MSTRG.14288.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14288.4.p1
Unique NameMSTRG.14288.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000118_pilon:393422..414989-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14288.4.p1 ID=MSTRG.14288.4.p1|Name=MSTRG.14288.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21568bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000118_pilon:393422..414989- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000118_pilon:393422..414989-

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TGACATTCCCAATGTACCAGTTGATATCATGTTCTCCTCTACACAAAAAG
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GAATCAACAGATCAATTGCACTGCTAACAATGTTGTAGACCGACCACAGT
ATAACAATGGAAATAATGGCTTCCAAAAACTTTTATCTCCAGCTCAAGTT
CCCATCTGGTTCACAAGTTATTGTTGATATATTCCGGTGGTTCGCCTTCT
CGGACTACTACTGGTTATTTACCATTACTGTATTAGTTCCACCAGAAGAT
TACAGAAATACGTCTGGTTTATGTGGAAATTGGGATCAGATTATTCCCAA
TAATAACCCCAACACACCATTCAATATGAAGAGCAAAGATGGAACAGTTT
ATGAAGTAGCACCGAGAACTATTGCACCAACAGGCTTCACTGAAAGTTGG
AAGTTCAGACAAGATCATTTCAATGTGGAACAGTTGCATGTAACTGTGCG
GTGGCAGTTCGTGAAGGGGATGACGTCATGATTGTAGATTCGTGCCGCAC
TGGTATACCACGCGCGCGATTTGCAAGCACGGTTGAACCACAGCCAGGAA
GTATAATGGAGAGAAGTACAAATGGAAAACAATTTACGATGAGAGTTGGA
GATTATATTTTGGCTAAATCTAATGCTCGATTATTTGAAATAATTTAGCA
CCCGTCTTCCGGACTTCAACACCATACAAAGTCTTCAAACATGCACGTAT
GAATTTCACAATACCCGTATCTGATCCCGAACAAAAAAGAGACGACTCCT
GTAGAGTGAACAATTATTGTTTTGCCAATGGTGAATCTCACCCAACAGAT
TGGTGTAAAAAATGCGTTGGACAGAACACGTTTACTGCCAGAAAAGTTTA
CAACAGATCATGGCATCGACACAACCTTCAATGGTGAATCTACAGTTCAG
AAAAGTCAATTATTAAGTTTCGCAGAGTTGACATGTGACATTCCCAATGT
ACCAGTTGATATCATGTTCTCCTCTACACAAAAAGGGATCCCAGTTGGAG
GCTTTGATATACGATTGTCTAATGATGGAAATAGTTTTACCAGTCAAAGT
TCACAATTTGTTATTTATGATTCGAAATGCTTGATTTGTGATGCAGCAAG
CCATAATTGCCGGTGGAAGGCGACAAACCAACTCTAGAAAAAGTAGCATT
TAATGGTTTATGCGATATTAGAAATAAAGATTGCCTACGTACGCGTGTTG
TTGGGAAAAACTTTGTTAATTCACCAAAACTTGCATGTCAAACCAATAAA
CTCAAGGTTTTGGATGATTTGAATGCAGCCAAGTTCTCATCTCTTGGCGT
TCTGAAAAATGAGTGCGAAGAAAAAGCCTTAAAGAATTTAAGTTTGTGGG
AAACAGGTCAAAATGGCAACCTTCAGCCACCACAAGCTGTTGGTAACGCA
TTATGCCCAAATGATTGCAGTGGTAAAGGCAAATGTGTCAATTCTACTTG
TGTATGTGATGCGGGCTATTTATCGACAGACTGCTCTATCCAGACAGTTT
CCGAGCACTGTGGTCGACGTCGTAAACGAAGAGACATCGGCGATGATGAA
ATCGTTCTTCCCGATGATGGAGAGGATGCTTTTTATTTCTACGATCCCCC
ACAACCAAATGGTACGCTTCCATCTTTCCCGACACCGAACGGTATCACGG
AGCAACAAGCTGATCAAGAATGCGATCAAATATTGCGACAATCAGATATC
GGTAAAGTTTGCTTAAAAATGATCCCTGATCTTGGTATTGATCAATACAA
ACACAGTTGCAAATTTGACGCAATGACTGTCACCTGGTACAAGTTTGTTT
TATTATCGAGGCGGCCCAAAGAAATGTCACCACAAGAGAACCCATAAGAA
ATGTTTTTGTGATACTAACGCTCACATGAATCAACAGATCAATTGCACTG
CTAACAATGTTGTAGACCGACCACAGTATAACAATGGAAATAATGGCTTC
CAAAAACTTTTATCTCCAGCTCAAGTTCCCATCTGGTTCACAAGTTATTG
TTGATATATTCCGGTGGTTCGCCTTCTCGGACTACTACTGGTTATTTACC
