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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000115_pilon:345232..352728+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14045.1.p1 ID=MSTRG.14045.1.p1|Name=MSTRG.14045.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7497bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:345232..352728+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
agaaaaacagaaagtttgtttgtaaaaaactgaacaaaaaggatggatga
aggaaaaacAATATTCATGATTTTCGGAAGTCGTAAATTTTGTAACAAAG
TGATTAATTTCCTTGGCCCTCACAACAATTTGGTGTATAAAAGGGGGAAG
TTTTGGAGGAATGGACATCATCTCACAGCTCATTACAGCTTGTGAAGAAG
AGCAACAAGCAGAAGAAAATCAATTCACAAGCATCATGTTGGCAATCTAT
ATTCTAGTTGTTGCTTTGGGTGAGTGCTTTATCAAGCCTTAAACAGAACA
TCTTTATCTTTAgtgacaatagaatttctattcgtTTGAGATTTGCCACT
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aattctattttttacattttacactggatttttttgagtgaaacaaaaat
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TTTGCCGTTTTGTATATCTAATTCTTTCTTTATGTTATAGCGACGATCCA
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TGATGGTGCTACGTATAGACTGAAAATATCTTGATGATTTTGTGCCTTTT
AACACTAATTATGCATATCGGTTGtcgaaatacgcattattagcgcttct
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CTGGCAATTATCGTCATCCAAATGGAGCCTGTGATCACTACATAGCCTGC
GGTGTTGGAtgtaaaaatgctaaaaacagACGATCCTACAAACATCTTTG
TACACAAAACATCATGCCGTGCCCAGGTGGTCTTTTCTACGATGAGAAAG
CTTATGGAGGATATGGAGCTTGCATTTATAAAGCTGAATCTAACTGTCTT
CAATTCCAAGGAGAAGTTTGCTACGGATCCACTCAAGAGTCATAGTAAGT
ACTTGTTTCCGTCACAACTGGCGGCCATCTTAAAATCATagccaaatttt
aagaaaataagaatatttatacAGGTTTAGTGAAATATTTCTTGCCCATC
CTTTGCAAGAGAacaagaacaaaatatttttaatgatgTGATAATACAAT
ATCTAGAAATTCTGGTATTATTCGCTCATCACTTAACTTTCATTCTTTAA
GAAGCTTTCCcttaaaacaatttaatttaCCTTTATAGTGGCACTTACAC
TCATCAATGTACTGGACAAGTCACCTTATTGAAACTCGTCTCCAAATCTG
GAAGTGTTGGATGTTACAAAGGTGTCACGCCTGGTTACTGGGGTGGATGC
CCACACGCCCCACCAATCAACGTCTGGATCACCGAGCACAGAGCTGACAA
CTtcaaatacgtcaaaaaatcaTACTACGACATTAAACACGACATCAAAT
TTCCCGAACCATTCACTGCTTACGACGCCAACAAATACGGATTCTATTAT
TTGAATGAATTCCATGACAAATCATCCTTCATCTACTTCACTGCAGGACA
TAATGATTATTACACCTACTTTGTCAAAGGAAAGAAATACCGTGTCTATT
ATGGTGAAGATTTGTTTGATCAAGGAGTTGGAAACAATGTAGGCAAACAC
TGCGTTTACGTCTACGCATCGTTCTACAAATACTACAAAccaaatcaagt
tatcaaattttaatttttatatttgattcACTCAATTTTATTAACAAAAC
CGATAttttcttttaacctaaatactttctaaaactttgtacgttttatt
ttgaatcttttaaattttttcaaatcgttcaaatcttttatatttCTATT
