MSTRG.14257.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14257.3.p1
Unique NameMSTRG.14257.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000117_pilon:1062118..1078706+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14257.3.p1 ID=MSTRG.14257.3.p1|Name=MSTRG.14257.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16589bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:1062118..1078706+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGCTTATGATGTGAAAATGTCCAAACAAGGCAAGACACGTCAGGCGCTT ATTATAAAATTCTGGattcaagatttttctttttgagcaGAAACATTTTC CTGCTAGCACGAATAACTTTTTCGATCGAAATGATTTGGATtggtttttt aacatttttaacactGACGTTCCCTTTGATCCAAACCTTTTCAGTACATG GCAATTGGACGGATTGGACGGACTGGGGCAATTGTGATCAGACGTGTGGT CAAGGTATTCAGATGAGATACAGGTGGTGTATCAACCCTGTACCAGACAA CGGAGGTGATTATTGTGTTGGTGATGGCAATGAAACGAGATGGTGCAATG AAATCCCTTGTGACGGTGAGCTCCTTTTATTCCAAATCTAACATGATACG AATTCATCGAAAATGAGTTCTTTCGTTCGTtagcaaaattaaaatttaat tctATCTTTGTAACTTGAGTCACTGGTACCACTTTtcgattttactgatg gacgcgaTACAATTCTGTTATGAGAGTGCAAGGGACTTTGTTCGACTAAT TTTCACAAACTAAATTTTCACAAGTTcacaaaaattgtaattttacACCA AATTCGAATAATTTTCAAACGCGTACTTTATGACTCACATGGGATacctt attttctttttgcagGATATTATCTCGCCAACTCTTATACAAACTGCAAC CAAACATGCTCTAGTGTGTCAGAAGACTTTTTGTGTATCCCTACTTTCAC CCCATTTACACGAGATCTTCACAATTTCCCTCGTGATCCGAACCATTACA ACAGGACAATCGAGGTGACATGTGAACCGACCCATAACAATCACAGTCAA TCGATCCACCCTTCCTTTGATATGACGGATAAATCATGCCAGGGTTTCGA GCATCCTCCAAAGATGATTGATTGTGCTTCAAAACCAGATTCGCCAACTG ATCGAAGGTTGTGTTATTGTGGCGATGAAGGTACACACTATACAATATGT ACAAtcgtttttaatgatttgattttgtctGAGTCTTGTGTCTTCTGTCT ATGTCTGAGATCGAAATATATTGTGTTTAGGAACAATATGATATCCTGAC tctaatttttggtttttgtaacAGTTGTAGAGATGATGTTGTTCGAATAA GACACATGATAATTGTCTAAATAgtacagaaattttttttgattcctTTC GACCTTAATTTGTTGGTTTGCTTTACTCTAATCTATATctcttatctttt ttttgaacAGACGTAATGAACTTCTTGGAATGGGGTTTGTGGTCACCGTG CACAAAGTCATGTGCAATTGGAACACGCAAAAGAAGTCGTGAGTGTGCTG TAGACGATGAAGCCAGGTTTTGTCCGGAAGAAAAAATGTCCGATACTCAA GATTGTAACGCATTCCCTTGCCCAAGTAAGTCGTTTAAATTTACCAGCTT TCTTTCATATTCATAGCTTTAAAAGGCTGAAGTTTTGTTCTCCCCAAGCT TTACATTTGATATTTGTACTGTTGACGCTCtgcaattcgattttcaaggg aatcggattttcatcgaataagggaatgTATCGTtaacggtgactttcaa tattatccaataatggagcgtattgaatagtagaacgtcgaattagagag cgtcaactgtattttcatttattttttttcagtcaatggTCAATGGGGAA ACTGGACCGACTTTGGGGCGTGCACAGTGGCGTGTGGTTTTGGGCGTCGC TACCGCCAACGTGAATGCAACAATCCGAAGCCAGCGTTAGGTGGTGAAGA TTGTCCTTTTGGTGTGGTTGTTGATTTCTTGGAAGGATGCAATGCTTACC CTTGTCCCAGTAAGATATCTTTGTAACTTTAACACTACTTTTGATCATTT ACCACATTCTGCTGTTTGAGCGTACTAATCCGTCATATTTTAACGTTAAC TTTCCAGATGAATATTATATTATTTAAACCGTCATCTTCAGCCGATTGAC TATATTAAATATACGAAAACTCGGATACTGTAAGATTTAACAACCGGAAA TTGACCATAGACTCGTAATACCGCTTAATTTTGGCTCatagaataaaaaa taatgaattttgttCTGCGTGAAGCTCTCTTTCTTGAAAACGAACACTTT GTTTGATCATAGTTCATGGCGGTTGGGGTGCGTGGTATGAGATTGAAGAG TGTACACAACCATGTGGTTTGGGAGGTGTCAAGAGACAGCGTCGTTATTG CAATTCTCCACTACCACAATATGACGGACGGCCCTGTAACGGTCCTAGTG AACGCTTCTACAAATGCAACGAACATATTGTCTGTGAAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000117_pilon:1062118..1078706+

