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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000118_pilon:588583..591850+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14305.1.p1 ID=MSTRG.14305.1.p1|Name=MSTRG.14305.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3268bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000118_pilon:588583..591850+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTATATATACACATTTTGGTGGaacgctagtgtggctaactgaaGGTATT
tctttaacctttcttttttttcattttatacccAGTGTTCCTTGATTAAA
ATCGAGGCTTCAAAGCAGTGAAAGtcttggaaattcaaaaaaaataagat
aactaagcaaaaataattaatatttggagattaaaattaaaaacatgagA
TTAGTCATTCATGATTCCTATGATGATGTCAGTGCTTGGGCAGCCAAGTA
TATCCGAAATAAGATCAAGAGGTTCAAACCTGATGAAAACAAACATTTTG
TTCTTGGATTACCCACAGGTAAGAACTTAAATACCGTACACAAATGTCAA
GTACCGTatgttggtctaatgtcaacattcctcttataattttgacaccc
ttttgAATAATAAGAAAGTCTAAATCACTGACagacaaaagaattttttt
tttctctgaccGCTAAGTGAAGAAATGTAGTTTTCAACAGCAATTCCAAC
TCTCATTTTATTCCCAACAAAAAGAAGGCTGTCAAAATTAGATGAGATTG
ACATTGTTtgaccctttcagtcccaggaACACTCCTACAAATTTGCCGAT
TTGGGGCTTAATACTTATCTATTATGGTGCATGCAGTGTTGGTGCACTTA
AAGCAAATCCCAAAAAGTTGTCACTTACTGTACACAACTGATTGCAAGCA
AATCTTGGTACAGCTCGTTTTTCATACTGCCAATCAGATTTCAGGgtgtt
gtatttttttaatgttaAAAGCTCGAAAATCTtcacaatatatttttttt
ctataggGGGTACTCCTTTGGGAATGTATAAGGCCTTGATCAAGATGTAC
CAAGATGGTGAATTCTCATTTAAGTATGTCAAAACTTTTAATATGGATGA
GTACTGTGGATTACCAAGGGATCATCCAGAAAGTTATCATTACTACATGT
GGTCCAACTTCTTCAAGCACATTGATATTGACCCAAAGAATGTGAACTTG
TTAGACGGTAATGCGGCAGATTTGTGTGCTGAATGTGACCGATATGAAGA
GGAAATTAAAAAGGCTGGAGGAATTAATCTGTTTGTTGGAGGTATAACTT
AATTAATGTTTGATTCAGGGTCCACACTGCCTTGCattgattattatttt
taaagtaCCACGCATCAGACCTTCTTTTCTGGGCAAAATCTGTGGGATTA
AGGGTCTCCAGCATTAAGACAATGACACACTAATACATAATTATTATATG
AACTATAACTATTATATGAAGTatgaactaatttttttctcaacattgtt
ttgatgccagatttttgaatttctcaacATGACATCCCGTCTACAGTAGG
AAAAGGTCTAtgttttattaacttttttgttacttttctcACAAACTCCT
TATATATTTAAGgctatcttttgaaatttctttttatatttttctttcaa
aggtaTTGGACCAGATGGACATATAGCTTTTAATGAACCAGGATCCTCCT
TGGTTTCACGTACCAGAGTCAAAACACTAGCTATGGAGACTGTGGTAGCC
AATTCACGTTTCTTCGATAATGATATTAGTAAAGTACCAAAGATGGCATG
TACTGTTGGTGTTGGAACAGTTATGGATGCTGAAGAGGTTTGTGTCATTT
GAATGTGAATTTTGGAGTGTCCACttcgaaaaatgaaataaaattttagg
