MSTRG.1421.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1421.1.p1
Unique NameMSTRG.1421.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:3236101..3259333-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1421.1.p1 ID=MSTRG.1421.1.p1|Name=MSTRG.1421.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23233bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:3236101..3259333- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTTGGTAAATTGGAAGAAAATGAATGTTATGATATGCGTATAACCGTCA GAAAATTCGATGGCGAACTGGTTGTTTACATTAGAGAAGCCATTGTAACA GGTGAGTTGTTCTTTCAATTTTACATTATTTTATCATAGCTCGTGCCCCA ATGTATAACCCTTCGTGCGTCTTGGCGAAAGGGGAGGCGGAGAACTTTAG CAAACTAACTTAAGGAAACTTATTTTGGCAGGAAATAATTTTGCCGAATT TTGTCTAAATTCATCAAATTCGCTAAAATTAGTTCCCGCCAAAATAAGTT CCCTTAAAGGCTCTGACCATAGTGAATTTTTCATAATTGCCGTGTTTAAA ATGTGTTTTCTGACTGATGTAACCAAAAAAACTATGGCATGCTATACATT TTCTGTTAGACAAACTATTCCTGAATCTGAAAATTCAAAAATTGCATTGA AAAAAATTTGATGAAGAAGAAAATGAAGACTTTTGCGAGGAAGAGTATTT CAACTTTGAAGAGCTTAGTTTCGGCGGAGAAAAAACATTTTGAAACATTT TTGCAGTAAATGGGGTATCTTTTACCGACCAATAAAAAACTTTTGCGGAA AATTTTTGTAAATGCTTCTTTGTCTCGAAATCTTCAAAATAGTGGTTTTT CATCAATTTTTCATCTGGATTTTGCTTAAAAAAACAGTTATAACTTTTGA CACATCTTTTTAGAAAAATTTTCCGCAAAATTTAAAATAGTTCAATTCTT TGCGGACAGTTTGAAAAAAGTTCGAAACAAAAAGGTTAATTACCCATTAA AACTTAGCACTTTTTGTAAAAGAAGGTGATGCAACATATCATTAACGTCT TAACGTTCATAACGTCATTTTTGGCCCAGCGCTCATAGCGTACTGGGCCT TTCATTAGCAACTTTCCGTGTGTGTTTCCGCGCTATAATTTAATAAAGCG 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GTTTTAGCGAAGAAATTCATGGCTATCGGGGAGAAACTCCCTGGAAAGTT
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GTTTGAATGTCGCTGACCTAACCCTTGAGAGAGGCAGTAAGAACATATTG
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GAGAAGTCCCTACATTGTCAAGATAGCTTACCATTCATGTTATTTTCGGA
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CAGGCACATCAATATGAAGAACCGAGAACCCAGTGATGTTATTCCTAAAG
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TGTTTGGTGAAGCATTATCACGCTCACGCACAAAATTGTACATTGTGTCA
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TGATAGAAAGCAAGTTTAAAGGCAATAGGCTACATATCATTCTTGATGAA
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GTTGTCAGAAGAACCGCATAATTCAAAGAGAAGATATGAAAAAGGAGCAA
TCAGCTAATTGCCTTGAGGATCTTGGTATGAAGGAGTTCGAGCTGCTTAA
GACCATGCGTTATACCTCCAGTATCTGCCAATCCGTTTCTTTATCACTGA
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TGTAAATACTCTGGAAAAACAGGTGCTAAGATGATCTCGAAATTTGTCTA