GTCATaatacaaaacttttaaataaatttaCCTTAACAGGAACTACCCAT
TTTCTTCCACACTGAATTTTGAGTGATCCATCATCTTTCTAAGTTTGTGg
tatttaagaaaatttcagaGGCGCCTTATTTCCTCATGTTGTGGAAGact
attttgaaattagacTTTATTGGGGACTGAACCTTAGAATCACCTACGAA
TCCATGGCTAATCTGACCTCCTGCTTACActattgatgattttgatggaa
GCATTGACGGGGATATATTCCTCCAATGTTACAGCGCTGTTCTATTTAAG
TTGCAAAATTATTTAACGTCACTGGCTTGCGAGGGTGataaaattgttct
cataaaaaaccaGTGACACTTGAAACTTAGACCCAGAAGATATCATTCTa
aaaaaaCGTAGTATAAAAAAGCCATACTATGATatgatgaaaataatttc
atgAACACAGCTTTGGTCGGCCTGAAAATTATCCTGGTGATAAAAATACC
CCTGAGTTTTGTTCTCATTCTGCAAAACACTGGTATTTTATTCAATACTT
GGGGTATATGTGTTGTGATCTCTAATCTACCTCAATATCGGCATACATCC
GCGAACACTTATACAGAGGTGTAAATGTTGCCCGAATTTTCctatattat
tttatatttatttgatGAACCTTGAGAGCCGCTTTATAACTGACAGTAAG
CTAGTAAATATTTAGTTAATTAAAAATGCTATACAGTATTCtacaaattg
ctttttaaaCTGGCGACTAATAGAAACAATTAGTCAACGTAAAGCAGGTA
ATTTCATTACTTTGAATAATACTTAGAAACACATCATGTGTtgagttaag
ggctctgaccatagtcggaaaattgattttagtatctgaacacgaaagtt
atgttttacattctttaacacttttaacaaagaattgcctttataaattg
ctttttaatcaaatcccttaagagtaattaagaactgaattgcaaaaatg
acgttatgaactttaaaaagacgttaataatatgttgcatcaccttcttt
tataaaaagtgctaagttttaatgggtaattaacctttttgtttcgaagt
tttttcaaactgtccgcaaagaattgaactattttaaattttgcggaaaa
tttttctaaaaagatgtgtcaaaagttatgactgtttttttaagcgaaat
ccagatgaaaaattgaagaaaaaccactattttgaagatttcgagacaaa
gaagcatttacaaaaattttccgcaaacatttttattgttcagtaaaaga
tacaccatctactgcgaaaaaattttcaaaatgttttttcttcgctgaaa
ctaagctcttcaaagttgaaatactcttcctcgcaaaagtcttcattttc
ttcttcatcgaattttttcaatacaaattttgaattttcagattcaggaa
tagtttgtctaacagaaaatgtataacatgctatagttttattggttaca
tcagtcagaaaacacattttaaacacggcaattatgaaaaattcactatg
gtcagagcccttaagtaaaCAATCAACAAAGTAATAAAATCGCCAAATTT
CCTATCAGCTAATGCAAAGattcaaaatcgaaaatatgGGACGATCATGT
CGAAAACGAGAGGTTTAACCCTGtgatgatacacgttttttataagaaca
tccaacaaaTTTTTGACGCCTCTGGATGtcctttaattttttgagtttta
agcctaacaaaaatgctcttatcattttttgatattttttgtctaTTTCT
TCGAATTCAGGTGTTTTAGTGTCCGCAAGACgctaaaatgttcttgactt
gcTCTTTtctttggtcatcgaagccttattctCTTATCTAGTCTGTTTTT
AAGAATAGATTTcataataaaaagttaaaagctaAAAGTGTGAAAGCAGC
AAGAGCAAAACACGGAAATtctcaggaaaatggacaaaagttTTACTCTC
AAAATATTGTAAAGATGTAAATAATGTAAATAGTAAAGACGGGTGAAAGA
AGGCAGGGAAACATTATACGCGCAAAGTTTACAGTCGTTATGGGGGTATA
CGGGTAAAAATTAGCGGTAGAGCTTCGAAGAAACTTgcaaactctaccgg
ctgtaaaatcttttaaacaaaaaaaaataacagtTTGTGAATTTTCTTCC
TTGTTTTCTTCGGTTTTGAGCTTTCTTTTTacatagtgattcgtcttaga
ctatagagTAGTCTACAAGCGGACCACTAAACTGAAAATCAGAGTTGCAT
