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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000116_pilon:480018..492527+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14113.1.p1 ID=MSTRG.14113.1.p1|Name=MSTRG.14113.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12510bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000116_pilon:480018..492527+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aaaaaaaagaatgatatGGATGAGAAACTATTTTCAAGAAAGCATATTTC
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GCAAGCACGaaaatttttgggtttttacTCTCTTTATGTAGAAAACTGCC
AATTAAGGTGCAAAAAAGCAAAagggcgccgaaattagtaataaGAGACG
TCTTTTTTAGCTCTTTGTATTTcagcgcccccccccccaataccaccacg
ctactgattATTGTATTAGTGTAGACTAAagtcattttgttttcttttca
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AAAAGTTAAGCTCAAGAAATTAAGAAAGTCTTACAATCTGAACGAAGAAG
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tttttttgacACTTAATAAAAAACTGCCTTTACAAGTTGTTTGGTTATTC
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aaagtgctaagttttaatgggcaattaacctttttgttagATTAAccatt
ttcaagatttcgagacaaagaagcttttacaaaaattttccgaaaatctc
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gtccaacagaaaatgtataacatgccatagttttgttgctTACATCAGGC
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tgggtcgctcggacatgaagctatttgggccggacaatgtccgatgtccg
accgttatttcgagccctgggcaaatataaaaaaaacactatgGTCAGAG
AGCCCTTAacaatggttttggtaccatcggaaagatattttaatactctt
tctaaaaatatgCGGTTTATGGCCATTGGCCAGTCTTTCTAAAAATATGC
GGTTTATGGCCATTTAAATCAAGTGGTTAGGAGTTATAGCCTTAAGTCTG
GGACTTGCTATATTGGCAAAATTAAACCGTGTATACCGTGATTTTTAAAG
GATATAGTTTCTACCTCAAATAGTCCacacaatttgaaattaaaatttga
ctttAACCTTGAAAAGACCTACGTTAAGTACGACTTGAgtagaaaaagaa
agatattttatgaaacaagaaaaaaaaaagaattttcgtatctctttttc
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ACacggtaattatctttttatatctaGCGACTCTCCTGTCTATACTACTA
TATTGTCCTTTTGCATAAGACTCAACTTCCTGTACTAGAATTTCACTGGC
TTTTCCGGGACTTTTCCGCtttttttCCGGTATATccggcatgagattgg
aaagatttttttctcaatgtatatatgaaaaatcttttttacttACAAAA
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GGAAAGTGTCAGAGGAATCTTATTGAGGAAAGAGGAATCTTATgcaaacc
cagctggcacacaacgtcgtttcaacgtttatctaacgtctacaacgtct
atataacgttagatgaacgttgaaacaacgttgtgtgccagatggGTAAA
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GGTTTTGAAACGCCGGTTTGATGTGCCGTaaaaaaatgtacagcaagatt
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tttaaaaactctttttgtttaaccctttgaatttttttcatttgaacaGA
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AATCAAGCGATTTCATTGGTCCATTACACCGACCAATCAACGAGCGTGTC
