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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000117_pilon:614879..622609+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14205.2.p1 ID=MSTRG.14205.2.p1|Name=MSTRG.14205.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7731bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:614879..622609+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGTTGGCAGGTTTTTCATATGTCTAAAAGTAAGTATTATTTTTGTATACG
AAAGAGGTGAATAATTGTGTTTGCCCTTCCTATTTTTGAGCCACAAAAGT
GTGTGGGTGGCATTGAACTCGAACTCCTCTAAGATATTTAAAAAAATTGT
GAGTGTTCAATACACCTTTCCCGTAATTATTCAAACTTCTGCTACGACCC
TGCCGATTCCCCGGACAATCCGGGGATTTCTTGTAAATGTCCGGGAATTT
TaacatttattttgaaacttagtGCCCTGGACGCCCCGGACTTGGTGCGT
TGTTTGCGCTACGCACAACGCACGTAATGTAAAGATAGTGAAATATGCCT
TACTGGCACTGTGATGTGCCGTACTGGCTATGTGGCGTGCCGTACTGGCT
ATGTTGCGTGCCGTACTGGCCGCGCGACGTACTCTAACGGCCGCGCGGCG
TGgggttattttaaaaagcatggtACCCCCAATTGGTGCACCAATTGGGG
TACTCATTGGGGTACCCATTTAATTTACTGACCAGAATTAAATCGTgtga
aaaagaataacatacgcttttaaaaataaatgtagagtgatataattaat
acatgtaataataacatgtaatacaaaataatataatatgtGTTTATGCT
CGTTTGCTTTAAAACACGTGAGAATCAAAGACTACTTCctactgtcaatt
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aaagcaaatttagccaaatgaaagctaaaaatcgatggattatgcagtca
ttcacgccgagctggaattattactttacgccaactgaaaatcaaacaat
ctttgttgtaagtacccttacgccaatgtgccaaaaacgtttcagttgta
cgccgaagatcttcggcgttagttacacgaaatccatactggaCATCATA
TAAATGTAATTCTTATTCAAGGCAACCTTAGAACTATTGTAttttatgat
gtcatcaaaatttttggtaGAAAGTGTCAATTTagtgataaaaatgacaa
aagaaaatgtcactGCTTTTCTTTCTCTAAAAGCATCTCTACAGATTTTC
CAAGGCTAAAATGACTGTCAATTTGTATCTTTTTGTACAATGAGCATCAC
TTTcagtataataaatctttttggAGGAATTTGACTTACGATTatcatat
ttcaatattttttaaatatttttgcaagAAAGTGTCATTTTTTGTCAGCA
TTCTGACATGTAAAAAGAAGAGATATTAATAAGATGTTACTAGCCAGCAC
CTTACAATTTTCCTGATTTTAAGCTATAATATGATGTTGGTTACTGGATT
GGAATACTGTTTGGTTTGGTTACTGAATTTATTCTGGTCTTacttattct
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TGACAAAAGTTTTGTGACAATCTTAAATCTAACTTTCTTAAATCATCAAT
GAAAGATTGTAGCACTATATTATAATGAAATTAAGTGTCATTTAACAAAA
TTAAGGACAGAAAGTGGTACCCCAACAAGTACCCCAATTGGTGCACCAAT
TGGGGTaccatgctttttaaaataacccCGCGGCGTGTATACCTGATCGT
GCGGTACATTTAGATGGTCGCGCGGCGTGCCTCTACGGACGCGCGTGGTG
GTGCACAAGTTACATGTCCGGGgaaatatagttttttttcGATCCCCAGA
CATTTACCCCGGATTGTCCggggaatcggcagggtcgtcTTCTgatcaga
