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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000117_pilon:244961..253047+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14173.2.p1 ID=MSTRG.14173.2.p1|Name=MSTRG.14173.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8087bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:244961..253047+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATCATCACTACTTCCACTAAATCATGTAGAAGACCTTGTAGAAGGATGGC
TAAGTGAAGACATTCCACATTTCGACTATGGAGGTTTTGTTGTTGGAGAA
AAGCAGTCTTCTGCAGTTATTTTATGTAAATCCAAAGGTAACTACATAAG
TGATAAGTCTGATATGTTCTCTCGGGCTCGGGTGACTTTTAGTTTCAAAG
TTTCAAAACCTGACATTTAAGCCTGCAATACACGGGGATCGGAAAGGGTT
cttgaaaatttattattaaAGAGATTGTATTTATGATGCATTGCATTATT
GTCATCATAAGGCGGCCATTAAAAATTTGTTCTGCTTGCAACCAACAACA
CCAACTTGCATTTCTTTTGGATTTTTCGGTACGGAGAAGTGggaaaaagt
cttgaaaaagcaaattgtTCCTTTAACATATAccttaagttggtctaatg
tcgacatccctcagtcagggaaatcctcaattgcggtagtaatttcttac
tgcaattgcggtataaacgtcacttttaaatttttcatgtaCCGCAATTG
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gcaatttttgtacataattgatcatatctttttaacgcacagacaaaata
tttttcccgtagatcagattcttttagTAAAGAAAAGCTATCTTCTCGTA
CGATTTTTTACAGTCgatgtttttttatctttgtcgaccagcactatatg
tagctgttataagcctttgtaggctaatCACGATTGAaaactaccgcaat
tgcagtataccgcaattgagggatttccctgactgtccctcttctaattt
tgacatccCTTTTAAGAGataaaatttatacttagaaatttaatcaaaaa
tatatttcaaaaccaaaaaatttaaaaaatttaaaaatccataactcgga
gtttcatgctctaagcaatcatcagatgtaacatatatatatttgaaatg
AACAAGTTCACCATCAACTACTCGACTAAAATCATTCCATTACCATCGAC
TCCTGGTTGGttttatcgagcactctttgaatatgatttcacCTTATTTG
ATTGATACTTCGCTCCAACATTGTTGAGCACTCTCGAACATTGTattcta
tttttgaaatcaactttttgaaatGAACAAGTTCACCATCAACTACTCTA
CTAAAAACATTCCATTACCATCGACTCCTGGTTGGttttatcgagcactc
tttgaatatgatttcacCTTATTTGATTGATACTTCGCTCCAACATTGTT
GAGCACTCTCGAACATTGTattctatttttgaaatcaactttttgaaatG
AACAAGTTCACCATCAACTACTCGACTAAAAACATTCCATTACCATCGAC
TCCTGGTTGGttttatcgagcactctttgaatatgatttcaccttatttg
attgatacttagaAATTTAGTTAGAATTTCATGTTGATTAATTTTAAACA
CTCTagcataaaaaaatcaaacttattGAACTCCTATTGCTTcgaaaatt