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ATAGGCCcaaacgcgaaatttaatcccctcgAAAGTTTATTCCGTTAAAT
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TACTAGAATTTCACTGGCTTTTCCGGGACTTTTCCGCtttttttCCGGTA
TATccggcatgagattggaaagatttttttctcaatgtatatatggaaaa
tcttttttacttACAAAATTGCCGAACTTTCCAAAGCTCATTTTTTCACT
ACCCGGAGTCCCGGACTTGGAAAGTGTCAGAGGAATCTTATTGAGGAAAG
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gtgtgccagatggGTAAACGACGGTAGTAGCAAATGGAAATTTTCCATTA
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CGTCCCAAATGCGCTGCAAACCTGAAAGTTTTCACTTTTCCTTGTTTTAG
AAAGGTGGaagatttctctttaaaaactctttttgtttaaccctttgaat
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AAGCTGGTAAACCCACAAAAGTAAGCGTCTTgcacgtttcttttataaga
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ATGcgttttgttcttatatagtttgttcttataaaaaaacgtgtatatat
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TCAAACTATTTTTGTTTGTTAcatatttttgacttttataaGTAAAGAAC
CAATATTGCATATCAGCGTAAAATCAGTAAAAGAActcattttagaattt
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AAAGTTTCTACGGGAAAATATCTCAAactatctgattatccctttaagtg
tCTCTCTTtagggggtttcagggggtacccgattctgCAATTCCGCCAAA
TCTTTCTCCATTATCCATCAAATCGTTTCAAAAAGGACTAAAATTGCGac
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tgaaaatttgaaattccgTCCAAAACTTTGCTCCTCCGTccaaaaaaggg
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GGATGTGATTACCTTGAAGGTTTAATCTTATATAAGTGTCCCCTTTCGAT
GGCGATGAAATAATGTCTCTTAAGTACCTCTAGGTgtttacaatcatgga
caaaaggttgtagacaaatgaaatttcagtgaaaaatgatgagaaataga
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GTGGTAAGCCTTTGTGGTTAGACtccagtgggtgactttcaaagactttg
aacagctttcGATGGGtttggatgggtttggaaagcacccagaacctctt
gggagcttgtttttgatcgatattgaagtattttgcaaatattgcagaag
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tttttctctaTCAATAACACcattctcaaataaaaaatgtgtatgaattt
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AAGCGTGGAGTATAAGTTACTTCAACAAGGTCGTATAAGAGGACAAGCCT
TTGTGACATTTTCTGGTAAGTTTGAGATGCATTAGGGTTGATAAATGCTC
ATTTTGAAATCAGGATTCGATAGACCCTTTCATAAATTatgttacgaaca
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TACTTAGCGAATGAATGTACCTTCACCCTAGTCATCCCATTCCAGCTTTG
ACTTCCATGTAGGgtgccggggttcgattcccactcagtCCTGAGATTCA
TTTGTCAAGTAAATGTGCATTTGCTATGATTGAGTGGTAAAAAGAGTGCT
ATAATTTATGCTTTAATttagcataaattatgcagattgtggggaatttc
cctgttttcaatcaatttttgaccaccagaaagaaaagttgagactttga
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cttttttgaatttgaagacccccccccctcccccaaaaaaaaatcatgaa
tttttagGGCTTACAGTTTTgacaaaaaacgcaaaaaatcgcaaattacg