ATTACTGTATTAGTTCCACCAGAAGATTACAGAAATACGTCTGGTTTATG
TGGAAATTGGGATCAGATTATTCCCAATAATAACCCCAACACACCATTCA
ATATGAAGAGCAAAGATGGAACAGTTTATGAAGTAGCACCGAGAACTATT
GCACCAACAGGCTTCACTGAAAGTTGGAAGTTCAGACAAGATCATTTCAA
TGTGGAACAGTTGCATGTAACTGTGCGGTGGCAGTTCGTGAAGGGGATGA
CGTCATGATTGTAGATTCGTGCCGCACTGGTATACCACGCGCGCGATTTG
CAAGCACGGTTGAACCACAGCCAGGAAGTATAATGGAGAGAAGTACAAAT
GGAAAACAATTTACGATGAGAGTTGGAGATTATATTTTGGCTAAATCTAA
TGCTCGATTATTTGAAATAATTTAGCACCCGTCTTCCGGACTTCAACACC
ATACAAAGTCTTCAAACATGCACGTATGAATTTCACAATACCCGTATCTG
ATCCCGAACAAAAAAGAGACGACTCCTGTAGAGTGAACAATTATTGTTTT
GCCAATGGTGAATCTCACCCAACAGATTGGTGTAAAAAATGCGTTGGACA
GAACACGTTTACTGCCAGAAAAGTTTACAACAGATCATGGCATCGACACA
ACCTTCAATGGTGAATCTACAGTTCAGAAAAGTCAATTATTAAGTTTCGC
AGAGTTGACATGTGACATTCCCAATGTACCAGTTGATATCATGTTCTCCT
CTACACAAAAAGGGATCCCAGTTGGAGGCTTTGATATACGATTGTCTAAT
GATGGAAATAGTTTTACCAGTCAAAGTTCACAATTTGTTATTTATGATTC
GAAATGCTTGATTTGTGATGCAGCAAGCCATAATTGCCGGTGGAAGGCGA
CAAACCAACTCTAGAAAAAGTAGCATTTAATGGTTTATGCGATATTAGAA
ATAAAGATTGCCTACGTACGCGTGTTGTTGGGAAAAACTTTGTTAATTCA
CCAAAACTTGCATGTCAAACCAATAAACTCAAGGTTTTGGATGATTTGAA
TGCAGCCAAGTTCTCATCTCTTGGCGTTCTGAAAAATGAGTGCGAAGAAA
AAGCCTTAAAGAATTTAAGTTTGTGGGAAACAGGTCAAAATGGCAACCTT
CAGCCACCACAAGCTGTTGGTAACGCATTATGCCCAAATGATTGCAGTGG
TAAAGGCAAATGTGTCAATTCTACTTGTGTATGTGATGCGGGCTATTTAT
CGACAGACTGCTCTATCCAGACAGTTTCCGAGCACTGTGGTCGACGTCGT
AAACGAAGAGACATCGGCGATGATGAAATCGTTCTTCCCGATGATGGAGA
GGATGCTTTTTATTTCTACGATCCCCCACAACCAAATGGTACGCTTCCAT
CTTTCCCGACACCGAACGGTATCACGGAGCAACAAGCTGATCAAGAATGC
GATCAAATATTGCGACAATCAGATATCGGTAAAGTTTGCTTAAAAATGAT
CCCTGATCTTGGTATTGATCAATACAAACACAGTTGCAAATTTGACGCAA
TGACTGTCACCTGGTACAAGTTTGTTTTATTATCGAGGCGGCCCAAAGAA
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ACATGAATCAACAGATCAATTGCACTGCTAACAATGTTGTAGACCGACCA
CAGTATAACAATGGAAATAATGGCTTCCAAAAACTTTTATCTCCAGCTCA
AGTTCCCATCTGGTTCACAAGTTATTGTTGATATATTCCGGTGGTTCGCC
TTCTCGGACTACTACTGGTTATTTACCATTACTGTATTAGTTCCACCAGA
AGATTACAGAAATACGTCTGGTTTATGTGGAAATTGGGATCAGATTATTC
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GTTTATGAAGTAGCACCGAGAACTATTGCACCAACAGGCTTCACTGAAAG
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GCACTGGTATACCACGCGCGCGATTTGCAAGCACGGTTGAACCACAGCCA
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TGGAGATTATATTTTGGCTAAATCTAATGCTCGATTATTTGAAATAATTT
AGCACCCGTCTTCCGGACTTCAACACCATACAAAGTCTTCAAACATGCAC
GTATGAATTTCACAATACCCGTATCTGATCCCGAACAAAAAAGAGACGAC
TCCTGTAGAGTGAACAATTATTGTTTTGCCAATGGTGAATCTCACCCAAC
AGATTGGTGTAAAAAATGCGTTGGACAGAACACGTTTACTGCCAGAAAAG
TTTACAACAGATCATGGCATCGACACAACCTTCAATGGTGAATCTACAGT
TCAGAAAAGTCAATTATTAAGTTTCGCAGAGTTGACATGTGACATTCCCA
ATGTACCAGTTGATATCATGTTCTCCTCTACACAAAAAGGGATCCCAGTT
GGAGGCTTTGATATACGATTGTCTAATGATGGAAATAGTTTTACCAGTCA
AAGTTCACAATTTGTTATTTATGATTCGAAATGCTTGATTTGTGATGCAG
