|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000115_pilon:109697..119988+ Legend: exonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.14026.1.p1 ID=MSTRG.14026.1.p1|Name=MSTRG.14026.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10292bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:109697..119988+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CgggcctgaccgcgcgactacggtggaaaaggtgtattaagGACCATAGT
CGGCTAAGTTTTAAtaggtaattaactttttttctttcgaagttttttca
aactgtacgcaaagaattgaactgttttcgatttttgggaaaaattttct
aaattaatgcatcaaaagttatggctgtttttctatgaaaaattgggatg
gaaaattagtcaaaaagcactattttcaagattttgaagcaaataagatT
TTAAATAACTAATTTTAGTTCGGTAAGAGATATTCCATCTACCgccaaat
tcttttcaaaatgttttttctccaCCGAAAATAagcttttcaaagttgaa
atactcttcttcgcaaaagtcttcattttcttcttcatcaaattttttca
ttgtgatTCTTAAATTTCCAGTCTCACGGATAATttgcctaacagaaaat
gtataacgtgccacagttttgtgtgctacatcaagtagaactttatattt
tgtaagtggcaaatattgaaaattcaatatggtcagagcccttaagccaT
CCAAATTCACCATCCAGTAGACGGATTTAAATATGTTTTCGAGTTCTTTT
ATAGTCACGATTCTCTTGAAGAGGGTTATCCCCCAACTGCCCACAAAGTT
AACATATTTCCCACCTTATGAATATGGTCAACCTTCGCCTTTGTGATGGC
TGGTAGGATCTTTTTGATGGGATCTCATAGTGACTTGTCAAGTTGATAAA
AGTACCCAATGTAAGATCgttttatcgttttttttgccttttgaGTTCTT
CTTTTCCTCCTTCTTTATATTGCAAGAAGCCTGGTGATAGATGTTTTTCT
TGCGGGTTTTATTGGCCCATCATCTGGCTTTTCTTTAACTTGTCGCTGTT
CGTGGTACTGCACGtccattttgaagaaaaagtagCACTTTTTTATACGA
AGTGTACGAATTGCGAATAAACATTCGACTTTTGCTATCTTGCTGGGCTT
TTATGCCGCTTTGGCTTCTTGTTTAAATTTAAGATCAACCAAATCCTCAA
TTTTCGCAACGGTTGCAAGAGGTtgagcaaattttcaaaactagaaaact
tattttttattcaaaaggtAAAATCcggagttttcaaagaataccATGAC
AGTGCTAATAATTAATGTTTTATGTTTATCTGTTGGGTTCCAAAATTCAC
AATTTATTTCAGACCGACTGATTTTTCACCAGAGTTTAAAAATATGCTAA
CATTTGAGGATTCTTTCTCTAGAGTTCATAACGTTACTGATTTGATTTGG
GTTACTGATACAGCAGGATTATCGGGAGGAGGACCTGGTAAATTTTTTAT
GCGGTCTTGGATCTCtttttttGCTATTtctattttgaattatttcccTC
CTGTTTTAGACCAAAAAtagagaacaaactatataaaaacataaggcttc
gatggccaaattgttaagaacattttaaggctttgtagtcCCTAgaacac
tcaatttcttaggaaaatgagcaaaaatactcaaaaaaaattgtgaaaat
aagaacatgttaagaacatttttaggattcaaatttttggatgttcttgt
aaaaagaaaaacgtgtgtTTTTTAGGATTCTTACCGTTTCAATCCTGAGA
TTGCTTATATTTTCAGATTTCTAAATTATTctgaagtgttttttttctat
aagaccTACGAGAGTATTCTAAAAAATGGGAGTCTATCGTTTAGTATGTG