aatggcccgggaaaatgtgcgctccaccgttgtgggTTTttagcttctaa
cttttgatagcctAATTTTGGGGGCTAATGGCTTTTGGAGCCTTGGATGA
CGAGCagtcatatttaaaaaaaatcctttctgattggatgaaaggACTTT
ACCTTCAtctaatatgattttttttaaacaattgctatcaattttttgat
tggacaaaataaaacaaatgatatcGCCATGATTGGATAACAAAATATCT
GACACCTTCAAGAAAGCCTAGTAGGCGTAAAGCTAAAGGCCCAGCCAGTG
GTGGTAGTGTCGACATATTTTTCTGTTGCAGAGTCGCacgggggcactca
tatggtccaaccccttaagggtaggtttttcgagacccttgaaatgcact
gtaaggctGTACTTTTGGtagagtgcactacaagggtcttcttttaggtG
GATACAATATATATAAAGGTGTTTTTAGGGACTGCTAAATTGCAAGTCTG
ACAGTATAAATATAcgatgtatctttatagttttgactcgcactcatttt
gatctgttttgcaTATTGCGTCGACATCTCAGTTTCATTTTTGggcgatt
tttgaaaaataagatatGCAATCAAACTAGGTGAGGGttttcactgctca
agagcTGTACTGTAAGCTCAAATAGTTTCCAAACAGCCTTAAAGATCGAA
GCTAGTAAGGAAGGTCACAAAATAGCATACagtacatattttttataaga
accagtagcGGTGTTGCTCGCATCCctcagatccttggttagaaaaagct
atacctgtttacttttttcttgccagattcaacaagccatcaaccaacaa
aattaatactgacatcaaaaaattcacacgacctttccactagacacttc
taaattatctgccattatgaagatgttccgaaatcaaccaatcgggttta
caatcggaattcctctgggagttagcgagtcgggaaatgtaaagttacGT
AATAGGTAATACATAATTTTCTGGGGGTTAAAcgtataaataaaattgaa
atggtttgtttttttcttcattatatatttaagtttccattatcaaaatt
ctagaaatgctaGTTTATGGACCATATTAGAAAATTgttatatatttcgc
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atcgtaagattctcgggtcgtcttattgtttgttccttttgtcgagtctg
tcggtcctattgttcatgctaaatccatacacgatgacgtcaatgtttgg
cggcatacctgaaaataaaaacaaaaatattatcatattatttttgcatg
aattacgctaccttatacgtcattatagaattatacaaaacgaaagCGAG
TCTAGACCGCCCGCCTAGAGTGCAggccctaatattttttctctcgcggt
cttcaggggaaaacgaaagtgatcgatatattcttcgaaggaagaatttg
ccaaacaaacccctagacaaaaagatgtattttgaggttgggaatggatc
ctgcgaagatgaaaaaattttgactaggcgtttttttggcaaagccaaaa
actctaatttttttcttccctcaagctaaaaaggttacgggttttgggca
atcgaggcaaaaatcagcaaaaagctggtgttttccgtaaatctgagaat
tgcgataagatcctcactgAGTAGATTTATGGCAaggcttggctgttctt
attttttggcactttgagcctggaATGGTTCTTATCCTGGTATTATAATA
GGGTGAAATGtaggtattttaggctttacACCTAATCTTTACTACtatga
cccctaaattgcttgaaattgagtattCCAACATTTAATATTGAATGAAT
TTCTCTAAAATTGATATTTCTGGTGAAAACCGGTCAAAATGGTAACCAGA
TTTTCCAAAAGATCTAGGGTATgtgcagtagcgtggtgggttgACCAAAA
TTggggcaaactggggaggcaatatgtgacttcccaagcgatttaaagta
cctgaaaatcagacCGGTCTTGGTCCGGTATTACGAGCGGTCTAGTAgcg
gtcaaatttttgtttttagatcgGCCTCCAGACTTTCTAGAAATGTAATC
TCTAACGGTCGTGGCCGCTTCTAGACGTTCGTGGTCGATCGTTGGACCGG
TCCGGGCCGTTCGCTAGACCGGTCCGGGCCGCTAGTTAGTGATTTTTAGT