CAAGCCATAATTGCCGGTGGAAGGCGACAAACCAACTCTAGAAAAAGTAG
CATTTAATGGTTTATGCGATATTAGAAATAAAGATTGCCTACGTACGCGT
GTTGTTGGGAAAAACTTTGTTAATTCACCAAAACTTGCATGTCAAACCAA
TAAACTCAAGGTTTTGGATGATTTGAATGCAGCCAAGTTCTCATCTCTTG
GCGTTCTGAAAAATGAGTGCGAAGAAAAAGCCTTAAAGAATTTAAGTTTG
TGGGAAACAGGTCAAAATGGCAACCTTCAGCCACCACAAGCTGTTGGTAA
CGCATTATGCCCAAATGATTGCAGTGGTAAAGGCAAATGTGTCAATTCTA
CTTGTGTATGTGATGCGGGCTATTTATCGACAGACTGCTCTATCCAGACA
GTTTCCGAGCACTGTGGTCGACGTCGTAAACGAAGAGACATCGGCGATGA
TGAAATCGTTCTTCCCGATGATGGAGAGGATGCTTTTTATTTCTACGATC
CCCCACAACCAAATGGTACGCTTCCATCTTTCCCGACACCGAACGGTATC
ACGGAGCAACAAGCTGATCAAGAATGCGATCAAATATTGCGACAATCAGA
TATCGGTAAAGTTTGCTTAAAAATGATCCCTGATCTTGGTATTGATCAAT
ACAAACACAGTTGCAAATTTGACGCAATGACTGTCACCTGGTACAAGTTT
GTTTTATTATCGAGGCGGCCCAAAGAAATGTCACCACAAGAGAACCCATA
AGAAATGTTTTTGTGATACTAACGCTCACATGAATCAACAGATCAATTGC
ACTGCTAACAATGTTGTAGACCGACCACAGTATAACAATGGAAATAATGG
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TCAATGTGGAACAGTTGCATGTAACTGTGCGGTGGCAGTTCGTGAAGGGG
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AAATGGAAAACAATTTACGATGAGAGTTGGAGATTATATTTTGGCTAAAT
CTAATGCTCGATTATTTGAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14288MSTRG.14288Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14288.4.p1.exon19MSTRG.14288.4.p1.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon18MSTRG.14288.4.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon17MSTRG.14288.4.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon16MSTRG.14288.4.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon15MSTRG.14288.4.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon14MSTRG.14288.4.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon13MSTRG.14288.4.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon12MSTRG.14288.4.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon11MSTRG.14288.4.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon10MSTRG.14288.4.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon9MSTRG.14288.4.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon8MSTRG.14288.4.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon7MSTRG.14288.4.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon6MSTRG.14288.4.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon5MSTRG.14288.4.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon4MSTRG.14288.4.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon3MSTRG.14288.4.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon2MSTRG.14288.4.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14288.4.p1.exon1MSTRG.14288.4.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14288.4.p1MSTRG.14288.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000118_pilongenomesc0000118_pilon:393422..414989 -