CATATGAAGTGAAGTGCACTGTAGGAGCTCAATATCAGACTCTGAACAGG
TGTCTTTTGAAACTGAattcaaaatatatattatcTTATAGATTCATCAA
TAGAAAGATTTTTGTAGCTGAATGCAAAGGCGTATGGGAGTATTCATATA
ATCGATCAAAAAAGGGAAGGAAACgtgtttttaagaaatatattattatt
ttatcaatattcaaaatctttttcatattttgcattCGTATTCATAAAAA
GCGTACTACGATGTACTATTATAAAGCACGAGGGAAGTTTTGTTGTGGTT
TCTAGAGTTACAGAGTAAAGAGAGAGACTGCAGTAGATTATTGAATGGTT
TTGAagttttgacgatttttttatCGTAGTATTCTTTGTAGAGAGATTGA
AAGAGAGAAATGGCATCTCTAATTGCTCTAAGTCGAATCTCGATGATTCT
TTTGTTAACTTTCTAGCTTCCATCCAGGAGCTTTGGTTTTAAAGTCCGGG
GACACTTATATTGTCTGGTCCACGGAATGTGCTgcctttaagggctctga
ccatagtcagaaaattgattttagtatctgaaacataaaagttatgtttt
aaattctttaacacttttaacaaagaattgcctttataaattgtttttta
atcaaatcccttaagagtaattaagaacttgattgcaaaaatgacgttat
gaactttaaaaagacgttaataatatgttgcatcaccttcttttataaaa
agtgctaagttttaatgggtaattaacctttttgtttcgaactcttttca
aactgtccgcaaagaattgaactattttaaattttgcggaaaatttttct
aaaaagatgtgtcaaaagttatgactgtttttttaagcaaaatccagatg
aaaaattgatgaaaaaccactattttgaagatttcgagacaaagaagcat
ttacaaaaattttccgcaaaaatttttattgttcggtaaaagatacacca
tttactgcgaaaaattcttcaaaatgttttttcttcgccgaaactaagct
cttcaaagttgaaatactcttcctcgcaaaagtcctcattttcttcttca
tcaaactttttcaatgcaatttttgaattttcagattcaggaatagtttg
tctaatagaaaatgtataacatgctacagttttgttggttacatcagtca
gaaaacacattttaaacacggcaattatgaaaaattcactatggtcagag
cccttaagggaaGGTTTTCcgagaccctcgaaatgcaTTGTAAGTGTGTA
CTTTTGAGAGATTGCACTATAATCTGATCTTTTTTAGCTGCATACACCGT
AAGGTCGGGTTTGGGAAAAATCTGGATGTATCTTTATATAGTATTTTTGG
ACTCGCACCGATTTTGATTTGTTTAGCACATTGTGTTAACATCTCTGGGC
TCATTTTCAGGTGCCTTCAGcgaaataagatatgaaatcaaactaccCTG
TAAGGGTCAAAAACGTttggtaaaatgcactgtaagggtaccttttcaaa
GCTCAAGGGCGGCACTGTAAGGCCGAttctgaaaataactttttggcGGC
ACaagccgtcgtttagaaatcgagtgccccccgggTTTTAAAGAGTCGAA
GAGTCGCGTATCTGTTGATTTCTCGAATCAATCATATTTCTTTCAATGGA
CAAATCGGTGGGACCGGGTGGAACattacaatatttttattttacttttt
agcttcttttaCAGGATTTATGGATCAATTCCGGAGATTGTAAAATATGA
TCAACCACATACTggtgacgctctctaattctatctttaaggggaatcgg
attttcatcggaTAAGGGAACGTATTGAATAGATAGGTTTAAATCAGCCA
TTCCataaagttataagaaaaaaaaaaacaacaagctttatttttatttc
agcaAAAACTTTTCGGTAAAACCACCATGTATGTATTGAATAGAagaacg
tcgtttatgagagttttacCTTGTTGACGGTGACGGTGACTTGAAACATC
CTGTCTCCATGACTTGGTCAGAATTCTTCAGCCATCGTTGGCAAAAAAGG
GGGGTTAATGAACTATAGTTCTTTTTAAAGTAAGCCGGGGACCTATTGTG
