|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000117_pilon:352135..360310- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14186.1.p1 ID=MSTRG.14186.1.p1|Name=MSTRG.14186.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8176bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:352135..360310- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAATGGCGTCGAAACCTCAATTTTGTATGGTGGAAAATACGAAAAGAGG
AAAAAAAATTCATCAATTCTGGGAATGGAAATTTCATAAAATTTCATGAT
TTTTTCATTACTCGTCATCACTTTTCTAGGTGAGGCTGTAAGCTGGTAAG
TGTGCTTTTATTTTGATATGATTATGGCTGAATTTATCAGATTTCATCAA
AACTGTGACATTTTGTTTTTTCTTTGACTTTATAGACGTTTTTAGTCAAC
TTTTTGCTTTTCATTCAGATTCGTTGTTTGCATAGACATTCAATCTTTTT
TGATCAGGACCCAAGACTCACCATAAACATTTGGAATCAATTTTAGTCAG
GATGTCATGTCCATCCAGAGGGTGTGTCAATCGAACAAATTGACCGCCGT
TATCAGATTATCAATTCCAGAATTTGTCTGTAACAGGCAGTGTAGACCTA
AAGCTCTAAGCCAGCATCTAATAACATGAAAACCAGAATATGATTCTTCA
ATGTGAATCAAAACTATAAAGTGCACTTACAAACATCAATCAGTTACATC
AATATGCCTTCTTACCTGTCTTTAAAAATATAAATAAAAGTAATCACGGA
AAAGGACGGAAAAAAAAAGACATAAGTGTGAGAACAGAGTAATCAAACTC
GTTAGAAAAAGTACCATTAGAAGTCATAAAAAATCAACCTGAATAAATGC
AATCGAAATTCCAGAGAACTTCATAATTCCCCAAACAACATTATATTACT
ATGTCAAACTCCATCACATAAATTTTACAATTACGTCAGAGTAGAACTAC
GCTCGCCACCGAAGAGGTTTATTTGGAAAGGGTAATTATATTTTATTGTT
CGCTTCTTTTTTAAAGATTCGCCGGGTTGGAAAAGTATGAATTTCTTTGT
ACATATTTTACCTACCCCAAATATTTAGGAGGCTGAGTTTTAAACGAATC
ATCAAGTTGAAACGAACGATAAATGTATCAAGGTCTGTTTTATTTACCCC
CTGGTGACTTAACAAAAGAGACTTAACTCGATGTTACAATCCAATTATTG
AAAGTTTGTCTCAGCCTTTTTATAATGAGCGAGACATACGTTCTCTGATT
ACGCAATTTTCATATTGACATTTTCGAGGCATTTTGATGTAACTGTCAAT
TTGTCAGATCTAACAAAATTAATAACCACACTGTCATCATTGACAATAAA
ACAAACTATTTTCTGTCAAGAGCCTTGTAAACATTCCAACAACTTCCATC
AAAATGATCTATCACAGCTCAGTCTACCATTTTTAGCGCGGTCCGAGGAT
TGAGCCAAGAACGCACCGCGAACTCCAGCGCCGGCGAGAACTTCAATCTG
TCAATCATTTTCTCAAGCGAAGAGTACGCGAAGCGATTCTAGCTGTACGA
TAGTGCCGCGGGTCATCAATGGATAGTATTCAATCATCATTATCCCTTTA
TTTTCATTCCTAGAACTTTTGCAAAAAAAAGGAAAAATAGAAAAGTTGTA