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GAAGTTGATGCTGATATGCAATTCAAGGGACCTATTGCCATTCGCCCGAT
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TTGGGAGAACGAAGTTCCAGTTCTTCTTACAGACTGCAGAGGTTGTCGGG
GAATGGAAAATGACGAGACGAGTCACACTCATTGTCTATGTATAATTCGG
TATCAGTAAAAACACATCCTCTTGGCTATTCTGAAAACTCGTATCGAGAA
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CGATATCTGTCTCTGGATGGCAATTTAATGATATTTTATCCACCCTCATA
CCCTGCAGTAGTCCTAATGACATTACCAGGATCTGAAAGAGAAAGCCTCC
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GAAGTCTTCTGTAAGAAGATCATGAACAGAGCACAGATTGACGTCTTGTT
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CGAGAACCCAGTGATGTTATTCCTAAAGCTAGCTCAAATTTGACGGAAGC
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GTATGGATTGCTGATGAAAATACTTTCGATATGAGGTTTTGGTTTTGTGG
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GTGGAAGAGAAGGATATTACCACTGTTTACCTAGGGTACGAAGAATATTC
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GTGCTAAGATGATCTCGAAATTTGTCTATCCAAAGGGTGTAACAAGTGGT
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GTGTCAGTTAAAAGACATAGAACGAGACCCTATGGATCAGGTAAAAGTGT
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CTGTTTACCTAGGGTACGAAGAATATTCACTACTTCAAGTACAAATGGAA
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TGGAAATGATAGAAAGCAAGTTTAAAGGCAATAGGCTACATATCATTCTT
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TACAAAGTTGTCAGAAGAACCGCATAATTCAAAGAGAAGATATGAAAAAG
GAGCAATCAGCTAATTGCCTTGAGGATCTTGGTATGAAGGAGTTCGAGCT
GCTTAAGACCATGCGTTATACCTCCAGTATCTGCCAATCCGTTTCTTTAT
CACTGAAAAAGGTTGAAGAGCAGGAAGCTGTATACGATATTCCTATAAAA
TCGACCACCAACGAAATTCAGTCAAGAGGAACAGCTTCAATTCCAATGAC
GTTAAATCTGAAATCAAGCAAAGATCAAGCTGACGAGGGTACGAATGTTG
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GAGTTGTGTAAATACTCTGGAAAAACAGGTGCTAAGATGATCTCGAAATT
TGTCTATCCAAAGGGTGTAACAAGTGGTGTTAGACGGAAAGGGGAAACTC
CCTTGCTATTGCAACTTGAAGTATTGACTATGACGAGTCTCGAAATGATG
GTTCATTTGTTGAATACTTTTGTATTAAAGAACAAAAGAGGAAAGAATAC
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CCCGATTAGCCCTAAAAGTAGCAGGTACTAGATATGTCGAGTATACAGAC
AATATACGAGGACAACCCGCAAAAAGTACATCTCACAAGAAAGCTATCCT
CTACAGTTGGGAGAACGAAGTTCCAGTTCTTCTTACAGACTGCAGAGGTT
GTCGGGGAATGGAAAATGACGAGACGAGTCACACTCATTGTCTATGTATA
ATTCGGTATCAGTAAAAACACATCCTCTTGGCTATTCTGAAAACTCGTAT
CGAGAAAATGTTTTGGCAAATAAGAAGAAAGTCGTTCGATTCCAAACTGG
TGCTGGTCAGGAAAAACGATCATTGCAAAGCATTGACAGTGCTAAATATG
TCAACAACAATTTTCCTGATGAAGACATTGTCCTTCCTTATTTGAATACA