gtgagtgttcaatTAGGTTTGATTATTTTGTTCAGTTAAACTTTAATCTC
CCGGATGCAGGAGTTGGTTGGATCCGGATCGGGATCGGGATTGGAATTGG
GAGTGCTATCGACCTCCAATTTggaatttttgatttaaaaaaatctagac
AAACCTTAACTCGCCAAATGTCTGTatgttactttaatgggataaacttt
cacagggattgaatttcgcggataggcccaaccgcaaaatttaatcccaa
aaatctctaaaatttaGTCATTGCTACAGCATTGCTGTGGACCTActata
ttaaataaaataaactaaaatataaataaattttaacggatagatatatt
ataaagataaatgggctaaaatatGACTTAAAAAGCAGAGGCTTCAGAGA
TTATGATTATGTGAATTAGAGTAGGGCTTGCAAAAGCAAAAGTATTACTC
AGGAATTGTGTATTGAGTGTTATAGTGTTGTATCTAAGCAAAATCAATGA
TTAATACTGTGTGAGAAATTAGTCAAACATTAATATTAAGATACatataa
acaatttaaaaaaagaaaagaactcAACCTAAAAAGGTCATATTTAGGAC
TTTTTTCAAGCTCAAAATCGCCAAGTAACCTAAAAGGTTCAGGCCATACT
AGGGTCATAACATTGAATATAACAACTTACTACGCAGCATTTTTACAGAA
CTTGCCCTCAGCCAGGACAAAagactacacgctttttcttataagaatta
tGTACTTTGACTGAGGGtgaagtattcttaagaaattgctaaaattgagg
gtgaaatattcttaacgtattcttattatttcagagaaaaatttcCTTTC
TAGACAGCTTATGTGAATAATTCTAATATACGTATACATACACAACAGAA
AGTATACGATATCTCTTTTGTTAATTGATTtgtgtcacttttgttttccc
attttttgaaaaatggcagTTTTATTCTTATTGATTGATTAAAACTCAAT
ACAATTACTTCCATGAAATAAAGAAGGCACTGCACTCATTACCAGTGTCA
GGTAGGTTGAGGCAAGTTCGAAAGCAtccaaaaattattgaaattattgC
TGTTTTCAATATGATGTCAGCAAAAACTTTAAATGCTATTGCCAAGATGC
tggtttgaaatttgaaaaattgaaacaactaaaaacgaaagtgaaatcta
GCCGCACGGTAAATCCTGTAATGTTGATATCGGAGATTTAGTCTAAAGCT
ATCGTTATAGCATGTTTCACTATCAACCTTTTAGGCAATCGATGTCAAAT
TAGCTTAGTAAAGTCATAATTGCAAATGTAGAACGATGAATTCGGTATAC
ATACATAAATGTTGTCTGTGAGTTCCTTGTAAATTGTTTATTAAAAACAT
TCtatatgttttttgttttttttgttgtttttttttaaacattattattt
ccttgatctccaaaaatattggttcttcttacaagaaaagtgttatataa
tgtatatgctgtgtgtataaaatatataaataactaaCAACTCGAACAGA
TACGGGAAGAAGGACTCAATCGGAAGGAATAAGGAAAACTAAGTGAAGCT
CGGAATCAGAATACTGAGATATGACGTTTGGAAGTTTTTTCGATTAGTAA
TAATTAAACTGGATAACGGCTTGTTCGCAAGATAGTCGTCCTAGATAAAT
TATGGCAGAcagtaagaaataaataaactattCTTAGATGAATAATATCT
CGTAAATATATTATGATTTTATATAGGCCGAGGACTAGGCATAGAAACAA
GATTGTGAGAAgtgtgaaaaaataaataaaaaatattgtagTTAATTCGA
TATGTAAAGTTTTTAAGTTTGATAAGTTTGTATGGTACTGTAAATCAGTT
GACCGTAAATCCTTGCTCTAAGAAAAGATCTCATTGTTTATGATtaaatg
aaacttttcattttcaagctcATGTCTAatgtttgtatatttttgggATT
