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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000006_pilon:3012425..3028690+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1411.1.p1 ID=MSTRG.1411.1.p1|Name=MSTRG.1411.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16266bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:3012425..3028690+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATCAATTCAAGATGAACTTCTTTATGTTTCATTATCCTTTTTGGTAACTT
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AGTTGTAAACTCACGGAGAGCATAAAGCTCGGccataaaacatgaaaaat
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TAAGGTTCTGCTAGAAGCCTGTGATGAATATGAGACATTACGTCTTCAGT
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TGTCGAAGTGGGTCATTGTCTAAACCGatgaattcttcatcaaatttaag
gCGGTCGTTATCCAGTGATGTGAGCACTGTTCTAGTAATATTATATTACC
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aaataccgaaggaattttgcccaatttccgaaattccgaagaaaaaaggg
tcgatttccgtaATTCCGAAATACCATACGCCCCCAACCTACATTGGCCT
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AAATTTTAATTAGTTGTTTTGGTTGCATGACTGCACAGTTTCAGGATTTG
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ttcattaatttgtCTTTCAAGGGTCAgagaattcgaattaaagaTGAGCT
AGCACGAACGGTCCTATCTTCatatgtttttttaaagaaaaaggctAGTT
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GGATATAGAAAACTGTATGTGGCTCTGTATGCTCTGTATGCAACTGAGAA
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caaattcaaattcaaattcaaattcaaaacttgTTTATTCGCATGCATAT
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atgtttaagtttgtataaattaggggaggggttactaccgtgaaaagcac
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ggcaaaaatcctgaaaaattttaattttggcgtgaATTAATTtgggcgaa
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GGGTTGAtagtttctttgaaaactcaacttctgatactcagggtacggGT
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CTTTGTTAGTGAACCCCCTGACGTTATTACATTTTCTATGCATGGTGTGT
TGGCCTaagaattttcataaaaagtgaTATTTAGTGATAGCGGTCTAAAA
ATTCAGAACTATACCACAACGAACCCAAAAACGTGGGAATTACCACGTCG
GGTTAGTTACAGgtataattatatggttgattacatttagcttagatttg
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tttgaaatgttttcaatgaacctcggggttattaatcccaaatcaccctc
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GTTATTTTTTGAAAGAGAAGTTCTACTGCGGTAcgttaaaatcagtactt
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GGACACTTTTAGGAAGAATTTTTTACTGGGGTGGCCAGTGGGGTGGATca
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GGtggctacacgcttttttataagaatacactttataagaatctccATGA
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agttgaatttgcgttcaaaaggaatgatcttagtcctacagtaatttttg
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gaacggacggacgaaaggacgaacgtacggacggacggacaaaggttaat
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Caaatgacttactggtttttcctataaaaagcgtatatctgaagatactg
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cgcgcgaAATTATGAGATCTTTGCCCAACTTCAATCTTGTGCATAAATTA
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CGTCTACAATGCTGAATGAGGAGTTGGAAAGCAAAACTGGGCCAGCTATA
TCATTCATCAGCATTGTAAACTGGGGGGAAGGGGTAAACACATTATAAAT
ATTAGTCTAGAATCAAAATTCTCATTATATTATGAACAAGCTTGTTCATT
ATGcatgaagctatgaatgccatcttCAGTCGCTTAtaggctccctgcgg