aTGTTTCTCCAGGTTCAAAGTACTTTGGTTAACCCCGCCTTTTCTAGATG
AAAGATGAACCTTTCCCCTATTTGAAAATTGCCCTATTATCAGCCATTTT
TTACCCAAACGCCCTTTATTCATCAGAACATCATTTTATAATAAAGTGAA
AACTAGAAATCTAATTTtaataatgaataaaattaaatttctagttttca
cTTTTATCATTAAATTTATCTGGCCCagcaagaaattttttcaataacat
CATTTTTCCACGTTTTaggaacatttcaaaataaaaactttaaatcaaCA
TAACATGATCATCATAACCAAAGAAGCATTTTATCTAGAGGAAGTAGGAA
TTGACCTCATGAaataatacttttcttttttcttgcaATCTCATATTATG
ATCAATGATGTCAAAAACATTTCAGGTCATGGTATTGATTACTGGACAAT
CTAAAGCATTTGCCTTGCACAAAGCCATAGAGGAAGGGATTAGTCACATG
TGGACCGTATCTGCATTCCAACAACATCCTAATACTATCTTTGTGTGCGA
CGAAGAAGCTACAAATGAACTCAAAGTCAAAACTGTCAAATATTTCAAAG
GTTGTCATATTGTTATTGTCAACAATTAGTACAAAATTCTGCTAGAATAT
TTAGTTGTCTAAGCACATGATATTCCCTACATAACTGCAAAGACTAGAAT
CCTGACCCTCACTTTCCAAAAACAGACTGTTTTATGTAACTTTCAGATCC
CCCTTAGCTTTTACTAATGAATTTGATACTCAATGTATGTTATAACAACC
TATTTTGATGTTGAATTTATAGAGAGCTTTAATATTGGAATCGTAGTATA
AAAAGTAATTTCCAAGCAGATCTTATACTTCTTTAGACTTGTTTAGAGTA
GAACAGGTTACTGCCAGGATGGGTGATACGATATGTGATAGAAATAGTAC
ACCTGCTCAATACATCTATCGAGCTTTGAATCAGCTTTCAGTGTAGTTTA
CCAGAAAGGAACGGAATTACGTCAAAATTCTGTATCCGTAAGAAAATCGA
TGCAacaacattgtgaattttgacgcCAATTCTTTCTGGTAAACCCATTC
TTTCAATGCTTTAAGGGTTTATTATAGGTGTATTGTTGGTTACAAGTATG
CTGCGATGcttattcatattttttaatgactttttataGGTTTAATGAAT
TTGTATCATGGGCTTGTGGAAGATCTTGATGAAGATGGAAACAGCAAATC
ACCCAATAAAGATGAATGTTATACATGTaattgaattaatttttgctgAT
TAAAACGGTCATGTCTGTTGGCAAGAAATTACTTGGCTAGTTTGCGGTGA
TTGTGCTATAGAgctagaaagaaaattttagcGGAATCTTTTTAAACCTG
TATTAAAAAGAaacatgaattaaaaaaaagattttagatCCATTTCattc
aacaaatttttgattttatccgTACAACACAAGCATTGGTATTGATccct
tttgaaacatttttcaacatttttaaactGCATTATTTCCTTTGCATTTT
GAGGAGGCTAAATTCTCC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000118_pilon:588583..591850+ >MSTRG.14305.1.p1 ID=MSTRG.14305.1.p1|Name=MSTRG.14305.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4320bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000118_pilon:588583..591850+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgagATTAGTCATTCATGATTCCTATGATGATGTCAGTGCTTGGGCAGC
CAAGTATATCCGAAATAAGATCAAGAGGTTCAAACCTGATGAAAACAAAC
ATTTTGTTCTTGGATTACCCACAGgGGGTACTCCTTTGGGAATGTATAAG
GCCTTGATCAAGATGTACCAAGATGGTGAATTCTCATTTAAGTATGTCAA
AACTTTTAATATGGATGAGTACTGTGGATTACCAAGGGATCATCCAGAAA