TTGTGGGAATGCTCTAATTTGATGATCAATATCATATTATCGTATGTATA
CTCTGAAAGTGCCAGGTTTTTTAGTGTCTTGACCCTGAGTCCCATCATCA
CAGTCTAGACGATTTGGCAACACAACAAAATGAACTTTGGAGCTCAAACC
ATTAGGCCAATAATCAGCCCACACTGGGTGATCATAAAGTCTTTGATTTG
GTGTGAACCAGCTGCTTCCACCAAAACAGTTAATATTACGTGATAGAAAG
CTAGTATCATCATCCAATGTTCTGACAGATTCGGTTCGACCTATTGCACG
GTTACATAACCCACCATTATTGAGACCTAAGATATATTCTTTTAGCTCAA
CACCAACTGCATTATGGTTTGTGACGAAGCTTATTGTTCTTCCAACGTTT
GGCTTGTGACAATAAAACCTGATTTCTGTGATTGGAGTTTGAGAATGAAT
TTGCGGAAGATAGTGTCCCCATCCAATAGAAAATCTCCATTTTGAAGCTG
AAGAAATGAATCCAAGTCACCAATTGTCATTTCAGTTGCAGTTGAGCTTG
CAAATTTGTTTGTATAGTTAGCCAACATCATCCATCCACCTTGAAAAATA
TAGAAAcgcttttgaatattttattatCTTTAACACACTgaacaatttat
ttttgaaagaaacatCAATCCCTATGATCAGAGTCAAGATAAAATTGAGG
ATCCTGCAGAACatatctcaaaacttaataagcatgaggggttggaataa
aaatgtcctgggtggaaaatttttgaaaaggaggctaatacagcagaatt
aggacaaaagagggacctttcaaaaacattttcccaaaaattaataagcg
gggggggacggctattaggtacccgagagtactcaACTATATAGTATCTA
AAACAAAGTGAAACAGGAATTATATTTTACGGTACTCACCATGATCAGTG
TCCATATCACAGTAAACATCTCGCATTTTCCCGTTCAAATTGATCTTGTA
ATATCCTGATGTTGCTAAAGGCTTTCTATCTTTCATCTCTTTGCACGTTC
GTGCGTCTACAGAAAAGAAACTCAAACGAattttaatttgaagatcatAT
CGTTTCAACCAATGTTTTGAATCGATAATAATAGAAAGTATTGAATGTCT
TCACCCGACCTACTTACCccgaaacctgccgacccaaaatatttattgcc
attttatagtagaattattttttcttcaaaaatttcaaaccttcaTATCA
AAACCTGTATCTTGCCTGTCCTGTTCTATCTTAAGCTtaagaaattatat
tttctaTTATATTATCCCTTTCCCTTTTACAACTACCTgctgttttgaaa
agttgaaatcttCAAAGTAAACTCtttttttAAGTGCAGCCTAACGCATG
ACGACATGAAGTTCCAAGACTTTGCATAAAGGTTTTTAAAGCTCTCATGA
AGCGTATTGATATAGGAAATAAGATCGGGCATGATCAGAGTCAAGGTCCA
ACTTTCTCCAAAATTGTAATTGTCATAAAAACCCTAACTTTAGGCCATTA
ATTAGTTATGTGGTACTTACTTATGTTCACGCATGCGTACGAGTCATCCT
GGTAGTTTGGTACACAATTCTCCTCTCTTTGACAAGGATCTTTACTACAa
ccattcttttaaaaaaaaacaaagaaaaataattttttcgttTAATTAGC
TATTAAGTTCTTTCTAGACCACATTTCCCGTTCCCCTATTTCACGAAGTT
CACACGAGGAGTTCGGTAAGAATCAACGGGTTTCCGTCTATGAAAAAATG
TTATTCTTCtttcctttcatttttttcatttatttcttaAGCATTGTGTA
ATGCTCTACCGTgtttactctgtaccagagtgtatctcacgactATCGTA
gcgcaatgaattttgaaattagccgtagatattgggttttTGTACAGACA
ATACCGTGTTAGGCCCGTGTTAGGCGATTACAAAGACGGTTTCAATAAAT