AACAATTACATCAGAAAAATGTTGTAAAAGGATGTCAACCGAGCGATCGG
GGCCGGTCCCCTAAACTCGTAGCGGCCTTTTGGTAAAATTTTACCGGTCA
TTTACCGGCCCTCAAAAGACCGTCTAAAGACCGGTcccattttcaggtac
tttaaatcgcttggggagtcacatatttgcaaaagttttgattttgggGT
CCCCTATGAAAGTAGTACCAGGCTAGAAATAGTGCACAGTACGCCAAATA
TATTCGGAGTGAGGCAGTGATTACTTTTGGCGTATTGGCGTAAGGAACAG
ATATAAAGTAAAATATTGGCGtaagtcaaagcttttcaagacgaGATGCC
ATCCTAACGCCTGATTTCTTTATGCCAGGATTATTAAGCTTTGCCTCTCC
CTTGACGGCCATATAACAACGTAGAGTGTAAATAGAATAAAAAGCTTATT
TGGAGCAATTTTTAAGCatgagaaaatcaaatatcCCAGGGTTTTCGGTT
TTCGGCGTAGATAtcaattaaaaataataataattcggCGTGGACTTAGC
ATCGTTTCCACACTGGACTAGCATAGAAATTGATACGCTGTCAGGTTATC
CTGACGCTAAGAATATGCAATGTTTCTGAAGTTATTATGTTATTAATTTT
GGAGTCAAAATGGTCTGTTGCATCCTTTAgtatatcattttgaaaaacat
aattATTTGCTTCTGATcacatactttaggcgtacaaactttcgcgagca
gaaactttcgcgattttcgagaattttggcccttttagcgaaaataaata
tctttaaaaattctaggaagggccattcgcgaaagtttatgcttgtgaaa
aatccttgacaaaatagaaaatctgtaaaacttcaagctttgaataaaat
gaaacttttatggcactttttagcctgctaaaagactaataagtcaaagg
acaaatgtttcaagccaatccaagaagtatttgtccctctaagccatttt
tcatgtgaaaattctcaattttacgtcttgatttgcgaaagtttatgctc
tcgaaaaatatttttccgttaaattcgcgaaagtaaatgtcgtgaatttc
acgatttttcgtcctcgcgaaagtttctgctcccgaaagtttgtacacct
aaagtatAAAGTCTCTTTAACTGGAACCTCTATGACACGGTTGTCTCCTT
tactcaaacaagttttatagTTCCTTCAGTTCACAATgacttataaacct
tacttcgtaactcgaaatttccctAATTccaacaaatttgtgttccttca
gtgtttgagttatggagactcaactgtactAACAATGAATGTTGTGCTTT
TCAGGTTAAAAtgtgaaatgaaatgaaagggAAAATAAAGACGTAATGTT
CTTGTTATATGTGCAAGCTGTTTCAACCTTTGCATGCTTTATTATTGGCT
TTTTGATCTCCATTCCAATTGGATCGAACCGGTCTAAACATGACGGCCAG
TGTTTACTATACGCCAATCTTGAAATTCATGGCCCTCCAGAGGATGGTTT
GATTAGCAAGAACTTGCTGCCCGGCTCAAGACTTACTTGtgatttttgca
tattttctgGAACTGTATCTTTGATTATTGGATTGGTGTTGTTGATAGCT
ACTATTTATACTATTCTACAAAATGGATTCAAACGATTCAACTTGACTAG
ATATATTGGTGATCGcgagaaaaggaaaaataagtAAGTTGTCATTTTTC
ACACTGATTCAATTGAGTGGACACATCTAAAATTTGCAATTAAACTTATT
CAATTTTGTTCATTTGAACCGTTGTTTATTACATTAGTCGCATATTTCCA
AGTCAGCTAACAAAATCCTGCGAAAACTAACATTCTAAGATTCTTTCTAT
TTCAGTAAGCCGTTGATAGGAGCTTGGATAAATTTTTGTAGTGCAGCTGT
CATGGCATTGTTGACGTTCGTCACAGCTTGTCTCATATCATCTGGCTTTC
ACGAGTTCTGTGAGCAAGGTCTGAAGAATATACACAAAGCTGATCTCGGA
AGGTTTGTCTTCTTCCCAGtccaatctttctttaatttcaatatttgcat
tttttgaagaaattattaTAATTTTCCTCGTATACTTTGAGTGTGTGAGG
CTGATTCAAAAGTTTTACGTAAGTATCCCCTCTTTTCATTGTTGAAGAGC