TTTTTTACTGCTCTATTCACATACTGAATTTGAAAGATCTTCTATGTGGC
GTTTTTTTGCAAACTTCAAAAAACTGATTTTTGTCCCGCCTTTGCGGGAC
TTTGGCTTAAGTGCTTGAGTGCAGCATAGGGTACAAAGTCCAAACATGCG
TTTCCCGTAATTTTTGTGTGAAGAGTTAGGTCTACACTGACAGGGGGGTG
GAAGACACAGGATTTCCGAGGGCAAAAGTTTTCACCAAAATTCGAAATTT
CCAAGGCGAGAGAAGAAAATGTATGAATTTCCAAGGCAATTGAATTAAAA
AAGGAAAAAAAGAGTGGAATTTCCGATGCATTTTGCAAAAGTACATGGAT
TTTTATCGGAATTTCCGACCACCACTGTCCAGACGATCTCAATCGAACAG
AATCGACGATCGGACCAGTGGAACCAAATCGATTGCAATCGACCGATTAG
AATTCGATTGTCGAACGCAATCGAATCTCAATCGAATATTACCGCAATTT
TCAGATTCGATTGATATTCGATTGATATTCGATTGCGTTCGATTTATGTT
CGATTGCGTTTGATTGCGTTTCGATCGTCGATTCATTGATCCCGGATTGT
TCATCGCATAATTTCTACGGGAAATCGAAAGTAATTTCATTCGGCTTGTG
ATGATTGAGAGCTTGGATGTTGGGAAGCTGCAAGAATAAAGCCAGACATC
TCAATCGAACGGAATAAAAGATCGAACCAGTCGAACAATAATCGAACCAA
TTGAATATTACCCAAAATTTTGATGTTCGATTGAGATTCGATTGCATTCA
ACAATCGAATTTCAATTGGTCGATTGGTTCGATCGTGGATTCCGTTCAAT
TGAGATCGTCTGGCACTGTGAAAGAAAAATTATTTCCGAGGCTAGAAAAA
ATTTAAAAATGCATGTCGTCCGACGGATGGGTATATAACAAAAATTTTCT
GGAATGGCCCATTTGCACGGGGTGTGCATTTGCAACGGTTTCATCGATTT
TTTCCAACCCTGTGCAAATGAGCTAGAACGTGTACATAGTGTCCTCCAGG
GTTTGTTCCCCCCACCAAATTCTTGATTTTTTTAAATCTCCCCCCTCTTT
TTTTCCCCCCTATGACTTTTCAGTTTTTTAGTTTCCCCCCTCTTTTTTGC
TTTCCCCCCAGAAAATTCTGAAAATATCATTTCCCCCCATATACCCGTAT
AAATTTCTCAAATTTCAACCTGACACAGACGTAAAATTTTGCTGCAAAAG
GAGTACTAGACAAAATAGACGAAAATTGGCTAATTTTCAATCATGATCTA
ATCACATGATATCATGTGGACTGACCTTGGTTGCTGAGATAAAATTGAAG
TGATTTCACACTTCCCCCACCAAATTTGCCAACTATTGATGTTTTCCCCC
CTCTTTTTTTTCCCCCCTTTACTATTCAAATTTTCATTTTCCCCCCTCAC
CCATTCAAAACTGGAAAATTGATTTCCCCCCCCTTTATAAAGGGGGGGGG
GAGGACACTATGGTGTAAAGCAAAATGCGCGAAAATTAACAAATCTCAAA
TTTAAAATGAAAATGACTTAAAACGAAGACAAATGGCATTTACATTTTTT
TCTTTAGCCTTTAGAAAATTTTTGTCTACGAGTTAAAATTTTGATCTGTG
CATTTTTTTATAATCAAGTCAAACATTTTTCCACTCTGTGTAAATGCAAC
GGGTGTTTTTTTGTCACTTTCGTTTTTGACCTGTTGCATTTGCTGCATGT
CGAACCCTGTGCAAATGCAAGGATTTCCGTGACTGTCTAAAGGATCACCA
CCATCAGGAAAAAGTAAACTGGCACTTTTTTTTAAAGAAGTTAACATTTT
CAAAAACTGAAGTTAAAATTTGAGCCGTATATAAGAAATTTTGATCAGAG