TCCCGTTTCAGCCTATACATCGTAAAGTTTTGAAGAGATCTAGGCCTTTC
TGtgtaaaatgaaattgatttttccgGCTTCAAAGAAATTCTTTAAGATC
CGaaaaaaaGACCTTTCTTTTGTTAGAAATCTATTAACTCTAAAAACTAT
ATCAGCATGGCTTTATAGTTTTAATATATGAAGATACTTACAACAATAAC
GACATGGATAGACCCTACATCTGCGGTCAGATTATTTGAGGTATAAATAT
CTGTTTGTAAAATTTCACAATCAAATCCACTCAAAGTTAATTTGAGATTC
ATACTCTGGCATTTTCCACTTGTTAATAAGCACTCTTTCACGCAGCCTTC
CTTATCGTTTGTTGTTAAAGCCTTTATTGGGGGGTCGACCATTCGATGAC
CTGTCATATATTTAACACGAATGTAACTGATATTGACTGAGATTTTTGTT
CCCTCTGGCTTATGAATAACGCGTGAAGATTGGTAGCAATAAAGTGTTGC
AATACTTGAGAAAATGATAGCCAGATAACTCACTGGAaaaataatattca
atttttcaaacattttttcagcGTTGTTGTCTATATTTTTTGACCCCTGA
AAAATCTTTATTCTTTTCATACAtgagaaattttgtaattttttttctca
agtatcacaataataatgatatatatcATGAATCAAGCCATTCTGTAGCT
ACGGTAAAATTTTTCATTCGATTTAatccaatatttaaaaaaaactttta
taatgAATGAGCATTTTTGTCTTTGAATATATGAAATCCTTTTGAATCTG
CGTGCTGAAAAAATAGGACTCAATTGAACAGGTCTCTTCATTTCATAAAA
CTAAGTCACTTTCAAGCCTCTCTTCCGAAGAAATACTATGACAACTTATT
GTCAACAGGtttttttAAATGTGCATTGtacaaaaatatcgaaaaaggtT
GTGTCTGTCTAGTCTACACAATTGACAGCTCCATGCTTTTAGATTTTTTA
GGCCTTCGTTTTGTGCTCAAAACGATAATATGTGACGTCACGTAGCGTCT
GTCAAACCTTTATCAAATCATCGACTCCTGATCACTGTATAAAATTTGCA
TTTTAAGTAGTGTTAGAAAAGCAGTTAATGTAAATGATCATGAATGAAAC
CCTAAAAAGTATCGATCCAGATTCGATCCACTCTGAAAatggaaataaaa
agaaaagggtTTTTAACCTTCGCTGCTGTCTTTCCTATCAACATGAATTC
GTTTGATATCCCACACTTGAGTTAATAATCCATTTGTATAATATATGTCG
AATATGTGACATACCGGAGCTGCAACGTCTTCATTTTGCTAATTATTCCA
TTCGCTTTTATCCTATAGGTGTTCTGTGTGGGCAGCCCTTCGTCAACACT
ATATTCGAAAAACTTGGCTGTAAAGTTCAATGGCATCACAGTGATGGTAC
CCTGCTGGAACCTATTTGCCGGGTGGCTGAAGTCTCTGGTCCCGTCAATA
AGTTACTTCAAGGAGAACGTCTGGCGTTGAACGTTTTAACAAGAGCGAGT
GGAATAGCCACTATAGGCCATCAATATCAAGAAATTCGTACGAAGAATGG
TTGGAAGGGTGAAATAGCGGCCACCAGGAAGACAACACCTGGTTTTCGTC
TTGTGGAGAAGTATGCTGTGTTAGTTGGCGGTTGCTCTACACACAGGTAA
TTTCCTTTCGTCAAATGCCGAATTAAGCTTGTTCAAACACCAGtatacaa
ttttcagaatttcgaGCTTCtcctaaaaattttattgatcCTAGAAGTCG
ACCATTACTAGCGGTTTCTATTATATTAAAATCTACTTCTAGTTTTTAAC
CTTTAAGAAGCAACTAGAAGAAGGTGGTGGTATgataccatatactaccg
ggccctTTGATCGCATCATCCAAAAAAGCTCTTTTGTGGACCACGGAATG
