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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000117_pilon:561870..580854+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14201.5.p1 ID=MSTRG.14201.5.p1|Name=MSTRG.14201.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18985bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:561870..580854+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAACATGATAAAGAGGAAAGGAAAGGTAAACTGATTTCTTTTGACCATTC
CAGAACTTCAAATACCCATGATTTAGGCGTGAGTGCCATTCTGCtaacat
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ccttattgctatttaagtttcatcatcaggtaggtccattcagcatgttg
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caaccctgaccctaactgatccTGACCCTAACCAACATAAACAATTTTCA
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TTATTTGCATCAATGAGAAACAATCTAAAATATTTAATGTTATATACAGA
GATGTTTTGTTCCTAAgacgtgaacaactgaactgttcacatgatagaga
aatgtaaaaaacaacttttttaaaagaacatcttcctaaagagaagaTTT
GTTATGGTTATTTCTGTGTAAATCACAATGTTTAATTCCTAAAACGTACT
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catgttctaaaGAGATATGTTTCAGCCAATCAAGTTTTTCacaattctca
acttcagttgagctacaatctgacaatgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtc
tgtctgtctgtctgtcacaaaaactttagggcagcctgtagacttcaaaa
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tggggggtgtttttttttttctttttttgaaaattttgatttttggggcc
tggggacgagtttttcgccaaaatgaggctaaaactttagggcagcctgg
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ggggtctagggacgagtttttcgccaaaacgaggctaaaactttagggca
gcctggagacttcaaaaatgcttggatttggctgaaattttgcacacttg
ttccttgggtgaatatctgggggtgtttttttctttttttgaaaattttg
aTttttggggtctagggacgagtttttcgccaaaacgaggctaaaacttt
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gactatatgTAGCCTGTGCTTGAAttgaaaacgcgtatcgcctagtaatT
TGTTACACACTtgacaccgggcagaatgctaatgaaaggtccagtacgct
aaagctagctgggccaacATAGACCGAacaaagtctaaaccaggctctat
caacaaaaacactgcaaaaacgaaggtaacagacagacagacagacagac
agacagacagacagacagacagacaaagtgacatacagactacggctatt
aatacaTAAATTTGGTGTGCTAGGCCTCTTTTAAATTTGCCAGTGGgcaa
atttttctcaattttgagaaatgttaagtaaaattttcaaatcaagaaaC
TAATAATGGCATGACCAACAAATAGACttcaaaaaacaattaattATTTA
ACATGACATTATTGTTTTGAGAAAGGTTTGCAGAGATTCTCAATCACTTT
TGTTCTGCTgtaaataaaggaaaaaagaatTTGGTGGGGTTGATCTTTTT
TCCTAAAAAGCTCTTTAGTGCATAGATACAGAAGAGTCTCAGGGTGCTCA
AAATATTCATAATTCAAGCTCTATTATATTTTAGAATCATATTTTAAagg
ttaaaattcaaaatgtcaagCAATGGCAAAAGACAAATAACCAACCAAGG
TTTTAATCCTCAAGGGAATCAATACACCTCATATAATGATGGTAGCTATT
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TCCTATTATGCACCAACTGGAAACAACTCACAAACAGGTTTTTACAAAGA