caaaaactgcaggttttcaagcttggtaacattcaaattcggaatcagca
ccctcaagtTGACTAAAATTAATGGTCAAAGCTTGTTCACCGCGGCATTG
AAACTTTAGCAATCCGCTGGCCATGGTCTACCATGGTATATCACCAGTAC
GTAGCTCTTTGTGTCGTGATCACCAGTAACCGGATGTAGTAACAGTGTAC
ATTTAGTCTTATGCAATAGTTCGGTTGCTTGACCGATCTTAATTAAGTCA
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AGCTAGAAGTGTGATATATTTTTAATGATTCttgttttgtttcaaaactG
TGCTTTTTGTGTTACGGAGGTATGGATAGAAAACGGattaaaattgctat
tttttctTGACAGATCTTGAATGCGCTGTCCGCGCTTTAAATCTTTGTAA
TGGCTACATGCTTCATGGAAAACCCATGGTTATTCAATATGGCCGACCTA
GAAGTGAGggttgaatttcaaatttttttaatgggTTGTCTTGGTGTCCT
GTCCTGACCAAACCAAAGGTTATCTAGTGATTAGCGTTTCCTCGGTGGAA
AGTCCGAGGTCATCCCCAGCTGACACTTAACgtttttttcaacgtttatc
taatgtacacaacaacgtccatataacgttagatgaatgtttaaacaacg
ttgtgtccAAGCTGGGTCCAGATAAGTGACGGTTAAACTTTGATGTTATA
ACCGATTGTAGACTCTCCTAccagagtcgatattttacatgGATAGCcta
gtaatctaggacttttagacagtatttcgattgttttcacggggtccacg
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ggTTGGAAACCAGAGGATGTCTAAAATGGTAGACGAGAGGTGaattaaaa
cttttaatttattaattgattATGGATGCTAGCCTGGAGGCTCAATATGA
GTTCTTGATGAATTGGATGGCACTGATGAGTAGCCTGGTGTATAATGACT
TCATTTTTGACTTTGCCATAGAACGCAGCAAAACATCTACatctacaatc
ggcgccgaaatattgtggacaaaaaggggaattccctcaaaactttaaag
ccgcaagtgatttttaagtgctttgaagtacagttggaaagttttaacat
tagatttgac Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000116_pilon:480018..492527+ >MSTRG.14113.1.p1 ID=MSTRG.14113.1.p1|Name=MSTRG.14113.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3255bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000116_pilon:480018..492527+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGTTGTTAATTTTGTCTTCAGAAATTTCTGGATCGTATGATGTCAA
CCATGCAGTCAAAAGAGCAAAAACTGatcTTTCTTTTGACCATCCAGTCG
TTGCAACGTTACGTGAATATGAAGAAAAAGTTAAGCTCAAGAAATTAAGA
AAGTCTTACAATCTGAACGAAGAAGATGAAGTTGAAGTTGAAGAAGAGGA
AGAGAAAAAATCATCTAACGAGACTATAGACATGGAAGACAACGACAAAT
CAAGCGATTTCATTGGTCCATTACACCGACCAATCAACGAGCGTGTCCAA
CCCACGCCTGAACAACTAATATATAAGAATCGTTTAGAGCTAAACCAACT
GTTGGAGATTGAGAAATTCAAATCATACAAAGCTGGTAAACCCACAAAAG
TACTATACATCAAGAATCTTGCCAAGCAAACGACATCCGAAGATTTGGCT
TgtttattttcaagatttttcgtTCAGAATCAATCAAGCGTGGAGTATAA
GTTACTTCAACAAGGTCGTATAAGAGGACAAGCCTTTGTGACATTTTCTG
ATCTTGAATGCGCTGTCCGCGCTTTAAATCTTTGTAATGGCTACATGCTT
CATGGAAAACCCATGGTTATTCAATATGGCCGACCTAGAAGTGAGggttg
aATGTTGTTGTTAATTTTGTCTTCAGAAATTTCTGGATCGTATGATGTCA
ACCATGCAGTCAAAAGAGCAAAAACTGatcTTTCTTTTGACCATCCAGTC
GTTGCAACGTTACGTGAATATGAAGAAAAAGTTAAGCTCAAGAAATTAAG
AAAGTCTTACAATCTGAACGAAGAAGATGAAGTTGAAGTTGAAGAAGAGG
AAGAGAAAAAATCATCTAACGAGACTATAGACATGGAAGACAACGACAAA
TCAAGCGATTTCATTGGTCCATTACACCGACCAATCAACGAGCGTGTCCA
