCTTTAGAAGCCGTTGATAAAAAGACA
AATGATTACGTCACTGTTAGTCGAATGTTTTATTTCGTCACTGTAACAGC
AAGTACTTTTAATTTGATTGCGTTTTGTATCGATAGATTTGTAGCAGTAT
CGAATCCAATAAAATATCGACAAATAATGCGATTTAAGATTTGCGTATTC
TTAGTAGCATTGATTTGGCTGTTATCGATTGGAATCGCATGTATTTATTT
GGCTGTCGGTTATATCGATTTTATTATCTTTTTCGCTCAAATCTCAATGG
CGTTAGTGTTAGTAATGTGTGCTATAACGGTTAGATTATTATGTATGCTG
AATTTAAAAGCAAAGAAACGTCGTAAACTTACGTCGTCACATTCCCGTTT
ACAGAACGAACGTGTTACCGTGTTATTTCTCACGTTTTTGATCACGTTTC
TGTTATGTAACACGCCAGCTATTGTCATGATGtatttgatcaaattttac
aCGACCATGGACTGTACTGTTCGACATGTTATACGAGATTTATCATTCCT
ATTTGTCGTTTCAAACTCAGCGCTTAATCCTTTATTCTGTACTATAAGAC
TTAAACCGTTTAACCAAGccattaaaatcattttcaactaTAAAGCTGAA
GGAATTGAATCTCCACTTTATGGCAGGAATGGATCATCTCACAGACGCAG
TGATGCAATGAGACGGAAGTCGAGTGAGAAAAGTATTttattggagaaaa
aaaagttgCAGAAGTCATCAACTTTGAAAGCTTGATATGTGTTATCGTTC
GATTGTGAATTTTTGGACGAGatttttattcattattttctttattaacG
ACGTAGGAGGGACTTGATCTGATGCCGATCAAACTAACttcttttgtatt
tatgacatttttgataatatttcaaTTGATATTATATCGGGAAGAAAAGA
TTGGTCTAAAAATAGTTGGTTTTAATCTTAATTCAACATTCTATGAAATG
AACATTGTTTAATACGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000119_pilon:59518..65934+ >MSTRG.14337.1.p1 ID=MSTRG.14337.1.p1|Name=MSTRG.14337.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2118bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000119_pilon:59518..65934+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggaTGACATGAGGAACCATTCACATTCTGAATGCACACATCACATAAT
TTGCAGCACCATGACGAACACACCGTGCCCAGGATTTCATGCACCGCCGG
CCCTGTCCGTATTCACATCGGTTGTTTCCGCTGTTTTATGCATCTTGACT
GTAATCGGAAATCTCCTGGTTTGTTTAGCCGTTTTGAAAGATCCACAACG
AAAATTACGAACACCATTCATGTTTATTATCGTGAATCTGGCCATTACTG
ACCTCATTGTTGGCATAGTAACGCTACCGATATCTGTGGTCACACATGCT
TTAGAAGCCGTTGATAAAAAGACAAATGATTACGTCACTGTTAGTCGAAT
GTTTTATTTCGTCACTGTAACAGCAAGTACTTTTAATTTGATTGCGTTTT
GTATCGATAGATTTGTAGCAGTATCGAATCCAATAAAATATCGACAAATA
ATGCGATTTAAGATTTGCGTATTCTTAGTAGCATTGATTTGGCTGTTATC
GATTGGAATCGCATGTATTTATTTGGCTGTCGGTTATATCGATTTTATTA
TCTTTTTCGCTCAAATCTCAATGGCGTTAGTGTTAGTAATGTGTGCTATA
ACGGTTAGATTATTATGTATGCTGAATTTAAAAGCAAAGAAACGTCGTAA
ACTTACGTCGTCACATTCCCGTTTACAGAACGAACGTGTTACCGTGTTAT
TTCTCACGTTTTTGATCACGTTTCTGTTATGTAACACGCCAGCTATTGTC
ATGATGtatttgatcaaattttacaCGACCATGGACTGTACTGTTCGACA
TGTTATACGAGATTTATCATTCCTATTTGTCGTTTCAAACTCAGCGCTTA
ATCCTTTATTCTGTACTATAAGACTTAAACCGTTTAACCAAGccattaaa
atcattttcaactaTAAAGCTGAAGGAATTGAATCTCCACTTTATGGCAG
GAATGGATCATCTCACAGACGCAGTGATGCAATGAGACGGAAGTCGAGTG
AGAAAAGTATTttattggagaaaaaaaagttgCAGAAGTCATCAACTTTG
AAAGCTTGAatggaTGACATGAGGAACCATTCACATTCTGAATGCACACA
TCACATAATTTGCAGCACCATGACGAACACACCGTGCCCAGGATTTCATG
CACCGCCGGCCCTGTCCGTATTCACATCGGTTGTTTCCGCTGTTTTATGC
ATCTTGACTGTAATCGGAAATCTCCTGGTTTGTTTAGCCGTTTTGAAAGA
TCCACAACGAAAATTACGAACACCATTCATGTTTATTATCGTGAATCTGG
CCATTACTGACCTCATTGTTGGCATAGTAACGCTACCGATATCTGTGGTC
ACACATGCTTTAGAAGCCGTTGATAAAAAGACAAATGATTACGTCACTGT
TAGTCGAATGTTTTATTTCGTCACTGTAACAGCAAGTACTTTTAATTTGA
TTGCGTTTTGTATCGATAGATTTGTAGCAGTATCGAATCCAATAAAATAT
CGACAAATAATGCGATTTAAGATTTGCGTATTCTTAGTAGCATTGATTTG
GCTGTTATCGATTGGAATCGCATGTATTTATTTGGCTGTCGGTTATATCG
ATTTTATTATCTTTTTCGCTCAAATCTCAATGGCGTTAGTGTTAGTAATG
TGTGCTATAACGGTTAGATTATTATGTATGCTGAATTTAAAAGCAAAGAA
ACGTCGTAAACTTACGTCGTCACATTCCCGTTTACAGAACGAACGTGTTA
CCGTGTTATTTCTCACGTTTTTGATCACGTTTCTGTTATGTAACACGCCA
GCTATTGTCATGATGtatttgatcaaattttacaCGACCATGGACTGTAC
TGTTCGACATGTTATACGAGATTTATCATTCCTATTTGTCGTTTCAAACT
CAGCGCTTAATCCTTTATTCTGTACTATAAGACTTAAACCGTTTAACCAA
GccattaaaatcattttcaactaTAAAGCTGAAGGAATTGAATCTCCACT
TTATGGCAGGAATGGATCATCTCACAGACGCAGTGATGCAATGAGACGGA
AGTCGAGTGAGAAAAGTATTttattggagaaaaaaaagttgCAGAAGTCA
TCAACTTTGAAAGCTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000119_pilon | genome | sc0000119_pilon:59518..65934 + |
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