>MSTRG.14257.3.p1 ID=MSTRG.14257.3.p1|Name=MSTRG.14257.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=60102bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:1062118..1078706+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGAGGGCGGAAAATGTCTTGATCAACTTTCAAACGTTATCATTGGC
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TTCGTTTGGAAGCCATCACAGAGTACGGCAATGGAACGGTTCAGGAGGAA
ACCCATTACACGGGTGTGGGAACGTTTCCTTTTGATGTGGAGTTAGGGAA
GCGATACAACGCAACAGTTTGGGCGATCACACACGAAGGCGTAGGCGTGG
GGACGACACATGAATTCATATCACTGGGTGACTATCCACATTACCCACCC
AACGCCACAGCGTACAACACCTCACTGACCAGCCTCAATGTCAGCATCGA
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ATTACAAAGAGTTTGACAATGATCCGGAAAAAGATAATAATATTACCGCA
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TTATGCGATTGAAGGATTGGCAATATTCACCAATTACTCCATCTTGGTGA
GAGTTGCCAACGTTAATGGTGAAGGGCCTCTCTTCAATTTGTCATGCTAC
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TATGGAATGATTTCACACTTGAGAAATTTGGAATCACTCTGACGTCTGTT
TTCCCTCAGAACACGAAGATTGATGGCCCTTTCACCTACTTTGTATCACC
TGACACGTTCACGCAACTGTCAGATGAGCTGGATTACTTTAGAGTATACA
GAATCACGTTAACCACACACACCAAGAGTGGCCCCGGTCCAACTGTTGAT
TTTTGTCAAGTTACTAATTCTTATTATCCACAAGGTCGTCCACAAACAGT
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TTGACGTGACCGAAGAAGGAGGGGTTATTATGAATTACACCATAACCTAC
ACATCTGTTGATTGGCCAGATACTCTACACACAATCGTTACTGACAGCAT
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TCGTCCAATGGTCCGATATTTTATCCATGGACAAACGTGGTATTATCACT
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CTCACTACCTAAACTTCAAATTGTTAGATTATCTTCAAATGACAATGATA
GCATGACCACATACGATAGAACAGAGATAGTTCCACTTGAAGGTCATTTT
ATCCTTGACGAAGAACTTTTTTATTCGACCTGGTTAACCGGTCTGGGAGA
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CTGGTGTTGGACCGTACAGCCCTGAATTTGTCTTCAGAACAGTGGAAAAT
GTGCCAAGTTTCTATCCGGTCATCAACAGCACTGGGGAAGTTTCAGCTTT
CGAGGTCTTCGTCAGATTTCCGAACCTAACTCGACCATACCACCAGGGTG
TGTTGTTAGGGTATAAAGTGTATTACCAAGAGATTGATTTGATCCAAGAT
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TTGCACCTCCACCCATCCCTGGTGAAGAGGATGAGATTGATGAGAACCTC
TACGAAATGATTTTGTTTGATCTGTTACCAGGAGTCAACTACACTGTCtg
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GCAATGAAACGAGATGGTGCAATGAAATCCCTTGTGACGGATATTATCTC
GCCAACTCTTATACAAACTGCAACCAAACATGCTCTAGTGTGTCAGAAGA
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CTTCAAAACCAGATTCGCCAACTGATCGAAGGTTGTGTTATTGTGGCGAT