TCTTCAATACGGCTAATTTGGCACTGAATGTAGAAAGATTGCTCAGGGTC
AGATTATGCTAAAATCTGCTCTCAAATTTTGGCCGAATTCCCGCCttttt
ttATAACTGTGCATTCGTAGATTTAAAAAGTGTGCCTCCCAAGTCACGTT
TTAACCCTTCTTACTAATATTTCTGTAAACTCTTTAAAAGTCCAATAATC
CTCGGGTTTTTAGGCGATTTTGGAATTCTTTGAGGTCTTTTTATACACTT
ATTGCTTATATCGAGGTCAAatatttttacttctttttgaaACTATCTTT
GTAAGTAGTGgattaaacttaaactttttaTTTGACATTATTGATAATAA
AGTCGATAAAAGTTTATATCGATTATAAAGTGTTCACAAGGTGTGGCCTT
TTTGAAGTTACAAAGAAGATTCTTTAGATGACGAACTGTTCTTGCAGAGA
GTGGTATTATACTTGTCACGCAAAGCGAGAGAGTAATGCAGTAGCGTTTT
AGATTGATTGAACAGAGTATGCGAGTAGTATGTATAAATCAATTAATATT
ACATTGCGACAGATAAAATAAGATATAGCGGTTTGGATCGAATTATACTT
tctcttttttgataatatgtATGTTGTTGTTGTGTCTGTTTGAATGGTGG
ATTTTTTGATGCAGCAGTTTTATCTGAATGAGATGTTTGAAAAGTTTAAG
TGATGTTACATTATTGTGTTAATATCACGGAGTGGGTTATCGATTGGATT
CGGAGATCGGTTATGGATTGCACTAGCGCCACCCCTTGattcttttcttt
aatttctgaCACCAAGTGGTATCGAGTAtcattacacccccttctcacag
acccactgggacccctccCCGCTAGAAATTGGccgaaatatcgtccccag
tgggaaattagactctaatttttgtccatggtgaaaataatcaaataaac
aaatcctcactgtaaaCTTTGTGCTATTTTCCTccatctccactgaattt
tctgacttgaaaagtATGGGATAAGAATTCCAGCCATAATGCATAAAATG
CCAGTATCAACCCCCATCAAGTTTTTGTCCGTTATTTCTaccctaccccc
ccccccccccccccacatctggctgaaaatattctaccgggtctgtgaga
aggggtgtatcaTTTTTCTACTAAGTATAAAGTCTGCTATGACCTGGTCA
GGGGTTCAGCTAATACTCTTGATCACCGTAGCCGAGTGCTTTACCGTTGC
ACTCCGCAAGGGTGACCGAACGTTGGCCCATAAGAAATAAGACAGATTTT
CTCCCCTATTAAATAGTTTAAAGCTCCCCTGATTATAGAAATATTATTTA
ATCCCAAATATAATTTTCTAACTCTTTTTTACAGTTCATTCATTGTTCGG
ACTAGTAAGATTTTAGTTGATAACTGAGACATGTAGCCTAGTCTAGACTA
TCCCCGGGTGTGTCTCATTCCACTGTATTGACCTGAGTGACAACTTGCAG
TCATATATCAACTAGTTTGTTCATATAGCACAGATCAATTAGAGACAATT
AGGATATAATAGAAGATATAATATGTCTTAATTGCAGACACTCGACCGCA
CAAATAACTATTCTACGGATATTTTGAACTAAGATGTAGCTATAAGGAAC
TATGCAGCTTTTTGCAGTACGTTCTTTATGCTTTAGCTTTTATTCATAAA
GAATCTGATCTCCGAGAAAGACTATGATAGTAGTGAAAGATGTCGCGGAA
CTTACTTGGAAATTGGCGTAAGGAATATTAGAAAacatagtttttttttc
ttcttcTttcttagaTAATTTGTATGCAAAGCCGTTTCTTTTTGCTAGGT
TTTTATATGACAAATTTCTCTAACGAAAATGAGCGATAAATAGAAAAAGA
TGTTTGGTAATGGAATGAATCCGATCTCTTTTTCCAGTAAAACTCCGGGG
GGTTACTAAGTTTGTGAGGTGACGGGTATACCAAATtaccaaattttatg
actcTTTGACAGGGTTGACTTTTGATATTTCGTTTAATATCATATATTCA
CATCCTTGAAAGTCTCTCATaaagggtacaaaaaccattaaaaagcaaag
aGTCTCTTAAAGGGTCCTTAGTACCCTCGGGCTTATTAAGGTATATActt