CCTTAGTACCATTGTTCTAATGATCGAGCTATCCTTGATATCTAACATAA
ATGGTCCCTCAGCCAATCCTCTAATGTTTTCGTGCCCTGTCTCTTCAAAT
TCCTCGCCTCTAGCTCACCAAAAAGTAACATTCAACAAACCGCAAACTTT
TGTATTATTTCTGTTTATTGTTTGTAAACAGAAAATGGCAAAATCTGCAT
TCAGACTTCCTACGCACAGAAAAATGTAATTAACAAACATGAAGCTAATT
AACAATCTGCCAGGATGGCTAATTAGATATccgtgaaaaagaaaaacaga
aagtttgtaaaagactgaacgaaaaggatagactaagggaaaaCAATATT
CATGATTTTCGGAAATCGTAAATTTTGCAACAAAATGATTAATTTCCTTG
GTTCTCACAACAATTTGGTGTATAAAAGGGGGAAGTTTTGGAGGAATGGA
CATCATCTCACAGCTCAACACAGCTTGTGAAGAAGAGCAACAAGcagaag
aaaataaattcacaaGCATCATGTTGGAAATCTATATTCTAGCCGTTGCT
TTGGGTAAGTGCTTTATCAAGCCTTAAATAGGACATCTTTATCTCAGTAC
TCTGATAAAGTTTTTAAAGACACTTCTTCCCACGTCCTTACTGGAAAGTT
CTATGAACATTTtatccccggtgggaaaattactctacaatttcagccca
TTCTCATAcccatttgaaaaaaaattccaatccCAAACCACCCTCACTAA
GATTTttaatttaagaacaatagaatttccccattgagattttctACTGC
GGGAAAAATTCTCACCGGGGCTGTATGACAAAGGTTTTCTGTGGCATAAA
GCTTAGACAATGCCGGGTgtaaaaatgttataaatcttaagtatatttag
attttaggttttaaattctattttctacattttacattggatttttttga
gtgaaacaaaaatttctttgcaGCCGaaaaaaaCTTCCTATATTCTTGTG
GATACGGTTGAATATTTGCCGTTTTGTATATCTAATTCCTTCTCTATGTT
ATAGTGACGATCCATGTGCAAGCCAGTGCTAATAATCCTTTCACCtatga
agaaaatttgaaagctGGTAAGTAggaatttatttaatttgaattaaGTG
AGGACAACAATGTTTAAGTTGTAGCCTCAAGGAGAGTCTATGAGAGGAGG
AGAGTTCAATTTGAGTGTTATTTGCTTTAATGGAATATATTTttgggaat
taaatttcgcggatggctcGAACGTAGTAGCGtagattgaaaatattttg
aagatctTGTGCCTTTTTACACCAAATCTTGCATCAGTTGtcgaaatacg
cattattagcgcttctttgataaCACTAAACATTCAAATTGTTATTCGGG
ACTTTCATCAAAACGATTTCGTGTTTGGGGTCAAATTCACGTAAATAGCC
GATGAAGTCGTATActccttcttttattttgagttATTGAGAAATTCATC
ATCACTATAATTCccttctttttatattttagttGATGCATACTTTTGTA
AGGGAAAATCTGGCAATTATCGTCATCCAAATGGAGCCTGTGATCACTAC
ATAGCCTGCGGTGTTGGAtgtaaaaatgctaaaaacagACGATCCTACAA
ACGTCTTTGTACACAAAACATCATGCCGTGCCCAGGTGGTCTTTTCTACG
ATGAGAAAGCTTATGGAGGATATGGAGCTTGTATTTATAAAGCTGAATCT
AACTGTCTTCAATTCCAAGGTGAAGTTTGCTATGGATCCACTCAAGAGTC
ATAGTAAGTACTTGTTTCCGTCACAACTGGCGGCCATCTTAAAATCATag
ccaaattttaagaaaataagaatatttatgcAGGTTTAGGAAAGTATTTC
TTGCGCCCATCCCTTGCAAGAGAACaagaacaaaatgtttttaatgatgT
GATAATACAATATCTAGAAATTCTGGTATTATTCGCTCATCACTTAACTT
TCATTCCTTAAgaagcttttccttaaaacaatttaatttaCCTTTACAGT
GGCACTTATACTCATCAGTGTACTGGACAAGTCACCTTATTGAAGCTGGT
CTCCAAATCTGGAAGTGTTGGATGTTACAAAGGTGTCACGCCTGGTTACT
GGGGTGGATGTCCAAACGCCCCACCAATCAACGTCTGGATCACCGAGCAC
AGAGGTGACAACTTCAAATACGTCAAAAAGTCATACTATGACATTAAACA
CGACATCAAATTTCCCGAACCATTCACTGCTTACGACGCCAACAAATACG