GAAGACGTAATGAACTTCTTGGAATGGGGTTTGTGGTCACCGTGCACAAA
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AACGCATTCCCTTGCCCAAtcaatggTCAATGGGGAAACTGGACCGACTT
TGGGGCGTGCACAGTGGCGTGTGGTTTTGGGCGTCGCTACCGCCAACGTG
AATGCAACAATCCGAAGCCAGCGTTAGGTGGTGAAGATTGTCCTTTTGGT
GTGGTTGTTGATTTCTTGGAAGGATGCAATGCTTACCCTTGTCCCATTCA
TGGCGGTTGGGGTGCGTGGTATGAGATTGAAGAGTGTACACAACCATGTG
GTTTGGGAGGTGTCAAGAGACAGCGTCGTTATTGCAATTCTCCACTACCA
CAATATGACGGACGGCCCTGTAACGGTCCTAGTGAACGCTTCTACAAATG
CAACGAACATATTGTCTGTGAAATGGTGAGGGCGGAAAATGTCTTGATCA
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AGCTACCATCTTGGCTTTAAAATTCGTTTGGAAGCCATCACAGAGTACGG
CAATGGAACGGTTCAGGAGGAAACCCATTACACGGGTGTGGGAACGTTTC
CTTTTGATGTGGAGTTAGGGAAGCGATACAACGCAACAGTTTGGGCGATC
ACACACGAAGGCGTAGGCGTGGGGACGACACATGAATTCATATCACTGGG
TGACTATCCACATTACCCACCCAACGCCACAGCGTACAACACCTCACTGA
CCAGCCTCAATGTCAGCATCGATAACTTCCCAGAAGATTTATGGAATGAC
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AAAAGATAATAATATTACCGCATACACTGAAGTCCGTATTGATCGTGACC
CGAACAGAGAGATGAATCATACTTATGCGATTGAAGGATTGGCAATATTC
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CAGAATTGGCCGCCCTTACGCCCGTTGACAACCGCCTTGAGATTAAATGG
AATTATACAGACGACATCCACATATGGAATGATTTCACACTTGAGAAATT
TGGAATCACTCTGACGTCTGTTTTCCCTCAGAACACGAAGATTGATGGCC
CTTTCACCTACTTTGTATCACCTGACACGTTCACGCAACTGTCAGATGAG
CTGGATTACTTTAGAGTATACAGAATCACGTTAACCACACACACCAAGAG
TGGCCCCGGTCCAACTGTTGATTTTTGTCAAGTTACTAATTCTTATTATC
CACAAGGTCGTCCACAAACAGTCGACATTCTTGGAGTCGATCGAACCTCC
ATGAATTTTTCGATCGGTCAAGTTGACGTGACCGAAGAAGGAGGGGTTAT
TATGAATTACACCATAACCTACACATCTGTTGATTGGCCAGATACTCTAC
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TGGAACAGCTATTCATCCTTCCCACCCACAGGGTGCGCTGATCTCCCTCC
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CCTCCAAAGATGATTGATTGTGCTTCAAAACCAGATTCGCCAACTGATCG
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AATGTCCGATACTCAAGATTGTAACGCATTCCCTTGCCCAAtcaatggTC
AATGGGGAAACTGGACCGACTTTGGGGCGTGCACAGTGGCGTGTGGTTTT
GGGCGTCGCTACCGCCAACGTGAATGCAACAATCCGAAGCCAGCGTTAGG
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ATGCTTACCCTTGTCCCATTCATGGCGGTTGGGGTGCGTGGTATGAGATT
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TTATTGCAATTCTCCACTACCACAATATGACGGACGGCCCTGTAACGGTC
CTAGTGAACGCTTCTACAAATGCAACGAACATATTGTCTGTGAAATGGTG
AGGGCGGAAAATGTCTTGATCAACTTTCAAACGTTATCATTGGCTGAGCT
ACAAGTTTTCGAAGATTGTCCAATCAAACTTACTTACAACGGGAAGGACT
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GAAGTTGAGGGCGTTGGCGTCACACAATACAAGGCGGAAGTAAGGGTGGT
CAACCGCCTCCCAATCCACGACAGCTACCATCTTGGCTTTAAAATTCGTT
TGGAAGCCATCACAGAGTACGGCAATGGAACGGTTCAGGAGGAAACCCAT
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CACATGAATTCATATCACTGGGTGACTATCCACATTACCCACCCAACGCC