ATGGAACCACAGTCCTTTAGAAGTGTTTTAGCGAAGAAATTCATGGCTAT
CGGGGAGAAACTCCCTGGAAAGTTCTATCTGTTGTCTTCTTTCAATGCCA
GAAAACATTTGGAGAAGACACTTGGTGTAAAGAAAAAATGTATCGAAGAG
CAGTTTCGATATCTGTCTCTGGATGGCAATTTAATGATATTTTATCCACC
CTCATACCCTGCAGTAGTCCTAATGACATTACCAGGATCTGAAAGAGAAA
GCCTCCATCAGCTGATCTTCAGAGCAGATGAAAACCTCAAATCGTATCTC
GCGTTGCACGAAGATCTTTTTCAAGTCAAAAGATTTGTTATTATCAATGT
CATTGCGGCTGTTCATCACAAAAGAGAAGACGTCGAGAAGTCCCTACATT
GTCAAGATAGCTTACCATTCATGTTATTTTCGGACTTTGTCTACGATTCT
CAAACTTGGTGGGATAAAATTGAAGACTTCTTGGAGCAAATAGCTAACAA
CCTTGAGGAAGCTGACCAACAAAGCACATTCGAAATTTCTGCACGATCGA
TCCTTCTCGAAGCATTGATCGATGATAACTTTCCAACTCTTTTTGCGAAA
GATGAAGAAGTCTTCTGTAAGAAGATCATGAACAGAGCACAGATTGACGT
CTTGTTAGACAAAGCTCGACATAAATTAGTGAAAGATGCGTATAACCGTC
AGAAAATTCGATGGCGAACTGGTTGTTTACATTAGAGAAGCCATTGTAAC
AGATTCGAGCGAATCTGGAACTCCAGATGAGATACACTGGGTTCTTCCAA
AAAGCACAACGATATACGACAACGAGAAAGTGAAAACATCAAATTCACAC
CTTTGAGATATTTCAATAAGGAAAGAAGAAGATAATGAACGTGCTTTCCC
AGGTACAAACTCTTATCTGCCTGTCCAACTCCAAGCACAACAAACTATTC
CGCACCAGCAGTATGTCTATCAAACAATGCAGCCGCAACAGGCTACTCCA
CTAAGGACATCTACTCAAGTTAAAATTTCTGCTCCCGCAACCCCCATACC
TGTATCACAATCAATACCAGTTGATAGTGATGAAAAACTGAAACAGAATA
AGGCTAATGCCGAGTTTGCGGCAAAAGTTGCTGCCCAAGTTGCCGCAAGA
CAGGTACTTAAATATGCAGCCGGAAGAATTGGAGCAAGGCTTTATACCGT
CGTACTTGGGAGAGAAAGGGCAATGTTACACCAGCAGGCACATCAATATG
AAGAACCGAGAACCCAGTGATGTTATTCCTAAAGCTAGCTCAAATTTGAC
GGAAGCAATTAAACTATTAGTTGACCATAAACACGTAAAAGACAAAACTG
ACGTTTGCAGAGGCAATGCTGTTGTGATACCGAATTCTTTGATCAATAAA
AAGGTTGTATGGATTGCTGATGAAAATACTTTCGATATGAGGTTTTGGTT
TTGTGGGATTTGAGTGATATTTATGGAAGACAGATGTTTGGTGAAGCATT
ATCACGCTCACGCACAAAATTGTACATTGTGTCAGTTAAAAGACATAGAA
CGAGACCCTATGGATCAGGTAAAAGTGTTATTGTCAATGAATTGATTCAA
AGATCAGTGGAAGAGAAGGATATTACCACTGTTTACCTAGGGTACGAAGA
ATATTCACTACTTCAAGTACAAATGGAAAGATTTTGTCAAACTATACCAG
GTGATATAGTTTGTTTGAATGTCGCTGACCTAACCCTTGAGAGAGGCAGT
AAGAACATATTGCCTCTTCGAGAATCATTGGAAATGATAGAAAGCAAGTT
TAAAGGCAATAGGCTACATATCATTCTTGATGAATATGATACTGAAGAGC
TTAACAATAAAGAAGCAAAGAAGATAAGACAACTTCTGGACGGCAGTTTT
TTCAAAAATTGCCAAATCACAATTGCTGTACAAAGTTGTCAGAAGAACCG
CATAATTCAAAGAGAAGATATGAAAAAGGAGCAATCAGCTAATTGCCTTG
AGGATCTTGGTATGAAGGAGTTCGAGCTGCTTAAGACCATGCGTTATACC
TCCAGTATCTGCCAATCCGTTTCTTTATCACTGAAAAAGGTTGAAGAGCA
GGAAGCTGTATACGATATTCCTATAAAATCGACCACCAACGAAATTCAGT
CAAGAGGAACAGCTTCAATTCCAATGACGTTAAATCTGAAATCAAGCAAA
GATCAAGCTGACGAGGGTACGAATGTTGAAATGGATACAGATGGAAATTC
CATGGAAGTACCAACCCTTCGGATTGATGAGTTGTGTAAATACTCTGGAA
AAACAGGTGCTAAGATGATCTCGAAATTTGTCTATCCAAAGGGTGTAACA