CCAACCTTGAAAACTAATTGTTGTTCGGGAGAACGCAACGGTCTCTTGAA
TAACTAATTACTCCAGCAAAACCCACCAAAAATATTTTTAATGATAATGT
CATATATATGATTGTTTTGTCCTTCATAACACAGCAGTTACCTAGGGCCA
CGATAATTTATCACATTTATACTGACTGGGGGAGAGTAATCTAGGTGGAG
TAATTAGTTACTGTTGATCATTGCGCTCTCCTAAACTACTAATTTGAAGA
ACAACTTGCCAAGTAACTAACTAACTAACCTATTTACGTGTGTGGAATTA
TTTTTCATTTTTACTTAAGCCTGTAATCAAGGCCTAACAAATCAAAGAGC
TATCTTAGGAATTGAATAACAAATTTTGGTTGGTTTGTTAGCTGGCTGCT
GCACGTTGTTAATCTGTCATTTTGGGTTGTTTCAAGTTTTCAAGTTTTAA
TTAATTGTCTTGGGATCTTGAACTTGATTAGGCAACTCTTATCCTCGTTG
TTGCAAATACATCCTGTAGATGACTGTTGTTTTTTTTGAAAGCTTGATTT
CCCAGTGTGACTAACTGACTTATCCGTTCACTTGTATCTGATTTTCCAAT
GACGTATTGGTGGGTATTTGCGGCTACCCACGCTAATGCTCTAAAGGAGT
GGGCCAAATTAATTGTAATCAATCTTGTCAAACAATATTGCATCACAATC
AAACGTAATTGAGAATCAATTTAACAAATAGAACGTTGTTCAAACACAAT
CAAATATTATCCAGTAATCGGCCGTTCGATTGTTTCTATTGTGTTGTGAT
TTTTGTTTTTTGAACTTGTTTGATTGACAATGTCTGGATAGATAATATAA
TCCATATCTATCTATAAATTTAAGTGACATCAGGCCCGAAGGCCCATTCT
CGCTACATAATACACTTCCCATATTTTGCAAAACGGTTACTAGTGCATAT
TTTGTTGCTCTCCACAGTTTGGTCTCTGGGAGAAACCCGTTTTTTGCCTG
TGTTTCCTTGGGGAAAGTTGGTTTTTTGAAATTTTCTTAAGTTCTGTCAA
ACAGAATCCTCTCAAATTTTAATTATGTTTTTTCTATTTATGCTATTATA
CCACCCTGAAAATTTTGAAGACATTGATATATATCAAGACAATGATAATG
ATAACATAACATTTGAATTGGTGCACACACTTATAATTAAAATTCAATTG
TCAGTTTAAAGCCTGACCTCTTCAAATCCTCGGTTAGGAAAAGCTGTACC
TGTTTTTCCTGGAGGTACTGGAACGTTCCAGGAACACTATGGAATGTTCA
GGAACTTCTCAAAAATCTCCCAATCAAGGTTCTCCCAATAGATGTATGCT
TTCATTATAATTTCCAAATTATTTTCTCAAAAATGTTTAATTTTATTATC
ATGTAGGTCCATAAGAATAAAGCTTGTTTACTTTTAAAAGATTTTACTAG
GCATGGAAGTATTTGAAAACCCAGCTATTTTTTATTTATCAATTGATGAA
CCAATTATCCCAAACATTTTGGAAGATTTGAAAAAAGGTGGCTTCAATGA
GAATGTGCAATGTATAGAGCTGAGCGAAGATGAATTAGAAAGAGCTCAAA
CAGAAATATGCAATGACTTGACAACACCCTTTATTTTGTTTTGTGCAGAA
GGGAAAGTAAACTGTAAGTAAATATTTCGGAAATTTTTTCTTTAGTATTA
GTATAGTTATGCTTTGAACACTGTCTTATGTTCAATGACGTTTTGTTTTT
ACTTTGCCGAATCGTGACAGTGCAATAAAAAGCAAAAGGTTTATTTCAGA
TCAACAATAATTTTCTTATAAATAAATAAATTGATGAAATTATACATAAA