TTGCATAAAGAAACCATTTTTGGAGTTACTgattttaaacatttataaTT
TTGTTCATTCCGATTCATTTCACAGCTGTGACCTGCTTGAAAGTTATGTC
GGTCCATTTTATAAACAGTTGACAATAGCTCAGGTAAGCTCATCCTCCTA
CCAAATCCATACTTTTAACCCTccaaaaaaaaggattggaaagGTCGATG
AGGAAGGgggatgttcttaaaaagcACCAATCCAAGCACCTGAAACAGTT
TCTATTCTCGTCTTTATCAATATTGAATTTAGCTATACGGATATCTAAGT
CTCTCAGGGTTATTCGTACATATTCTTCCGTGCTAATGTGTATAGTTCTA
TATGCTATATTATAACAGAAGAGACTCAGAACCACTTTTTCTAACTACAA
CCcgtcttttgtcattttttaataGGTCAGCGCGTGGTTGGGAGCGCTGT
TTTGGATCATTTTAACGGTGACAGGTCGAATGAATGTCCGAAATATGCGT
CCGAAACGAACCCGGTTAATGGCGGATGACGGTGAAGACTATCAGCAGAT
CGAAAGTCCCACCCATTTGTGACGTAATATTGATTACACTGATGACGTAA
TCAAATTAACATAGTAACGTTCCTTCTTCAACTACTGGGTGAGCTAAATC
GAATGTTTGTAAGTAATAAAACATTCAGTGCTGATTGCTGCAtaacggaa
atttttttttgaagttgcaAAAGGTCGAACaaattattatacattttttt
gctgaagaGACAAGATTTAGCTTGTGTGACTacggttttatttttttggg
tgTTCACATTTTTCCTTTCGATGATTAGGGGTTAGTTTTATTTCAGACCT
TTTTACGTCGATGattaaaaactgttttcctGCTATCATACAAGGCTGTA
GAACTTTGACAGGTATCAAACAAACTCCGAACTTTTCAGGGAATATTGAC
TATCTTTTCATAAGAACTGGAtttttttAGGAGTGTTAAATGAAACATCT
CAGGCTAGGTAGAAGTATAGAAAGtagaatttatatttttaaacttttaa
ggATTAAACAAATATAAgatattttatgatttatgaaaATTAGGATTATG
TTCAGTTTATTATGAAATCGATTTTGGAGAACTTtttgtctttatgctga
cacTGTACATATCTGTAAgtatttttaagaaagaaactttttcttacgGA
GATTTATTTATTAAGATCTACACAAGAGTTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000117_pilon:614879..622609+ >MSTRG.14205.2.p1 ID=MSTRG.14205.2.p1|Name=MSTRG.14205.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2760bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:614879..622609+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTCTTGTTATATGTGCAAGCTGTTTCAACCTTTGCATGCTTTATTAT
TGGCTTTTTGATCTCCATTCCAATTGGATCGAACCGGTCTAAACATGACG
GCCAGTGTTTACTATACGCCAATCTTGAAATTCATGGCCCTCCAGAGGAT
GGTTTGATTAGCAAGAACTTGCTGCCCGGCTCAAGACTTACTTGtgattt
ttgcatattttctgGAACTGTATCTTTGATTATTGGATTGGTGTTGTTGA
TAGCTACTATTTATACTATTCTACAAAATGGATTCAAACGATTCAACTTG
ACTAGATATATTGGTGATCGcgagaaaaggaaaaataaTAAGCCGTTGAT
AGGAGCTTGGATAAATTTTTGTAGTGCAGCTGTCATGGCATTGTTGACGT
TCGTCACAGCTTGTCTCATATCATCTGGCTTTCACGAGTTCTGTGAGCAA
GGTCTGAAGAATATACACAAAGCTGATCTCGGAAGCTGTGACCTGCTTGA
AAGTTATGTCGGTCCATTTTATAAACAGTTGACAATAGCTCAGGTCAGCG
CGTGGTTGGGAGCGCTGTTTTGGATCATTTTAACGGTGACAGGTCGAATG
AATGTCCGAAATATGCGTCCGAAACGAACCCGGTTAATGGCGGATGACGG
TGAAGACTATCAGCAGATCGAAAGTCCCACCCATTTGTGAATGTTCTTGT