AGTGGTGTTAGACGGAAAGGGGAAACTCCCTTGCTATTGCAACTTGAAGT
ATTGACTATGACGAGTCTCGAAATGATGGTTCATTTGTTGAATACTTTTG
TATTAAAGAACAAAAGAGGAAAGAATACAGATAAGAAGTTGATGCTGATA
TGCAATTCAAGGGACCTATTGCCATTCGCCCGATTAGCCCTAAAAGTAGC
AGGTACTAGATATGTCGAGTATACAGACAATATACGAGGACAACCCGCAA
AAAGTACATCTCACAAGAAAGCTATCCTCTACAGTTGGGAGAACGAAGTT
CCAGTTCTTCTTACAGACTGCAGAGGTTGTCGGGGAATGGAAAATGACGA
GACGAGTCACACTCATTGTCTATGTATAATTCGGTATCAGTAAAAACACA
TCCTCTTGGCTATTCTGAAAACTCGTATCGAGAAAATGTTTTGGCAAATA
AGAAGAAAGTCGTTCGATTCCAAACTGGTGCTGGTCAGGAAAAACGATCA
TTGCAAAGCATTGACAGTGCTAAATATGTCAACAACAATTTTCCTGATGA
AGACATTGTCCTTCCTTATTTGAATACAATGGAACCACAGTCCTTTAGAA
GTGTTTTAGCGAAGAAATTCATGGCTATCGGGGAGAAACTCCCTGGAAAG
TTCTATCTGTTGTCTTCTTTCAATGCCAGAAAACATTTGGAGAAGACACT
TGGTGTAAAGAAAAAATGTATCGAAGAGCAGTTTCGATATCTGTCTCTGG
ATGGCAATTTAATGATATTTTATCCACCCTCATACCCTGCAGTAGTCCTA
ATGACATTACCAGGATCTGAAAGAGAAAGCCTCCATCAGCTGATCTTCAG
AGCAGATGAAAACCTCAAATCGTATCTCGCGTTGCACGAAGATCTTTTTC
AAGTCAAAAGATTTGTTATTATCAATGTCATTGCGGCTGTTCATCACAAA
AGAGAAGACGTCGAGAAGTCCCTACATTGTCAAGATAGCTTACCATTCAT
GTTATTTTCGGACTTTGTCTACGATTCTCAAACTTGGTGGGATAAAATTG
AAGACTTCTTGGAGCAAATAGCTAACAACCTTGAGGAAGCTGACCAACAA
AGCACATTCGAAATTTCTGCACGATCGATCCTTCTCGAAGCATTGATCGA
TGATAACTTTCCAACTCTTTTTGCGAAAGATGAAGAAGTCTTCTGTAAGA
AGATCATGAACAGAGCACAGATTGACGTCTTGTTAGACAAAGCTCGACAT
AAATTAGTGAAAGATGCGTATAACCGTCAGAAAATTCGATGGCGAACTGG
TTGTTTACATTAGAGAAGCCATTGTAACAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1421MSTRG.1421Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1421.1.p1MSTRG.1421.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1421.1.p1.exon10MSTRG.1421.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1421.1.p1.exon9MSTRG.1421.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1421.1.p1.exon8MSTRG.1421.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1421.1.p1.exon7MSTRG.1421.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1421.1.p1.exon6MSTRG.1421.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1421.1.p1.exon5MSTRG.1421.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1421.1.p1.exon4MSTRG.1421.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1421.1.p1.exon3MSTRG.1421.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1421.1.p1.exon2MSTRG.1421.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1421.1.p1.exon1MSTRG.1421.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:3236101..3259333 -