AGACTAACTATCACCTATGCCAACTGCATTATTTCCTTGTTGATTTTGGT
CCTTTTTAGGGAAACGTATTGGAAAAATAGCAGGTATCTCATTTGGAGTA
GGACTTGCATCTGTTGTAGCTGCACCCCTTGTTCTCACAGCAGCAGGATT
TACATCAGGAGGTATTGATTCTGGTTTTTTGTTGTTTTGTTTTCTTATGG
TTTGATAGAGCCAAATTTTAACTTCTTCGTTGAATTTGTTATTCCAGCTT
TCCAGAATGAGAGATTTTCTGTGACGTGCTATTTCAGTTTTTAGAGTAAA
TAAATTCAAATCAAGTTATTTATATTGAAAAAGTATTTTATTAAAAAGGT
AAACTTATTTTGCTAGGTGTTGCTTCAGGAAGTGCTGCTGCAGCTGCTCA
AAGTGCATTTTATGGAGGTGCAACTGGTGGAATTTTTTCTATACTTCAAA
GTGCTGGAGCTGTTGGCATTGGAATTTTTGGGAATACTGCTATTGGTTTA
GCAGGTGCTAGCGCTGGTGCAGGTTTAGCAGCAGCTGCAGGAGCTGGTGC
AAATGAAACAGCTTTAGTTAGAAAACCTGCTGTGATTGGTATACTTTCTA
GGTGGGCTAGAAATAACAATAATGTTAAAAATGAAGACAAAAAGAAAATT
AAAACTTTTACAGATAAGAAGTTGGGAATTAAAGAAGATCCAAATTATGT
ACCTTGGAGTATTATGGCCAAGGATTTGTTTCAAACAGCAATAGGGTCTC
TTGAAGCTTTGAAACCAACAGTTTTGGTATATTTTAAAGATAGTTATATT
AAACTCGAGTGAGTTCTGGCACGTCCAACTTTTCTGTGAGCCAATGCAAA
CAAATCGGACTAGTTTAGGGGTACTATGTTATACATCAAAAGAAGCTTAT
TCCAATGTACATTAACGAAATTGCTGTCAGTGTTGAATTTTTTTGTAAAG
AAAAATGATTCTTTTAATGAAGTTTCTATTTATTAGATACTCAAAGAGTA
GCTCATAATTTTTTTAAATCCAGAAATAGAGAAATTAGAGAACTAGAGGA
ATTCTTGAATTGCTAAATCTGATCCTAGATAAAAAGCATAATGTGTTACT
TTCACTTTCAGATGATTTTGCATAACCTTGTTGAACTTTTGACACCCAGG
AGAGGGGGAGACGTTTTCTAGTGTCATTTTTAAAGTCAATTCAAAGAAAA
TTATTATATACATTTTATTATAGAGCATGATCCTGATCCTAAAATTATTA
TAAATTTATATTTATGGTAGCCTAACTATTTACTAAATATTTTTACAGAT
AGATTTTTAACTCAGATTTATTTCGTATATAAGGGTACCCTTTCACAATT
TAAGATGTTTTTACTATGAAATCTTTAAGTTTTTACACTTATCGAGAAAA
GTGAACTTAGTACTTGCGTGTTAAAGTTATAAAGTAATAACTCAATTTTT
ATTTTAATACTGTATTCTCAAGCAGTGTAGGACACTTGTTACTTTGCAAG
ACCTCAAGAAACTGACAGAATTTGTTTGTGGGTCGAATCATATTTTTGTA
TTTTTAATAATTTATATTATAATGATATTAAATCTTTAATCTTATTGTGC
ATGGAAATTAAGATTGTCTTTTTTATTATTTAGGTTAAATAACAACCTTT
AAATGCATTAAAATAGACAAGGGCGTAGATAAAAGGACTGGTTGCCAAGA
AGGTGTATTATGGGAAATGTTTATTTTGTCACCATTCAATACAATGATAT
TACTTTTTATTATAGTGTAGTGACAATATCAAAATGATGAAAAATAGATC
AATTACATTCATTTTCATGTTATTGCTCATCACAGGACCAGGTATTTTGC
TTTCTTTTTGTTACAGTATATGGCCCCTAAAACGTCGTTCAAACTTAAGA