TATATGTGCAAGCTGTTTCAACCTTTGCATGCTTTATTATTGGCTTTTTG
ATCTCCATTCCAATTGGATCGAACCGGTCTAAACATGACGGCCAGTGTTT
ACTATACGCCAATCTTGAAATTCATGGCCCTCCAGAGGATGGTTTGATTA
GCAAGAACTTGCTGCCCGGCTCAAGACTTACTTGtgatttttgcatattt
tctgGAACTGTATCTTTGATTATTGGATTGGTGTTGTTGATAGCTACTAT
TTATACTATTCTACAAAATGGATTCAAACGATTCAACTTGACTAGATATA
TTGGTGATCGcgagaaaaggaaaaataaTAAGCCGTTGATAGGAGCTTGG
ATAAATTTTTGTAGTGCAGCTGTCATGGCATTGTTGACGTTCGTCACAGC
TTGTCTCATATCATCTGGCTTTCACGAGTTCTGTGAGCAAGGTCTGAAGA
ATATACACAAAGCTGATCTCGGAAGCTGTGACCTGCTTGAAAGTTATGTC
GGTCCATTTTATAAACAGTTGACAATAGCTCAGGTCAGCGCGTGGTTGGG
AGCGCTGTTTTGGATCATTTTAACGGTGACAGGTCGAATGAATGTCCGAA
ATATGCGTCCGAAACGAACCCGGTTAATGGCGGATGACGGTGAAGACTAT
CAGCAGATCGAAAGTCCCACCCATTTGTGAATGTTCTTGTTATATGTGCA
AGCTGTTTCAACCTTTGCATGCTTTATTATTGGCTTTTTGATCTCCATTC
CAATTGGATCGAACCGGTCTAAACATGACGGCCAGTGTTTACTATACGCC
AATCTTGAAATTCATGGCCCTCCAGAGGATGGTTTGATTAGCAAGAACTT
GCTGCCCGGCTCAAGACTTACTTGtgatttttgcatattttctgGAACTG
TATCTTTGATTATTGGATTGGTGTTGTTGATAGCTACTATTTATACTATT
CTACAAAATGGATTCAAACGATTCAACTTGACTAGATATATTGGTGATCG
cgagaaaaggaaaaataaTAAGCCGTTGATAGGAGCTTGGATAAATTTTT
GTAGTGCAGCTGTCATGGCATTGTTGACGTTCGTCACAGCTTGTCTCATA
TCATCTGGCTTTCACGAGTTCTGTGAGCAAGGTCTGAAGAATATACACAA
AGCTGATCTCGGAAGCTGTGACCTGCTTGAAAGTTATGTCGGTCCATTTT
ATAAACAGTTGACAATAGCTCAGGTCAGCGCGTGGTTGGGAGCGCTGTTT
TGGATCATTTTAACGGTGACAGGTCGAATGAATGTCCGAAATATGCGTCC
GAAACGAACCCGGTTAATGGCGGATGACGGTGAAGACTATCAGCAGATCG
AAAGTCCCACCCATTTGTGAATGTTCTTGTTATATGTGCAAGCTGTTTCA
ACCTTTGCATGCTTTATTATTGGCTTTTTGATCTCCATTCCAATTGGATC
GAACCGGTCTAAACATGACGGCCAGTGTTTACTATACGCCAATCTTGAAA
TTCATGGCCCTCCAGAGGATGGTTTGATTAGCAAGAACTTGCTGCCCGGC
TCAAGACTTACTTGtgatttttgcatattttctgGAACTGTATCTTTGAT
TATTGGATTGGTGTTGTTGATAGCTACTATTTATACTATTCTACAAAATG
GATTCAAACGATTCAACTTGACTAGATATATTGGTGATCGcgagaaaagg
aaaaataaTAAGCCGTTGATAGGAGCTTGGATAAATTTTTGTAGTGCAGC
TGTCATGGCATTGTTGACGTTCGTCACAGCTTGTCTCATATCATCTGGCT
TTCACGAGTTCTGTGAGCAAGGTCTGAAGAATATACACAAAGCTGATCTC
GGAAGCTGTGACCTGCTTGAAAGTTATGTCGGTCCATTTTATAAACAGTT
GACAATAGCTCAGGTCAGCGCGTGGTTGGGAGCGCTGTTTTGGATCATTT
TAACGGTGACAGGTCGAATGAATGTCCGAAATATGCGTCCGAAACGAACC
CGGTTAATGGCGGATGACGGTGAAGACTATCAGCAGATCGAAAGTCCCAC
CCATTTGTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000117_pilon | genome | sc0000117_pilon:614879..622609 + |
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