GATTCTACTATTTGAATGAATTCCATGACAAATCATCCTTCATCTATTTC
ACTGCAGAACATAATGATTATTACACCTACTTTGTCAAAGGAAAGAAATA
CCGTGTCTATTATGGTGAAGATTTGTTTGATCAAGGAGTCGGAAACAATG
TAGGCAAACACTGCGTTTACGTCTACGCATCGTTCTACAAATACTACAAA
ccaaatcaagttatcaaattttaatttttatatctGATTTACTGAAATTT
TCTAACAAAACcgatattttttttaacccaaatactttctaaaactttgt
atgttttattttgaatctttgagatttttttaaaatctttaaaatctttt
atatttctattgtcataatacaaaaattttaaataaatttttcataacTG
AAACTACCCATTAAAGCtttatgaattaaaaaaatcaataggCTGAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000115_pilon:345232..352728+ >MSTRG.14045.1.p1 ID=MSTRG.14045.1.p1|Name=MSTRG.14045.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3672bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:345232..352728+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACATCATCTCACAGCTCATTACAGCTTGTGAAGAAGAGCAACAAGC
AGAAGAAAATCAATTCACAAGCATCATGTTGGCAATCTATATTCTAGTTG
TTGCTTTGGTGACGATCCATGTGCAAGCCAGTGCTAATAATCCTTTCACC
tatgaagaaaatttgaaagctGttGATGCATACTTTTGTAAGGGAAAATC
TGGCAATTATCGTCATCCAAATGGAGCCTGTGATCACTACATAGCCTGCG
GTGTTGGAtgtaaaaatgctaaaaacagACGATCCTACAAACGTCTTTGT
ACACAAAACATCATGCCGTGCCCAGGTGGTCTTTTCTACGATGAGAAAGC
TTATGGAGGATATGGAGCTTGTATTTATAAAGCTGAATCTAACTGTCTTC
AATTCCAAGGTGAAGTTTGCTATGGATCCACTCAAGAGTCATATGGCACT
TATACTCATCAGTGTACTGGACAAGTCACCTTATTGAAGCTGGTCTCCAA
ATCTGGAAGTGTTGGATGTTACAAAGGTGTCACGCCTGGTTACTGGGGTG
GATGTCCAAACGCCCCACCAATCAACGTCTGGATCACCGAGCACAGAGGT
GACAACTTCAAATACGTCAAAAAGTCATACTATGACATTAAACACGACAT
CAAATTTCCCGAACCATTCACTGCTTACGACGCCAACAAATACGGATTCT
ACTATTTGAATGAATTCCATGACAAATCATCCTTCATCTATTTCACTGCA
GAACATAATGATTATTACACCTACTTTGTCAAAGGAAAGAAATACCGTGT
CTATTATGGTGAAGATTTGTTTGATCAAGGAGTCGGAAACAATGTAGGCA
AACACTGCGTTTACGTCTACGCATCGTTCTACAAATACTACAAAccaaat
caagttatcaaattttaaATGGACATCATCTCACAGCTCATTACAGCTTG
TGAAGAAGAGCAACAAGCAGAAGAAAATCAATTCACAAGCATCATGTTGG
CAATCTATATTCTAGTTGTTGCTTTGGTGACGATCCATGTGCAAGCCAGT
GCTAATAATCCTTTCACCtatgaagaaaatttgaaagctGttGATGCATA
CTTTTGTAAGGGAAAATCTGGCAATTATCGTCATCCAAATGGAGCCTGTG
ATCACTACATAGCCTGCGGTGTTGGAtgtaaaaatgctaaaaacagACGA
TCCTACAAACGTCTTTGTACACAAAACATCATGCCGTGCCCAGGTGGTCT
TTTCTACGATGAGAAAGCTTATGGAGGATATGGAGCTTGTATTTATAAAG
CTGAATCTAACTGTCTTCAATTCCAAGGTGAAGTTTGCTATGGATCCACT
CAAGAGTCATATGGCACTTATACTCATCAGTGTACTGGACAAGTCACCTT
ATTGAAGCTGGTCTCCAAATCTGGAAGTGTTGGATGTTACAAAGGTGTCA
CGCCTGGTTACTGGGGTGGATGTCCAAACGCCCCACCAATCAACGTCTGG
ATCACCGAGCACAGAGGTGACAACTTCAAATACGTCAAAAAGTCATACTA