ttgttggacctaccccggtgggctgtaggtcctataaattaacctctgtt
cgtccgttcgttcgttcgtccgttcgttactagcttttctcgggattggc
tcattagtttttcctaatttttggcacaaagatgcaaaatggtaatgccc
aaaatgtgacggagcccgattttcgaaaaaaattcatttccggccgaaaa
tgccggaaatatgccggaaaaaccggttttttggcattttctcgagattt
catcattagttttttctgattttttgcacaaagatgcgtattagcaatgc
ctaaaacatggattagtccgatttttgagaaaaattctattccggctgaa
aatgccggaaatatcccggaaatcgccgtttttgaagattttcattggac
tttttccttatatttcgttgtttttttcacacaaaaacattatttgtagc
aatgcccaccatcaagcatggtttaattgtcaataaaagtgatttttgaa
gccggaactttctaaaaatcgccggaacagcctattttcgccggaaaaac
ggtatttcttgaatttctcgagctgtactttatattttttcatgaaattt
tgcacactgatgcaaaatggcaatacctaaaatatgacagagcctgattt
tcaattaacgtacttttccggccgaaaatgccggaaatatgccggaaaaa
ccggttttttggcattttctcgagatttcatcataagttttttctgattt
tttgcacaaagatgcgtattaacaatgtctaaaacatggcctagttcgat
ttttgagaaaaattctattccggctgaaaatgccggaaatatcccggaaa
tcgccgtttttgcagattttcatcggactttttccttatatttcgttgtt
tttttcacacaaaaacattattgatagcaatgcccaccatcaagcatggt
ttaattgtcaataaaagtgatttttgaagccggaactttctaaaaatcgc
cggaacaaacAGCtatttttcgccggaaaaaacggtatttcttgaatttc
tcgagctgtactttatatttttttcatgaaattttgcacactgatgcaaa
atgacaatacctaaaatttgacggagcccgattttcgaaaaatatttttt
cccggccgaaaatgccagaaatatatgccggaaaaccgttttttttttac
attttctcgaattttcatctttagctttttctgattttttgcagaaagat
gcgtatttgcaatgctcaaaacatggccgagttcgatttttgagaaaaaa
atttttccggttgaaaatgccggaaatcgccgtctttgcagattttcatt
atatgttttccttgtatttctatgttcttcacacaaaaacattattgata
acaatgctcaccatcaagcatgattcaattgtcaataaaactgatttttg
cgaccagaactttctattaatttttccctacaacccttccctctcccccc
atcaacaatcaatgatgaatttattgcgttatgcattttcgctaaacgat
atattttctgactgatttttttctcctcgcattgctatctaactttcatc
atcaggtaggtccattcagcatctagcttgttttcaTTGTTGTTTGTGGG
TGAAATTTATGTCAGATAGAATCACAGACAGCTTGCTTGAGTTTTTATTG
AAGATTATTCCTAGCTGGACTTTGCAAAATTggtctacacgctttttttt
atataaggaacacgtttataaggaactcgatgctgaaaatggtccaaaaa
ataaggaattgtttaggaactgctcaggctgagaataagaaaacaagttt
taaggaacagtaagagatgccccggggggggggggtacttaggcaaatgg
agggtacggtatgtgccgcccttaagggtaccttttttggacttccaaag
tcccgctaagggtcggaaaaatcagaaaatcaaatttcagtcccactaag
ggtcggaaaattaggaaaatttcaactttttaccccctgaaagatcgaaa
tttggtcaaaattggtcagatttgtcccgctaagggtcgtaaaattccca