TAACCATACCGggaaaagttggtatcaaaactCACATGGTGATAAGAAGT
ATTACTGATGGTGATAGATGATGTtgttgattaaaaaagaaaggaatatA
ATTTAAAGAGAAGGCTTACTAATTaaaaaaaGAGAAGATAGAAATATTGT
GTTATGTaaacatttttatattattttttattttgcatcagattatattg
ttttgtacatgcaccttttgtagttttCACACTTAGCAATATTGAAACTA
AATACACTGCCTAGTGTCACTATTCATACAGattttcttttacataaccc
attgttttattatcttttatttttgattgttttttggtaaaaattaaGGT
ACCACGTTCTTAAAAAACtgttctttcaaaaaatgtctGACATGATTTAA
GTTTTGCAGTTTAAAGTAAAAAGTGAACTAGAATTTTACCTTCAATGCAC
TATAAATTCTGAGCCCGTTTAGGCCACATTTATTATTGATTATTGATCAT
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atgaaagaaaaagggaaatttacTATTGATGAGTTGGTGCTATGCTATGA
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ACTATTTGAATTTATcttacttttatttaaaatatagCTTACACCCAAGA
ACCTTAATGGAGGACTAGCCAAGGTTCTAAGCTACTAGTATGATTTAAAA
AGATGTACACTATTAGCTTGTTGCAAAAAGActcaataaaaacttttgcc
aaaGACTTTTCTTGTATTCCCAGGCAAGGCAATGAAAACATTTTGTtatt
aaaggaaaaaaataataacatctaCCTTATTCCAAGAGCAATTGAAAAAT
TAtaagctttttgtttttgtttggaacgcattattttatcaaaacaatca
gaaaCCATAAATCTGTTTGGGTGCAATAAAACAAGCAGCAAGTAGATTTT
CTTTGCAATCAGatgtttgaaacttttttttaatggaggTTAAACATCAC
GCCTGACACTCTGGATATAGAGGACTTTATTCTTAAAAAGAGCGCTCAAA
ATACTTCTACATATTCTACGCCTTTTGATTACATACTTTGTGCAAAAATA
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agtttattttaaaaaataatttccattttcaactttaataatttttctgt
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AAGTCAACGAGTATTACATTCATTTCCAAGGATGGAATAAAAGGTaagct
tgtttaaaaaaattaatcattttaCTCTCACTACTTGTAACTGTGCAAAA
CATGCAAATCAGATAAATAAGTTTAAATATCAGTGACAAACCAtgtactc
taggggctgagttaggtcccgtatgcgcatcggcgtatagtcattttttc
ttttgatcatgaaagtatagtccttgaagagtcagaaaacgtgtgtggcg
ttatttggatcaggcacaaatttccataatggcggattttagattttcaa
ccctttttagccctcttgcttgaaaaaaattttcttttgactttaaacat
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ggtcagaatcatggtctgaaaatttcgttatctggagatatgaagcactt
tcgatttcgattttttgaaatgactacttttggttccagatttgcgtggc
tgtaacatttgattggcttacttagtttacttgaaattttcggagggtct
tgcctaccgttcaaataataaaattcaggaaaagtttttagtctacatga
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ttgaaaacgaaagtacttcatagctcgagaaaataaagaaataaagctTT
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ATCAAGTATACATTTTAACTATTTACTTGAAACTTGACTTTGAATTAATT
TAAGCATCCCAATATGTAAATTGTCTACTTAAAGACTAATATTACGCAGA
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TTGGTGTTCTGACAGGCtcgctttgttttttttggggggaattccctgag
attttctcattagttttttctgtcgttttgtttattttgaatttaatatt
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TGggaattatttttattgaataagaattttcatttctttctgtTCATAGA