tggcaattatAGTAGAACCAGCAAACTTTTGGTTAGACttggatattctt
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CGATATTCTTAACACGCTTAAGTAATacgtttctttacttaaaagttgaa
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AAGCTGTCACTTtgttagtctagcaagctagacgactaattcagacatag
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aaatatttaaaatctccTTGTTGGTTTTTCTCTTGCTGGTAGCCTTACTC
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GGTTAAACCGTTAAGAGGGATCTCTATTGTCCAGAAAGCACCATCTTGGT
CTGCCAAACTTAACCAGATTCCTGCAACGTTTCAAAAGACTAATGAGGTC
CAAGATGAGGTTCCAGTTACTTTCAACATAGAAAACATAAAAGGTTTGAA
GCTGAATCGGAGCTCTGTCATACAACGATATAGAAAACGACATGGGTTTC
AAAATGATACTCAAAAACATGACACCGTCTGCAAAATACCAAATTTAGAT
CCACTCGGTCCGAGTGGAATGAATGCTTGGGTCACAAAAGCAAAACAACG
TTGCAACGTGATAAAACTTGGTAAAATTTTTAATAATCGTTTGGTCATTG
AAGATCCTGGGAGAAAGATTAGTAGCGTTACAATGGAGTATATTTTAAGA
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ACTTCCacgttcatttttctttatctcAAAACATCAGTTTTGATGTCAAT
CAAGGGTCATTTATATCCAGCCCTTTGGAACACGATTTCATCAAAGTTAG
CATCACTCAAAAATCTGGTGTACAAAAACGTGAATACTATTCAACGATCT
CAAACAAAACTAAAGTATGTGGTCAACATGGTCGTAAATTAGATTCAGAT
GGTCAACGATATGGTGATAAATCCAATCCACAAGCAACAACAACAGGATT
ACCTTTCAATATTCATATGTTTATGGTTGATGCAACATCTAAGGGTAATG
CGTACCGACAGATGCCAAGACTGATGGAGATTTTAGAGGAGGATCCAGAT
GCAATGGTTTTCAAAGCTCATGGAATTCACGGTGATGGGACCACTTGTCA
AATCATGGCTACACTCGCTGGTAAGTGCTCCCTTTTTCTCAAGTGAACTA
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GTGAAGTattgtatttctattgtttcagaaaacaaaaaaaaacaacagaa
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AATAAATGCTAGTATACCAAGcggatacatttatgaaatctggtgtgaga
aaaacatcaccagacaagtaaaatcaaacaaaatgcttataatgacacgg
aattttcaattgggaatatctttcttatatttctccgagaagagctgaga
tttaCTTATAAtagacgtgagtctcatagctccaatgtggtatgaaaatc
tttcggtggcacgtggtggcacggtggtttttttaaggttgaagtataaa
atttctgatgtcaatattaaatttcttatacatagcatatttttgcatct
ttctcgcaatataaaacgtcataacgacatattATTTGCAATTAACTAGC
TGAttttgaatctcggaggaaagcttaaagtctcttttaggaattggata
agtgctcCATGATGAGgaactgaaataaaaatactACGAAAAATCGTTTA
ttggtggaaggagggtgaacaataatgtcattactgccgacaaggcttgt
acatgagaaataaacgtcataacgacatattATTTGCAATTAACTAGCTG
AGTTTGAGTCTCGGAGGAAAGcttaaagtctcttttgggaattggataag
tgctcCATGATGAggaacgaaaataaaaatactaCGAAAAATCGTTTAtt
ggtggaaggagggtgaacaataatgtcattactgccgacaaggcttgtac
atgagaaattggcaaaaatcagtctGTTGTTTTTCCAGCGTCTAATAATT
CCTTGGTAAAATACGAGTTagtctatttcataggattcgtgcatcTGTGT
TATATGATTTTCTGTTCAATTTAaaggcaaaaatgaaaaaatctgtgCAG
ACTTTCCTTTACGAAAAATGttggttattttttttttttgtcatcagttt
tttttttaaacttaagtatttggatgggtcacaggcaaagaaacaacaaa
tttcttcattgataatttttttttgttgttccTTGCCTATGACCCATCCA
AAATATTTAAGTTTTAATAATGGAAAGACAGTCATTGAAGAGTTTTCTCT
ATTGTTGTTACCTTAAAACTTATAATCTCGTAAACGAGTGTTCAACAATA
AAAAGTTGATTACTGTAGTTATGTAGAAAAATTTCGTGTACTAAAAATAC
GAATCCTATTAAAACAGGCAAGTGACAagcaattttatattttaatttat
ATACTGCGAGTATCAGACCTTAATTCACCCTGTGAGGACAGATCGATATT
CAGTTAAGTGCGGTAATTATCCAGGACTTTGGATGAATGCCGAACCAATG
AAACTTGAAGACGCAAAATAAAGTGGAGATCATTATTAAAACATAgcgga
gtctctataactcgaacctctgtaactcaaatgtctccttaactctcCTT
AactccttaacttgaacaagttttatagtcccttcagttaacaatgtttT
ATGAATTCCTATTCCATAACTCGAAGCAAAAAGAagacccttgcagtgca
ctctatcaaaaatacacccttacagAGATTCCTACCCAATAAGAAACCTA
CCCAATAAGAAACCTACCCaataagggcggcacatgctgtgggtcggacc