ATTACCTATATTCGTTTTCTGTTTAGGCATGATTTGTCATCCATGGTCAT
GTTAAAAGACAATCATATTTGGTCTGTTGGTGACATCAAAAAATCCGTTC
AAAAGGCTCGGTCTGTATGTGGCTTCTCTACAAAAATTGAAGTCGAATGT
CGCAGTGTAAAAGAGGCTTTAGAAGCTTGTAGTGCTggtgctgacgtcat
catgttGGATAATTTTGACGCGGCAATCACTGAGAAATCAGCTCAAGAGA
TTAAAGGACACTATCCACATGTGATATTGGAGGTTAGTGGAGGTGTGACT
CTTCAGAATGCAAGTGATTACATGACTCCCACTATTGATGTGTTATCCAG
CAGTAGTTTAACTCAAGGATATTCAACTCTAGATTTCTCCATGAAAATCA
TGAAAGACGGCAAAGACCCCACAAATCCACTCGTGACGGCGTAAAACGTC
CAGATGTAATTTACGGTaggatatttttgtatttttataaatattttttt
acatctCTGGAATAAAAGGCTTAAAGCTTAAAGTGTAAGGTTTGCTTATT
ATTTAATTACTGACTTTCCGCTGGAAACAAATACTCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000117_pilon:244961..253047+ >MSTRG.14173.2.p1 ID=MSTRG.14173.2.p1|Name=MSTRG.14173.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2928bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:244961..253047+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCATCACTACTTCCACTAAATCATGTAGAAGACCTTGTAGAAGGATGGCT
AAGTGAAGACATTCCACATTTCGACTATGGAGGTTTTGTTGTTGGAGAAA
AGCAGTCTTCTGCAGTTATTTTATGTAAATCCAAAGGTGTTCTGTGTGGG
CAGCCCTTCGTCAACACTATATTCGAAAAACTTGGCTGTAAAGTTCAATG
GCATCACAGTGATGGTACCCTGCTGGAACCTATTTGCCGGGTGGCTGAAG
TCTCTGGTCCCGTCAATAAGTTACTTCAAGGAGAACGTCTGGCGTTGAAC
GTTTTAACAAGAGCGAGTGGAATAGCCACTATAGGCCATCAATATCAAGA
AATTCGTACGAAGAATGGTTGGAAGGGTGAAATAGCGGCCACCAGGAAGA
CAACACCTGGTTTTCGTCTTGTGGAGAAGTATGCTGTGTTAGTTGGCGGT
TGCTCTACACACAGGCATGATTTGTCATCCATGGTCATGTTAAAAGACAA
TCATATTTGGTCTGTTGGTGACATCAAAAAATCCGTTCAAAAGGCTCGGT
CTGTATGTGGCTTCTCTACAAAAATTGAAGTCGAATGTCGCAGTGTAAAA
GAGGCTTTAGAAGCTTGTAGTGCTggtgctgacgtcatcatgttGGATAA
TTTTGACGCGGCAATCACTGAGAAATCAGCTCAAGAGATTAAAGGACACT
ATCCACATGTGATATTGGAGATTTCTCCATGATCATCACTACTTCCACTA
AATCATGTAGAAGACCTTGTAGAAGGATGGCTAAGTGAAGACATTCCACA
TTTCGACTATGGAGGTTTTGTTGTTGGAGAAAAGCAGTCTTCTGCAGTTA
TTTTATGTAAATCCAAAGGTGTTCTGTGTGGGCAGCCCTTCGTCAACACT
ATATTCGAAAAACTTGGCTGTAAAGTTCAATGGCATCACAGTGATGGTAC
CCTGCTGGAACCTATTTGCCGGGTGGCTGAAGTCTCTGGTCCCGTCAATA
AGTTACTTCAAGGAGAACGTCTGGCGTTGAACGTTTTAACAAGAGCGAGT
GGAATAGCCACTATAGGCCATCAATATCAAGAAATTCGTACGAAGAATGG