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TTctgaagagaaagaagaatcTGACAAACAGACTCCTGAGGTCGAGGTTA
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TTAAACTCTGGGATGAATTAGTTTTTGTAAGCCAGAACTATCTAAAAATG
ACTGGAACAACCAATGATAATGGGGGGAGGGGTTTTTCATGGTTTCAGCC
TTgaattttgggcaaaattttaaggggaaaattcttgaaattttcagaaa
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aagttttttttcttcttaaataTACCTAATATACCGTTTAAGATAGTAAA
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ATTTTTTGGCCCCTGTAATGACACACTCTGTAATAAATGCCACAGTTGCA
ATACCTGCTGCACTTTGTAATACCAAAagctgacacactttgtaataaaa
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ttttttaaccaacgaaatttttaaatattgtatAAATCAGCTATGAAAAG
AAGATTAGACATGGAATGTTTTAACTTTCATagtaaaaaggaaaattaaa
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AGGTATGTCAGACAACTTCACATACATGTATATAACTAAAACCTTTGCAT
TCTGTTATATTTCTTGTCTTAACGGTTTTGAAATCTTAGAAAAATCtcta
agttttgttttgaatggaAATTTCCCTCCATTATAAAGTGCGTCAGCTTT
TTGTAATACAAAGCGTGTTGGTTTTTAGTTCTTTCTATCTGATTCGCATG
CCAGGGGTCATGTCTGTAATAAATTCCATgtgtattttattcaaaaaatt
taaggGGCACTTTAGAATAGAAAAAGAAGATTTAAGGGGGGATTAGGAAA
TAAGGGCACAGTAAAAAATTAATTCCAAATTGAGTGGGGAGAAATGGGGT
AGTTTACTGTTTAAGGGGAGACGGGAAAACATGGATGAAACCATGTTTTA
TTTAAGTTCTTGAGCTGTTCTTGCTTCCCTACTGATATAAAGCAACAATA
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gattttttggctcaaagatGCATATCAGCAATGTCTGAAATTTAATTTAG
TCTGGTTTCTTGCATTCATTGTACACTTTAATGGGTTAAATTTTCGtgaa
gattaaatttcgcaaatgTGGGTGTTATCCACGAAAGTCCCAATGAAAAT
TTGGAAATGCCTTATCCGCGAGACTACAAGTGTGCGTTTTGAGAGGTTAC
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agaaaaaaaatatcatgcCATGACATGAGATGATttgcaaaacaaaaaga
tgataGACCAAGATCCGAAGTTCTTTATAACAGCTGCCCAAAAGCTGCAA
TTTGGGATTTGAAATTGAGGCGAGGAATAAAAGGTCTATCATGCATTTTA
GAGTTCTCCGTTATAAATGATGTCTGCAATTAGGACGAACTATGGCTGGG
GCATTCCCACACATAGCACCATTTCTGACAAGACAGACAATTGAAAATAA
GAGATTTgaattcaatattttgaattcaatttCATACCATGATttgtttt
ttgacgtcaaaaatcggTTTAAGAGCAGAGAGATTGTTTTCAAGTTGACG
ACGATACGTAACAGTCAGTGTCAGTTTCTGAAATGCCAATTTTGGAGTGG
CTATTTAGAATGGTTGGAGAGAAGAGCTGCAAGACTCTATTGAGAATATC
ATTACAGCTGAAGAATGGCCAAATTTTCGAAATGAGATCTTCATACTCGC
ATTCCTGGTCTGATTTGGATGCATCTTGACTTTGAGGAATTCGTCCGTGA
ATTCAATCTACTTAAGATCGGATAATATCTCATGTACAGGAAGAACTTGT
CGTGAAATGTTTAGTTTTGATACCGATGAGATCTATTCTGCGCTGATCAA
AGTCCATAATTCTTTCAAGCTCACATTGCATATGGTTTTTGTGGTCTATC
AATATTAAATACCATTGAAATTTTTccgattttgctgaaaattggACTCA
GTAATAACTTTATCTTGGGTGCATCGGATGTCAATTTAGTCATTAATAGT
TGCATTGAGATCTACAATAAACTACAGTCTTGCACACAAACCTTCACTTA
AAGTCTGCAAATAAAGTAACAGTCTCCGTTTCCCTATACCAAAAGGTCAG