ACAGCGTACAACACCTCACTGACCAGCCTCAATGTCAGCATCGATAACTT
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AAGAGTTTGACAATGATCCGGAAAAAGATAATAATATTACCGCATACACT
GAAGTCCGTATTGATCGTGACCCGAACAGAGAGATGAATCATACTTATGC
GATTGAAGGATTGGCAATATTCACCAATTACTCCATCTTGGTGAGAGTTG
CCAACGTTAATGGTGAAGGGCCTCTCTTCAATTTGTCATGCTACACCAAG
GAGAGCACACCTGAAGCACCGCCAGAATTGGCCGCCCTTACGCCCGTTGA
CAACCGCCTTGAGATTAAATGGAATTATACAGACGACATCCACATATGGA
ATGATTTCACACTTGAGAAATTTGGAATCACTCTGACGTCTGTTTTCCCT
CAGAACACGAAGATTGATGGCCCTTTCACCTACTTTGTATCACCTGACAC
GTTCACGCAACTGTCAGATGAGCTGGATTACTTTAGAGTATACAGAATCA
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GTGTATCCCTACTTTCACCCCATTTACACGAGATCTTCACAATTTCCCTC
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TGCAATTGGAACACGCAAAAGAAGTCGTGAGTGTGCTGTAGACGATGAAG
CCAGGTTTTGTCCGGAAGAAAAAATGTCCGATACTCAAGATTGTAACGCA
TTCCCTTGCCCAAtcaatggTCAATGGGGAAACTGGACCGACTTTGGGGC
GTGCACAGTGGCGTGTGGTTTTGGGCGTCGCTACCGCCAACGTGAATGCA
ACAATCCGAAGCCAGCGTTAGGTGGTGAAGATTGTCCTTTTGGTGTGGTT
GTTGATTTCTTGGAAGGATGCAATGCTTACCCTTGTCCCATTCATGGCGG
TTGGGGTGCGTGGTATGAGATTGAAGAGTGTACACAACCATGTGGTTTGG
GAGGTGTCAAGAGACAGCGTCGTTATTGCAATTCTCCACTACCACAATAT
GACGGACGGCCCTGTAACGGTCCTAGTGAACGCTTCTACAAATGCAACGA
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AAACGTTATCATTGGCTGAGCTACAAGTTTTCGAAGATTGTCCAATCAAA
CTTACTTACAACGGGAAGGACTTAGAGATTAATTGTGATGGAATGAAACC
CGTCTACGGGCTGAGTCAAATCGAAGTTGAGGGCGTTGGCGTCACACAAT
ACAAGGCGGAAGTAAGGGTGGTCAACCGCCTCCCAATCCACGACAGCTAC
CATCTTGGCTTTAAAATTCGTTTGGAAGCCATCACAGAGTACGGCAATGG
AACGGTTCAGGAGGAAACCCATTACACGGGTGTGGGAACGTTTCCTTTTG
ATGTGGAGTTAGGGAAGCGATACAACGCAACAGTTTGGGCGATCACACAC
GAAGGCGTAGGCGTGGGGACGACACATGAATTCATATCACTGGGTGACTA
TCCACATTACCCACCCAACGCCACAGCGTACAACACCTCACTGACCAGCC
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GAGAGATGAATCATACTTATGCGATTGAAGGATTGGCAATATTCACCAAT
TACTCCATCTTGGTGAGAGTTGCCAACGTTAATGGTGAAGGGCCTCTCTT
CAATTTGTCATGCTACACCAAGGAGAGCACACCTGAAGCACCGCCAGAAT
TGGCCGCCCTTACGCCCGTTGACAACCGCCTTGAGATTAAATGGAATTAT
ACAGACGACATCCACATATGGAATGATTTCACACTTGAGAAATTTGGAAT
CACTCTGACGTCTGTTTTCCCTCAGAACACGAAGATTGATGGCCCTTTCA
CCTACTTTGTATCACCTGACACGTTCACGCAACTGTCAGATGAGCTGGAT
TACTTTAGAGTATACAGAATCACGTTAACCACACACACCAAGAGTGGCCC
CGGTCCAACTGTTGATTTTTGTCAAGTTACTAATTCTTATTATCCACAAG
GTCGTCCACAAACAGTCGACATTCTTGGAGTCGATCGAACCTCCATGAAT
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AA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14257MSTRG.14257Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14257.3.p1MSTRG.14257.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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Position
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