GTTATCATTACTACATGTGGTCCAACTTCTTCAAGCACATTGATATTGAC
CCAAAGAATGTGAACTTGTTAGACGGTAATGCGGCAGATTTGTGTGCTGA
ATGTGACCGATATGAAGAGGAAATTAAAAAGGCTGGAGGAATTAATCTGT
TTGTTGGAGgtaTTGGACCAGATGGACATATAGCTTTTAATGAACCAGGA
TCCTCCTTGGTTTCACGTACCAGAGTCAAAACACTAGCTATGGAGACTGT
GGTAGCCAATTCACGTTTCTTCGATAATGATATTAGTAAAGTACCAAAGA
TGGCATGTACTGTTGGTGTTGGAACAGTTATGGATGCTGAAGAGGTCATG
GTATTGATTACTGGACAATCTAAAGCATTTGCCTTGCACAAAGCCATAGA
GGAAGGGATTAGTCACATGTGGACCGTATCTGCATTCCAACAACATCCTA
ATACTATCTTTGTGTGCGACGAAGAAGCTACAAATGAACTCAAAGTCAAA
ACTGTCAAATATTTCAAAGGTTTAATGAATTTGTATCATGGGCTTGTGGA
AGATCTTGATGAAGATGGAAACAGCAAATCACCCAATAAAGATGAATGTT
ATACATGTaattgaatgagATTAGTCATTCATGATTCCTATGATGATGTC
AGTGCTTGGGCAGCCAAGTATATCCGAAATAAGATCAAGAGGTTCAAACC
TGATGAAAACAAACATTTTGTTCTTGGATTACCCACAGgGGGTACTCCTT
TGGGAATGTATAAGGCCTTGATCAAGATGTACCAAGATGGTGAATTCTCA
TTTAAGTATGTCAAAACTTTTAATATGGATGAGTACTGTGGATTACCAAG
GGATCATCCAGAAAGTTATCATTACTACATGTGGTCCAACTTCTTCAAGC
ACATTGATATTGACCCAAAGAATGTGAACTTGTTAGACGGTAATGCGGCA
GATTTGTGTGCTGAATGTGACCGATATGAAGAGGAAATTAAAAAGGCTGG
AGGAATTAATCTGTTTGTTGGAGgtaTTGGACCAGATGGACATATAGCTT
TTAATGAACCAGGATCCTCCTTGGTTTCACGTACCAGAGTCAAAACACTA
GCTATGGAGACTGTGGTAGCCAATTCACGTTTCTTCGATAATGATATTAG
TAAAGTACCAAAGATGGCATGTACTGTTGGTGTTGGAACAGTTATGGATG
CTGAAGAGGTCATGGTATTGATTACTGGACAATCTAAAGCATTTGCCTTG
CACAAAGCCATAGAGGAAGGGATTAGTCACATGTGGACCGTATCTGCATT
CCAACAACATCCTAATACTATCTTTGTGTGCGACGAAGAAGCTACAAATG
AACTCAAAGTCAAAACTGTCAAATATTTCAAAGGTTTAATGAATTTGTAT
CATGGGCTTGTGGAAGATCTTGATGAAGATGGAAACAGCAAATCACCCAA
TAAAGATGAATGTTATACATGTaattgaatgagATTAGTCATTCATGATT
CCTATGATGATGTCAGTGCTTGGGCAGCCAAGTATATCCGAAATAAGATC
AAGAGGTTCAAACCTGATGAAAACAAACATTTTGTTCTTGGATTACCCAC
AGgGGGTACTCCTTTGGGAATGTATAAGGCCTTGATCAAGATGTACCAAG
ATGGTGAATTCTCATTTAAGTATGTCAAAACTTTTAATATGGATGAGTAC
TGTGGATTACCAAGGGATCATCCAGAAAGTTATCATTACTACATGTGGTC
CAACTTCTTCAAGCACATTGATATTGACCCAAAGAATGTGAACTTGTTAG
ACGGTAATGCGGCAGATTTGTGTGCTGAATGTGACCGATATGAAGAGGAA
ATTAAAAAGGCTGGAGGAATTAATCTGTTTGTTGGAGgtaTTGGACCAGA
TGGACATATAGCTTTTAATGAACCAGGATCCTCCTTGGTTTCACGTACCA
GAGTCAAAACACTAGCTATGGAGACTGTGGTAGCCAATTCACGTTTCTTC
GATAATGATATTAGTAAAGTACCAAAGATGGCATGTACTGTTGGTGTTGG
AACAGTTATGGATGCTGAAGAGGTCATGGTATTGATTACTGGACAATCTA