TTGGAAGGGTGAAATAGCGGCCACCAGGAAGACAACACCTGGTTTTCGTC
TTGTGGAGAAGTATGCTGTGTTAGTTGGCGGTTGCTCTACACACAGGCAT
GATTTGTCATCCATGGTCATGTTAAAAGACAATCATATTTGGTCTGTTGG
TGACATCAAAAAATCCGTTCAAAAGGCTCGGTCTGTATGTGGCTTCTCTA
CAAAAATTGAAGTCGAATGTCGCAGTGTAAAAGAGGCTTTAGAAGCTTGT
AGTGCTggtgctgacgtcatcatgttGGATAATTTTGACGCGGCAATCAC
TGAGAAATCAGCTCAAGAGATTAAAGGACACTATCCACATGTGATATTGG
AGATTTCTCCATGATCATCACTACTTCCACTAAATCATGTAGAAGACCTT
GTAGAAGGATGGCTAAGTGAAGACATTCCACATTTCGACTATGGAGGTTT
TGTTGTTGGAGAAAAGCAGTCTTCTGCAGTTATTTTATGTAAATCCAAAG
GTGTTCTGTGTGGGCAGCCCTTCGTCAACACTATATTCGAAAAACTTGGC
TGTAAAGTTCAATGGCATCACAGTGATGGTACCCTGCTGGAACCTATTTG
CCGGGTGGCTGAAGTCTCTGGTCCCGTCAATAAGTTACTTCAAGGAGAAC
GTCTGGCGTTGAACGTTTTAACAAGAGCGAGTGGAATAGCCACTATAGGC
CATCAATATCAAGAAATTCGTACGAAGAATGGTTGGAAGGGTGAAATAGC
GGCCACCAGGAAGACAACACCTGGTTTTCGTCTTGTGGAGAAGTATGCTG
TGTTAGTTGGCGGTTGCTCTACACACAGGCATGATTTGTCATCCATGGTC
ATGTTAAAAGACAATCATATTTGGTCTGTTGGTGACATCAAAAAATCCGT
TCAAAAGGCTCGGTCTGTATGTGGCTTCTCTACAAAAATTGAAGTCGAAT
GTCGCAGTGTAAAAGAGGCTTTAGAAGCTTGTAGTGCTggtgctgacgtc
atcatgttGGATAATTTTGACGCGGCAATCACTGAGAAATCAGCTCAAGA
GATTAAAGGACACTATCCACATGTGATATTGGAGATTTCTCCATGATCAT
CACTACTTCCACTAAATCATGTAGAAGACCTTGTAGAAGGATGGCTAAGT
GAAGACATTCCACATTTCGACTATGGAGGTTTTGTTGTTGGAGAAAAGCA
GTCTTCTGCAGTTATTTTATGTAAATCCAAAGGTGTTCTGTGTGGGCAGC
CCTTCGTCAACACTATATTCGAAAAACTTGGCTGTAAAGTTCAATGGCAT
CACAGTGATGGTACCCTGCTGGAACCTATTTGCCGGGTGGCTGAAGTCTC
TGGTCCCGTCAATAAGTTACTTCAAGGAGAACGTCTGGCGTTGAACGTTT
TAACAAGAGCGAGTGGAATAGCCACTATAGGCCATCAATATCAAGAAATT
CGTACGAAGAATGGTTGGAAGGGTGAAATAGCGGCCACCAGGAAGACAAC
ACCTGGTTTTCGTCTTGTGGAGAAGTATGCTGTGTTAGTTGGCGGTTGCT
CTACACACAGGCATGATTTGTCATCCATGGTCATGTTAAAAGACAATCAT
ATTTGGTCTGTTGGTGACATCAAAAAATCCGTTCAAAAGGCTCGGTCTGT
ATGTGGCTTCTCTACAAAAATTGAAGTCGAATGTCGCAGTGTAAAAGAGG
CTTTAGAAGCTTGTAGTGCTggtgctgacgtcatcatgttGGATAATTTT
GACGCGGCAATCACTGAGAAATCAGCTCAAGAGATTAAAGGACACTATCC
ACATGTGATATTGGAGATTTCTCCATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000117_pilon | genome | sc0000117_pilon:244961..253047 + |
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