GAAAGAAGTGAGTGGATAACTGAAGGGGAAGGGGGTGGGAAATGAAGGGT
ATGGGGGTAATGACCAGACTCGGAAGGAAACTATGAGATTTTGTCTGGTC
AATCTTCTAGAAAGAGGTAATCAATTACATGAATGTCGTTTTGTTTGACC
GCATTTTTTGTTTCTCTGATGACTATTAATCTACAACAAAACACTGCTTC
TTTACTAAAACATTGTGAACGACAGTTTGATAAttcactagttttacatt
gtATTTCTTAATTCAAGATACGAAACCATTTGTGAGTCAAACTCGAAAAT
GAGGATTATCCTAATTGTATACTTTGGTcaatttttagcgattttagTAA
GCATGCAGAACGTCTTTAGTCACCTTCTTGAGAAGTAGTGTGGGTGTCAG
AACCCTTCACAAGATTTGTAACAGTGAATTTTCTATTAATAAGCCTTTCA
TGCTGCAACAAGGTTTTCTAGTTGACGTCACCATCACATTGTTAAAAAAC
TACTTCTCTTTGCACGCTTTGTTTAGAGGTTAAAGTCACCTTTGCTCAAC
TTCCACGAcgggagaattttttttgttaaagtgACTAGCTATCCACaaaa
aaaCCTGTAAGCTAGCTGGCTAAGTTAACCTCTTTATCAATTATTGTTCT
CGTTTATTTCAGAGACGCCTTGCGTGACCTTGATACTTGAGCGGGATAAA
TATAAGCCCTCTTTGTAACACGATACCTAAAATACCATCAATCATCATCA
TAAATACTTCAAATACATCCCTTTGACCCCGTCAATGTCATTTGAATTTT
ACCTAGAAGGACCACTATTTCGGCTATTTTTCCCGTATCTGTTCGAGTTG
TTAGTTatttatataccgggtgcgccacaaaaaagtttctctctttgaaa
ctgattttctcaaaatctaaaaacgttaaaagaaccattcctattttatt
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ttaatcatgtaaaggctattgcgattgccaaatttaaactaaaaatttaa
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ttttttggtcgaCATTTTCGAGGACCCTAGCCCTCGTTTTTGGGATTTGT
CGGGTCAAACCAACATATCTTCAATCAGACTTACGCTCAAGGGCTGTTTG
AGCCAGACTGGGGATGCAAATAACATTCTTCATTCCGTCCTCTCTGATTG
AAAATTAGCcaactcctttagagctttagctaACCGCCATCGAAATATCA
GATAAGTCAAGCTTCTTTCATGTTAATTTAACTCGCAAGAAGAATCGATT
TTTATAGGTACTTCAAAACATTGTTTTCTAACGGAATTAGATGGTAATAT
GAAAAGCGCCTCTGAGGGGGGAGTTGAAACCACATTTAGACCAATATTGA
TCAACGATCTcactttttcccattttgtTAACATGTAACCATAAAACCAC
CCAAATTTTCTGCTACCATTGCCATGTGAATAAAATGCATCACACGAAAA
TTTAACTTTTGTCATTTCTGACAGAGGCATATAGAAACCACTCACTGAGC
GACCCTAATTTGTTTTGCTTTGGTTCTGAAATATGAAGCATTTTCAAGTA
CCATTTACCATTACATAATCTTATGTAATCTTTTATTTAAACGGGAGTAA
TAGCAATTAATAACAATTTTCCCTAAGAGACGCTATAGTATCCCCTTGCT
AACCCACGGGCAAAATATGTTCCAGAAGTCTCACCCCAAAtttttttAGT
GAATTCAGGAAAAGTGACAGCCACACTTTTTACCTACACGTTCATCGTTT
TCAGGAAGAGATCAAGGTGATCCAGTTGCCACCTGTTTCATTGGATATTC
CCAAAGTGTTGGCAAATAAGCTAGAAGATGATTGCTATAACATCAAACGC
AagaaaaaggtataaaaaaattatcggaTCTCATTACCAAGGTAATGTGC
CGGATGTATTTCTTTCGGTACTGATGGAATCCTACGAAGCATTTTGAAGT
GTTTCTATACTTGATAGCTTTGGATATTTATTGCAAAAGAGTTATCCTGA
TATCTATACTAGTCCAAATTATCGACCCttcaaaatgatcaattttatgT
CGAaccttattttttcttctttcttctagCTCATCCACTTACCCCGGACT
CCTTCAGTGGCTACCATTTTGTCCGATTATTACGAACATTGTAAAAAGAT
CATCAAAAAACCTGAAGAAAAGGATACTAGGTAAAAActatttaaatcaa
atttcCCAGATTTTCCTGGTAATTTCTCGTGGATGAAAACGATCGTTCAA
TAAGTCCTGTTTGCGGTCGAATAACGACTACTAGCATAATTACAAGATTT
ACATAAATCAGAATATAGTCAGAATATATTTTAACCGGAAGGAAAAAGAA