aaattttcctttgttttctcctttttagtcccggtaagggtccaaagttc
gaaagtcgggcggcaccccccgtcagctcgcaaccCTAGTACCCCCCCGG
AGAGATGCTATGTAAATAAGGAACTCGATAAGGAATTTTGAGGCTGAAAT
TCTCTGTAAAAATAAGGAACTCCAGGCTCAGAGCAAAGTTAAGGTTCCTT
ATAAAAGaaaaacgtgtataagggAAGAGAAGAATTTTTGCCACTTATGA
ATCTCTTGAATCTTTCGTTTGAAACTGTTACAAGCCTTACAATCATATAA
CAACAAAGCTATTAAACTATTCTTCCATTTCAATTACATAATAGaacaaa
aacgaaagaaaaaattaaaacgaGCCAATCAGAACAAAGGAAAATACAAC
GCAAGCCAATCATGATGGATGACAGTAGTGATGATGAACGAGAATCATTG
GCTGGTGAAAGGTCACATGACCCATCAACAGTCTTCGCAACAATgattaa
atttgatttcaatTACATCACCAAGACATGGATAGGACGTGTCAAATTAG
CTCAGCTCATTTGCTGCATATTAGCAGGTTGTATTCTCCCAACAACAATA
GCGTTCTATTTCACACGTTTCTCATTCTACACCTTCGTCATCTGGACATG
TTTCATGTACATCTTTATCGATCTCCTCATCCACGTGACCAGCATCGCAA
AATTGGCGCCCGACTTTTGCCGGACCACCGATATCATGATGTATCCGTTA
TTTATCGGTGCGTTAACACTTCTCTTGAGTGCTTCATTAGTGGCTAGCGT
AACTGACATTCATCATGGTAGCCGAGCAACGCGCATtggattttcagcat
tttttggatTGATCCTAATGGCCTTATTCTTGTTTGAAGCCTTTTTACAG
TACCGTCGAGCACGTAACAACGGTGTAGAGCCACCTTTGTTTAGTTTCTC
ATTGCCAGGAAGAAGAGCACCCACTACTGATATTGACGCTGAGAACGGAA
ACATTCCCGCTGGACGAAATATTGTAATTTCAAGACCGACATCCCTTAGG
GCCGTCGAGGAACAACCACCACCTTATAGTAAGGGAATGGAAGGGGCGGA
CAAAGGTGGCGTCGCTGTGCCCCTTGGATCTTATGGTGGACAGTAAACTT
TCCAATAATTATTTGCGTGATCTCATCAAACAGTACCTTACATAGGAAAt
gcagaaaaaattattttcaatagagcaaaatatgttttaaggtattaaat
caaatataaactTGTACAGAtttttttCGAAGATTCGTATTCGTGTAATA
TTTACGTATTCACAATTTGGACAaattgtcaacaacaacaatTTTAGTAG
AAAAGATGATTCTTTAAAAGCAATTTAGTTACCCATTATAGGATATTATG
ATAATACCACGTAAtggactcttccagaaaaaaattgaaaatggggAGGG
GAGGTGGAGGATATTTGAATATTTGGaaatttgccccccccccacggaca
ttttgacttttgacccccgggCAGCAGGTATAACCcaccggacaagcatc
agttgacccctggacattcaaaagtaccctcaaacagagcaatgTTACCC
AAAAATAGAGTATTTTTACCCCccagacaaggcaaattttgtagattttt
tactACCCCCCGGATACTTTATCCTCCACCttccatgtacggacattttt
tAGAAGAGCCCAATATGACCCTtttgtaaagtatttttttgaatgTATAG
AATTTTTGTATCATAGTTTGAAATTACAGCCTTAGCGTAAatataaattc
aatttttcttaaaaactaattgagatatatttttcaagCCCTGCTAAGGC
TAATAAAGTCCCCAAAATAGCATCATTGGACACCAATATCCAATAAAGTA
ACCCCCTGTTACCGACACAGTTAAAAGGATTGAGTTTTTCTGATCAGAAA
TTTGTATGGTGTATGGTTTACAAATTGTACACCAGTCGACGCAGAATTTC
ATGTAGATTCCAAATATGCAATAACAACTTTTGTTTTAAGTTATGAACTT
TGACCCTCTACTGCGAGTACTCAGAGTTCTAGTCTAGTCGACTGACAATG