atatgagtgtcccccccGGAATCCTTTATCAATACCCACAAAACATTTGT
TTATGCTTATGGGTTTGAAACCGAAAGTGTTGAGGAGAGAGTTTAGGTTT
CCCAAAATATCCATTGTTTTATCCAATTCTTTATCATATAGGTTATCAAT
ACAATCAAGAAGACTCCAATCCATGGCAACCTCCAAACAAAAAGAATTGT
GATGACATCGAtctaatttttaaagatttccaaaaatcaGGCTACACAAC
ACTTTACAATGAGGACATAGTCCTCGGAGGTGTTTTTCATTATAAGATGA
ACGGGTTCAACAAACCTCCTACAGATTGGTACCCACGCCCTTACTGGATA
GCCGCCCATGAAATGCAAGGGGGTTGCGGGAAGCCACCTTGTATATGTGA
GGCTGAAGAAGTGATTCAAGCAATGAAGACTTTTACAACTTCGTGTGAAG
ATGAGAAGAAATTCTCCATTCAGATAACAAATAATGCTCATGACGATATG
aaccttttgtttttgttggaagatcatcTTATCGGTAAGAATCAATTAAA
TTTGAGATAGATgtcacccagctggcacacaacgttgttctaACGTTTGT
CAAACGTTCAAAACGTCCATATTACGTTAGCTGAACgatgaaacaacgtt
gtgtgctaacTGGGTCACGACTCGCAAGAGTCATTTTCCAAATATAAACT
ATACGAGAGGCCCAAAACATTCAATCTTTTGAAGTATGACTTTGAAGGAA
GTTCGCAAGGTTTAGCCTATACTTTCTCGTCTTTCGTCTCGTCGAACTTT
ATACTGTCACAAAAATCAAGGTTCTATTCTACGCGCATTCAACaagaaca
aaattttcagaattagcTAAACTGTGAAGCTCAGTTCAAAATTTCTTAAA
CAATTATTTTTCAGATATTTACGAATTCTACAGGGAGAAAGCACGTGTCG
ACAACaccattttgattctttttggTGATCACGGCGCCCGATGGGGAGCA
CGCGGTAATTTCCGGAACACAAAGCAAGGTAGATTAGAAGAATTCAACCC
ATTTTATTCAATAATTTTACCGCCAAGTTTTAAACGAAATTACAGGGAGT
TATACGACAATATCGAAGCGAACCAGCATGTTCTGACGTCACATTTTGAC
GTACATTGGACTTTAAAACATATCTTATCTTATCCAAATGTCGAGGAAAA
ACGCACTGCCGGACAAAGTTTATTCACAAAGATCGATCCAAAAGCTCGGA
CATGCAAACAGAGCGGTGTACcacaaaaatattgtttttgtatgaagacT
ACGCGAATCGATTCAAATTCTACTCAAGCTTTCAAAATTGCTGAGACAGT
TGTTTCATTTATTAATAATAAGATTGAAGAGTATGACATAATACCAAAAC
AACTCTGTGCTCATTTAACATTGACGAAAATTATAAGTTTGGAATATGCT
ACAGATGAGCAGAAAAACGAAGGTATATTTTACATCATGTTCGAAGTTGC
GCCTTCCAATGCAACATTTGATGTCCGTGTGCGCAAAGACTTGAATAAAC
GAAACGAAACTTATCATGTAGATCCAGAGATTAGCAGAACAAATCTTTAT
AGAAATCAGCCAGCTTGTATACAAATGGCATATCCAAAGCTAGCACCATA
TTGTTATTGCAAATCCCAAACTTGATAGACTTAAGAGtttagttgtatgt
tttttacatattattagggtagcttttgtccattttttatatggattttt
tGTAGAGAAAGGGGGTTGTACTCTTACCATGTGACGGGATTGACCCtttt
ttttagtacggtattacaggatttgacgaaaaaatagacgggaaaacggt
attctGGTAAAAGCAGACGGTGAATTTTATTTGTAGTATAGTATATCTGA
TGATCGCACAAAGGCGTGAAACTGACAGTAATatatggattttaaatttt
aactaATGAAAATATA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:3012425..3028690+ >MSTRG.1411.1.p1 ID=MSTRG.1411.1.p1|Name=MSTRG.1411.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6291bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:3012425..3028690+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATTATGGATACTTATTCAACGGTTAAACCGTTAAGAGGGATCTCTAT
TGTCCAGAAAGCACCATCTTGGTCTGCCAAACTTAACCAGATTCCTGCAA
CGTTTCAAAAGACTAATGAGGTCCAAGATGAGGTTCCAGTTACTTTCAAC
ATAGAAAACATAAAAGGTTTGAAGCTGAATCGGAGCTCTGTCATACAACG
ATATAGAAAACGACATGGGTTTCAAAATGATACTCAAAAACATGACACCG
TCTGCAAAATACCAAATTTAGATCCACTCGGTCCGAGTGGAATGAATGCT
TGGGTCACAAAAGCAAAACAACGTTGCAACGTGATAAAACTTGGTAAAAT
TTTTAATAATCGTTTGGTCATTGAAGATCCTGGGAGAAAGATTAGTAGCG
TTACAATGGAGTATATTTTAAGAGGGCGTAAAAGAAAGGCGGATGGTAGT
TTACATCCACCCGAAGGGCGTGCATCAATGATTACAGATAGAACATATAA
TTATCATAAAGTACTCAATGACGACTTCCacgttcatttttctttatctc
AAAACATCAGTTTTGATGTCAATCAAGGGTCATTTATATCCAGCCCTTTG
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CAAAGCTAGCACCATATTGTTATTGCAAATCCCAAACTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000006_pilon | genome | sc0000006_pilon:3012425..3028690 + |
|