TTTCTCTCAAATGCAGAGGAAAAGAAGTTTTACAAAGATTTTTGCTGCAT
GCAAAACTTTAACATCTCTACTTTATTTCCAGAAAGTTCTTTTTCAAAAT
TTTCAACTTCAAAAACAATTTTTGATCGCTTAAAGATGGGTAGCTTTTTT
CAAATGGTCCTAAAAACATAGGTTTGCAATTTTAGTGATATCTAGAGACC
TCTTTAAATTGAGAATATGAAATTCTGACCCTTTTAGTTTTCTCCTATAT
TTTGCAAAAAAAATGACAGGATTTGCCATTTTTGCTGATTCATGATTCAG
TGAAAATTTTTATGTATAATGTTAATGTTTTCTTATAAAACTATTAAGCC
AAGTTTGATAAGAACAGAATTCAAAGATTTTTTGCTGTTGCTCATTTTTA
GAATTTTCGGTTTTCTCAATGCTGGTTCTAGGGCCCCCAAAATACTAGTT
GACCTTTAAGATGCTATATCTTTTACTCATATTCTAAAGTCACAAATGCT
TTAATTTTCTATATTCCATTTTCTAGTTTTTTTTTCAATATTCAAGGAGC
TAGAGTAAGTTATGTGCAATTTTTATCCAATTTTGGTGCTGTAATACTTC
TTTCAGACCAAAATATGTTATTTTGAATTTGTTTTAAATCTTCAGAAACC
TGCAGAAACATACTCATTTTTAGATATAACCACCATTCTTTCAAAACAAA
CTGAAATCGTCTGATTCTGACTAATCGAAGGGTTATAACCCTCATTTTAA
TAACGATCTACATTTTGGGGGCCATAGGATTGAAATAATCTGTTATTCTC
CTAAGATTGTAAGATATTAAAAGTACCACCGAAAAAGTTTTTTTGCTACC
TAAAGATTAAGTTACATCTTAACATTTTTCATAGCCATGGCTGAAATAAA
GGACACAAGTACCGGGTGACCCACGAAAAAGTTCGGACGTTTCTCGGCGT
CTTGAGGCCGAAAAAATGTCCAAAAGTGCTTGGAGTTTTATTATTTAGAA
AGTAGATATCCTAACTTAAAATCCGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000117_pilon:352135..360310- >MSTRG.14186.1.p1 ID=MSTRG.14186.1.p1|Name=MSTRG.14186.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2277bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:352135..360310- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGTTGCTTCAGGAAGTGCTGCTGCAGCTGCTCAAAGTGCATTTTATGGA
GGTGCAACTGGTGGAATTTTTTCTATACTTCAAAGTGCTGGAGCTGTTGG
CATTGGAATTTTTGGGAATACTGCTATTGGTTTAGCAGGTGCTAGCGCTG
GTGCAGGTTTAGCAGCAGCTGCAGGAGCTGGTGCAAATGAAACAGCTTTA
GTTAGAAAACCTGCTGTGATTGGTATACTTTCTAGGTGGGCTAGAAATAA
CAATAATGTTAAAAATGAAGACAAAAAGAAAATTAAAACTTTTACAGATA
AGAAGTTGGGAATTAAAGAAGATCCAAATTATGTACCTTGGAGTATTATG
GCCAAGGATTTGTTTCAAACAGCAATAGGGTCTCTTGAAGCTTTGAAACC
AACAGTTTTGGTATATTTTAAAGATAGTTATATTAAACTCGAGTGAGGAA
ACGTATTGGAAAAATAGCAGGTATCTCATTTGGAGTAGGACTTGCATCTG