TGACATTAAACACGACATCAAATTTCCCGAACCATTCACTGCTTACGACG
CCAACAAATACGGATTCTACTATTTGAATGAATTCCATGACAAATCATCC
TTCATCTATTTCACTGCAGAACATAATGATTATTACACCTACTTTGTCAA
AGGAAAGAAATACCGTGTCTATTATGGTGAAGATTTGTTTGATCAAGGAG
TCGGAAACAATGTAGGCAAACACTGCGTTTACGTCTACGCATCGTTCTAC
AAATACTACAAAccaaatcaagttatcaaattttaaATGGACATCATCTC
ACAGCTCATTACAGCTTGTGAAGAAGAGCAACAAGCAGAAGAAAATCAAT
TCACAAGCATCATGTTGGCAATCTATATTCTAGTTGTTGCTTTGGTGACG
ATCCATGTGCAAGCCAGTGCTAATAATCCTTTCACCtatgaagaaaattt
gaaagctGttGATGCATACTTTTGTAAGGGAAAATCTGGCAATTATCGTC
ATCCAAATGGAGCCTGTGATCACTACATAGCCTGCGGTGTTGGAtgtaaa
aatgctaaaaacagACGATCCTACAAACGTCTTTGTACACAAAACATCAT
GCCGTGCCCAGGTGGTCTTTTCTACGATGAGAAAGCTTATGGAGGATATG
GAGCTTGTATTTATAAAGCTGAATCTAACTGTCTTCAATTCCAAGGTGAA
GTTTGCTATGGATCCACTCAAGAGTCATATGGCACTTATACTCATCAGTG
TACTGGACAAGTCACCTTATTGAAGCTGGTCTCCAAATCTGGAAGTGTTG
GATGTTACAAAGGTGTCACGCCTGGTTACTGGGGTGGATGTCCAAACGCC
CCACCAATCAACGTCTGGATCACCGAGCACAGAGGTGACAACTTCAAATA
CGTCAAAAAGTCATACTATGACATTAAACACGACATCAAATTTCCCGAAC
CATTCACTGCTTACGACGCCAACAAATACGGATTCTACTATTTGAATGAA
TTCCATGACAAATCATCCTTCATCTATTTCACTGCAGAACATAATGATTA
TTACACCTACTTTGTCAAAGGAAAGAAATACCGTGTCTATTATGGTGAAG
ATTTGTTTGATCAAGGAGTCGGAAACAATGTAGGCAAACACTGCGTTTAC
GTCTACGCATCGTTCTACAAATACTACAAAccaaatcaagttatcaaatt
ttaaATGGACATCATCTCACAGCTCATTACAGCTTGTGAAGAAGAGCAAC
AAGCAGAAGAAAATCAATTCACAAGCATCATGTTGGCAATCTATATTCTA
GTTGTTGCTTTGGTGACGATCCATGTGCAAGCCAGTGCTAATAATCCTTT
CACCtatgaagaaaatttgaaagctGttGATGCATACTTTTGTAAGGGAA
AATCTGGCAATTATCGTCATCCAAATGGAGCCTGTGATCACTACATAGCC
TGCGGTGTTGGAtgtaaaaatgctaaaaacagACGATCCTACAAACGTCT
TTGTACACAAAACATCATGCCGTGCCCAGGTGGTCTTTTCTACGATGAGA
AAGCTTATGGAGGATATGGAGCTTGTATTTATAAAGCTGAATCTAACTGT
CTTCAATTCCAAGGTGAAGTTTGCTATGGATCCACTCAAGAGTCATATGG
CACTTATACTCATCAGTGTACTGGACAAGTCACCTTATTGAAGCTGGTCT
CCAAATCTGGAAGTGTTGGATGTTACAAAGGTGTCACGCCTGGTTACTGG
GGTGGATGTCCAAACGCCCCACCAATCAACGTCTGGATCACCGAGCACAG
AGGTGACAACTTCAAATACGTCAAAAAGTCATACTATGACATTAAACACG
ACATCAAATTTCCCGAACCATTCACTGCTTACGACGCCAACAAATACGGA
TTCTACTATTTGAATGAATTCCATGACAAATCATCCTTCATCTATTTCAC
TGCAGAACATAATGATTATTACACCTACTTTGTCAAAGGAAAGAAATACC
GTGTCTATTATGGTGAAGATTTGTTTGATCAAGGAGTCGGAAACAATGTA
GGCAAACACTGCGTTTACGTCTACGCATCGTTCTACAAATACTACAAAcc
aaatcaagttatcaaattttaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000115_pilon | genome | sc0000115_pilon:345232..352728 + |
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