MSTRG.14032.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14032.1.p1
Unique NameMSTRG.14032.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000115_pilon:168438..173811+

Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14032.1.p1 ID=MSTRG.14032.1.p1|Name=MSTRG.14032.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5374bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:168438..173811+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CATTATGCATTCCGTCATTCATTTTTAGAATGGAATTAATtcaaattcat gtaaaaaaaacaatgaatttgGCATCTGACATGAACGCATCTCAAAAGCA GACAGAAGAATTATTAATTTATGTTGGCGATTTACTAAACTTAGCACATC CAGACATTTACGATCACTGGCCTCGAGGCTACTCGTCAGCAGAATCAGTA TTAAAGGCTGGAAATTTGTATTCCTCTGTGAATGAAAAAGCCATCTGTTT TAACAAGGAGCATCCATTGTACTATTATACACTTGAACCTGGAGAACCAT GCCCAGATTGTTTGGAGATTCCTGATATTCGTCGATATTACCTTTCATTG AAGGGTAAATTTCAAAGATGGTTTTCGAGCCCCCATATGTGTCGACTGAT GCTAGATCATTGGAAAAATAAAGATGACTGGTTACATGAAACCGGAACCT CGTTTCCAGCAAATGAAATTTGGCATGGATCACGGTTTAAAGAAGTGAAA TGGTTTTGGGATCCTAATTCAATTTGGGCACTCCCTCATCGATGCAGGTG TGAAAATATAATCAATCTTGAAGATGTTACTCAAAACGAACCTCCATCTT TAACTATAACATGTGATAATTGTCAAAGAAGTGAAACAATTCGTCCTGTT TATGTCACTGGTGATCCGCGCAATATCGCTCTTATAGGACATTGGGATGG ATGGCAAACAGGTTTTGGTAGAGGATATTTAAAAGGCTCAGGTAAATTTG ttcttattcttacttttttgtaaGATGATATCTTTTAAACAAAGAAAGAG AGATGAGAGTTTCAAAAGAATGCTATATTAGGTTAGTCGCAAACATTAAA TTAAAGcatatttaataaaaaagaacaaaattacAGTTTTCGAAAAACTT TGAGTCTCAGAACTGTTCTTAGATTgttttttttggccattttgagccTT 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TGGTACCCATAGTTTTCTATTGAAGAGATAAGACCAAGATAATTGAAAAA GAAACGTAAAACTGAATACTCACAAAATTAAATGAATacctttaaggtat gtgtttATTCgctaatattttatttcaaaaatcactttttagaGGCCCTC TCAGAAGTCTGTCTGACAAAATATTACTTCTTTGAATCAAACTATTATCc tgtttatttctttttatcgAAACTGGTAAACATTAGGTAAGTTTTATCCC CAAAAGTCATTAACCTGTATTTGatgttgttcttattttttaattatctt aGAATTGCAAGATGGCCATTGTCCGAAACATATTGAAAAATGTACGTCTT GGACCGCAGAAGAATGGCGTAAATTTGCCTACCCTATGGCCGAAGTCTTG TTACTAGATATTCCTGACAACGAGTACCACCTCCTTTGGTTAACTGCGCG TGTTGTGGAACTTTTGTTCCACCGAAGAGATGGTCTCACAAACgatgaaa ttaaaaatctgGATAAGATTTGTTGGAGGAGATTAATTTTGTTGGAAGAA CAAATTGGCCCAAAACAATGCGTGATCACCTGTCACAACAGTATACATAT CAGTGAAGATATTTCTCGATTTGCCCACTGTGATAACTTTTGGTGCTTTA ATAATGAGCGTGCTGTAAAAAGGTAATATTCTTTCAAAGTTCGTTCCTGT CCattgaaagccaaaaattaagttttaaaattattaataATTAGAGATTT TGGAATACGCAGTCTGGAATATTTGGTGCCGTCAGGATGCCTCATGATGT AGGtttttttAACATTCTAAATGCAGTACCAAATATGCTAGTCGTAAATT TTTTCGACCAGACTAATGGGGATGGTAAAATATCGGTTTTGTGTACGTTA AGGGTCAGAAAAAAGAGGGTTGGAGCCGGCTGGTATGCACATATTGTCAT 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GGGTTGCAGGTTGAAGTGTACAGGAATTACCGATCTTGTTACTTTCCTGG CAAGATGTCCCACGTCAAGCTGGAGTCCTTTGTGATGTTTCAGGACGAGA GTATTGGGAAAATATCCGAATTTATATTGGTGGAAGGTGAAGGAGAAGGA ACCAAATACGTACGTGCGCAAATGTTAGAAAATACTGGTGACACCGTAAA AGATATCTCTATATATCGTACCGCCAACGTAGAGTCCATTACAtcggcca aaaaaattaaacgtGCCGTAATTGCTTACCCTCGCGATGTTgacttattt tttattattgattTGAACAGaggtatttttgattttgaacatGAAGTTCT TTGATACTTTgtattaagtttttttattcatttatcatttgatgacaaat ttatctatttgtgacatttttatctttGTAAATAGCTCCTTACAataacc agaggaatgtaaagagatggaaaacagcttcttgaaaacaatggacttaa aaattgaactagtaatcggcaaaaaaggaaaaacaaattttctttttatc gtcaaatcatgtagaaaccgtccgatttgtatagCGAGCCGTCTATTCTG GACTTTTATTTAATGACCttatca

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000115_pilon:168438..173811+

>MSTRG.14032.1.p1 ID=MSTRG.14032.1.p1|Name=MSTRG.14032.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=17094bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:168438..173811+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTATGCATTCCGTCATTCATTTTTAGAATGGAATTAATtcaaattcatgt
aaaaaaaacaatgaatttgGCATCTGACATGAACGCATCTCAAAAGCAGA
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CAGAAAATTGTCAGAATTTACTTTGTGATGATATATCGGAGTACATAATT
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AGAAGTGAAACAATTCGTCCTGTTTATGTCACTGGTGATCCGCGCAATAT
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GCACAAGCTTCCAAACAAACAGCCCACTGCTTTGGATCCTTATTTAGAAC
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GAAACAAAgTTGTGTCGAGCCTAGAAGGGGCAAAGATTTATGCAGAAAAT
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ACCGCAGAAGAATGGCGTAAATTTGCCTACCCTATGGCCGAAGTCTTGTT
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TTGTGGAACTTTTGTTCCACCGAAGAGATGGTCTCACAAACgatgaaatt
aaaaatctgGATAAGATTTGTTGGAGGAGATTAATTTTGTTGGAAGAACA
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AATGAGCGTGCTGTAAAAAGATACAAGGCAGTTCCAACGAATTTTAAGAA
CGTCGAAGCGACTTATGCTAAAATGGAGGTGTTTAGAGAGATGAAGTCAT
TGGAAGGAAAGCAAATTCGATGGACACACAAAGAGGATGACAGAAACAAA
gTTGTGTCGAGCCTAGAAGGGGCAAAGATTTATGCAGAAAATTGTCAGAA
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acgtGCCGTAATTGCTTACCCTCGCGATGTTgacttattttttattattg
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14032MSTRG.14032Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14032.1.p1MSTRG.14032.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14032.1.p1.exon1MSTRG.14032.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14032.1.p1.exon2MSTRG.14032.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.14032.1.p1.exon4MSTRG.14032.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14032.1.p1.exon5MSTRG.14032.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.14032.1.p1.exon7MSTRG.14032.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000115_pilongenomesc0000115_pilon:168438..173811 +