TTGTAGCTGCACCCCTTGTTCTCACAGCAGCAGGATTTACATCAGGAGAT
GGAAGTATTTGAAAACCCAGCTATTTTTTATTTATCAATTGATGAACCAA
TTATCCCAAACATTTTGGAAGATTTGAAAAAAGGTGGCTTCAATGAGAAT
GTGCAATGTATAGAGCTGAGCGAAGATGAATTAGAAAGAGCTCAAACAGA
AATATGCAATGACTTGACAACACCCTTTATTTTGTTTTGTGCAGAAGGGA
AAGTAAACTGTGTTGCTTCAGGAAGTGCTGCTGCAGCTGCTCAAAGTGCA
TTTTATGGAGGTGCAACTGGTGGAATTTTTTCTATACTTCAAAGTGCTGG
AGCTGTTGGCATTGGAATTTTTGGGAATACTGCTATTGGTTTAGCAGGTG
CTAGCGCTGGTGCAGGTTTAGCAGCAGCTGCAGGAGCTGGTGCAAATGAA
ACAGCTTTAGTTAGAAAACCTGCTGTGATTGGTATACTTTCTAGGTGGGC
TAGAAATAACAATAATGTTAAAAATGAAGACAAAAAGAAAATTAAAACTT
TTACAGATAAGAAGTTGGGAATTAAAGAAGATCCAAATTATGTACCTTGG
AGTATTATGGCCAAGGATTTGTTTCAAACAGCAATAGGGTCTCTTGAAGC
TTTGAAACCAACAGTTTTGGTATATTTTAAAGATAGTTATATTAAACTCG
AGTGAGGAAACGTATTGGAAAAATAGCAGGTATCTCATTTGGAGTAGGAC
TTGCATCTGTTGTAGCTGCACCCCTTGTTCTCACAGCAGCAGGATTTACA
TCAGGAGATGGAAGTATTTGAAAACCCAGCTATTTTTTATTTATCAATTG
ATGAACCAATTATCCCAAACATTTTGGAAGATTTGAAAAAAGGTGGCTTC
AATGAGAATGTGCAATGTATAGAGCTGAGCGAAGATGAATTAGAAAGAGC
TCAAACAGAAATATGCAATGACTTGACAACACCCTTTATTTTGTTTTGTG
CAGAAGGGAAAGTAAACTGTGTTGCTTCAGGAAGTGCTGCTGCAGCTGCT
CAAAGTGCATTTTATGGAGGTGCAACTGGTGGAATTTTTTCTATACTTCA
AAGTGCTGGAGCTGTTGGCATTGGAATTTTTGGGAATACTGCTATTGGTT
TAGCAGGTGCTAGCGCTGGTGCAGGTTTAGCAGCAGCTGCAGGAGCTGGT
GCAAATGAAACAGCTTTAGTTAGAAAACCTGCTGTGATTGGTATACTTTC
TAGGTGGGCTAGAAATAACAATAATGTTAAAAATGAAGACAAAAAGAAAA
TTAAAACTTTTACAGATAAGAAGTTGGGAATTAAAGAAGATCCAAATTAT
GTACCTTGGAGTATTATGGCCAAGGATTTGTTTCAAACAGCAATAGGGTC
TCTTGAAGCTTTGAAACCAACAGTTTTGGTATATTTTAAAGATAGTTATA
TTAAACTCGAGTGAGGAAACGTATTGGAAAAATAGCAGGTATCTCATTTG
GAGTAGGACTTGCATCTGTTGTAGCTGCACCCCTTGTTCTCACAGCAGCA
GGATTTACATCAGGAGATGGAAGTATTTGAAAACCCAGCTATTTTTTATT
TATCAATTGATGAACCAATTATCCCAAACATTTTGGAAGATTTGAAAAAA
GGTGGCTTCAATGAGAATGTGCAATGTATAGAGCTGAGCGAAGATGAATT
AGAAAGAGCTCAAACAGAAATATGCAATGACTTGACAACACCCTTTATTT
TGTTTTGTGCAGAAGGGAAAGTAAACT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000117_pilon | genome | sc0000117_pilon:352135..360310 - |
|