AAGCATTTGCCTTGCACAAAGCCATAGAGGAAGGGATTAGTCACATGTGG
ACCGTATCTGCATTCCAACAACATCCTAATACTATCTTTGTGTGCGACGA
AGAAGCTACAAATGAACTCAAAGTCAAAACTGTCAAATATTTCAAAGGTT
TAATGAATTTGTATCATGGGCTTGTGGAAGATCTTGATGAAGATGGAAAC
AGCAAATCACCCAATAAAGATGAATGTTATACATGTaattgaatgagATT
AGTCATTCATGATTCCTATGATGATGTCAGTGCTTGGGCAGCCAAGTATA
TCCGAAATAAGATCAAGAGGTTCAAACCTGATGAAAACAAACATTTTGTT
CTTGGATTACCCACAGgGGGTACTCCTTTGGGAATGTATAAGGCCTTGAT
CAAGATGTACCAAGATGGTGAATTCTCATTTAAGTATGTCAAAACTTTTA
ATATGGATGAGTACTGTGGATTACCAAGGGATCATCCAGAAAGTTATCAT
TACTACATGTGGTCCAACTTCTTCAAGCACATTGATATTGACCCAAAGAA
TGTGAACTTGTTAGACGGTAATGCGGCAGATTTGTGTGCTGAATGTGACC
GATATGAAGAGGAAATTAAAAAGGCTGGAGGAATTAATCTGTTTGTTGGA
GgtaTTGGACCAGATGGACATATAGCTTTTAATGAACCAGGATCCTCCTT
GGTTTCACGTACCAGAGTCAAAACACTAGCTATGGAGACTGTGGTAGCCA
ATTCACGTTTCTTCGATAATGATATTAGTAAAGTACCAAAGATGGCATGT
ACTGTTGGTGTTGGAACAGTTATGGATGCTGAAGAGGTCATGGTATTGAT
TACTGGACAATCTAAAGCATTTGCCTTGCACAAAGCCATAGAGGAAGGGA
TTAGTCACATGTGGACCGTATCTGCATTCCAACAACATCCTAATACTATC
TTTGTGTGCGACGAAGAAGCTACAAATGAACTCAAAGTCAAAACTGTCAA
ATATTTCAAAGGTTTAATGAATTTGTATCATGGGCTTGTGGAAGATCTTG
ATGAAGATGGAAACAGCAAATCACCCAATAAAGATGAATGTTATACATGT
aattgaatgagATTAGTCATTCATGATTCCTATGATGATGTCAGTGCTTG
GGCAGCCAAGTATATCCGAAATAAGATCAAGAGGTTCAAACCTGATGAAA
ACAAACATTTTGTTCTTGGATTACCCACAGgGGGTACTCCTTTGGGAATG
TATAAGGCCTTGATCAAGATGTACCAAGATGGTGAATTCTCATTTAAGTA
TGTCAAAACTTTTAATATGGATGAGTACTGTGGATTACCAAGGGATCATC
CAGAAAGTTATCATTACTACATGTGGTCCAACTTCTTCAAGCACATTGAT
ATTGACCCAAAGAATGTGAACTTGTTAGACGGTAATGCGGCAGATTTGTG
TGCTGAATGTGACCGATATGAAGAGGAAATTAAAAAGGCTGGAGGAATTA
ATCTGTTTGTTGGAGgtaTTGGACCAGATGGACATATAGCTTTTAATGAA
CCAGGATCCTCCTTGGTTTCACGTACCAGAGTCAAAACACTAGCTATGGA
GACTGTGGTAGCCAATTCACGTTTCTTCGATAATGATATTAGTAAAGTAC
CAAAGATGGCATGTACTGTTGGTGTTGGAACAGTTATGGATGCTGAAGAG
GTCATGGTATTGATTACTGGACAATCTAAAGCATTTGCCTTGCACAAAGC
CATAGAGGAAGGGATTAGTCACATGTGGACCGTATCTGCATTCCAACAAC
ATCCTAATACTATCTTTGTGTGCGACGAAGAAGCTACAAATGAACTCAAA
GTCAAAACTGTCAAATATTTCAAAGGTTTAATGAATTTGTATCATGGGCT
TGTGGAAGATCTTGATGAAGATGGAAACAGCAAATCACCCAATAAAGATG
AATGTTATACATGTaattga
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000118_pilon | genome | sc0000118_pilon:588583..591850 + |
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