TAAAAAGTTAACAGGTCAGAGATATTGGAGTTATGAACATTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000115_pilon:109697..119988+ >MSTRG.14026.1.p1 ID=MSTRG.14026.1.p1|Name=MSTRG.14026.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1734bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:109697..119988+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ggcctgaccgcgcgactacggtggaaaaggtgtattaagGACCATAGTCG
GCTAAGTTTTAAtagaacaaaaacgaaagaaaaaattaaaacgaGCCAAT
CAGAACAAAGGAAAATACAACGCAAGCCAATCATGATGGATGACAGTAGT
GATGATGAACGAGAATCATTGGCTGGTGAAAGGTCACATGACCCATCAAC
AGTCTTCGCAACAATgattaaatttgatttcaatTACATCACCAAGACAT
GGATAGGACGTGTCAAATTAGCTCAGCTCATTTGCTGCATATTAGCAGGT
TGTATTCTCCCAACAACAATAGCGTTCTATTTCACACGTTTCTCATTCTA
CACCTTCGTCATCTGGACATGTTTCATGTACATCTTTATCGATCTCCTCA
TCCACGTGACCAGCATCGCAAAATTGGCGCCCGACTTTTGCCGGACCACC
GATATCATGATGTATCCGTTATTTATCGGTGCGTTAACACTTCTCTTGAG
TGCTTCATTAGTGGCTAGCGTAACTGACATTCATCATGGTAGCCGAGCAA
CGCGCATtggattttcagcattttttggatTGATCCTAATGGCCTTATTC
TTGTTTGAAGCCTTTTTACAGTACCGTCGAGCACGTAACAACGGTGTAGA
GCCACCTTTGTTTAGTTTCTCATTGCCAGGAAGAAGAGCACCCACTACTG
ATATTGACGCTGAGAACGGAAACATTCCCGCTGGACGAAATATTGTAATT
TCAAGACCGACATCCCTTAGGGCCGTCGAGGAACAACCACCACCTTATAG
TAAGGGAATGGAAGGGGCGGACAAAGGTGGCGTCGCTGTGCCCCTTGGAT
CTTATGGTGGACAGTAAggcctgaccgcgcgactacggtggaaaaggtgt
attaagGACCATAGTCGGCTAAGTTTTAAtagaacaaaaacgaaagaaaa
aattaaaacgaGCCAATCAGAACAAAGGAAAATACAACGCAAGCCAATCA
TGATGGATGACAGTAGTGATGATGAACGAGAATCATTGGCTGGTGAAAGG
TCACATGACCCATCAACAGTCTTCGCAACAATgattaaatttgatttcaa
tTACATCACCAAGACATGGATAGGACGTGTCAAATTAGCTCAGCTCATTT
GCTGCATATTAGCAGGTTGTATTCTCCCAACAACAATAGCGTTCTATTTC
ACACGTTTCTCATTCTACACCTTCGTCATCTGGACATGTTTCATGTACAT
CTTTATCGATCTCCTCATCCACGTGACCAGCATCGCAAAATTGGCGCCCG
ACTTTTGCCGGACCACCGATATCATGATGTATCCGTTATTTATCGGTGCG
TTAACACTTCTCTTGAGTGCTTCATTAGTGGCTAGCGTAACTGACATTCA
TCATGGTAGCCGAGCAACGCGCATtggattttcagcattttttggatTGA
TCCTAATGGCCTTATTCTTGTTTGAAGCCTTTTTACAGTACCGTCGAGCA
CGTAACAACGGTGTAGAGCCACCTTTGTTTAGTTTCTCATTGCCAGGAAG
AAGAGCACCCACTACTGATATTGACGCTGAGAACGGAAACATTCCCGCTG
GACGAAATATTGTAATTTCAAGACCGACATCCCTTAGGGCCGTCGAGGAA
CAACCACCACCTTATAGTAAGGGAATGGAAGGGGCGGACAAAGGTGGCGT
CGCTGTGCCCCTTGGATCTTATGGTGGACAGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000115_pilon | genome | sc0000115_pilon:109697..119988 + |
|