ACCCACGCCTGAACAACTAATATATAAGAATCGTTTAGAGCTAAACCAAC
TGTTGGAGATTGAGAAATTCAAATCATACAAAGCTGGTAAACCCACAAAA
GTACTATACATCAAGAATCTTGCCAAGCAAACGACATCCGAAGATTTGGC
TTgtttattttcaagatttttcgtTCAGAATCAATCAAGCGTGGAGTATA
AGTTACTTCAACAAGGTCGTATAAGAGGACAAGCCTTTGTGACATTTTCT
GATCTTGAATGCGCTGTCCGCGCTTTAAATCTTTGTAATGGCTACATGCT
TCATGGAAAACCCATGGTTATTCAATATGGCCGACCTAGAAGTGAGggtt
gaATGTTGTTGTTAATTTTGTCTTCAGAAATTTCTGGATCGTATGATGTC
AACCATGCAGTCAAAAGAGCAAAAACTGatcTTTCTTTTGACCATCCAGT
CGTTGCAACGTTACGTGAATATGAAGAAAAAGTTAAGCTCAAGAAATTAA
GAAAGTCTTACAATCTGAACGAAGAAGATGAAGTTGAAGTTGAAGAAGAG
GAAGAGAAAAAATCATCTAACGAGACTATAGACATGGAAGACAACGACAA
ATCAAGCGATTTCATTGGTCCATTACACCGACCAATCAACGAGCGTGTCC
AACCCACGCCTGAACAACTAATATATAAGAATCGTTTAGAGCTAAACCAA
CTGTTGGAGATTGAGAAATTCAAATCATACAAAGCTGGTAAACCCACAAA
AGTACTATACATCAAGAATCTTGCCAAGCAAACGACATCCGAAGATTTGG
CTTgtttattttcaagatttttcgtTCAGAATCAATCAAGCGTGGAGTAT
AAGTTACTTCAACAAGGTCGTATAAGAGGACAAGCCTTTGTGACATTTTC
TGATCTTGAATGCGCTGTCCGCGCTTTAAATCTTTGTAATGGCTACATGC
TTCATGGAAAACCCATGGTTATTCAATATGGCCGACCTAGAAGTGAGggt
tgaATGTTGTTGTTAATTTTGTCTTCAGAAATTTCTGGATCGTATGATGT
CAACCATGCAGTCAAAAGAGCAAAAACTGatcTTTCTTTTGACCATCCAG
TCGTTGCAACGTTACGTGAATATGAAGAAAAAGTTAAGCTCAAGAAATTA
AGAAAGTCTTACAATCTGAACGAAGAAGATGAAGTTGAAGTTGAAGAAGA
GGAAGAGAAAAAATCATCTAACGAGACTATAGACATGGAAGACAACGACA
AATCAAGCGATTTCATTGGTCCATTACACCGACCAATCAACGAGCGTGTC
CAACCCACGCCTGAACAACTAATATATAAGAATCGTTTAGAGCTAAACCA
ACTGTTGGAGATTGAGAAATTCAAATCATACAAAGCTGGTAAACCCACAA
AAGTACTATACATCAAGAATCTTGCCAAGCAAACGACATCCGAAGATTTG
GCTTgtttattttcaagatttttcgtTCAGAATCAATCAAGCGTGGAGTA
TAAGTTACTTCAACAAGGTCGTATAAGAGGACAAGCCTTTGTGACATTTT
CTGATCTTGAATGCGCTGTCCGCGCTTTAAATCTTTGTAATGGCTACATG
CTTCATGGAAAACCCATGGTTATTCAATATGGCCGACCTAGAAGTGAGgg
ttgaATGTTGTTGTTAATTTTGTCTTCAGAAATTTCTGGATCGTATGATG
TCAACCATGCAGTCAAAAGAGCAAAAACTGatcTTTCTTTTGACCATCCA
GTCGTTGCAACGTTACGTGAATATGAAGAAAAAGTTAAGCTCAAGAAATT
AAGAAAGTCTTACAATCTGAACGAAGAAGATGAAGTTGAAGTTGAAGAAG
AGGAAGAGAAAAAATCATCTAACGAGACTATAGACATGGAAGACAACGAC
AAATCAAGCGATTTCATTGGTCCATTACACCGACCAATCAACGAGCGTGT
CCAACCCACGCCTGAACAACTAATATATAAGAATCGTTTAGAGCTAAACC
AACTGTTGGAGATTGAGAAATTCAAATCATACAAAGCTGGTAAACCCACA
AAAGTACTATACATCAAGAATCTTGCCAAGCAAACGACATCCGAAGATTT
GGCTTgtttattttcaagatttttcgtTCAGAATCAATCAAGCGTGGAGT
ATAAGTTACTTCAACAAGGTCGTATAAGAGGACAAGCCTTTGTGACATTT
TCTGATCTTGAATGCGCTGTCCGCGCTTTAAATCTTTGTAATGGCTACAT
GCTTCATGGAAAACCCATGGTTATTCAATATGGCCGACCTAGAAGTGAGg
gttga
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000116_pilon | genome | sc0000116_pilon:480018..492527 + |
|