TAATAGTTTCAAATCCCAAAAATGGCTAAGCCATTGAAAGATATAATAAG
ATAATTATAAGATAAAATGGAAAACTGAAAGATtctaaatgaagaaagaa
atatttgaggttttatctttttttgcaaattcgagccttgcgattcttaa
attatTAAGATTACTAATTCTTATAGAAACTGTATTTTAATGATTTGGTA
TGGtagttgtctgtacacaaacccagtatctacggcttatttcaaaattc
attgccgtggagggtctgttgtcattgtcttttctacgaagcgataaacg
tgagatacactttGGTACAGAGAAGTGTGGTAGTGACTCTACTCTAAAGG
ACATTTTGTTAAGCTTCTTACTTCATGGCGTTCGTAATCTAGACGCCATG
TTCTAATTGCAATTCTTAGAAGGAGAAGTTTTCCGGAGTTGTATTGGACT
TTGCTCTAAAAATAGTACTTTGCTTTTTTAAAATCATGCTGAACTGTGCT
GAATCATACCAAAACTAAAAGTAATTAAATGTAATGAATCATAAGTTAGt
tccaaatctcttttttcatgattgCTCTCTTTCGTCCGCAATTGCAAATT
CTTGCAAAAATGTTGTCAGTTTTAAGCTTCCGCTTGAAGCTTCGTTTTAA
TGAGTTATCAAACCAATTAAGAGCTAAATGTAGACAAATCATCTTGTCAC
TGTGCCAGCTAtaagatttaatttttaataGCTATTCTATTTTGATTGCT
TGATGTCTTTAACAATTAAAACAACCTTGATAGTTTTGAATTAAGTAATC
ACCCATTTAGGTGAGTGACGTCATTCCAGAGGAAAATAGATTTCTGCTGA
ACTCGtctgattttttctttcttcagttTGACCATCGTTGAGGAACTGAT
CGACGGTCTAACCACCTATTTTAACTTCTACTTGAACACGCTGTTGTTGT
ATAACTTTGAACGCGAACaatatttgaagttttttcCGCTTCAAAAGCCA
CCGCCTCATTTGATCGCCCTTCACACCGCAACACCGCCCGTAACCCCTTT
GCTATCCCCGAAACTTTCATCAATTGTTGCCATGGAAAAAGCGACGACTT
CAAAAGAATCATCTCGCTCTAACTCTCGCTCAAGTTCTTTCAGTGAAGAT
GCACCTCTATCATTGGTCGGTGAAAAAGTGGTCCCAAGGCCGCGCGGCCG
CCCAAGTCGTCGAAAATCGAACATAGAACAGGACTCAGCCAAACGGAAAC
GCACAGACTCTGGTTCAAGTAAAACACCGCTTTCACCAATGTCTCCTGTA
GACCCTCCCACCCCTCTACGTGAAAACTCGTCAGAACGACCAACGAAGAG
AGAAACCAGGTCATTGCGACAGAACAGTCTTTCACGCTCTCAAGAGGTCA
AAGAAGAAATGATAAAAACAGAGATTAAGATCGAACAAAAAGAATCGGCT
GATGAGCAGGGTTCTGGTATAAATTCATTCATTAATTTGAAGGATCCAGA
TATCTAATTTCTGAGGTTGATATGTTTGCTTTTAAATTGCCAGAAGATTC
TGTACGTATCAACCTCAGAAATTAGATATCTGGATCCTTCAAATCGTTAT
TAAAGTCCGTCTGATATCATTGGATGACGACACTGGTTAGATATTTATCA
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TGAAATATTGCTTCGATCTATAATCCTTTATCACT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000117_pilon:561870..580854+ >MSTRG.14201.5.p1 ID=MSTRG.14201.5.p1|Name=MSTRG.14201.5.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=15750bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:561870..580854+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCCAGACCTGTTGAAGCCCTTAACCGTGCAAACAGACATGCCACACCCTC
CTGTTCAACCACCATTTAAAGACCATTCTTTTATGATGTATCCCATCGGA
ACCGACAAAAAGACCACGCCCATGCAAGTTTACGGACCCGAACACTTTTT
ACGCTTGTTTGTAAAACTACCTGTACTCCTCGCCTCTTCCAGCATCGAAC
AACCGAAGCTCTCTGTTATTTTGCGGAACGTCTCAAAGCTTCTAGAGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000117_pilon | genome | sc0000117_pilon:561870..580854 + |
|
